Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών
Η μεσογειακή μύγα αποτελεί το κύριο παράσιτο πολλών καλλιεργούμενων φρούτων προκαλώντας ετησίως μεγάλες καταστροφές σε γεωργικές καλλιέργειες. Η μελέτη του εντόμου τόσο σε γενετικό όσο και σε πληθυσμιακό επίπεδο μπορεί να συμβάλλει σημαντικά στην ανάπτυξη ή και τη βελτίωση αποτελεσματικών και φιλικώ...
Κύριος συγγραφέας: | |
---|---|
Άλλοι συγγραφείς: | |
Μορφή: | Thesis |
Γλώσσα: | Greek |
Έκδοση: |
2008
|
Θέματα: | |
Διαθέσιμο Online: | http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/1123 |
id |
nemertes-10889-1123 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
nemertes-10889-11232022-09-05T20:23:54Z Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών Οικονόμου, Αικατερίνη Ζαχαροπούλου, Αντιγόνη Ζαχαροπούλου, Αντιγόνη Μίντζας, Αναστάσιος Κίλιας, Γεώργιος Μεσογειακή μύγα Καλλιεργούμενα φρούτα Μέθοδοι ελέγχου Μικροδορυφόροι Πληθυσμιακές μελέτες Ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα πολυακρυλαμιδίου Αυτοραδιογραφία Ξενιστής Ceratitis capitata Medfly Cultivated fruits Control methods Microsatellites Analysis of natural populations Polyacrylamide gel electrophoresis Autoradiography Host 576.875 Η μεσογειακή μύγα αποτελεί το κύριο παράσιτο πολλών καλλιεργούμενων φρούτων προκαλώντας ετησίως μεγάλες καταστροφές σε γεωργικές καλλιέργειες. Η μελέτη του εντόμου τόσο σε γενετικό όσο και σε πληθυσμιακό επίπεδο μπορεί να συμβάλλει σημαντικά στην ανάπτυξη ή και τη βελτίωση αποτελεσματικών και φιλικών προς το περιβάλλον μεθόδων ελέγχου. Οι μικροδορυφόροι είναι απλές επαναλήψεις ενός νουκλεοτιδικού μοτίβου που αποτελείται 1-6 ζεύγη βάσεων. Αποτελούν πολύ χρήσιμους γενετικούς δείκτες διότι είναι άφθονοι και διάσπαρτοι στο γονιδίωμα των ευκαρυωτκών οργανισμών. Επιπλέον είναι υψηλά πολυμορφικοί, κληρονομούνται ως συνυπερέχοντες Μεντελικοί δείκτες και αναλύονται εύκολα μέσω PCR, χαρακτηριστικά που τους καθιστούν πολύτιμα εργαλεία για πληθυσμιακές και εξελικτικές μελέτες. Από τους μικροδορυφορικούς δείκτες που αναπτύχθηκαν στο εργαστήριό μας, επιλέχθηκαν 10 με βάση το βαθμό πολυμορφισμού που έδειξαν σε εργαστηριακά στελέχη. Οι δείκτες αυτοί χρησιμοποιήθηκαν στην ανάλυση 481 ενηλίκων ατόμων που προέρχονταν από 19 διαφορετικά δείγματα φρούτων που συλλέχθηκαν από εννέα διαφορετικές περιοχές της Δυτικής Ελλάδας και της Βόρειας Πελλοπονήσου. Η γενοτυπική ανάλυση πραγματοποιήθηκε με ηλεκτροφόρηση των προϊόντων της PCR για κάθε γενετικό δείκτη σε πήκτωμα πολυακρυλαμιδίου και επακόλουθη αυτοραδιογραφία. Η στατιστική επεξεργασία των αποτελεσμάτων, με τη βοήθεια υπολογιστικών προγραμμάτων αποκάλυψε σημαντική γενετική διαφοροποίηση μεταξύ των δειγμάτων, που αποδίδεται εκτός των άλλων παραγόντων (κλιματολογικές συνθήκες, γεωγραφική προέλευση) στο είδος του ξενιστή. C. capitata, is the main pest of many cultivable fruits and responsible for a significant loss in annual products, resulting in great economic damage. Studies on the genetic and population analysis will make a contribution towards the development or the improvement of environmental friendly control methods. Microsatellites are tandem simple sequence repeats of short (1-6) nucleotide motifs. They are very important genetic markers because they are dispersed and abundant in most eukaryotic genomes. They are highly polymorphic, inherited as co-dominant Mendelian markers and easily scored by PCR. Consequently, they have become one of the most popular molecular markers with application in many genetic studies, including genetic analysis of natural populations and evolutionary studies. From the available microsatellites in our laboratory, were selected ten (10), based on their polymorphism in laboratory strains. They were used for the screening of 481 adult flies in the medfly, collected from nineteen (19) different samples of fruits from nine (9) different areas in west Greece and north Peloponnesus. Analysis of genotype composition in the samples was achieved by polyacrylamide electrophoresis of the PCR products, for every genetic marker and then autoradiography. The statistic analysis of our results using software programs, revealed an important genetic differentiation in samples. Except for many factors (climatic conditions, geographic origin), the host origin will be responsible for this genetic differentiation. 2008-12-04T09:23:02Z 2008-12-04T09:23:02Z 2006 2008-12-04T09:23:02Z Thesis http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/1123 gr Η ΒΥΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της 0 application/pdf |
institution |
UPatras |
collection |
Nemertes |
language |
Greek |
topic |
Μεσογειακή μύγα Καλλιεργούμενα φρούτα Μέθοδοι ελέγχου Μικροδορυφόροι Πληθυσμιακές μελέτες Ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα πολυακρυλαμιδίου Αυτοραδιογραφία Ξενιστής Ceratitis capitata Medfly Cultivated fruits Control methods Microsatellites Analysis of natural populations Polyacrylamide gel electrophoresis Autoradiography Host 576.875 |
spellingShingle |
Μεσογειακή μύγα Καλλιεργούμενα φρούτα Μέθοδοι ελέγχου Μικροδορυφόροι Πληθυσμιακές μελέτες Ηλεκτροφόρηση σε πήκτωμα πολυακρυλαμιδίου Αυτοραδιογραφία Ξενιστής Ceratitis capitata Medfly Cultivated fruits Control methods Microsatellites Analysis of natural populations Polyacrylamide gel electrophoresis Autoradiography Host 576.875 Οικονόμου, Αικατερίνη Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
description |
Η μεσογειακή μύγα αποτελεί το κύριο παράσιτο πολλών καλλιεργούμενων φρούτων προκαλώντας ετησίως μεγάλες καταστροφές σε γεωργικές καλλιέργειες. Η μελέτη του εντόμου τόσο σε γενετικό όσο και σε πληθυσμιακό επίπεδο μπορεί να συμβάλλει σημαντικά στην ανάπτυξη ή και τη βελτίωση αποτελεσματικών και φιλικών προς το περιβάλλον μεθόδων ελέγχου.
Οι μικροδορυφόροι είναι απλές επαναλήψεις ενός νουκλεοτιδικού μοτίβου που αποτελείται 1-6 ζεύγη βάσεων. Αποτελούν πολύ χρήσιμους γενετικούς δείκτες διότι είναι άφθονοι και διάσπαρτοι στο γονιδίωμα των ευκαρυωτκών οργανισμών. Επιπλέον είναι υψηλά πολυμορφικοί, κληρονομούνται ως συνυπερέχοντες Μεντελικοί δείκτες και αναλύονται εύκολα μέσω PCR, χαρακτηριστικά που τους καθιστούν πολύτιμα εργαλεία για πληθυσμιακές και εξελικτικές μελέτες.
Από τους μικροδορυφορικούς δείκτες που αναπτύχθηκαν στο εργαστήριό μας, επιλέχθηκαν 10 με βάση το βαθμό πολυμορφισμού που έδειξαν σε εργαστηριακά στελέχη. Οι δείκτες αυτοί χρησιμοποιήθηκαν στην ανάλυση 481 ενηλίκων ατόμων που προέρχονταν από 19 διαφορετικά δείγματα φρούτων που συλλέχθηκαν από εννέα διαφορετικές περιοχές της Δυτικής Ελλάδας και της Βόρειας Πελλοπονήσου.
Η γενοτυπική ανάλυση πραγματοποιήθηκε με ηλεκτροφόρηση των προϊόντων της PCR για κάθε γενετικό δείκτη σε πήκτωμα πολυακρυλαμιδίου και επακόλουθη αυτοραδιογραφία. Η στατιστική επεξεργασία των αποτελεσμάτων, με τη βοήθεια υπολογιστικών προγραμμάτων αποκάλυψε σημαντική γενετική διαφοροποίηση μεταξύ των δειγμάτων, που αποδίδεται εκτός των άλλων παραγόντων (κλιματολογικές συνθήκες, γεωγραφική προέλευση) στο είδος του ξενιστή. |
author2 |
Ζαχαροπούλου, Αντιγόνη |
author_facet |
Ζαχαροπούλου, Αντιγόνη Οικονόμου, Αικατερίνη |
format |
Thesis |
author |
Οικονόμου, Αικατερίνη |
author_sort |
Οικονόμου, Αικατερίνη |
title |
Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
title_short |
Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
title_full |
Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
title_fullStr |
Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
title_full_unstemmed |
Ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας Ceratitis Capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
title_sort |
ανάλυση φυσικών πληθυσμών της μεσογειακής μύγας ceratitis capitata : διερεύνηση της σχέσης γενότυπου και των ξενιστών της με τη χρήση μικροδορυφορικών δεικτών |
publishDate |
2008 |
url |
http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/1123 |
work_keys_str_mv |
AT oikonomouaikaterinē analysēphysikōnplēthysmōntēsmesogeiakēsmygasceratitiscapitatadiereunēsētēsschesēsgenotypoukaitōnxenistōntēsmetēchrēsēmikrodoryphorikōndeiktōn |
_version_ |
1771297309185802240 |