Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων
Τα τελευταία χρόνια υπάρχει έντονη ερευνητική δραστηριότητα γύρω από την ανάπτυξη νέων, ταχύτερων και πιο αξιόπιστων αναλυτικών μεθόδων και βιοαισθητήρων για την ταυτοποίηση ή τον ποσοτικό προσδιορισμό νουκλεϊκών οξέων. Η παρούσα μεταπτυχιακή εργασία είχε ως στόχο την ανάπτυξη νέων βιοαισθητήρων D...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2017
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/10271 |
| id |
nemertes-10889-10271 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Βιοαισθητήρες Χημειοφωταύγεια Μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός Biosensors Chemiluminescence DNA Single nucleotide polymorphisms 543 |
| spellingShingle |
Βιοαισθητήρες Χημειοφωταύγεια Μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός Biosensors Chemiluminescence DNA Single nucleotide polymorphisms 543 Σπύρου, Έλενα Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| description |
Τα τελευταία χρόνια υπάρχει έντονη ερευνητική δραστηριότητα γύρω από την ανάπτυξη νέων, ταχύτερων και πιο αξιόπιστων αναλυτικών μεθόδων και βιοαισθητήρων για την ταυτοποίηση ή τον ποσοτικό προσδιορισμό νουκλεϊκών οξέων.
Η παρούσα μεταπτυχιακή εργασία είχε ως στόχο την ανάπτυξη νέων βιοαισθητήρων DNA είτε για (α) τη γονοτύπιση μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών είτε για (β) τον προσδιορισμό ειδικών αλληλουχιών νουκλεϊκών οξέων.
Πιο συγκεκριμένα, το Θεωρητικό Μέρος χωρίζεται σε τέσσερα κεφάλαια. Στο Κεφάλαιο 1 παρουσιάζεται γενικά η ανάλυση των νουκλεϊκών οξέων. Γίνεται εκτενής αναφορά στην αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) αλλά και στους τρόπους ανίχνευσης και ταυτοποίησης των προϊόντων της PCR. Στο κεφάλαιο 2 περιγράφεται ο όρος μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός και παρουσιάζονται τρόποι γονοτύπισης των πολυμορφισμών αυτών. Στο κεφάλαιο 3 παρουσιάζονται οι χημειο(βιο)φωταυγείς ιχνηθέτες και ο τρόπος που χρησιμοποιούνται για την ανάλυση νουκλεϊκών οξέων. Τέλος στο Κεφάλαιο 4 γίνεται εκτενής περιγραφή των βιοαισθητήρων DNA και των τύπων που έχουν αναπτυχθεί μέχρι σήμερα.
Το πειραματικό μέρος χωρίζεται σε δύο κεφάλαια. Στο κεφάλαιο 5 παρουσιάζεται η ανάπτυξη βιοαισθητήρα ξηρών αντιδραστηρίων για την ανίχνευση μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών με χρήση φαινομένου χημειοφωταύγειας. Περιγράφονται αναλυτικά όλα τα αντιδραστήρια και όργανα που χρησιμοποιήθηκαν, τα στάδια της μεθόδου καθώς και τα αποτελέσματα που προέκυψαν. Τέλος στο Κεφάλαιο 6 παρουσιάζονται οι μελέτες για την ανάπτυξη βιοαισθητήρα ξηρών αντιδραστηρίων για ανίχνευση ειδικών μονόκλωνων και δίκλωνων αλληλουχιών. Η ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων είναι ένας κλάδος που έχει αρχίσει τα τελευταία χρόνια να βρίσκει εφαρμογή στην αναλυτική χημεία και είναι η πρώτη φορά που χρησιμοποιείται για την ανάλυση νουκλεϊκών οξέων. Έτσι πιστεύουμε ότι η παρούσα μεταπτυχιακή εργασία συνέβαλλε και σε ερευνητικό επίπεδο. |
| author2 |
Χριστόπουλος, Θεόδωρος |
| author_facet |
Χριστόπουλος, Θεόδωρος Σπύρου, Έλενα |
| format |
Thesis |
| author |
Σπύρου, Έλενα |
| author_sort |
Σπύρου, Έλενα |
| title |
Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| title_short |
Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| title_full |
Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| title_fullStr |
Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| title_full_unstemmed |
Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| title_sort |
ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων |
| publishDate |
2017 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/10271 |
| work_keys_str_mv |
AT spyrouelena anaptyxēchēmeiophōtaugeiometrikōnbioaisthētērōngiaanalysēnoukleïkōnoxeōn AT spyrouelena developmentofchemiluminescentbiosensorsfornucleicacidsanalysis |
| _version_ |
1771297314027077632 |
| spelling |
nemertes-10889-102712022-09-05T20:52:16Z Ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων για ανάλυση νουκλεϊκών οξέων Development of chemiluminescent biosensors for nucleic acids analysis Σπύρου, Έλενα Χριστόπουλος, Θεόδωρος Χριστόπουλος, Θεόδωρος Καλογιάννη, Δέσποινα Αγγελοπούλου, Αικατερίνη Spyrou, Elena Βιοαισθητήρες Χημειοφωταύγεια Μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός Biosensors Chemiluminescence DNA Single nucleotide polymorphisms 543 Τα τελευταία χρόνια υπάρχει έντονη ερευνητική δραστηριότητα γύρω από την ανάπτυξη νέων, ταχύτερων και πιο αξιόπιστων αναλυτικών μεθόδων και βιοαισθητήρων για την ταυτοποίηση ή τον ποσοτικό προσδιορισμό νουκλεϊκών οξέων. Η παρούσα μεταπτυχιακή εργασία είχε ως στόχο την ανάπτυξη νέων βιοαισθητήρων DNA είτε για (α) τη γονοτύπιση μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών είτε για (β) τον προσδιορισμό ειδικών αλληλουχιών νουκλεϊκών οξέων. Πιο συγκεκριμένα, το Θεωρητικό Μέρος χωρίζεται σε τέσσερα κεφάλαια. Στο Κεφάλαιο 1 παρουσιάζεται γενικά η ανάλυση των νουκλεϊκών οξέων. Γίνεται εκτενής αναφορά στην αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) αλλά και στους τρόπους ανίχνευσης και ταυτοποίησης των προϊόντων της PCR. Στο κεφάλαιο 2 περιγράφεται ο όρος μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός και παρουσιάζονται τρόποι γονοτύπισης των πολυμορφισμών αυτών. Στο κεφάλαιο 3 παρουσιάζονται οι χημειο(βιο)φωταυγείς ιχνηθέτες και ο τρόπος που χρησιμοποιούνται για την ανάλυση νουκλεϊκών οξέων. Τέλος στο Κεφάλαιο 4 γίνεται εκτενής περιγραφή των βιοαισθητήρων DNA και των τύπων που έχουν αναπτυχθεί μέχρι σήμερα. Το πειραματικό μέρος χωρίζεται σε δύο κεφάλαια. Στο κεφάλαιο 5 παρουσιάζεται η ανάπτυξη βιοαισθητήρα ξηρών αντιδραστηρίων για την ανίχνευση μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών με χρήση φαινομένου χημειοφωταύγειας. Περιγράφονται αναλυτικά όλα τα αντιδραστήρια και όργανα που χρησιμοποιήθηκαν, τα στάδια της μεθόδου καθώς και τα αποτελέσματα που προέκυψαν. Τέλος στο Κεφάλαιο 6 παρουσιάζονται οι μελέτες για την ανάπτυξη βιοαισθητήρα ξηρών αντιδραστηρίων για ανίχνευση ειδικών μονόκλωνων και δίκλωνων αλληλουχιών. Η ανάπτυξη χημειοφωταυγειομετρικών βιοαισθητήρων είναι ένας κλάδος που έχει αρχίσει τα τελευταία χρόνια να βρίσκει εφαρμογή στην αναλυτική χημεία και είναι η πρώτη φορά που χρησιμοποιείται για την ανάλυση νουκλεϊκών οξέων. Έτσι πιστεύουμε ότι η παρούσα μεταπτυχιακή εργασία συνέβαλλε και σε ερευνητικό επίπεδο. In recent years there is a continuous increasing research activity towards to the development of new, rapid and reliable analytical methods and biosensors for detection or quantification of nucleic acids. The present master thesis focuses on the development of biosensors both for (a) the single nucleotide polymorphisms genotyping and (b) for detection of specific DNA sequences. More specifically, the theoretical background of this thesis is divided in four chapters. In Chapter 1, it is presented, generally, the analysis of nucleic acids. Extensive reference to the polymerase chain reaction (PCR) and the ways of detection and identification of PCR products are shown. Chapter 2 describes the term single nucleotide polymorphism and it is presented the ways of genotyping these polymorphisms. Chapter 3 presents the chemiluminescent probes and the methods that are used for the analysis of nucleic acids. Finally, Chapter 4 is a comprehensive description of DNA biosensors and biosensors types that have been developed to date. The experimental section is divided in two chapters. In chapter 5, it is described the development of a dry reagent biosensor for detection of single nucleotide polymorphisms, by using chemiluminescence. It is described, in detail, all reagents and instruments used, the stages of the process and the results obtained. Finally in chapter 6, it is presented the studies for the development of a chemiluminescent dry reagent biosensor for detection of single and double stranded nucleotides. In recent years, chemiluminescent biosensors are a field that has started to find application in analytical chemistry, and it is first used for the analysis of nucleic acids. So we believe that this thesis help in research level. 2017-05-12T16:48:10Z 2017-05-12T16:48:10Z 2016-03 Thesis http://hdl.handle.net/10889/10271 gr 0 application/pdf |
