Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών

Τα πρόδρομα βλαστικά κύτταρα έχουν την ικανότητα τόσο της αυτο-ανανέωσης όσο και της διαφοροποίησης, κατά την εμβρυογένεση και την ενήλικη ζωή. Η αλληλεξάρτηση του πολλαπλασιασμού και της διαφοροποίησης ελέγχεται από πρωτεΐνες, οι οποίες συντονίζουν τις δύο διαδικασίες. Οι πρωτεΐνες Geminin, GemC1/L...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Καλλιακούδας, Θεόδωρος
Άλλοι συγγραφείς: Ταραβήρας, Σταύρος
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2018
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/11509
id nemertes-10889-11509
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Κυτταρικός κύκλος
Νευρικά βλαστικά κύτταρα
Geminin
Cell cycle
Neural stem cells
GemC1
McIdas
571.84
spellingShingle Κυτταρικός κύκλος
Νευρικά βλαστικά κύτταρα
Geminin
Cell cycle
Neural stem cells
GemC1
McIdas
571.84
Καλλιακούδας, Θεόδωρος
Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
description Τα πρόδρομα βλαστικά κύτταρα έχουν την ικανότητα τόσο της αυτο-ανανέωσης όσο και της διαφοροποίησης, κατά την εμβρυογένεση και την ενήλικη ζωή. Η αλληλεξάρτηση του πολλαπλασιασμού και της διαφοροποίησης ελέγχεται από πρωτεΐνες, οι οποίες συντονίζουν τις δύο διαδικασίες. Οι πρωτεΐνες Geminin, GemC1/Lynkeas και McIdas αποτελούν μέλη της ίδιας υπεροικογένειας, εμφανίζοντας ομολογία στην επικράτεια του σπειροειδούς σπειράματος. Έχουν προταθεί ως μόρια ρυθμιστές για τον καθορισμό της μοίρας των πρόδρομων βλαστικών κυττάρων, ρυθμίζοντας την πρόοδο του κυτταρικού κύκλου και της διαφοροποίησης, μέσω της αλληλεπίδρασής τους με μεταγραφικούς παράγοντες και σύμπλοκα αναδιάταξης της χρωματίνης. Ωστόσο, ο μηχανισμός, ο οποίος συντονίζει τα δύο μονοπάτια, δεν έχει πλήρως διαλευκανθεί. Στην παρούσα διπλωματική εργασία μελετήθηκε ο in vitro ρόλος των μελών της υπεροικογένειας Geminin στο προφίλ του κυτταρικού κύκλου, στη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού και στο μεταγραφικό μονοπάτι της πολυκροσσογένεσης. Η πρωτεΐνη Geminin χαρακτηρίζεται ως αρνητικός ρυθμιστής του κυτταρικού κύκλου στα μετάζωα, αλληλεπιδρώντας με τον παράγοντα αδειοδότησης της αντιγραφής Cdt1 και αναστέλλοντας την επαναντιγραφή του γενετικού υλικού. Επιπρόσθετα, έχει σημαντικό ρόλο στις αποφάσεις αυτο-ανανέωσης και διαφοροποίησης των νευρικών βλαστικών κυττάρων της κοιλιακής ζώνης του αναπτυσσόμενου φλοιού και των ενήλικων νευρικών βλαστικών κυττάρων της υποεπενδυματικής ζώνης των πλάγιων κοιλιών. Με σκοπό να διερευνηθεί ο ρόλος της πρωτεΐνης Geminin στο προφίλ του κυτταρικού κύκλου, in vitro, απομονώθηκαν νευρικά βλαστικά κύτταρα (Neural Stem Cells, NSCs) από τον εγκεφαλικό φλοιό εμβρύων μυών, όπου έχει αποσιωποιηθεί ιστοειδικά το γονίδιο Geminin στα αρχικά στάδια της νευρογένεσης. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι τα νευρικά βλαστικά κύτταρα, απουσία της Geminin, φαίνεται να επανεισέρχονται στον κυτταρικό κύκλο με μεγαλύτερο ρυθμό, σε διαφορετικά χρονικά σημεία, μετά την έξοδό τους από τον κυτταρικό κύκλο, σε G0 φάση. Οι πρωτεΐνες GemC1 και McIdas, τα δύο νέα μέλη της υπεροικογένειας Geminin, έχει βρεθεί ότι συμμετέχουν στη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου στα σπονδυλωτά. Συγκεκριμένα, η πρωτεΐνη GemC1 συμμετέχει στο σχηματισμό του προεναρκτήριου συμπλόκου στις θέσεις έναρξης της αντιγραφής, ενώ η πρωτεΐνη McIdas ανταγωνίζεται την πρόσδεση του παράγοντα Cdt1 με την πρωτεΐνη Geminin. Πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι οι πρωτεΐνες GemC1 και McIdas δρουν στα αρχικά στάδια του μονοπατιού της διαφοροποίησης των πολυκροσσωτών κυττάρων στην υποεπενδυματική ζώνη των πλάγιων κοιλιών και στο αναπνευστικό επιθήλιο των μυών, στο δέρμα των εμβρύων Xenopus, στον πρόνεφρο του zebrafish, καθώς και σε ex vivo καλλιέργειες επιθηλιακών κυττάρων του αναπνευστικού επιθηλίου, ρυθμίζοντας καθοδικά την έκφραση μεταγραφικών παραγόντων, όπως οι Myb, Ccno, p73 και Foxj1 παράγοντες, οι οποίοι εμπλέκονται στα επιμέρους στάδια της βιογένεσης των πολλαπλών κροσσών. Ανοδικά των παραγόντων GemC1 και McIdas εντοπίζεται η δράση του κανονικού Notch μονοπατιού, αναστέλλοντας την έκφρασή τους. Παλαιότερες μελέτες, in vitro, σε ανθρώπινες καρκινικές κυτταρικές σειρές, υποστηρίζουν ότι τα μέλη της υπεροικογένειας p53 ρυθμίζουν διαφορικά την έκφραση των γονιδίων JAG1 και JAG2. Με βάση in vitro μελέτες του εργαστηρίου μας, οι οποίες υποστηρίζουν ότι οι παράγοντες GemC1, E2F5 και p73 αλληλεπιδρούν, σχηματίζοντας σύμπλοκα, διερευνήθηκε ο πιθανός ρόλος των συμπλόκων GemC1/E2F5, GemC1/p73 και GemC1/E2F5/p73 στη μεταγραφική ενεργότητα των γονιδίων JAG1 και JAG2. Τα αποτελέσματά μας από την εκτοπική υπερέκφραση των πρωτεϊνών GemC1, E2F5 και p73, σε όλους τους πιθανούς συνδυασμούς, προτείνουν λειτουργική συνέργεια των GemC1/E2F5 και των GemC1/p73, οδηγώντας σε διαφορική επαγωγή της έκφρασης των γονιδίων JAG1 και JAG2, αντίστοιχα, ενώ δεν υπήρξε λειτουργική συνέργεια μεταξύ του p73 και του συμπλόκου GemC1/E2F5. Τέλος, μελετήθηκε ο πιθανός ρόλος των πρωτεϊνών GemC1 και McIdas στη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού, ο οποίος αποτελεί κέντρο για τη σηματοδότηση των κυττάρων. Καθώς το κύτταρο βρίσκεται στη G1 φάση ή εξέρχεται από τον κυτταρικό κύκλο, σε φάση G0, το κεντροσωμάτιο μεταναστεύει στην κυτταροπλασματική μεμβράνη, όπου ακολουθεί η αγκυροβόληση του μητρικού κεντριολίου και ο σχηματισμός του αξονήματος του πρωτογενούς κροσσού. Ένα σύνολο πρωτεϊνών έχει βρεθεί να πλαισιώνει τη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού, όμως, το μοριακό μεταγραφικό δίκτυο, το οποίο ρυθμίζει και συντονίζει τα επιμέρους στάδια του μονοπατιού, είναι ελάχιστα κατανοητό. Με σκοπό να διερευνηθεί ο ρόλος των πρωτεϊνών GemC1 και McIdas στη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού, χρησιμοποιήθηκε in vitro σύστημα καλλιέργειας ινοβλαστών από έμβρυα μυών, οι οποίοι καλλιεργούνται σε συνθήκες στέρησης ορού από το θρεπτικό τους μέσο, ώστε να εξέλθουν από τον κυτταρικό κύκλο και να εμφανίσουν πρωτογενή κροσσό. Η αποσιώπηση της έκφρασης του γονιδίου GemC1 δεν ανέδειξε κάποιον πιθανό ρόλο στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού, ενώ αντίθετα, η αποσιώπηση της έκφρασης του γονιδίου McIdas οδήγησε σε μειωμένο ποσοστό των κυττάρων που εμφάνισαν τον πρωτογενή κροσσό στην επιφάνειά τους. Συμπερασματικά, περεταίρω μελέτη απαιτείται, ώστε να προσδιοριστεί ο ακριβής μηχανιστικός ρόλος των μελών της υπεροικογένειας Geminin στις διαδικασίες ρύθμισης του πολλαπλασιασμού και της διαφοροποίησης των πρόδρομων βλαστικών κυττάρων.
author2 Ταραβήρας, Σταύρος
author_facet Ταραβήρας, Σταύρος
Καλλιακούδας, Θεόδωρος
format Thesis
author Καλλιακούδας, Θεόδωρος
author_sort Καλλιακούδας, Θεόδωρος
title Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
title_short Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
title_full Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
title_fullStr Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
title_full_unstemmed Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
title_sort η μελέτη της επίδρασης της geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών
publishDate 2018
url http://hdl.handle.net/10889/11509
work_keys_str_mv AT kalliakoudastheodōros ēmeletētēsepidrasēstēsgemininstonkyttarikokyklotōnneurikōnblastikōnkyttarōnmyōn
AT kalliakoudastheodōros studyoftheroleoftheproteingemininincellcycleprogressofneuralstemcells
_version_ 1771297195290525696
spelling nemertes-10889-115092022-09-05T09:41:10Z Η μελέτη της επίδρασης της Geminin στον κυτταρικό κύκλο των νευρικών βλαστικών κυττάρων μυών Study of the role of the protein Geminin in cell cycle progress of neural stem cells Καλλιακούδας, Θεόδωρος Ταραβήρας, Σταύρος Ταραβήρας, Σταύρος Λυγερού, Ζωή Τσοπάνογλου, Νικόλαος Kalliakoudas, Theodoros Κυτταρικός κύκλος Νευρικά βλαστικά κύτταρα Geminin Cell cycle Neural stem cells GemC1 McIdas 571.84 Τα πρόδρομα βλαστικά κύτταρα έχουν την ικανότητα τόσο της αυτο-ανανέωσης όσο και της διαφοροποίησης, κατά την εμβρυογένεση και την ενήλικη ζωή. Η αλληλεξάρτηση του πολλαπλασιασμού και της διαφοροποίησης ελέγχεται από πρωτεΐνες, οι οποίες συντονίζουν τις δύο διαδικασίες. Οι πρωτεΐνες Geminin, GemC1/Lynkeas και McIdas αποτελούν μέλη της ίδιας υπεροικογένειας, εμφανίζοντας ομολογία στην επικράτεια του σπειροειδούς σπειράματος. Έχουν προταθεί ως μόρια ρυθμιστές για τον καθορισμό της μοίρας των πρόδρομων βλαστικών κυττάρων, ρυθμίζοντας την πρόοδο του κυτταρικού κύκλου και της διαφοροποίησης, μέσω της αλληλεπίδρασής τους με μεταγραφικούς παράγοντες και σύμπλοκα αναδιάταξης της χρωματίνης. Ωστόσο, ο μηχανισμός, ο οποίος συντονίζει τα δύο μονοπάτια, δεν έχει πλήρως διαλευκανθεί. Στην παρούσα διπλωματική εργασία μελετήθηκε ο in vitro ρόλος των μελών της υπεροικογένειας Geminin στο προφίλ του κυτταρικού κύκλου, στη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού και στο μεταγραφικό μονοπάτι της πολυκροσσογένεσης. Η πρωτεΐνη Geminin χαρακτηρίζεται ως αρνητικός ρυθμιστής του κυτταρικού κύκλου στα μετάζωα, αλληλεπιδρώντας με τον παράγοντα αδειοδότησης της αντιγραφής Cdt1 και αναστέλλοντας την επαναντιγραφή του γενετικού υλικού. Επιπρόσθετα, έχει σημαντικό ρόλο στις αποφάσεις αυτο-ανανέωσης και διαφοροποίησης των νευρικών βλαστικών κυττάρων της κοιλιακής ζώνης του αναπτυσσόμενου φλοιού και των ενήλικων νευρικών βλαστικών κυττάρων της υποεπενδυματικής ζώνης των πλάγιων κοιλιών. Με σκοπό να διερευνηθεί ο ρόλος της πρωτεΐνης Geminin στο προφίλ του κυτταρικού κύκλου, in vitro, απομονώθηκαν νευρικά βλαστικά κύτταρα (Neural Stem Cells, NSCs) από τον εγκεφαλικό φλοιό εμβρύων μυών, όπου έχει αποσιωποιηθεί ιστοειδικά το γονίδιο Geminin στα αρχικά στάδια της νευρογένεσης. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι τα νευρικά βλαστικά κύτταρα, απουσία της Geminin, φαίνεται να επανεισέρχονται στον κυτταρικό κύκλο με μεγαλύτερο ρυθμό, σε διαφορετικά χρονικά σημεία, μετά την έξοδό τους από τον κυτταρικό κύκλο, σε G0 φάση. Οι πρωτεΐνες GemC1 και McIdas, τα δύο νέα μέλη της υπεροικογένειας Geminin, έχει βρεθεί ότι συμμετέχουν στη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου στα σπονδυλωτά. Συγκεκριμένα, η πρωτεΐνη GemC1 συμμετέχει στο σχηματισμό του προεναρκτήριου συμπλόκου στις θέσεις έναρξης της αντιγραφής, ενώ η πρωτεΐνη McIdas ανταγωνίζεται την πρόσδεση του παράγοντα Cdt1 με την πρωτεΐνη Geminin. Πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι οι πρωτεΐνες GemC1 και McIdas δρουν στα αρχικά στάδια του μονοπατιού της διαφοροποίησης των πολυκροσσωτών κυττάρων στην υποεπενδυματική ζώνη των πλάγιων κοιλιών και στο αναπνευστικό επιθήλιο των μυών, στο δέρμα των εμβρύων Xenopus, στον πρόνεφρο του zebrafish, καθώς και σε ex vivo καλλιέργειες επιθηλιακών κυττάρων του αναπνευστικού επιθηλίου, ρυθμίζοντας καθοδικά την έκφραση μεταγραφικών παραγόντων, όπως οι Myb, Ccno, p73 και Foxj1 παράγοντες, οι οποίοι εμπλέκονται στα επιμέρους στάδια της βιογένεσης των πολλαπλών κροσσών. Ανοδικά των παραγόντων GemC1 και McIdas εντοπίζεται η δράση του κανονικού Notch μονοπατιού, αναστέλλοντας την έκφρασή τους. Παλαιότερες μελέτες, in vitro, σε ανθρώπινες καρκινικές κυτταρικές σειρές, υποστηρίζουν ότι τα μέλη της υπεροικογένειας p53 ρυθμίζουν διαφορικά την έκφραση των γονιδίων JAG1 και JAG2. Με βάση in vitro μελέτες του εργαστηρίου μας, οι οποίες υποστηρίζουν ότι οι παράγοντες GemC1, E2F5 και p73 αλληλεπιδρούν, σχηματίζοντας σύμπλοκα, διερευνήθηκε ο πιθανός ρόλος των συμπλόκων GemC1/E2F5, GemC1/p73 και GemC1/E2F5/p73 στη μεταγραφική ενεργότητα των γονιδίων JAG1 και JAG2. Τα αποτελέσματά μας από την εκτοπική υπερέκφραση των πρωτεϊνών GemC1, E2F5 και p73, σε όλους τους πιθανούς συνδυασμούς, προτείνουν λειτουργική συνέργεια των GemC1/E2F5 και των GemC1/p73, οδηγώντας σε διαφορική επαγωγή της έκφρασης των γονιδίων JAG1 και JAG2, αντίστοιχα, ενώ δεν υπήρξε λειτουργική συνέργεια μεταξύ του p73 και του συμπλόκου GemC1/E2F5. Τέλος, μελετήθηκε ο πιθανός ρόλος των πρωτεϊνών GemC1 και McIdas στη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού, ο οποίος αποτελεί κέντρο για τη σηματοδότηση των κυττάρων. Καθώς το κύτταρο βρίσκεται στη G1 φάση ή εξέρχεται από τον κυτταρικό κύκλο, σε φάση G0, το κεντροσωμάτιο μεταναστεύει στην κυτταροπλασματική μεμβράνη, όπου ακολουθεί η αγκυροβόληση του μητρικού κεντριολίου και ο σχηματισμός του αξονήματος του πρωτογενούς κροσσού. Ένα σύνολο πρωτεϊνών έχει βρεθεί να πλαισιώνει τη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού, όμως, το μοριακό μεταγραφικό δίκτυο, το οποίο ρυθμίζει και συντονίζει τα επιμέρους στάδια του μονοπατιού, είναι ελάχιστα κατανοητό. Με σκοπό να διερευνηθεί ο ρόλος των πρωτεϊνών GemC1 και McIdas στη βιογένεση του πρωτογενούς κροσσού, χρησιμοποιήθηκε in vitro σύστημα καλλιέργειας ινοβλαστών από έμβρυα μυών, οι οποίοι καλλιεργούνται σε συνθήκες στέρησης ορού από το θρεπτικό τους μέσο, ώστε να εξέλθουν από τον κυτταρικό κύκλο και να εμφανίσουν πρωτογενή κροσσό. Η αποσιώπηση της έκφρασης του γονιδίου GemC1 δεν ανέδειξε κάποιον πιθανό ρόλο στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού, ενώ αντίθετα, η αποσιώπηση της έκφρασης του γονιδίου McIdas οδήγησε σε μειωμένο ποσοστό των κυττάρων που εμφάνισαν τον πρωτογενή κροσσό στην επιφάνειά τους. Συμπερασματικά, περεταίρω μελέτη απαιτείται, ώστε να προσδιοριστεί ο ακριβής μηχανιστικός ρόλος των μελών της υπεροικογένειας Geminin στις διαδικασίες ρύθμισης του πολλαπλασιασμού και της διαφοροποίησης των πρόδρομων βλαστικών κυττάρων. During embryogenesis and adulthood, precursor cells have the ability either to self-renew or to generate the appropriate types of differentiated cells. Coordination of proliferation and differentiation is governed by proteins that are involved in both processes. The proteins Geminin, GemC1/Lynkeas and McIdas consist of Geminin superfamily members, sharing homology in coiled-coil domain. The Geminin superfamily members are characterized as regulators of cell cycle progress and differentiation, interacting with transcriptional factors and chromatin remodeling complexes. However, the mechanism, that coordinates these processes, remains poorly understood. In this study, we investigate the in vitro role of Geminin superfamily members in cell cycle profile, primary cilium biogenesis and transcriptional pathway of multiciliogenesis. Geminin has been initially characterized as a negative regulator of cell cycle progression in metazoans, interacting with licensing factor Cdt1, and preventing the re-replication of DNA until the beginning of the next cell cycle. Furthermore, Geminin has a key role in cellular decisions, involving self-renewal and differentiation of neural stem cells in developing cortex, as well as in adult brain. Recent studies suggest that Geminin coordinates the self-renewal and differentiation decisions of type-B1 slow-dividing neural stem cells in the subependymal zone of the lateral ventricles. Aiming to gain insight into the in vitro role of Geminin as regulator of cell cycle profile, neural stem cells (NSCs) have been derived by cerebral cortex of mouse embryos lacking Geminin expression. Our results show that upon Geminin deletion, the neural stem cells re-enter into cell cycle at a higher rate, in different time points, after cell cycle exit, in G0 phase. The GemC1 and McIdas proteins, the two novel members of Geminin superfamily, have been proposed as candidates in regulation of cell cycle progression in vertebrates. Specifically, GemC1 mediates the formation of the pre-initiation complex during DNA replication, and McIdas binds to Geminin and inhibits its association with Cdt1. Moreover, the GemC1 and McIdas proteins have been characterized as early regulators of multiciliogenesis pathway, acting upstream of other transcription factors that regulate the later stages of apical docking and cilia formation, like Myb, Ccno, p73 and Foxj1, in different biological systems and organisms, including the subependymal zone of lateral ventricles and airway epithelium of mice, the skin of Xenopus embryos, the zebrafish pronephros and ex vivo model of mouse tracheal epithelial cells. The canonical Notch pathway acts upstream of GemC1 and McIdas and represses their expression. Previous studies have proposed that the protein members of p53 family participate in transcriptional regulation of JAG1 and JAG2 genes, in different human cancer cell lines. In previous studies from our lab it has been shown that the GemC1, E2F5 and p73 proteins interact, forming complexes that demonstrate possible models of transcriptional regulation. Through ectopic expression of various combinations of these proteins, in vitro, we demonstrated that the GemC1/E2F5 and GemC1/p73 complexes possibly lead to an upregulation of JAG1 and JAG2 genes, respectively. On the other hand, we failed to detect a notable synergy between p73 and GemC1/E2F5 complex in transactivation activity of JAG1 and JAG2 genes. Finally, we investigate the in vitro role of the GemC1 και McIdas proteins in primary cilium biogenesis. The primary cilium is characterized as signaling center, and protrudes from the apical surface of different cell types that usually enter in G1 phase of cell cycle or arrest in G0 phase. During primary cilium biogenesis, the centrosome migrates in apical surface and the mother centriole anchors in plasma membrane, forming the axoneme. A dozen of proteins participate in primary cilium assembly and disassembly, however, the transcriptional pathway that regulates the different stages of biogenesis pathway, remains poorly characterized. In this study, mouse embryonic fibroblasts (MEFs) were derived by mouse embryos, lacking GemC1 expression, and cultured in serum starvation conditions in order to arrest in G0 phase and reveal the primary cilium. Our results do not reveal any possible implication of GemC1 in primary cilium formation. In contrast, the knockdown McIdas expression leads to decreased number of fibroblasts that reveal primary cilium on their apical surface. To conclude, further investigation is necessary in order to reveal more details about the mechanistic role of Geminin superfamily members in coordination of proliferation and differentiation processes of precursor cells. 2018-08-28T08:13:34Z 2018-08-28T08:13:34Z 2018-05 Thesis http://hdl.handle.net/10889/11509 gr 0 application/pdf