Επεξεργασία εικόνων βιολογικού περιεχομένου

Στην παρούσα διπλωματική εργασία αντικείμενο μελέτης αποτελούν εικόνες που προέρχονται από συνεστιακό μικροσκόπιο και απεικονίζουν τομές εγκεφάλου ποντικών. Σκοπός της εργασίας είναι η αποθορυβοποίηση των εικόνων αυτών και η μελέτη τεχνικών καταμέτρησης των κυτταρικών πυρήνων. Συγκεκριμένα μελετήθηκ...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Παπούλια, Άννα
Other Authors: Δερματάς, Ευάγγελος
Format: Thesis
Language:Greek
Published: 2018
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10889/10995
Description
Summary:Στην παρούσα διπλωματική εργασία αντικείμενο μελέτης αποτελούν εικόνες που προέρχονται από συνεστιακό μικροσκόπιο και απεικονίζουν τομές εγκεφάλου ποντικών. Σκοπός της εργασίας είναι η αποθορυβοποίηση των εικόνων αυτών και η μελέτη τεχνικών καταμέτρησης των κυτταρικών πυρήνων. Συγκεκριμένα μελετήθηκε ο Φασματικός διαχωρισμός (Spectral Clustering) με χρήση λαπλασιανών γραφημάτων (graph laplacians), η χρήση του αλγορίθμου Μέγιστης ροής (οικογένεια Continuous max-flow αλγορίθμων), ο αλγόριθμος k-means, η τεχνική ανάλυσης σε πρωταρχικά στοιχέια (Singular Value Decomposition) σε συνδυασμό με χαμηλής τάξης (low rank) μητρώα και ο αλγόριθμος Watershed. Μετά την ολοκλήρωση της μελέτης διαπιστώθηκε ότι το φιλτράρισμα με χρήση διμερούς φίλτρου είναι το καταλληλότερο για αυτού του είδους τις εικόνες. Ωστόσο όσον αφορά την κατάτμηση, κανένας από τους περιγραφόμενους αλγορίθμους δεν ήταν σε θέση να δώσει ικανοποιητική λύση στις περιοχές όπου υπάρχει συνωστισμός και επικάλυψη κυττάρων.