Σύνθεση και βιολογική αξιολόγηση δυνητικά αντιβακτηριακών πεπτιδίων

• Κύριος συγγραφέας: Πλακαντωνάκη, Μαρία
• Άλλοι συγγραφείς: Βλάμης, Αλέξιος
• Μορφή: Thesis
• Γλώσσα: Greek
• Έκδοση: 2018
• Θέματα: Λιποσώματα; Σύνθεση πεπτιδίων σε στερεά φάση; Κυκλικός διχρωισμός; Λιπιδικές μεμβράνες; Συστήματα τοξίνης-αντιτοξίνης; Εscherichia coli; Liposomes; Solid phase peptide synthesis; Circular dichroism; Lipid membranes; Toxin-antitoxin systems; 571.957

Τα βακτήρια μπορούν και επιβιώνουν κάτω από αντίξοες περιβαλλοντικές συνθήκες με διάφορους κυτταρικούς μηχανισμούς. Ένας από αυτούς είναι τα ενδογενή συστήματα τοξινών-αντιτοξινών που επιτρέπουν την επιβίωση των βακτηρίων σε εχθρικά περιβάλλοντα. Στην παρούσα διπλωματική εργασία, πραγματοποιήθηκε η σύνθεση και η in vitro αξιολόγηση των πεπτιδικών αναλόγων των τοξινών-αντιτοξινών MqsΑ, MqsR, HicA και RelE της Escherichia coli. Η σύνθεση των αναλόγων έγινε σε στερεά φάση επί της 2-χλωροτριτυλοχλωριδίου ρητίνης (CLTR-Cl), η οποία συνδυάζεται με την Fmoc/tBu μεθοδολογία, χρησιμοποιώντας τα Ν,Ν'-διισοπρoπυλοκαρβοδιιμίδιο/1-υδροξυβενζοτριαζόλιο (DIC/HOBt) ως αντιδραστήρια σύζευξης. Η Να ομάδα των αμινοξέων προστατεύτηκε με Fmoc, ενώ η πλευρική αλυσίδα του κάθε αμινοξέος προστατεύτηκε ως εξής: Arg(Pbf), Asn(Trt), Cys(Trt), Asn(Trt), Glu(tBu), His(Trt), Lys(Boc), Ser(tBu), Thr(tBu), Tyr(tBu). Ο έλεγχος της καθαρότητας των τελικών προϊόντων έγινε με υγρή χρωματογραφία υψηλής επίδοσης ανάστροφης φάσης (RP-HPLC) και η ταυτοποίησή τους με φασματομετρία μάζας (ESI-MS). Την σύνθεση ακολούθησε in vitro αξιολόγηση των πεπτιδίων. Μελετήθηκε η δευτεροταγής δομής των τεσσάρων πεπτιδικών αναλόγων με φασματομετρία κυκλικού διχρωισμού και εξετάστηκε και η αλληλεπίδραση τους με λιπιδικές μεμβράνες λιποσωμάτων.