Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας
Η Φασματοσκοπία Πρωτονίου Μαγνητικού Συντονισμού αποτελεί μια μη επεμβατική διαγνωστική μέθοδο. Η μέθοδος εκμεταλλεύεται το φαινόμενο του πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και της χημικής μετατόπισης, με τη χρήση συστημάτων Μαγνητικού Τομογράφου Υψηλών Πεδίων 1,5Τ ή 3Τ. Η σημαντικότερη διαφορά της,...
Κύριος συγγραφέας: | |
---|---|
Άλλοι συγγραφείς: | |
Μορφή: | Thesis |
Γλώσσα: | Greek |
Έκδοση: |
2019
|
Θέματα: | |
Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/12853 |
id |
nemertes-10889-12853 |
---|---|
record_format |
dspace |
institution |
UPatras |
collection |
Nemertes |
language |
Greek |
topic |
Μαγνητική φασματοσκοπία Magnetic spectroscopy MRS |
spellingShingle |
Μαγνητική φασματοσκοπία Magnetic spectroscopy MRS Μπέκου, Ελένη Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
description |
Η Φασματοσκοπία Πρωτονίου Μαγνητικού Συντονισμού αποτελεί μια μη επεμβατική διαγνωστική μέθοδο. Η μέθοδος εκμεταλλεύεται το φαινόμενο του πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και της χημικής μετατόπισης, με τη χρήση συστημάτων Μαγνητικού Τομογράφου Υψηλών Πεδίων 1,5Τ ή 3Τ.
Η σημαντικότερη διαφορά της, από τις συμβατικές τεχνικές της Μαγνητικής Τομογραφίας είναι η ανάδειξη των βιοχημικών πληροφοριών ενός μαλακού ιστού.
Στην κλινική πράξη, δεν χρησιμοποιείται ακόμη ως κύριο διαγνωστικό εργαλείο καθώς εμφανίζεται ευαίσθητη σε διάφορους παράγοντες. Οι παράγοντες αυτοί μελετούνται εκτενώς στην παρούσα εργασία, για τη βελτιστοποίηση της τεχνικής.
Η τεχνική της Φασματοσκοπίας ξεκινάει με τη λήψη ανατομικών εικόνων που λειτουργούν σαν οδηγό για την τοποθέτηση ενός ή πολλαπλών ογκοστοιχείων στην περιοχή ενδιαφέροντος (SVS, CSI τεχνικές), με τη χρήση ακολουθιών παλμών όπως PRESS ή STEAM. Για τη σωστή λήψη των φασμάτων μια σειρά παραμέτρων πρέπει να ληφθούν υπόψη, όπως η θερμοκρασία και η ανατομική περιοχή. Η θερμοκρασία είναι ένας παράγοντας που προκαλεί μετατόπιση του φάσματος κατά 0,1ppm, λόγω της άμεσης επίδρασης με τους δεσμούς μεταξύ των ηλεκτρονίων και τη χημική μετατόπιση. Ενώ, παράλληλα η θέση και το μέγεθος του ογκοστοιχείου, μπορεί να οδηγήσουν σε λάθος διάγνωση.
Μετά τη λήψη των φασμάτων ακολουθεί η προ-επεξεργασία και η ποσοτικοποίηση. Δύο βήματα που πραγματοποιούνται είτε αυτόματα από το λογισμικό του Μαγνητικού Τομογράφου (όπως FuncTool GE), είτε από λογισμικά πακέτα όπως LCModel, TARQUIN, jMRUI και MRS Analyzer. Τα παραπάνω λογισμικά λόγω διαφορών στα βήματα της προ-επεξεργασίας και της ποσοτικοποίησης δίνουν μεγάλες αποκλίσεις ανάμεσα στα αποτελέσματα τους.
Πιο συγκεκριμένα, το MRS Analyzer διαπιστώθηκε το πιο αξιόπιστο λογισμικό για διαφορική διάγνωση για φάσματα όμως, μονού ογκοστοιχείου(SVS), αναδεικνύοντας την ελάχιστη προ-επεξεργασίας ως αξιόπιστη μέθοδο. Ακολουθεί, το LCModel που λόγω της απόλυτης ποσοτικοποίησης που πραγματοποιεί δίνει ακριβή αποτελέσματα ακόμη και για παραμορφωμένα υψηλού θορύβου φάσματα. Στη συνέχεια, το TARQUIN που παρέχει ομαλότερη γραμμή βάσης και απόλυτη ποσοτικοποίηση για μακρομόρια και λιπίδια χαμηλής συγκέντρωσης. Τέλος, το jMRUI είναι ένα λογισμικό που επιτρέπει στο χρήστη να επιλέξει μέσα πληθώρα βημάτων μετά-επεξεργασίας και αλγορίθμων ποσοτικοποίησης, αυξάνοντας την πιθανότητα συστηματικών σφαλμάτων.
Τέλος, πραγματοποιήθηκε η μελέτη της αξιοπιστίας της Φ.Π.Μ.Σ με ποιοτικούς ελέγχους, όπως αυτοί ορίζονται από διεθνής οργανισμούς. Η έλλειψη ολοκληρωμένων πρωτοκόλλων ποιοτικού ελέγχου της Φασματοσκοπίας καθιστά αναγκαία τη δημιουργία τους. |
author2 |
Τσούγκος, Ιωάννης |
author_facet |
Τσούγκος, Ιωάννης Μπέκου, Ελένη |
format |
Thesis |
author |
Μπέκου, Ελένη |
author_sort |
Μπέκου, Ελένη |
title |
Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
title_short |
Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
title_full |
Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
title_fullStr |
Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
title_full_unstemmed |
Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
title_sort |
ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας |
publishDate |
2019 |
url |
http://hdl.handle.net/10889/12853 |
work_keys_str_mv |
AT mpekouelenē posotikopoiēsētōnmetabolikōncharaktēristikōntouenkephaloukaielenchosmeprotypaomoiōmatamagnētikēsphasmatoskopias AT mpekouelenē quantificationofmetabolicfeaturesandqualitycontrolwithstandardphantominbrain1hmrs |
_version_ |
1771297330907054080 |
spelling |
nemertes-10889-128532022-09-05T20:37:35Z Ποσοτικοποίηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του εγκεφάλου και έλεγχος με πρότυπα ομοιώματα μαγνητικής φασματοσκοπίας Quantification of metabolic features and quality control with standard phantom in brain 1-H MRS Μπέκου, Ελένη Τσούγκος, Ιωάννης Θεοδώρου, Κυριακή Καψαλάκη, Ευτυχία Mpekou, Eleni Μαγνητική φασματοσκοπία Magnetic spectroscopy MRS Η Φασματοσκοπία Πρωτονίου Μαγνητικού Συντονισμού αποτελεί μια μη επεμβατική διαγνωστική μέθοδο. Η μέθοδος εκμεταλλεύεται το φαινόμενο του πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού και της χημικής μετατόπισης, με τη χρήση συστημάτων Μαγνητικού Τομογράφου Υψηλών Πεδίων 1,5Τ ή 3Τ. Η σημαντικότερη διαφορά της, από τις συμβατικές τεχνικές της Μαγνητικής Τομογραφίας είναι η ανάδειξη των βιοχημικών πληροφοριών ενός μαλακού ιστού. Στην κλινική πράξη, δεν χρησιμοποιείται ακόμη ως κύριο διαγνωστικό εργαλείο καθώς εμφανίζεται ευαίσθητη σε διάφορους παράγοντες. Οι παράγοντες αυτοί μελετούνται εκτενώς στην παρούσα εργασία, για τη βελτιστοποίηση της τεχνικής. Η τεχνική της Φασματοσκοπίας ξεκινάει με τη λήψη ανατομικών εικόνων που λειτουργούν σαν οδηγό για την τοποθέτηση ενός ή πολλαπλών ογκοστοιχείων στην περιοχή ενδιαφέροντος (SVS, CSI τεχνικές), με τη χρήση ακολουθιών παλμών όπως PRESS ή STEAM. Για τη σωστή λήψη των φασμάτων μια σειρά παραμέτρων πρέπει να ληφθούν υπόψη, όπως η θερμοκρασία και η ανατομική περιοχή. Η θερμοκρασία είναι ένας παράγοντας που προκαλεί μετατόπιση του φάσματος κατά 0,1ppm, λόγω της άμεσης επίδρασης με τους δεσμούς μεταξύ των ηλεκτρονίων και τη χημική μετατόπιση. Ενώ, παράλληλα η θέση και το μέγεθος του ογκοστοιχείου, μπορεί να οδηγήσουν σε λάθος διάγνωση. Μετά τη λήψη των φασμάτων ακολουθεί η προ-επεξεργασία και η ποσοτικοποίηση. Δύο βήματα που πραγματοποιούνται είτε αυτόματα από το λογισμικό του Μαγνητικού Τομογράφου (όπως FuncTool GE), είτε από λογισμικά πακέτα όπως LCModel, TARQUIN, jMRUI και MRS Analyzer. Τα παραπάνω λογισμικά λόγω διαφορών στα βήματα της προ-επεξεργασίας και της ποσοτικοποίησης δίνουν μεγάλες αποκλίσεις ανάμεσα στα αποτελέσματα τους. Πιο συγκεκριμένα, το MRS Analyzer διαπιστώθηκε το πιο αξιόπιστο λογισμικό για διαφορική διάγνωση για φάσματα όμως, μονού ογκοστοιχείου(SVS), αναδεικνύοντας την ελάχιστη προ-επεξεργασίας ως αξιόπιστη μέθοδο. Ακολουθεί, το LCModel που λόγω της απόλυτης ποσοτικοποίησης που πραγματοποιεί δίνει ακριβή αποτελέσματα ακόμη και για παραμορφωμένα υψηλού θορύβου φάσματα. Στη συνέχεια, το TARQUIN που παρέχει ομαλότερη γραμμή βάσης και απόλυτη ποσοτικοποίηση για μακρομόρια και λιπίδια χαμηλής συγκέντρωσης. Τέλος, το jMRUI είναι ένα λογισμικό που επιτρέπει στο χρήστη να επιλέξει μέσα πληθώρα βημάτων μετά-επεξεργασίας και αλγορίθμων ποσοτικοποίησης, αυξάνοντας την πιθανότητα συστηματικών σφαλμάτων. Τέλος, πραγματοποιήθηκε η μελέτη της αξιοπιστίας της Φ.Π.Μ.Σ με ποιοτικούς ελέγχους, όπως αυτοί ορίζονται από διεθνής οργανισμούς. Η έλλειψη ολοκληρωμένων πρωτοκόλλων ποιοτικού ελέγχου της Φασματοσκοπίας καθιστά αναγκαία τη δημιουργία τους. Magnetic resonance spectroscopy (MRS) is a non-invasive diagnostic tool. MRS relies on two physics phenomena, the nuclear magnetic resonance and the chemical shift, using high fields 1,5T or 3T MRI systems. The major difference between MRS and other MRI techniques is that the former highlights biochemical information related to soft tissues. In clinical practice, MRS isn’t used as a main diagnostic tool due to its sensitivity on few parameters. The aim of the current study is to improve these parameters. To begin with, spectroscopy takes anatomic images, which can guide the placement procedure of a single or multiple voxels on the region of our interest, by using pulses sequences like PRESS or STEAM. Taking into consideration few parameters, for instance temperature and anatomic region, is mandatory, in order to achieve proper spectra. Temperature may shift spectra 0,1ppm, since it affects hydrogen bonds and the chemical shift. In addition, voxel's positioning and size may lead to voxel bleeding, and therefore to a wrong diagnosis. Preprocessing and quantitation of the spectrum follow. These steps can be carried out automatically by MRI workstation or with the assistance of software packages, such as LCModel, TARQUIN, jMRUI and MRS Analyzer. These software packages are based on different pre-processing and quantitation parameters that lead to different results. More specifically, according to our research, MRS Analyzer has been found to be the most reliable single voxel (SVS) spectrum software, indicating the minimum pre-treatment as reliable method for diagnosis. As far as LC Model is concerned, we can conclude that it gives accurate results even for distorted high-noise spectra. Regarding TARQUIN, it provides a smoother baseline and absolute quantification for low-concentration macromolecules and lipids. Finally, jMRUI is software that offers to users various post-processing steps and quantification algorithms to use, increasing failures. To sum up, the current piece of work has investigated the reliability of the MRS, based on quality controls, which have been defined by international organizations. However, the deficiency of the existing MRS quality control protocols, demands a solution 2019-11-30T08:43:42Z 2019-11-30T08:43:42Z 2019-07 Thesis http://hdl.handle.net/10889/12853 gr 0 application/pdf |