Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a)
Στην παρούσα μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία, έλαβε μέρος η μελέτη της σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης όγκων ΤΝF-a ώστε το πεπτιδικό αυτό τμήμα να χρησιμοποιηθεί για να συνδεθεί με το τμήμα 1-68 του ΤΝF-a με την μέθοδο της Φυσικής Χημικής Σύνδεσης (Native Chemical Ligation), αλλ...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2018
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/11446 |
| id |
nemertes-10889-11446 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-114462022-09-05T20:39:54Z Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) Research on synthesis of the 69-157 fragment of the tumor necrosis factor TNF-a Ζηκάκη, Ελένη-Μαρία Γάτος, Δημήτριος Γάτος, Δημήτριος Μπάρλος, Κλεομένης Τσέλιος, Θεώδορος Zikaki, Eleni-Maria Παράγοντας νέκρωσης όγκων Πεπτίδια 2-χλωροτριτυλο-χλωρίδιο ρητίνη Πενταφθοροφαινυλεστέρας Σύνθεση σε στέρεα φάση Θειοεστερική σύνδεση Tumor necrosis factor Peptides Pentafluorophenyl ester 612.015 75 Στην παρούσα μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία, έλαβε μέρος η μελέτη της σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης όγκων ΤΝF-a ώστε το πεπτιδικό αυτό τμήμα να χρησιμοποιηθεί για να συνδεθεί με το τμήμα 1-68 του ΤΝF-a με την μέθοδο της Φυσικής Χημικής Σύνδεσης (Native Chemical Ligation), αλλά και της συμπύκνωσης πεπτιδικών τμημάτων σε στερεά και υγρή φάση. Η σύνθεση του τμήματος ΤΝF(69-157) βασίστηκε στον συνδυασμό σταδιακής σύνθεσης και συμπύκνωσης πεπτιδικών τμημάτων σε στερεά φάση, όπως επίσης και συμπύκνωσης ενεργών εστέρων (πενταφθοροφαινυλεστέρας) πεπτιδικών τμημάτων σε διάλυμα. Πιο συγκεκριμένα η πεπτιδική αλυσίδα συντέθηκε αρχικά σε τμήματα σε στερεά φάση και έπειτα αυτά συνδέθηκαν μεταξύ τους με την μέθοδο της συμπύκνωσης πεπτιδικών τμημάτων. Η επιλογή τομής του αναλόγου έγινε έτσι ώστε στο καρβοξυτελικό άκρο των πεπτιδικών τμημάτων να υπάρχει Γλυκίνη ή Προλίνη για να αποφευχθούν προβλήματα ρακεμίωσης. Για τη σύνθεση των πεπτιδίων αυτών πραγματοποιήθηκε σταδιακή σύνθεση των επιμέρους τμημάτων στην 2-χλωροτριτυλοχλωρίδιο ρητίνη, με την Fmoc/tBu μεθοδολογία και έπειτα απομάκρυνση των συντιθέμενων πεπτιδίων από τη ρητίνη με όξινες συνθήκες ώστε αυτά να χρησιμοποιηθούν για να πραγματοποιηθούν οι συμπυκνώσεις. Η σταδιακή σύνθεση αλλά και η συμπύκνωση των τμημάτων εμφάνισε πολλές δυσκολίες λόγω της λιποφιλικότητας των αμινοξέων που συνθέτουν την πεπτιδική αλυσίδα και για τον λόγο αυτό έλαβαν χώρα ποικίλες μέθοδοι σύνθεσης. Ο έλεγχος της πορείας της σύνθεσης και της καθαρότητας των τελικών προϊόντων έγινε με υγρή χρωματογραφία υψηλής επίδοσης (RP-HPLC) και η ταυτοποίησή τους με φασματομετρία μάζας (ESI-MS). In this postgraduate dissertation, we studied the synthesis of the fragment 69-157 of the tumor necrosis factor TNF-α so that this peptide fragment could be used to bind to TNF-α fragment 1-68 by the method of Native Chemical Ligation, and the condensation of peptide moieties into solid and liquid phases. The synthesis of the TNF segment (69-157) was based on the combined step by step synthesis and condensation of the peptide moieties in solid phase, as well as the condensation of active esters (pentafluorophenyl) peptide moieties in solution. In particular, the peptide chain was initially synthesized in solid phase fragments and then merged together by the method of fragment condensation. The intersection of the peptide was made such that at the carboxy-terminus of the peptide segments there was Glycine or Proline to avoid racemization. For the synthesis of these peptides, was performed step by step synthesis of the individual portions on the 2-chlorotrityl-chloride resin by Fmoc / tBu methodology and then removing the synthesized peptides from the resin under oxidative conditions to be used to effect the condensation. The step by step synthesis as well as the condensation of the fragments showed many difficulties due to the lipophilicity of the amino acids that constitute the peptide chain. Therefore, have been developed various synthesis methods. The control of the synthesis procedure and the purity of the final products was performed by high performance liquid chromatography (RP-HPLC) and their identification by mass spectrometry (ESI-MS). 2018-07-12T09:51:25Z 2018-07-12T09:51:25Z 2017-07-03 Thesis http://hdl.handle.net/10889/11446 gr 12 application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Παράγοντας νέκρωσης όγκων Πεπτίδια 2-χλωροτριτυλο-χλωρίδιο ρητίνη Πενταφθοροφαινυλεστέρας Σύνθεση σε στέρεα φάση Θειοεστερική σύνδεση Tumor necrosis factor Peptides Pentafluorophenyl ester 612.015 75 |
| spellingShingle |
Παράγοντας νέκρωσης όγκων Πεπτίδια 2-χλωροτριτυλο-χλωρίδιο ρητίνη Πενταφθοροφαινυλεστέρας Σύνθεση σε στέρεα φάση Θειοεστερική σύνδεση Tumor necrosis factor Peptides Pentafluorophenyl ester 612.015 75 Ζηκάκη, Ελένη-Μαρία Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) |
| description |
Στην παρούσα μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία, έλαβε μέρος η μελέτη της σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης όγκων ΤΝF-a ώστε το πεπτιδικό αυτό τμήμα να χρησιμοποιηθεί για να συνδεθεί με το τμήμα 1-68 του ΤΝF-a με την μέθοδο της Φυσικής Χημικής Σύνδεσης (Native Chemical Ligation), αλλά και της συμπύκνωσης πεπτιδικών τμημάτων σε στερεά και υγρή φάση. Η σύνθεση του τμήματος ΤΝF(69-157) βασίστηκε στον συνδυασμό σταδιακής σύνθεσης και συμπύκνωσης πεπτιδικών τμημάτων σε στερεά φάση, όπως επίσης και συμπύκνωσης ενεργών εστέρων (πενταφθοροφαινυλεστέρας) πεπτιδικών τμημάτων σε διάλυμα. Πιο συγκεκριμένα η πεπτιδική αλυσίδα συντέθηκε αρχικά σε τμήματα σε στερεά φάση και έπειτα αυτά συνδέθηκαν μεταξύ τους με την μέθοδο της συμπύκνωσης πεπτιδικών τμημάτων. Η επιλογή τομής του αναλόγου έγινε έτσι ώστε στο καρβοξυτελικό άκρο των πεπτιδικών τμημάτων να υπάρχει Γλυκίνη ή Προλίνη για να αποφευχθούν προβλήματα ρακεμίωσης. Για τη σύνθεση των πεπτιδίων αυτών πραγματοποιήθηκε σταδιακή σύνθεση των επιμέρους τμημάτων στην 2-χλωροτριτυλοχλωρίδιο ρητίνη, με την Fmoc/tBu μεθοδολογία και έπειτα απομάκρυνση των συντιθέμενων πεπτιδίων από τη ρητίνη με όξινες συνθήκες ώστε αυτά να χρησιμοποιηθούν για να πραγματοποιηθούν οι συμπυκνώσεις. Η σταδιακή σύνθεση αλλά και η συμπύκνωση των τμημάτων εμφάνισε πολλές δυσκολίες λόγω της λιποφιλικότητας των αμινοξέων που συνθέτουν την πεπτιδική αλυσίδα και για τον λόγο αυτό έλαβαν χώρα ποικίλες μέθοδοι σύνθεσης.
Ο έλεγχος της πορείας της σύνθεσης και της καθαρότητας των τελικών προϊόντων έγινε με υγρή χρωματογραφία υψηλής επίδοσης (RP-HPLC) και η ταυτοποίησή τους με φασματομετρία μάζας (ESI-MS). |
| author2 |
Γάτος, Δημήτριος |
| author_facet |
Γάτος, Δημήτριος Ζηκάκη, Ελένη-Μαρία |
| format |
Thesis |
| author |
Ζηκάκη, Ελένη-Μαρία |
| author_sort |
Ζηκάκη, Ελένη-Μαρία |
| title |
Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) |
| title_short |
Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) |
| title_full |
Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) |
| title_fullStr |
Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) |
| title_full_unstemmed |
Μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (TNF-a) |
| title_sort |
μελέτη σύνθεσης του τμήματος 69-157 του παράγοντα νέκρωσης των όγκων (tnf-a) |
| publishDate |
2018 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/11446 |
| work_keys_str_mv |
AT zēkakēelenēmaria meletēsynthesēstoutmēmatos69157touparagontanekrōsēstōnonkōntnfa AT zēkakēelenēmaria researchonsynthesisofthe69157fragmentofthetumornecrosisfactortnfa |
| _version_ |
1771297273360154624 |
