Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης

Οι δενδρίτες των CA1 πυραμιδικών νευρώνων, που βρίσκονται στον έσω κροταφικό λοβό του εγκεφάλου, μπορούν να χαρακτηριστούν ως “δυνατοί ” ή “αδύναμοι ” ανάλογα με το αν μετά από τη διέγερσή τους από κάποιο ερέθισμα , η ολοκλήρωση στο σώμα είναι μη γραμμική , και συγκεκριμένα υπερ-γραμμική ή γραμμι...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Kυρίμη, Bασιλική
Άλλοι συγγραφείς: Κωστόπουλος, Γεώργιος
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2017
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/10295
id nemertes-10889-10295
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Yπολογιστική μοντελοποίηση
Δενδρίτες
Ενδυνάμωση
Νευρώνες
Σώμα
Δενδριτική διακλάδωση
Computational modelling
Dendrites
Branch strength potentiation
Neurons
Soma
Dendritic arborization
612.810 46
spellingShingle Yπολογιστική μοντελοποίηση
Δενδρίτες
Ενδυνάμωση
Νευρώνες
Σώμα
Δενδριτική διακλάδωση
Computational modelling
Dendrites
Branch strength potentiation
Neurons
Soma
Dendritic arborization
612.810 46
Kυρίμη, Bασιλική
Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
description Οι δενδρίτες των CA1 πυραμιδικών νευρώνων, που βρίσκονται στον έσω κροταφικό λοβό του εγκεφάλου, μπορούν να χαρακτηριστούν ως “δυνατοί ” ή “αδύναμοι ” ανάλογα με το αν μετά από τη διέγερσή τους από κάποιο ερέθισμα , η ολοκλήρωση στο σώμα είναι μη γραμμική , και συγκεκριμένα υπερ-γραμμική ή γραμμική αντίστοιχα. Τα ποσοτικά κριτήρια που χρησιμοποιήθηκαν στην παρούσα μελέτη για τον χαρακτηρισμό των δενδριτών σε δυνατούς και αδύναμους, είναι το πλάτος των EPSPs και ο ρυθμός αύξησης του δυναμικού στο σώμα του νευρώνα. Για τον καθορισμό χρονικής εξέλιξης του μεμβρανικού δυναμικού σε διάφορα σημεία της μεμβράνης, χρησιμοποιήθηκε το λογισμικό NEURON, όπου ο νευρώνας προσομοιώνεται με ένα πολυτμηματικό μοντέλο με βάση τη μαθηματική θεωρία καλωδίων. Η μορφολογία του CA1 πυραμιδικού νευρώνα λήφθηκε από το αρχείο Duke- Southampton και προέρχεται από την τρισδιάστατη ψηφιοποίηση πραγματικών CA1 κυττάρων από τον ιππόκαμπο ποντικών. Από τους διαφορετικούς τύπους των τασεοελεγχόμενων διαύλων που βρίσκονται στους δενδρίτες του CA1 πυραμιδικού νευρώνα, επιλέξαμε αρχικά να μελετήσουμε τη μεταβολή στην αγωγιμότητα των διαύλων τύπου Κ1, που αναφέρεται ως αγωγιμότητα Α τύπου. Το φαινόμενο της δενδριτικής ενδυνάμωσης παρατηρήθηκε για έναν γειτονικό ως προς το σώμα του νευρώνα δενδρίτη. Σε περαιτέρω υπολογιστικά πειράματα όπου μειώνονταν ή αυξάνονταν άλλοι τύποι αγωγιμοτήτων δεν παρατηρήθηκε το φαινόμενο της δενδριτικής ενδυνάμωσης σε κανέναν δενδρίτη και συνεπώς μπορούμε να θεωρήσουμε ότι η μείωση της αγωγιμότητας τύπου Α παίζει ρόλο στην εκδήλωση του φαινομένου της δενδριτικής ενδυνάμωσης, αλλά δεν είναι το μοναδικό αίτιο. Η σχετική θέση του σημείου παροχής του ερεθίσματος πιθανώς να ευνοεί την εκδήλωση του φαινομένου εφόσον το μοντέλο δίνει υπερ-γραμμική απόκριση όταν ο δενρίτης εκφύεται από σημείο που βρίσκεται κοντά στο σώμα του νευρώνα και το ερέθισμα δίνεται σε σημείο του δενδρίτη που βρίσκεται σχετικά μακριά από το σημείο διακλάδωσης.
author2 Κωστόπουλος, Γεώργιος
author_facet Κωστόπουλος, Γεώργιος
Kυρίμη, Bασιλική
format Thesis
author Kυρίμη, Bασιλική
author_sort Kυρίμη, Bασιλική
title Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
title_short Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
title_full Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
title_fullStr Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
title_full_unstemmed Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
title_sort υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης
publishDate 2017
url http://hdl.handle.net/10889/10295
work_keys_str_mv AT kyrimēbasilikē ypologistikēmontelopoiēsētēsdendritikēsendynamōsēs
AT kyrimēbasilikē computationalmodellingofbranchstrengthpotentiation
_version_ 1771297220530798592
spelling nemertes-10889-102952022-09-05T14:07:12Z Υπολογιστική μοντελοποίηση της δενδριτικής ενδυνάμωσης Computational modelling of branch strength potentiation Kυρίμη, Bασιλική Κωστόπουλος, Γεώργιος Κωστόπουλος, Γεώργιος Ποϊράζη, Παναγιώτα Παπαθεοδωρόπουλος, Κωνσταντίνος Kyrimi, Vicky Yπολογιστική μοντελοποίηση Δενδρίτες Ενδυνάμωση Νευρώνες Σώμα Δενδριτική διακλάδωση Computational modelling Dendrites Branch strength potentiation Neurons Soma Dendritic arborization 612.810 46 Οι δενδρίτες των CA1 πυραμιδικών νευρώνων, που βρίσκονται στον έσω κροταφικό λοβό του εγκεφάλου, μπορούν να χαρακτηριστούν ως “δυνατοί ” ή “αδύναμοι ” ανάλογα με το αν μετά από τη διέγερσή τους από κάποιο ερέθισμα , η ολοκλήρωση στο σώμα είναι μη γραμμική , και συγκεκριμένα υπερ-γραμμική ή γραμμική αντίστοιχα. Τα ποσοτικά κριτήρια που χρησιμοποιήθηκαν στην παρούσα μελέτη για τον χαρακτηρισμό των δενδριτών σε δυνατούς και αδύναμους, είναι το πλάτος των EPSPs και ο ρυθμός αύξησης του δυναμικού στο σώμα του νευρώνα. Για τον καθορισμό χρονικής εξέλιξης του μεμβρανικού δυναμικού σε διάφορα σημεία της μεμβράνης, χρησιμοποιήθηκε το λογισμικό NEURON, όπου ο νευρώνας προσομοιώνεται με ένα πολυτμηματικό μοντέλο με βάση τη μαθηματική θεωρία καλωδίων. Η μορφολογία του CA1 πυραμιδικού νευρώνα λήφθηκε από το αρχείο Duke- Southampton και προέρχεται από την τρισδιάστατη ψηφιοποίηση πραγματικών CA1 κυττάρων από τον ιππόκαμπο ποντικών. Από τους διαφορετικούς τύπους των τασεοελεγχόμενων διαύλων που βρίσκονται στους δενδρίτες του CA1 πυραμιδικού νευρώνα, επιλέξαμε αρχικά να μελετήσουμε τη μεταβολή στην αγωγιμότητα των διαύλων τύπου Κ1, που αναφέρεται ως αγωγιμότητα Α τύπου. Το φαινόμενο της δενδριτικής ενδυνάμωσης παρατηρήθηκε για έναν γειτονικό ως προς το σώμα του νευρώνα δενδρίτη. Σε περαιτέρω υπολογιστικά πειράματα όπου μειώνονταν ή αυξάνονταν άλλοι τύποι αγωγιμοτήτων δεν παρατηρήθηκε το φαινόμενο της δενδριτικής ενδυνάμωσης σε κανέναν δενδρίτη και συνεπώς μπορούμε να θεωρήσουμε ότι η μείωση της αγωγιμότητας τύπου Α παίζει ρόλο στην εκδήλωση του φαινομένου της δενδριτικής ενδυνάμωσης, αλλά δεν είναι το μοναδικό αίτιο. Η σχετική θέση του σημείου παροχής του ερεθίσματος πιθανώς να ευνοεί την εκδήλωση του φαινομένου εφόσον το μοντέλο δίνει υπερ-γραμμική απόκριση όταν ο δενρίτης εκφύεται από σημείο που βρίσκεται κοντά στο σώμα του νευρώνα και το ερέθισμα δίνεται σε σημείο του δενδρίτη που βρίσκεται σχετικά μακριά από το σημείο διακλάδωσης. CA1 pyramidal neuron dendrites, positioned in the medial temporal lobe in the brain, can be characterised as strong or weak. If integration at the soma, after excitation by a given stimulus, is supra-linear /linear dendrites are characterised as strong/weak respectively. In this study, the amplitude of EPSPs as well as the increase rate of electric potential at the soma, were used as characterisation criteria. The NEURON software package was used to define the time evolution of the membrane potential in different points across the membrane. Using cable theory, the neuron is simulated as a multi-compartmental model. CA1 pyramidal neuron morphology was taken from Duke-Southampton archive of neuronal geometry, which includes data supplied by 3D digitization of real rat hippocampus cells. Among different types of voltage gated channels dispersed along the CA1 pyramidal neuron dendrites, we initially studied the effect of changing the K1-type channel conductance, referred as A-type conductance. Branch strength potentiation was observed for a dendrite positioned in the neighbourhood of the cell soma. In subsequent computational experiments, where other conductance types were decreased or increased, no sign of branch strength potentiation was shown. Therefore, we conclude that decreasing A-type conductance plays role in the phenomenon known as branch strength potentiation, but is not the only cause of the phenomenon. The relative position of the given stimulus may account for the phenomenon, since the response is supra-linear in the case that the given stimulus is at a point on a dendrite which is relatively far from the dendritic arborization ,the latter being on a site very close to the soma. 2017-06-01T09:56:09Z 2017-06-01T09:56:09Z 2016-09 Thesis http://hdl.handle.net/10889/10295 gr 0 application/pdf