Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία
Οι αιμοσφαιρινοπάθειες και κυρίως η β-μεσογειακή αναιμία, αποτελούν τις πιο κοινές υπολειπόμενες αυτοσωμικές διαταραχές στο σύνολο του παγκόσμιου πληθυσμού. Η β-θαλασσαιμία είναι διαταραχή του αίματος που χαρακτηρίζεται από μειωμένη (β+) ή απούσα (β0) σύνθεση των αλυσίδων β-σφαιρίνης , με αποτέλεσμ...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2019
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/12516 |
| id |
nemertes-10889-12516 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Αιμοσφαιρινοπάθειες Παράγοντες Kruppel β-μεσογειακή αναιμία Hemoglobinopathies Kruppel like factors β-thalassemia |
| spellingShingle |
Αιμοσφαιρινοπάθειες Παράγοντες Kruppel β-μεσογειακή αναιμία Hemoglobinopathies Kruppel like factors β-thalassemia Τζιώλια, Κωνσταντίνα Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| description |
Οι αιμοσφαιρινοπάθειες και κυρίως η β-μεσογειακή αναιμία, αποτελούν τις πιο κοινές υπολειπόμενες αυτοσωμικές διαταραχές στο σύνολο του παγκόσμιου πληθυσμού. Η β-θαλασσαιμία είναι διαταραχή του αίματος που χαρακτηρίζεται από μειωμένη (β+) ή απούσα (β0) σύνθεση των αλυσίδων β-σφαιρίνης , με αποτέλεσμα μεταβλητούς φαινοτύπους που κυμαίνονται από σοβαρή αναιμία έως κλινικά ασυμπτωματική αναιμία Τα συμπτώματα μπορεί να διαφέρουν σημαντικά ακόμη και μεταξύ ασθενών που φέρουν την ίδια μετάλλαξη στο HBB γονίδιο. Υπάρχουν τρεις τύποι που αντιπροσωπεύουν τη σοβαρότητα αυτής της ασθένειας: ελάσσονα β-θαλασσαιμία , ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-θαλασσαιμία (NTDT) και μείζονα β-θαλασσαιμία. Τα αυξημένα επίπεδα της εμβρυικής αιμοσφαιρίνης κατά την ενήλικη ζωή ενός ασθενή με β-μεσογειακή αναιμία, φαίνεται να συνεισφέρουν σημαντικά στην ηπιότερη κλινική εικόνα του. Η φαρμακολογική επαγωγή της σύνθεσης της εμβρυικής αιμοσφαιρίνης αποτελεί επιδίωξη και απώτερο στόχο στο πεδίο των αιμοσφαιρινοπαθειών. Η οικογένεια παραγόντων μεταγραφής- Krüppel like factors (KLFs) είναι μια οικογένεια μεταγραφικών παραγόντων που δεσμεύουν το DNA χάρη σε τρεις χαρακτηριστικούς δακτύλιους C2H2 - ψευδαργύρου στα C-άκρα τους. Όλα τα KLF αναγνωρίζουν τα πλαίσια CACCC ή CGCCC που βρίσκονται στους υποκινητές, ενισχυτές και άλλες περιοχές ελέγχου γονιδίων-στόχων.. Ενώ τα C-άκρα είναι παρόμοια σε διαφορετικά KLFs, τα Ν-άκρα ποικίλουν και κατά συνέπεια διαφορετικά KLFs μπορούν είτε να ενεργοποιήσουν είτε να καταστείλουν την μεταγραφή ή και τα δύο. Το KLF3 φαίνεται να λειτουργεί κυρίως ως καταστολέας της μεταγραφής και επομένως απενεργοποιεί τα γονίδια.
Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι να μελετηθεί η συσχέτιση του μονονουκλεοτιδικού πολυμορφισμού rs2242189 που εδράζεται στο γονίδιο KLF3, με την εμφάνιση και τη βαρύτητα της β-μεσογειακής αναιμίας σε πληθυσμό Ελλήνων ασθενών από δυο διαφορετικές ομάδες Ελλήνων ασθενών. Συγκεκριμένα, αναλύθηκαν δείγματα DNA ασθενών με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία, ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία μη εξαρτώμενη μεταγγίσεων και υγιών ατόμων με PCR και αλληλούχηση κατά Sanger. Τα αποτελέσματα μετά από γονοτύπηση των δειγμάτων ως προς τον rs2242189, υποδηλώνουν τη στατιστικά σημαντική συσχέτισή του με την ηπιότερη κλινική εικόνα της ασθένειας, καθώς στη σύγκριση των υγιών ατόμων και ατόμων που πάσχουν από ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-μεσογειακή αναιμία η τιμή p ήταν 0.0274. Στις συγκρίσεις υγιών ατόμων με ασθενείς με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία και ασθενών με ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-μεσογειακή αναιμία με ασθενείς με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία δεν παρουσιάστηκε κάποιο στατιστικώς σημαντικό αποτέλεσμα. |
| author2 |
Πατρινός, Γεώργιος |
| author_facet |
Πατρινός, Γεώργιος Τζιώλια, Κωνσταντίνα |
| format |
Thesis |
| author |
Τζιώλια, Κωνσταντίνα |
| author_sort |
Τζιώλια, Κωνσταντίνα |
| title |
Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| title_short |
Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| title_full |
Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| title_fullStr |
Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| title_full_unstemmed |
Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| title_sort |
μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο klf3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία |
| publishDate |
2019 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/12516 |
| work_keys_str_mv |
AT tziōliakōnstantina meletēsyschetisēsgenetikōndeiktōnstogonidioklf3metēbeltiōsētēsklinikēseikonasasthenōnmebmesogeiakēanaimia AT tziōliakōnstantina studyoftheassociationofpharmacogenomicbiomarkerinklf3genewiththeimprovementofclinicalphenotypeonbthalassemiapatients |
| _version_ |
1801184883003883520 |
| spelling |
nemertes-10889-125162022-09-05T13:56:24Z Μελέτη συσχέτισης γενετικών δεικτών στο γονίδιο KLF3 με τη βελτίωση της κλινικής εικόνας ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία Study of the association of pharmacogenomic biomarker in KLF3 gene with the improvement of clinical phenotype on β-thalassemia patients Τζιώλια, Κωνσταντίνα Πατρινός, Γεώργιος Σπυρούλιας, Γεώργιος Πουλάς, Κωνσταντίνος Tziolia, Konstantina Αιμοσφαιρινοπάθειες Παράγοντες Kruppel β-μεσογειακή αναιμία Hemoglobinopathies Kruppel like factors β-thalassemia Οι αιμοσφαιρινοπάθειες και κυρίως η β-μεσογειακή αναιμία, αποτελούν τις πιο κοινές υπολειπόμενες αυτοσωμικές διαταραχές στο σύνολο του παγκόσμιου πληθυσμού. Η β-θαλασσαιμία είναι διαταραχή του αίματος που χαρακτηρίζεται από μειωμένη (β+) ή απούσα (β0) σύνθεση των αλυσίδων β-σφαιρίνης , με αποτέλεσμα μεταβλητούς φαινοτύπους που κυμαίνονται από σοβαρή αναιμία έως κλινικά ασυμπτωματική αναιμία Τα συμπτώματα μπορεί να διαφέρουν σημαντικά ακόμη και μεταξύ ασθενών που φέρουν την ίδια μετάλλαξη στο HBB γονίδιο. Υπάρχουν τρεις τύποι που αντιπροσωπεύουν τη σοβαρότητα αυτής της ασθένειας: ελάσσονα β-θαλασσαιμία , ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-θαλασσαιμία (NTDT) και μείζονα β-θαλασσαιμία. Τα αυξημένα επίπεδα της εμβρυικής αιμοσφαιρίνης κατά την ενήλικη ζωή ενός ασθενή με β-μεσογειακή αναιμία, φαίνεται να συνεισφέρουν σημαντικά στην ηπιότερη κλινική εικόνα του. Η φαρμακολογική επαγωγή της σύνθεσης της εμβρυικής αιμοσφαιρίνης αποτελεί επιδίωξη και απώτερο στόχο στο πεδίο των αιμοσφαιρινοπαθειών. Η οικογένεια παραγόντων μεταγραφής- Krüppel like factors (KLFs) είναι μια οικογένεια μεταγραφικών παραγόντων που δεσμεύουν το DNA χάρη σε τρεις χαρακτηριστικούς δακτύλιους C2H2 - ψευδαργύρου στα C-άκρα τους. Όλα τα KLF αναγνωρίζουν τα πλαίσια CACCC ή CGCCC που βρίσκονται στους υποκινητές, ενισχυτές και άλλες περιοχές ελέγχου γονιδίων-στόχων.. Ενώ τα C-άκρα είναι παρόμοια σε διαφορετικά KLFs, τα Ν-άκρα ποικίλουν και κατά συνέπεια διαφορετικά KLFs μπορούν είτε να ενεργοποιήσουν είτε να καταστείλουν την μεταγραφή ή και τα δύο. Το KLF3 φαίνεται να λειτουργεί κυρίως ως καταστολέας της μεταγραφής και επομένως απενεργοποιεί τα γονίδια. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι να μελετηθεί η συσχέτιση του μονονουκλεοτιδικού πολυμορφισμού rs2242189 που εδράζεται στο γονίδιο KLF3, με την εμφάνιση και τη βαρύτητα της β-μεσογειακής αναιμίας σε πληθυσμό Ελλήνων ασθενών από δυο διαφορετικές ομάδες Ελλήνων ασθενών. Συγκεκριμένα, αναλύθηκαν δείγματα DNA ασθενών με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία, ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία μη εξαρτώμενη μεταγγίσεων και υγιών ατόμων με PCR και αλληλούχηση κατά Sanger. Τα αποτελέσματα μετά από γονοτύπηση των δειγμάτων ως προς τον rs2242189, υποδηλώνουν τη στατιστικά σημαντική συσχέτισή του με την ηπιότερη κλινική εικόνα της ασθένειας, καθώς στη σύγκριση των υγιών ατόμων και ατόμων που πάσχουν από ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-μεσογειακή αναιμία η τιμή p ήταν 0.0274. Στις συγκρίσεις υγιών ατόμων με ασθενείς με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία και ασθενών με ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-μεσογειακή αναιμία με ασθενείς με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία δεν παρουσιάστηκε κάποιο στατιστικώς σημαντικό αποτέλεσμα. Hemoglobinopathies, especially β-thalassemia, are the most common inherited autosomal disorders in the entire world population. Beta-thalassemia is a blood disorder characterized by decreased (b+) or absence (b0) composition of β-globin chains of hemoglobin, resulting in variable phenotypes ranging from severe anemia to anemia with clinically asymptomatic phenotype. The clinical phenotype of the patients is characterized by high heterogeneity and the symptoms may differ significantly even among patients carrying the same mutation in the HBB gene. There are three types that represent the severity of this disease: minor β-thalassemia, β-thalassemia independent transfusion (NTDT) and major β-thalassemia. Elevated levels of fetal hemoglobin in the adult life of a patient with β-thalassemia appear to contribute significantly to the milder clinical phenotype of the patient. The pharmacological induction of fetal hemoglobin synthesis is a pursuit and ultimate goal in the field of hemoglobinopathies. Krüppel like factors (KLFs) are a family of transcription factors. Transcription factors of this family bind DNA by virtue of three characteristic zinc C2H2 rings at their C-terminal. All KLFs recognize the CACCC or CGCCC boxes of the general form NCR CRC CCN and GC-rich motifs found in the promoters, enhancers and other target gene regions. While the C-terminus is similar in different KLFs, the N-terminus varies and therefore different KLFs can either activate or suppress transcription or both. The protein encoded by the KLF3 gene is a transcription factor. KLF3 seems to function primarily as a transcriptional repressor. It turns the genes off. This is achieved by the uptake of the co-repressors CTBP1 and CTBP2. CtBP binds to a short motif at the N-terminal region of KLF3, of the general form Proline - Isoleucine - Aspartate - Leucine - Serine (the PIDLS motif). CtBP, in turn, interacts with histone-modifying enzymes to alter chromatin and suppress gene expression. The aim of this study was to examine the association of the mononucleotide polymorphism rs2242189, based on the KLF3 gene, with the occurrence and severity of β-thalassemia in a population of Greek patients. This work was based on a previous study by Vassiliki Chondrou, Aikaterini Gravia, Joseph Borg and George. P. Patrinos, where they aimed to identify unique molecular pathways involved in the production of HbF, which will then be exploited in β-thalassemia patients’ stratification and possibly in the individualization of β-hemoglobinopathies therapeutics. The KLF3 gene is included in the gene list involved in the study and possibly plays a crucial role. In our study, DNA samples from two different groups of Greek patients were analyzed. Specifically, samples of patients with major β-thalassemia, patients with non- transfusion dependent β-thalassemia and healthy people were analyzed. PCR and Sanger Sequencing methodologies were carried out in our study. The results after genotyping of the samples for the rs2242189, suggest a significant association of rs2242189 with the milder clinical phenotype of the disease, as in the comparison of healthy people and people with non-transfusion dependent β- thalassemia, the p-value was 0.0274. The comparison between healthy people and patients with major β-thalassemia, as well as the comparison between patients with non- transfusion dependent β-thalassemia and patients with major β- thalassemia, showed no statistically significant effect. 2019-09-26T20:00:20Z 2019-09-26T20:00:20Z 2019-06-07 Thesis http://hdl.handle.net/10889/12516 gr 0 application/pdf |
