Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL
Τα τελευταία χρόνια γίνεται στροφή των υπολογιστικών συστημάτων προς την παράλληλη επεξεργασία. Ακόμα και οι οικιακοί υπολογιστές περιέχουν χιλιάδες εξειδικευμένους επεξεργαστικούς πυρήνες, με τη μορφή των GPUs που συνήθως διαθέτουν. Για την εκμετάλλευση αυτών, τα τελευταία χρόνια έχουν εμφανιστεί A...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2019
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/11876 |
| id |
nemertes-10889-11876 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-118762022-09-05T20:31:04Z Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL Searching in large databases using OpenCL Χατζηγιαννάκης, Θεόδωρος Δερματάς, Ευάγγελος Δερματάς, Ευάγγελος Σγάρμπας, Κυριάκος Chatzigiannakis, Theodoros Παράλληλη επεξεργασία Αλγόριθμος BLAST Parallel processing BLAST 004.35 Τα τελευταία χρόνια γίνεται στροφή των υπολογιστικών συστημάτων προς την παράλληλη επεξεργασία. Ακόμα και οι οικιακοί υπολογιστές περιέχουν χιλιάδες εξειδικευμένους επεξεργαστικούς πυρήνες, με τη μορφή των GPUs που συνήθως διαθέτουν. Για την εκμετάλλευση αυτών, τα τελευταία χρόνια έχουν εμφανιστεί APIs όπως το CUDA και το OpenCL, τα οποία προσφέρουν στους προγραμματιστές τη δυνατότητα να γράψουν γενικής χρήσης κώδικα που προορίζεται για εκτέλεση σε GPGPUs ή άλλες συσκευές επεξεργασίας. Στα πλαίσια της παρούσας διπλωματικής εργασίας εξετάστηκε ο αλγόριθμος BLAST, ο οποίος αποτελεί ένα από τα πιο θεμελιώδη εργαλεία αναζήτησης σε βάσεις δεδομένων βιολογικών αλληλουχιών. Στη συνέχεια, υλοποιήθηκε μια παραλληλοποιημένη εκδοχή του με χρήση του OpenCL. In recent years, there has been a tendency to process data in parallel. Even home computers contain thousands of specialized processing units in the form of GPUs. To utilize them, a number of APIs such as CUDA and OpenCL have emerged, which facilitate writing general-purpose code intended to execute on GPGPUs or other compute devices. We examine the BLAST algorithm, a fundamental tool used to search through biological databases, and we implement a parallel variant of it using OpenCL. 2019-02-01T18:03:09Z 2019-02-01T18:03:09Z 2018-10-08 Thesis http://hdl.handle.net/10889/11876 gr 0 application/octet-stream application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Παράλληλη επεξεργασία Αλγόριθμος BLAST Parallel processing BLAST 004.35 |
| spellingShingle |
Παράλληλη επεξεργασία Αλγόριθμος BLAST Parallel processing BLAST 004.35 Χατζηγιαννάκης, Θεόδωρος Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL |
| description |
Τα τελευταία χρόνια γίνεται στροφή των υπολογιστικών συστημάτων προς την παράλληλη επεξεργασία. Ακόμα και οι οικιακοί υπολογιστές περιέχουν χιλιάδες εξειδικευμένους επεξεργαστικούς πυρήνες, με τη μορφή των GPUs που συνήθως διαθέτουν. Για την εκμετάλλευση αυτών, τα τελευταία χρόνια έχουν εμφανιστεί APIs όπως το CUDA και το OpenCL, τα οποία προσφέρουν στους προγραμματιστές τη δυνατότητα να γράψουν γενικής χρήσης κώδικα που προορίζεται για εκτέλεση σε GPGPUs ή άλλες συσκευές επεξεργασίας. Στα πλαίσια της παρούσας διπλωματικής εργασίας εξετάστηκε ο αλγόριθμος BLAST, ο οποίος αποτελεί ένα από τα πιο θεμελιώδη εργαλεία αναζήτησης σε βάσεις δεδομένων βιολογικών αλληλουχιών. Στη συνέχεια, υλοποιήθηκε μια παραλληλοποιημένη εκδοχή του με χρήση του OpenCL. |
| author2 |
Δερματάς, Ευάγγελος |
| author_facet |
Δερματάς, Ευάγγελος Χατζηγιαννάκης, Θεόδωρος |
| format |
Thesis |
| author |
Χατζηγιαννάκης, Θεόδωρος |
| author_sort |
Χατζηγιαννάκης, Θεόδωρος |
| title |
Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL |
| title_short |
Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL |
| title_full |
Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL |
| title_fullStr |
Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL |
| title_full_unstemmed |
Αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση OpenCL |
| title_sort |
αναζήτηση σε μεγάλες βάσεις δεδομένων με χρήση opencl |
| publishDate |
2019 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/11876 |
| work_keys_str_mv |
AT chatzēgiannakēstheodōros anazētēsēsemegalesbaseisdedomenōnmechrēsēopencl AT chatzēgiannakēstheodōros searchinginlargedatabasesusingopencl |
| _version_ |
1771297284066115584 |
