Μεταβολομική ανάλυση βιολογικών υγρών, μέσω φασματοσκοπίας NMR

Η μεταβολομική μπορεί να οριστεί ως η ολοκληρωμένη ανάλυση όλων των μεταβολιτών (αποκαλούμενοι ως μεταβόλωμα) ενός απομονωμένου οργανισμού, κυτταρικού συστήματος, ιστού ή βιολογικού υγρού. Η προσέγγιση αυτή παρέχει το μεταβολικό φαινότυπο ενός βιολογικού συστήματος. Η μεταβολομική ανάλυση παρέχει τη...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Καραγκούνη, Ευδοκία
Άλλοι συγγραφείς: Σπυρούλιας, Γεώργιος
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2019
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/12459
Περιγραφή
Περίληψη:Η μεταβολομική μπορεί να οριστεί ως η ολοκληρωμένη ανάλυση όλων των μεταβολιτών (αποκαλούμενοι ως μεταβόλωμα) ενός απομονωμένου οργανισμού, κυτταρικού συστήματος, ιστού ή βιολογικού υγρού. Η προσέγγιση αυτή παρέχει το μεταβολικό φαινότυπο ενός βιολογικού συστήματος. Η μεταβολομική ανάλυση παρέχει την αμερόληπτη ταυτοποίηση και ποσοτικοποίηση όλων των μεταβολιτών. Ο τομέας της μεταβολομικής συνδυάζει βιοχημικές οδούς, αναλυτικές τεχνικές και ποικίλες μεθόδους στατιστικής ανάλυσης. Μία από τις φασματοσκοπικές τεχνικές που χρησιμοποιούνται στις μελέτες αυτές είναι η φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR). Η τεχνική αυτή παρέχει πληροφορίες για την ακριβή περιγραφή της φυσιολογικής κατάστασης ενός οργανισμού. Η χρόνια νεφρική νόσος (CKD) έχει σύνθετη παθογένεια, η οποία συνεπάγεται την αλληλεπίδραση γενετικών και περιβαλλοντικών παραγόντων. Η CKD είναι το τελικό σημείο μιας σειράς νεφρικών και συστηματικών ασθενειών (χρόνια σπειραματονεφρίτιδα, νεφροπάθεια IgA, διαβητική νεφροπάθεια κλπ.). Τόσο η διάγνωση όσο και η σταδιοποίηση της CKD βασίζονται συνήθως στην απέκκριση της λευκωματίνης στα ούρα ή/και στην εκτίμηση του ρυθμού σπειραματικής διήθησης (eGFR). Ωστόσο, η εκτίμηση του GFR έχει περιορισμούς, επειδή επηρεάζεται από βιολογικούς παράγοντες όπως η ηλικία, το φύλο και η μυϊκή μάζα. Επίσης, οι κλινικοί βιοδείκτες της νεφρικής λειτουργίας που χρησιμοποιούνται σήμερα, (άζωτο ουρίας αίματος και κρεατινίνη ορού) δεν είναι αρκετά εξειδικευμένοι. Οι περιορισμοί αυτοί δημιουργούν την απαίτηση να ανακαλυφθούν νέοι δείκτες της ασθένειας. Η παρούσα εργασία επικεντρώνεται στην ταυτοποίηση μεταβολιτών, μέσω ανάλυσης NMR φασμάτων από δείγματα ούρων από υγιή άτομα και ασθενείς με CKD, με στόχο την διερεύνηση της παθογένειας των ασθενειών, που προκαλούν τη νεφρική νόσο και τη μελέτη της εξέλιξης της νόσου. Τα δείγματα ούρων επιλέχθηκαν για την ανάλυση, καθώς τα ούρα είναι ένα βιολογικό υγρό πλούσιο σε μεταβολίτες και ο τρόπος συλλογής τους είναι μη-επεμβατικός. Η ανάλυση των δειγμάτων πραγματοποιήθηκε με τη βοήθεια της φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR) και μέσω της στατιστικής ανάλυσης που ακολούθησε παρατηρήθηκαν μεταβολές στα επίπεδα αρκετών μεταβολιτών, που αντανακλούν σημαντικές αλλαγές σε κύρια μεταβολικά μονοπάτια. Η ανάλυση των φασμάτων NMR από δείγματα ούρων ασθενών και υγειών ατόμων έχει δώσει μία εικόνα για τις ομοιότητες και τις διαφορές των μεταβολιτών τους, όμως είναι αναγκαία η περαιτέρω διερεύνηση των αποτελεσμάτων και η αύξηση του αριθμού των εξεταζόμενων δειγμάτων.