Βιολογικές βάσεις δεδομένων - Ανάκτηση αλληλουχιών με τη βοήθεια περιηγητών γονιδιωμάτων

• Main Authors: Papanikolaou, Georgios, Παπανικολάου, Γεώργιος
• Format: 7
• Language: Greek
• Published: 2016
• Subjects: ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΤΟΥ ΑΝΘΡΩΠΟΥ; Human Genetics

Στο θεωρητικό μέρος του κεφαλαίου παρουσιάζονται βασικοί διαδικτυακοί τόποι για την αναζήτηση πληροφοριών όπως οι ΟΜΙΜ, GeneTests, UniProt, εξηγείται η δομή και λειτουργία του International Nucleotide Sequence Database Collaboration, οι βάσεις GenBanK και RefSeq ενώ δίνεται ιδιαίτερη βαρύτητα στην παρουσίαση του περιηγητή γονιδιωμάτων (Genome Browser) του University of California, Santa Cruz (UCSC). Εξηγείται η δομή των αρχείων fasta για την αποθήκευση και επεξεργασία αλληλουχιών. Στις πρακτικές ασκήσεις πραγματοποιούνται αναζητήσεις πληροφοριών σχετικών με το γονίδιο TAS2R38 στους διαδικτυακούς τόπους και βάσεις που παρουσιάστηκαν στο θεωρητικό μέρος και εξηγείται η ανάκτηση της αλληλουχίας του γονιδίου TAS2R38 και της πρωτείνης και η ανάκτηση των αλληλουχιών ορθολόγων γονιδίων σε άλλα είδη.