Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR
Η προσαρμογή στην εξωμήτρια ζωή αποτελεί την κυριότερη πρόκληση για τα νεογνά, καθώς είναι μία περίοδος που χαρακτηρίζεται από ραγδαίες μεταβολικές αλλαγές. Ο νεογνικός οργανισμός είναι ιδιαίτερα ευπαθής και διάφοροι περιγεννητικοί παράγοντες μπορούν να επηρεάσουν τις μεταβολικές αλλαγές των πρώτων...
Κύριος συγγραφέας: | |
---|---|
Άλλοι συγγραφείς: | |
Μορφή: | Thesis |
Γλώσσα: | Greek |
Έκδοση: |
2018
|
Θέματα: | |
Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/11512 |
id |
nemertes-10889-11512 |
---|---|
record_format |
dspace |
institution |
UPatras |
collection |
Nemertes |
language |
Greek |
topic |
Μεταβολομική Ούρα Νεογνά Φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού Metabolomics Urine Newborns Nuclear magnetic resonance (NMR) 612.647 |
spellingShingle |
Μεταβολομική Ούρα Νεογνά Φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού Metabolomics Urine Newborns Nuclear magnetic resonance (NMR) 612.647 Γεωργακοπούλου, Ιωάννα Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR |
description |
Η προσαρμογή στην εξωμήτρια ζωή αποτελεί την κυριότερη πρόκληση για τα νεογνά, καθώς είναι μία περίοδος που χαρακτηρίζεται από ραγδαίες μεταβολικές αλλαγές. Ο νεογνικός οργανισμός είναι ιδιαίτερα ευπαθής και διάφοροι περιγεννητικοί παράγοντες μπορούν να επηρεάσουν τις μεταβολικές αλλαγές των πρώτων ημερών ζωής, οδηγώντας μακροπρόθεσμα στην εκδήλωση διαφόρων παθολογιών. Γι’ αυτό και η πρόγνωση των μεταβολικών διαταραχών είναι ιδιαίτερα σημαντική για την εξασφάλιση της μελλοντικής υγείας των νεογνών. Η γνώση των μεταβολικών διαδικασιών, που λαμβάνουν χώρα κατά την προσαρμογή στο εξωμήτριο περιβάλλον, θα διευκολύνει την ερμηνεία των δεδομένων που προκύπτουν από τη μελέτη παθολογικών καταστάσεων. Η μεταβολομική αποτελεί ένα ισχυρό πεδίο, ιδανικό για την παρακολούθηση αυτής της προσαρμογής, καθώς προσφέρει τη δυνατότητα παρακολούθησης αλλαγών στα μεταβολικά προφίλ.
Η παρούσα εργασία επικεντρώνεται στη μελέτη του μεταβολικού προφίλ των ούρων υγιών νεογνών και στην παρατήρηση της μεταβολής αυτού από την 1η στην 3η μέρα ζωής, με στόχο τον προσδιορισμό των φυσιολογικών μεταβολικών προσαρμογών, που λαμβάνουν χώρα από τη γέννηση έως και την τρίτη ημέρα ζωής. Τα δείγματα ούρων επιλέχθηκαν για την ανάλυση, καθώς τα ούρα είναι ένα βιολογικό υγρό πλούσιο σε μεταβολίτες και ο τρόπος συλλογής τους είναι μη-επεμβατικός. Η ανάλυση των δειγμάτων πραγματοποιήθηκε με τη βοήθεια της φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR) και μέσω της στατιστικής ανάλυσης που ακολούθησε παρατηρήθηκαν μεταβολές στα επίπεδα αρκετών μεταβολιτών, που αντανακλούν σημαντικές αλλαγές σε κύρια μεταβολικά μονοπάτια, όπως στον μεταβολισμό των νουκλεοτιδίων, των αμινοξέων και των υδατανθράκων.
Επιπρόσθετο στόχο της παρούσας εργασίας αποτέλεσε η μελέτη της επίδρασης διαφόρων περιγεννητικών παραγόντων στο νεογνικό μεταβολικό προφίλ των ούρων. Αναλυτικότερα το ενδιαφέρον εστιάστηκε στην μελέτη της επίδρασης των μεθόδων τοκετού, της προωρότητας, του καπνίσματος της μητέρας, του φύλου, της διατροφής και του νεογνικού ίκτερου στον μεταβολισμό των πρώτων ημερών ζωής, όπου μέσω μονομεταβλητής στατιστικής ανάλυσης, εντοπίστηκαν διαφορές στα επίπεδα ορισμένων μεταβολιτών, μεταξύ των συγκρινόμενων ομάδων, οι οποίες όμως δεν αναδείχθηκαν μέσω των πολυμεταβλητών στατιστικών μοντέλων, τονίζοντας την ανάγκη περαιτέρω διερεύνησης των αποτελεσμάτων και αύξησης του αριθμού των εξεταζόμενων δειγμάτων. |
author2 |
Σπυρούλιας, Γεώργιος |
author_facet |
Σπυρούλιας, Γεώργιος Γεωργακοπούλου, Ιωάννα |
format |
Thesis |
author |
Γεωργακοπούλου, Ιωάννα |
author_sort |
Γεωργακοπούλου, Ιωάννα |
title |
Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR |
title_short |
Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR |
title_full |
Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR |
title_fullStr |
Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR |
title_full_unstemmed |
Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR |
title_sort |
μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας nmr |
publishDate |
2018 |
url |
http://hdl.handle.net/10889/11512 |
work_keys_str_mv |
AT geōrgakopoulouiōanna metabolomikēanalysēbiologikōnygrōngiatēnanichneusēbiodeiktōnmesōphasmatoskopiasnmr AT geōrgakopoulouiōanna metabolomicanalysisofbiologicalfluidsforthedetectionofbiomarkersbynmrspectroscopy |
_version_ |
1771297326158053376 |
spelling |
nemertes-10889-115122022-09-05T20:33:06Z Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών για την ανίχνευση βιοδεικτών, μέσω φασματοσκοπίας NMR Metabolomic analysis of biological fluids for the detection of biomarkers by NMR spectroscopy Γεωργακοπούλου, Ιωάννα Σπυρούλιας, Γεώργιος Σπυρούλιας, Γεώργιος Βαρβαρήγου, Αναστασία Λάμαρη, Φωτεινή Georgakopoulou, Ioanna Μεταβολομική Ούρα Νεογνά Φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού Metabolomics Urine Newborns Nuclear magnetic resonance (NMR) 612.647 Η προσαρμογή στην εξωμήτρια ζωή αποτελεί την κυριότερη πρόκληση για τα νεογνά, καθώς είναι μία περίοδος που χαρακτηρίζεται από ραγδαίες μεταβολικές αλλαγές. Ο νεογνικός οργανισμός είναι ιδιαίτερα ευπαθής και διάφοροι περιγεννητικοί παράγοντες μπορούν να επηρεάσουν τις μεταβολικές αλλαγές των πρώτων ημερών ζωής, οδηγώντας μακροπρόθεσμα στην εκδήλωση διαφόρων παθολογιών. Γι’ αυτό και η πρόγνωση των μεταβολικών διαταραχών είναι ιδιαίτερα σημαντική για την εξασφάλιση της μελλοντικής υγείας των νεογνών. Η γνώση των μεταβολικών διαδικασιών, που λαμβάνουν χώρα κατά την προσαρμογή στο εξωμήτριο περιβάλλον, θα διευκολύνει την ερμηνεία των δεδομένων που προκύπτουν από τη μελέτη παθολογικών καταστάσεων. Η μεταβολομική αποτελεί ένα ισχυρό πεδίο, ιδανικό για την παρακολούθηση αυτής της προσαρμογής, καθώς προσφέρει τη δυνατότητα παρακολούθησης αλλαγών στα μεταβολικά προφίλ. Η παρούσα εργασία επικεντρώνεται στη μελέτη του μεταβολικού προφίλ των ούρων υγιών νεογνών και στην παρατήρηση της μεταβολής αυτού από την 1η στην 3η μέρα ζωής, με στόχο τον προσδιορισμό των φυσιολογικών μεταβολικών προσαρμογών, που λαμβάνουν χώρα από τη γέννηση έως και την τρίτη ημέρα ζωής. Τα δείγματα ούρων επιλέχθηκαν για την ανάλυση, καθώς τα ούρα είναι ένα βιολογικό υγρό πλούσιο σε μεταβολίτες και ο τρόπος συλλογής τους είναι μη-επεμβατικός. Η ανάλυση των δειγμάτων πραγματοποιήθηκε με τη βοήθεια της φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR) και μέσω της στατιστικής ανάλυσης που ακολούθησε παρατηρήθηκαν μεταβολές στα επίπεδα αρκετών μεταβολιτών, που αντανακλούν σημαντικές αλλαγές σε κύρια μεταβολικά μονοπάτια, όπως στον μεταβολισμό των νουκλεοτιδίων, των αμινοξέων και των υδατανθράκων. Επιπρόσθετο στόχο της παρούσας εργασίας αποτέλεσε η μελέτη της επίδρασης διαφόρων περιγεννητικών παραγόντων στο νεογνικό μεταβολικό προφίλ των ούρων. Αναλυτικότερα το ενδιαφέρον εστιάστηκε στην μελέτη της επίδρασης των μεθόδων τοκετού, της προωρότητας, του καπνίσματος της μητέρας, του φύλου, της διατροφής και του νεογνικού ίκτερου στον μεταβολισμό των πρώτων ημερών ζωής, όπου μέσω μονομεταβλητής στατιστικής ανάλυσης, εντοπίστηκαν διαφορές στα επίπεδα ορισμένων μεταβολιτών, μεταξύ των συγκρινόμενων ομάδων, οι οποίες όμως δεν αναδείχθηκαν μέσω των πολυμεταβλητών στατιστικών μοντέλων, τονίζοντας την ανάγκη περαιτέρω διερεύνησης των αποτελεσμάτων και αύξησης του αριθμού των εξεταζόμενων δειγμάτων. A major challenge from the moment that a child is delivered is the adaptation to the extrauterine life, where rapid metabolic changes take place. The neonatal organism is particularly vulnerable and the early life environment strongly affects these metabolic changes, that may be associated with pathological conditions, in the long run. Therefore, the prognosis of metabolic disorders is important to ensure both newborns’ health as well as their future health. The knowledge of the normal metabolic processes taking place during adaptation to the extrauterine environment, will facilitate the interpretation of data resulting from the study of other effects, such as pathological conditions. Metabolomics is a powerful field, ideal for monitoring of such metabolic variations, since it offers the possibility to identify alterations in metabolic profiles. The present study focuses on the investigation of the urinary metabolic profile of healthy newborns, aiming to determine the normal metabolic adjustments, that take place within the first three days after birth. As urine is a biological fluid collected in a non-invasive manner and particularly rich in metabolites, urine samples, from the 1st and the 3rd day of life, were selected for the subsequent analysis. Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy was used for the assessment of the urinary metabolic profiles, while multivariate & univariate statistics contributed to the observation of several metabolic alterations within the first three days of life, reflecting significant changes in major metabolic pathways, such as nucleotide, amino acid and carbohydrate metabolism. An additional objective of the current study was to evaluate the effect of various perinatal factors on the neonatal urinary metabolic profile. More specifically, we examined the effect of delivery mode, prematurity, maternal smoking, gender, nutrition and neonatal jaundice on the metabolism of the first three days of life. Among the studied groups, differences at the levels of certain metabolites were detected, via univariate statistical analysis, while multivariate statistical models failed to provide any validated differentiation, highlighting the need for further investigation of the results and an increase in the number of samples to reinforce our findings and extract new ones. 2018-08-28T08:45:54Z 2018-08-28T08:45:54Z 2018-05-16 Thesis http://hdl.handle.net/10889/11512 gr 0 application/pdf |