| Περίληψη: | Τα πεπτιδυλο-ανάλογα της χλωραμφενικόλης έχουν εδραιωθεί πρόσφατα ως χρήσιμα εργαλεία για την διερεύνηση της αλληλεπίδρασης της νεοσυντιθέμενης πολυπεπτιδικής αλυσίδας με το ριβόσωμα τόσο σε βιοχημικό όσο και σε δομικό επίπεδο. Στην παρούσα εργασία μελέτησα ένα νέο 10-πεπτιδικό ανάλογο της χλωραμφενικόλης (10mer-CAM) το οποίο ασκεί διττή ανασταλτική δράση στη λειτουργία του ριβοσώματος, επιδρώντας επάνω σε δύο διακριτές περιοχές του ριβοσώματος: το κέντρο της πεπτιδυλοτρανσφεράσης (PTC) και το τούνελ εξόδου της νεοσυντιθέμενης πολυπεπτιδικής αλυσίδας. Σύμφωνα με τα υπάρχοντα δεδομένα, πρόσδεση του 10mer-CAM στην θέση πρόσδεσης της χλωραμφενικόλης αναστέλλει το σχηματισμό τόσο της ακετυλο-φαινυλαλανινο-πουρομυκίνης όσο και της ακετυλο-λυσινο-πουρομυκίνης, έχοντας ωστόσο μειωμένη ανασταλτική δράση επάνω στο PTC, συγκριτικά με το μητρικό μόριο της χλωραμφενικόλης. Επιπλέον, φάνηκε ότι το ίδιο μόριο είναι ένας ισχυρός αναστολέας της σύνθεσης της πράσινης φθορίζουσας πρωτεΐνης (GFP) σε ένα in vitro σύστημα συζευγμένης μεταγραφής και μετάφρασης όπως και του πολυμερισμού της λυσίνης, δείχνοντας έτσι ότι είναι πιθανή η ύπαρξη μίας ακόμα ανασταλτικής δράσης. Καθώς τα δεδομένα από μελέτες προστασίας από χημική τροποποίηση υποστηρίζουν την αλληλεπίδραση της ένωσης μας με βάσεις του ριβοσωμικού RNA κοντά στην είσοδο του τούνελ εξόδου του ριβοσώματος (Α2058, Α2059) συμπεράναμε ότι η επιπρόσθετη αναστολή επάνω στη σύνθεση πολυπεπτιδίων προέρχεται από αλληλεπιδράσεις του πεπτιδυλο-αναλόγου με κατάλοιπα του τούνελ εξόδου. Η αναστολή αυτή πραγματοποιείται μέσω πλήρωσης του τούνελ και παρεμπόδισης της διόδου του νεοσυντιθέμενου πολυπεπτιδίου. Η διττή αυτή δράση του αναλόγου επάνω στο ριβόσωμα αυξάνει τη δραστικότητα του ως αναστολέα της βακτηριακής πρωτεϊνοσύνθεσης και προτείνει μία νέα πλατφόρμα τόσο για βελτίωση της αντιμικροβιακής δραστικότητας κλασσικών αντιβιοτικών όσο και για σύνθεση νέων.
|
|---|
