Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια

Πολυάριθμοι οργανισμοί εθνικής και διεθνούς εμβέλειας, όπως ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας, το κέντρο Πρόληψης και Αντιμετώπισης Ασθενειών, η Συμβουλευτική Επιτροπή για Επικίνδυνα Παθογόνα και το ΚΕΕΛΠΝΟ για τη χώρα μας, έχουν δώσει κατευθυντήριες οδηγίες, προκειμένου να προληφθεί ή να περιοριστεί η...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Σιάτης, Κωνσταντίνος
Άλλοι συγγραφείς: Πατρινός, Γεώργιος
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2019
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/12203
id nemertes-10889-12203
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Βιοασφάλεια
Βάση δεδομένων
Μικροοργανισμοί
Biosafety
Database
Biosecurity
Microorganisms
363.106
spellingShingle Βιοασφάλεια
Βάση δεδομένων
Μικροοργανισμοί
Biosafety
Database
Biosecurity
Microorganisms
363.106
Σιάτης, Κωνσταντίνος
Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
description Πολυάριθμοι οργανισμοί εθνικής και διεθνούς εμβέλειας, όπως ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας, το κέντρο Πρόληψης και Αντιμετώπισης Ασθενειών, η Συμβουλευτική Επιτροπή για Επικίνδυνα Παθογόνα και το ΚΕΕΛΠΝΟ για τη χώρα μας, έχουν δώσει κατευθυντήριες οδηγίες, προκειμένου να προληφθεί ή να περιοριστεί η έκθεση σε βιολογικούς παράγοντες, έτσι ώστε να περιοριστεί η έκταση ή ο κίνδυνος της μόλυνσης του πληθυσμού και του περιβάλλοντος. Με τον όρο «βιολογικοί παράγοντες», περιγράφεται οποιοσδήποτε μικροοργανισμός, ενδοπαράσιτο, ή κυτταρική καλλιέργεια, φυσικά ή κατασκευασμένα βάσει γενετικής μηχανικής, που μπορεί να προκαλέσει: Θάνατο, ασθένεια, ή άλλες βιολογικές δυσλειτουργίες στον άνθρωπο, στα ζώα, σε φυτά και σε οποιοδήποτε άλλο έμβιο ον, καθώς και να έχει επιπτώσεις στο αβιοτικό περιβάλλον. Βάσει έκθεσης σε μολυσματικούς παράγοντες ο ΠΟΥ έχει εκδώσει δύο ορισμούς σχετικά με τη βιοασφάλεια:. Ασφάλεια από ακούσια έκθεση (biosafety): οι τεχνολογίες περιορισμού και εκτίμησης κινδύνου που χρησιμοποιούνται σε ένα βιολογικό εργαστήριo προληπτικά, ώστε να προστατεύσουν από την ακούσια απελευθέρωση και έκθεση σε παθογόνα. Η ασφάλεια από ακούσια έκθεση σχετίζεται άμεσα με την υποχρέωση λήψης των απαραίτητων προληπτικών μέτρων, ώστε να προστατευτεί ο χειριστής, η κοινότητα αλλά και το περιβάλλον. Ασφάλεια από εκούσιο συμβάν (biosecurity): η διαχείριση ασφαλείας των παθογόνων και των πληροφοριών αυτών σε εργαστηριακή κλίμακα, ώστε να προστατευτούν από απώλεια, κλοπή ή μη εξουσιοδοτημένη, και ενδεχομένως κακόβουλη χρήση τους. Η παρούσα διπλωματική εργασία εκπονήθηκε με σκοπό να συγκεντρωθούν και καταγραφούν παθογόνοι μικροοργανισμοί αλλά και τοξίνες που αφορούν τη βιοασφάλεια, συνδυαστικά με τις επιπτώσεις που μπορεί να προκαλέσουν καθώς και με τον τρόπο με τον οποίο μπορεί να γίνει ανίχνευσή αυτών. Από την διερεύνηση και καταγραφή των βιολογικών παραγόντων προέκυψαν αρχεία δεδομένων με τη μορφή πινάκων. Σε κάθε πίνακα οι καταγραφές παίρνουν έναν αύξοντα αριθμό ο οποίος παραμένει ίδιος σε όλους τους πίνακες προκειμένου να υπάρχει αντιστοίχιση όλων των δεδομένων. Όλοι οι Βιολογικοί παράγοντες κατηγοριοποιούνται σε 4 υποομάδες ανάλογα με το εάν: ενέχουν βιολογικό κίνδυνο, 2) έχουν εξαιρεθεί, καθώς πρόκειται για στελέχη, είτε για τροποποιημένους γενετικά μικροοργανισμούς με τη βοήθεια της γενετικής μηχανικής οι οποίοι είναι σχετικά αβλαβείς παρά το γεγονός ότι προέρχονται από επιβλαβείς και επικίνδυνους παράγοντες, 3) πλέον δεν συγκαταλέγονται στους επικίνδυνους καθώς αντιμετωπίζονται αποτελεσματικά, συνεπώς δεν αποτελούν άμεσο κίνδυνο για την ασφάλεια και προαγωγή της δημόσιας υγείας, 4) προσβάλλουν φυτικούς οργανισμούς. Ειδικότερα για τους ιούς, περιλαμβάνονται και στοιχεία που αφορούν την κατάταξή τους κατά Baltimore, μια κατηγοριοποίηση που σχετίζεται με το γενετικό τους υλικό. Επίσης έχουν καταγραφεί πληροφορίες αναφορικά με τον τρόπο ανίχνευσης ή και διάγνωσης των βιολογικών παραγόντων. Ένα ακόμα πεδίο δεδομένων, αφορά την νόσο ή το σύνδρομο που μπορεί να προκληθεί από τους αντίστοιχους βιολογικούς παράγοντες. Όλα τα δεδομένα που συλλέχθηκαν συμπεριλαμβάνονται σε βάση δεδομένων που υλοποιήθηκε με τη βοήθεια του λογισμικού Microsoft Access. Τα αρχεία που δημιουργήθηκαν, είναι επιδεκτικά ενημέρωσης μέσω μελλοντικής απλής προσθήκης δεδομένων τα οποία ενδεικτικά αναφέροντας θα μπορούσαν να αφορούν: καταγραφή νέων παθογόνων, επανεμφάνιση νόσων ή συνδρόμων τα οποία είχαν εκλείψει ή είχαν μετριασθεί σε σημαντικό βαθμό και είχαν μεγάλο χρονικό διάστημα να εμφανιστούν, φαρμακευτική αγωγή που χρησιμοποιείται ή μπορεί να χρησιμοποιηθεί προληπτικά αλλά και θεραπευτικά, επιδημιολογικά δεδομένα χωρικής/χρονικής κατανομής των νόσων ή συνδρόμων, νέες εργαστηριακές τεχνικές που θα μπορούσαν να συμβάλλουν στην ανίχνευση/διάγνωση των εν λόγω βιολογικών παραγόντων. Στο σύνολό της, η συλλογή και καταγραφή δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια θα μπορούσε να συμβάλει στον πληρέστερο έλεγχο μετάδοσης ασθενειών μιας και μέχρι σήμερα η εξάλειψη ή και ο περιορισμός των μεταδοτικών ασθενειών που απειλούν τη δημόσια υγεία δεν ήταν αρκετά επιτυχημένος. Τέλος, μέσω της συνεχούς βιοεπαγρύπνισης αλλά και βιοπαρακολούθησης, όπου μπορούν να συμβάλλουν συνεργαζόμενοι φορείς όπως επιστήμονες στους τομείς υγείας, οικονομίας, αλλά και κοινωνικών /ανθρωπολογικών κατευθύνσεων, υπάρχει δυνατότητα επαρκέστερης αλλά και επιτυχέστερης διαχείρισης των διαφόρων ζητημάτων που αφορούν τη βιοασφάλεια.
author2 Πατρινός, Γεώργιος
author_facet Πατρινός, Γεώργιος
Σιάτης, Κωνσταντίνος
format Thesis
author Σιάτης, Κωνσταντίνος
author_sort Σιάτης, Κωνσταντίνος
title Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
title_short Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
title_full Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
title_fullStr Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
title_full_unstemmed Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
title_sort δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια
publishDate 2019
url http://hdl.handle.net/10889/12203
work_keys_str_mv AT siatēskōnstantinos dēmiourgiabasēsdedomenōnmikroorganismōnpouaphorountēbioasphaleia
AT siatēskōnstantinos microorganismsdatabasecreationconcerningbiosafetybiosecurity
_version_ 1771297254453280768
spelling nemertes-10889-122032022-09-05T14:10:19Z Δημιουργία βάσης δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια Microorganisms' data base creation concerning biosafety & biosecurity Σιάτης, Κωνσταντίνος Πατρινός, Γεώργιος Πατρινός, Γεώργιος Σιβολαπένκο, Γρηγόριος Τοπούζης, Σταύρος Siatis, Konstantinos Βιοασφάλεια Βάση δεδομένων Μικροοργανισμοί Biosafety Database Biosecurity Microorganisms 363.106 Πολυάριθμοι οργανισμοί εθνικής και διεθνούς εμβέλειας, όπως ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας, το κέντρο Πρόληψης και Αντιμετώπισης Ασθενειών, η Συμβουλευτική Επιτροπή για Επικίνδυνα Παθογόνα και το ΚΕΕΛΠΝΟ για τη χώρα μας, έχουν δώσει κατευθυντήριες οδηγίες, προκειμένου να προληφθεί ή να περιοριστεί η έκθεση σε βιολογικούς παράγοντες, έτσι ώστε να περιοριστεί η έκταση ή ο κίνδυνος της μόλυνσης του πληθυσμού και του περιβάλλοντος. Με τον όρο «βιολογικοί παράγοντες», περιγράφεται οποιοσδήποτε μικροοργανισμός, ενδοπαράσιτο, ή κυτταρική καλλιέργεια, φυσικά ή κατασκευασμένα βάσει γενετικής μηχανικής, που μπορεί να προκαλέσει: Θάνατο, ασθένεια, ή άλλες βιολογικές δυσλειτουργίες στον άνθρωπο, στα ζώα, σε φυτά και σε οποιοδήποτε άλλο έμβιο ον, καθώς και να έχει επιπτώσεις στο αβιοτικό περιβάλλον. Βάσει έκθεσης σε μολυσματικούς παράγοντες ο ΠΟΥ έχει εκδώσει δύο ορισμούς σχετικά με τη βιοασφάλεια:. Ασφάλεια από ακούσια έκθεση (biosafety): οι τεχνολογίες περιορισμού και εκτίμησης κινδύνου που χρησιμοποιούνται σε ένα βιολογικό εργαστήριo προληπτικά, ώστε να προστατεύσουν από την ακούσια απελευθέρωση και έκθεση σε παθογόνα. Η ασφάλεια από ακούσια έκθεση σχετίζεται άμεσα με την υποχρέωση λήψης των απαραίτητων προληπτικών μέτρων, ώστε να προστατευτεί ο χειριστής, η κοινότητα αλλά και το περιβάλλον. Ασφάλεια από εκούσιο συμβάν (biosecurity): η διαχείριση ασφαλείας των παθογόνων και των πληροφοριών αυτών σε εργαστηριακή κλίμακα, ώστε να προστατευτούν από απώλεια, κλοπή ή μη εξουσιοδοτημένη, και ενδεχομένως κακόβουλη χρήση τους. Η παρούσα διπλωματική εργασία εκπονήθηκε με σκοπό να συγκεντρωθούν και καταγραφούν παθογόνοι μικροοργανισμοί αλλά και τοξίνες που αφορούν τη βιοασφάλεια, συνδυαστικά με τις επιπτώσεις που μπορεί να προκαλέσουν καθώς και με τον τρόπο με τον οποίο μπορεί να γίνει ανίχνευσή αυτών. Από την διερεύνηση και καταγραφή των βιολογικών παραγόντων προέκυψαν αρχεία δεδομένων με τη μορφή πινάκων. Σε κάθε πίνακα οι καταγραφές παίρνουν έναν αύξοντα αριθμό ο οποίος παραμένει ίδιος σε όλους τους πίνακες προκειμένου να υπάρχει αντιστοίχιση όλων των δεδομένων. Όλοι οι Βιολογικοί παράγοντες κατηγοριοποιούνται σε 4 υποομάδες ανάλογα με το εάν: ενέχουν βιολογικό κίνδυνο, 2) έχουν εξαιρεθεί, καθώς πρόκειται για στελέχη, είτε για τροποποιημένους γενετικά μικροοργανισμούς με τη βοήθεια της γενετικής μηχανικής οι οποίοι είναι σχετικά αβλαβείς παρά το γεγονός ότι προέρχονται από επιβλαβείς και επικίνδυνους παράγοντες, 3) πλέον δεν συγκαταλέγονται στους επικίνδυνους καθώς αντιμετωπίζονται αποτελεσματικά, συνεπώς δεν αποτελούν άμεσο κίνδυνο για την ασφάλεια και προαγωγή της δημόσιας υγείας, 4) προσβάλλουν φυτικούς οργανισμούς. Ειδικότερα για τους ιούς, περιλαμβάνονται και στοιχεία που αφορούν την κατάταξή τους κατά Baltimore, μια κατηγοριοποίηση που σχετίζεται με το γενετικό τους υλικό. Επίσης έχουν καταγραφεί πληροφορίες αναφορικά με τον τρόπο ανίχνευσης ή και διάγνωσης των βιολογικών παραγόντων. Ένα ακόμα πεδίο δεδομένων, αφορά την νόσο ή το σύνδρομο που μπορεί να προκληθεί από τους αντίστοιχους βιολογικούς παράγοντες. Όλα τα δεδομένα που συλλέχθηκαν συμπεριλαμβάνονται σε βάση δεδομένων που υλοποιήθηκε με τη βοήθεια του λογισμικού Microsoft Access. Τα αρχεία που δημιουργήθηκαν, είναι επιδεκτικά ενημέρωσης μέσω μελλοντικής απλής προσθήκης δεδομένων τα οποία ενδεικτικά αναφέροντας θα μπορούσαν να αφορούν: καταγραφή νέων παθογόνων, επανεμφάνιση νόσων ή συνδρόμων τα οποία είχαν εκλείψει ή είχαν μετριασθεί σε σημαντικό βαθμό και είχαν μεγάλο χρονικό διάστημα να εμφανιστούν, φαρμακευτική αγωγή που χρησιμοποιείται ή μπορεί να χρησιμοποιηθεί προληπτικά αλλά και θεραπευτικά, επιδημιολογικά δεδομένα χωρικής/χρονικής κατανομής των νόσων ή συνδρόμων, νέες εργαστηριακές τεχνικές που θα μπορούσαν να συμβάλλουν στην ανίχνευση/διάγνωση των εν λόγω βιολογικών παραγόντων. Στο σύνολό της, η συλλογή και καταγραφή δεδομένων μικροοργανισμών που αφορούν τη βιοασφάλεια θα μπορούσε να συμβάλει στον πληρέστερο έλεγχο μετάδοσης ασθενειών μιας και μέχρι σήμερα η εξάλειψη ή και ο περιορισμός των μεταδοτικών ασθενειών που απειλούν τη δημόσια υγεία δεν ήταν αρκετά επιτυχημένος. Τέλος, μέσω της συνεχούς βιοεπαγρύπνισης αλλά και βιοπαρακολούθησης, όπου μπορούν να συμβάλλουν συνεργαζόμενοι φορείς όπως επιστήμονες στους τομείς υγείας, οικονομίας, αλλά και κοινωνικών /ανθρωπολογικών κατευθύνσεων, υπάρχει δυνατότητα επαρκέστερης αλλά και επιτυχέστερης διαχείρισης των διαφόρων ζητημάτων που αφορούν τη βιοασφάλεια. Many organizations of both national and international impact such as WHO, CDC, HCDCP have published guidelines in order to either prevent or eliminate exposure to biological factors. Global catastrophic biological risks refer to biohazards that have impact on both human and environment. The term biological factor refers to any microorganism, parasite, cell culture, naturally occurred or genetically modified that could cause death, illness or any other biological malfunctions on human, animals, plants and environment. According to exposure on infectious agents, WHO has established two definitions concerning Biosafety and Biosecurity. Biosafety protects people from biological risks while biosecurity prevents from unauthorized or intended use of biological factors with impact on both biotic and abiotic environment. The current study was conducted in order to collect and record pathogens and toxins concerning both biosafety and biosecurity and evaluate the impact they might have. Furthermore, detection methods concerning biological factors were also recorded. All data concerning biological factors were recorded on files with the form of tables. By this way a data base of biological factors was created. Every single record has a serial number which remains unique in all tables in order all data to be combined and referred to specific records. All data concerning biological factors were categorized in four groups according to: whether they exert biological risk or have been excluded as strains or genetically modified organisms that are relatively harmless though they are derived from dangerous agents, or are not included any more to dangerous factors as there are effective treatments at our disposal so they do not consist a threat for public health. The fourth group refers to biological factors that affect plants. More specifically, as far as viruses are concerned, Baltimore Classification was conducted and recorded. Data concerning diagnosis and detection of biological factors were added as well as syndrome or disease they can cause. All data collected were transferred in a data base that was created using Micorsoft Access software. All created files are susceptible and easy to update with data in the future that might concern: record of new pathogens, reappearance of diseases that have so far been disappeared, new treatment options that could be used as a preventive measure, statistical data concerning epidemiology spatial/temporarily and new laboratory methods applied to detect biological factors. Totally, both collection and record of data concerning biological factors that involve both biosafety and biosecurity could improve prevention and early detection of infectious diseases. Through continuous biosurveillance and biovigilance involving various scientific fields such as healthcare professionals, economists and socioanthropological scientists a more effective and successful management could be applied towards many fields concerning biosafety and biosecurity. 2019-06-30T09:58:51Z 2019-06-30T09:58:51Z 2019-02 Thesis http://hdl.handle.net/10889/12203 gr 0 application/pdf