| Summary: | Το δεοξυριβονουκλεϊκό οξύ (Deoxyribonucleic acid – DNA) περιέχει τις γενετικές πληροφορίες που καθορίζουν τη βιολογική ανάπτυξη όλων των κυτταρικών μορφών ζωής. Έχει τη μορφή της διπλής έλικας ενώ η μεταβίβαση της γενετικής πληροφορίας ξεκινά με την αντιγραφή του μακρομορίου του DNA. Η αντιγραφή ξεκινά από συγκεκριμένα τμήματα με την πρόσδεση των εναρκτήριων πρωτεϊνών. Παρόλα αυτά οι πληροφορίες που έχουμε μέχρι σήμερα δεν είναι αρκετές για να κατανοήσουμε σε βάθος τις βιολογικές διαδικασίες. Πιο συγκεκριμένα, για την έναρξη της αντιγραφής, δεν γνωρίζουμε πώς οι εναρκτήριες πρωτεΐνες αναγνωρίζουν τις θέσεις της έναρξης της αντιγραφής και αν σε αυτό διευκολύνει η δομή της διπλής έλικας ή ακόμη και οι προσωρινές αποδιατάξεις λόγω των θερμικών διακυμάνσεων των βάσεων που περιέχει. Είναι γνωστό ότι το μακρομόριο του DNA υπόκειται σε τέτοιες θερμικές αποδιατάξεις που οδηγούν σε παροδικά ανοίγματα. Η παρούσα εργασία μελετά αν υπάρχει συσχέτιση των θερμικών ανοίγματων του DNA με την αναγνώριση των θέσεων έναρξης της αντιγραφής. Αυτό γίνεται με τη βοήθεια του μοντέλου των Peyrard-Bishop-Dauxois. Οι οργανισμοί που μελετήθηκαν είναι το Escherichia coli από την οικογένεια των βακτηρίων, το Sulfolobus solfataricus P2 από την οικογένεια των αρχαιοβακτηρίων και το Saccharomyces cerevisiae από την οικογένεια των ευκαρυωτών.
|
|---|
