Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα
Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία πραγματοποιήθηκε δομική μελέτη δύο πρωτεϊνών και ενός πεπτιδίου φαρμακευτικού ενδιαφέροντος, μέσω περίθλασης ακτίνων Χ από πολυκρυσταλλικά δείγματα (XRPD). Συγκεκριμένα μελετήθηκαν, η απόκριση της Πρωτεάσης 3C του ιού Coxsackievirus B3 σε συνθήκες κρυστάλλωσης με με...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2018
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/11497 |
| id |
nemertes-10889-11497 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-114972022-09-05T20:26:54Z Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα Structural studies of pharmaceutical peptides and proteins via X-ray powder diffraction Φίλη, Σταυρούλα Μαργιωλάκη, Ειρήνη Γεωργίου, Χρήστος Ροσμαράκη, Ελευθερία Fili, Stavroula Πεπτίδια Κρυσταλλογραφία Ακτίνες-Χ Πρωτεΐνες Περίθλαση Κρυστάλλωση Peptides Crystallography X-rays Proteins Diffraction Crystallization 572.6 Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία πραγματοποιήθηκε δομική μελέτη δύο πρωτεϊνών και ενός πεπτιδίου φαρμακευτικού ενδιαφέροντος, μέσω περίθλασης ακτίνων Χ από πολυκρυσταλλικά δείγματα (XRPD). Συγκεκριμένα μελετήθηκαν, η απόκριση της Πρωτεάσης 3C του ιού Coxsackievirus B3 σε συνθήκες κρυστάλλωσης με μεταβαλλόμενο pH και συγκέντρωση του πολυμερούς PEG, η επίδραση του οργανικού προσδέτη 4-bromoresorcinol στη δομή της ανθρώπινης ινσουλίνης σε αυξανόμενο pH και πραγματοποιήθηκε βελτιστοποίηση της δομής ενός συνθετικού αναλόγου της Σωματοστατίνης, του Octreotide. Για την επίτευξη των μελετών αυτών πραγματοποιήθηκαν πειράματα κρυσταλλώσεων όλων των προαναφερθέντων μορίων. Τα πολυκρυσταλλικά δείγματα που παρήχθησαν χρησιμοποιήθηκαν σε πειράματα περίθλασης ακτίνων Χ που πραγματοποιήθηκαν στο Ευρωπαϊκό σύγχροτρον, ESRF και στο εργαστηριακό μας περιθλασίμετρο. Από τα δεδομένα περίθλασης που συλλέχθηκαν πραγματοποιήθηκε δομική ανάλυση στο επίπεδο της μοναδιαίας κυψελίδας για όλα τα μόρια, ενώ για το Octreotide ήταν δυνατή και η βελτιστοποίηση της δομής του πεπτιδίου. Τα αποτελέσματα ενισχύουν την μέθοδο XRPD ως ένα ισχυρό ερευνητικό εργαλείο κατάλληλο για το δομικό χαρακτηρισμό μικρών πεπτιδίων και πρωτεϊνών. In the present postgraduate thesis, a structural study of two proteins and one peptide of pharmaceutical interest was performed using the X-Ray Powder Diffraction (XRPD) method. More particularly, the studies conducted here include the response of Coxsackievirus B3 Protease 3C to variation of pH and concentration of PEG polymer, the effect of the organic ligand 4-bromoresorcinol on the structure of human insulin with increasing pH and the refinement of the structure of Octreotide, a synthetic analogue of Somatostatin. To perform these studies, crystallization experiments for all the above-mentioned molecules were performed. The polycrystalline samples that were produced were used in X-ray diffraction experiments performed at the European Synchrotron, ESRF and on a laboratory diffractometer. All collected diffraction data were analyzed at the unit-cell level, while for Octreotide it was also possible to refine the peptide structure. These results bolster the XRPD method as a powerful research tool suitable for the structural characterization of small peptides and proteins. 2018-08-01T11:17:54Z 2018-08-01T11:17:54Z 2017-06-16 Thesis http://hdl.handle.net/10889/11497 gr 12 application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Πεπτίδια Κρυσταλλογραφία Ακτίνες-Χ Πρωτεΐνες Περίθλαση Κρυστάλλωση Peptides Crystallography X-rays Proteins Diffraction Crystallization 572.6 |
| spellingShingle |
Πεπτίδια Κρυσταλλογραφία Ακτίνες-Χ Πρωτεΐνες Περίθλαση Κρυστάλλωση Peptides Crystallography X-rays Proteins Diffraction Crystallization 572.6 Φίλη, Σταυρούλα Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| description |
Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία πραγματοποιήθηκε δομική μελέτη δύο πρωτεϊνών και ενός πεπτιδίου φαρμακευτικού ενδιαφέροντος, μέσω περίθλασης ακτίνων Χ από πολυκρυσταλλικά δείγματα (XRPD). Συγκεκριμένα μελετήθηκαν, η απόκριση της Πρωτεάσης 3C του ιού Coxsackievirus B3 σε συνθήκες κρυστάλλωσης με μεταβαλλόμενο pH και συγκέντρωση του πολυμερούς PEG, η επίδραση του οργανικού προσδέτη 4-bromoresorcinol στη δομή της ανθρώπινης ινσουλίνης σε αυξανόμενο pH και πραγματοποιήθηκε βελτιστοποίηση της δομής ενός συνθετικού αναλόγου της Σωματοστατίνης, του Octreotide. Για την επίτευξη των μελετών αυτών πραγματοποιήθηκαν πειράματα κρυσταλλώσεων όλων των προαναφερθέντων μορίων. Τα πολυκρυσταλλικά δείγματα που παρήχθησαν χρησιμοποιήθηκαν σε πειράματα περίθλασης ακτίνων Χ που πραγματοποιήθηκαν στο Ευρωπαϊκό σύγχροτρον, ESRF και στο εργαστηριακό μας περιθλασίμετρο. Από τα δεδομένα περίθλασης που συλλέχθηκαν πραγματοποιήθηκε δομική ανάλυση στο επίπεδο της μοναδιαίας κυψελίδας για όλα τα μόρια, ενώ για το Octreotide ήταν δυνατή και η βελτιστοποίηση της δομής του πεπτιδίου. Τα αποτελέσματα ενισχύουν την μέθοδο XRPD ως ένα ισχυρό ερευνητικό εργαλείο κατάλληλο για το δομικό χαρακτηρισμό μικρών πεπτιδίων και πρωτεϊνών. |
| author2 |
Μαργιωλάκη, Ειρήνη |
| author_facet |
Μαργιωλάκη, Ειρήνη Φίλη, Σταυρούλα |
| format |
Thesis |
| author |
Φίλη, Σταυρούλα |
| author_sort |
Φίλη, Σταυρούλα |
| title |
Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| title_short |
Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| title_full |
Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| title_fullStr |
Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| title_full_unstemmed |
Δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων X από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| title_sort |
δομική μελέτη πεπτιδίων και πρωτεϊνών φαρμακευτικού ενδιαφέροντος μέσω περίθλασης ακτίνων x από πολυκρυσταλλικά δείγματα |
| publishDate |
2018 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/11497 |
| work_keys_str_mv |
AT philēstauroula domikēmeletēpeptidiōnkaiprōteïnōnpharmakeutikouendiapherontosmesōperithlasēsaktinōnxapopolykrystallikadeigmata AT philēstauroula structuralstudiesofpharmaceuticalpeptidesandproteinsviaxraypowderdiffraction |
| _version_ |
1771297306939752448 |
