Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου

Τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin, τα οποία είναι η Geminin, ο McIdas και ο GemC1 συγκροτούν μια ομάδα παραγόντων, η οποία εμφανίζει αυξημένη συντήρηση λόγω της λειτουργικής επικράτειας του σπειροειδούς σπειράματος, την οποία έχουν κοινή. Μέσω του σπειροειδούς σπειράματος, τα μέλη της υπέρ-ο...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Πετρουλάκη, Βασιλική
Άλλοι συγγραφείς: Λυγερού, Ζωή
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2020
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/13047
id nemertes-10889-13047
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Κυτταρικός κύκλος
Αντιγραφή
Cell cycle
McIdas
GemC1
Replication
DNA
571.84
spellingShingle Κυτταρικός κύκλος
Αντιγραφή
Cell cycle
McIdas
GemC1
Replication
DNA
571.84
Πετρουλάκη, Βασιλική
Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
description Τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin, τα οποία είναι η Geminin, ο McIdas και ο GemC1 συγκροτούν μια ομάδα παραγόντων, η οποία εμφανίζει αυξημένη συντήρηση λόγω της λειτουργικής επικράτειας του σπειροειδούς σπειράματος, την οποία έχουν κοινή. Μέσω του σπειροειδούς σπειράματος, τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin μπορούν να σχηματίζουν ομοδιμερή και ετεροδιμερή μεταξύ τους, με αποτέλεσμα να ασκούν τις πολύπλοκες δράσεις τους. Σύμφωνα με ευρήματα από το εργαστήριό μας και άλλες ερευνητικές ομάδες, τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin εμπλέκονται στα ρυθμιστικά μονοπάτια τα οποία ελέγχουν την ομαλή εξέλιξη του κυτταρικού κύκλου και σε μονοπάτια διαφοροποίησης. Η Geminin ήταν το πρώτο μέλος της υπέρ-οικογένειας το οποίο χαρακτηρίστηκε για το ρόλο του στον κυτταρικό κύκλο. Ταυτοποιήθηκε ως αναστολέας της αντιγραφής του DNA, λόγω της ικανότητάς της να προσδένεται στον αδειοδοτικό παράγοντα Cdt1, με αποτέλεσμα τελικά να αποτρέπει την επαναντιγραφή. Επίσης, η Geminin έχει τη δυνατότητα να αλληλεπιδρά με παράγοντες αναδιαμόρφωσης της χρωματίνης και μεταγραφικούς παράγοντες. Ακόμη, συμμετέχει σε διαδικασίες κυτταρικής διαφοροποίησης. Στη συνέχεια, ανακαλύφθηκαν ο McIdas και ο GemC1 με βάση την ομοιότητα που έχουν με τη Geminin, ιδιαίτερα στην επικράτεια του σπειροειδούς σπειράματος. Όπως και στην περίπτωση της Geminin,τα δύο νεότερα χαρακτηρισμένα μέλη της υπέρ-οικογένειας συσχετίστηκαν με διαδικασίες διαφοροποίησης και του κυτταρικού κύκλου. Όσον αφορά στη διαφοροποίηση, έχει δειχθεί ότι συμμετέχουν ενεργά στο μονοπάτι της γένεσης των πολυκροσσωτών κυττάρων, διότι έχουν την ικανότητα να επάγουν τη μεταγραφική ενεργοποίηση πολλών γονιδίων που εμπλέκονται στο εν λόγω μονοπάτι. Όσον αφορά στην εμπλοκή τους στον κυτταρικό κύκλο, είναι γνωστό ότι ο McIdas είναι απαραίτητος για την πρόοδο του κυτταρικού κύκλου και έχει τη δυνατότητα με την πρόσδεσή του στη Geminin, να αναστέλλει την πρόσδεση της δεύτερης στον αδειοδοτικό παράγοντα Cdt1. Ακόμη, υπάρχουν ενδείξεις σύμφωνα με τις οποίες ο McIdas υπόκειται σε ρύθμιση κατά τη διάρκεια της μίτωσης. Αντίθετα, ο GemC1 εμπλέκεται στο σχηματισμό του προ-εναρκτήριου συμπλόκου της αντιγραφής του DNA. Για τον περεταίρω χαρακτηρισμό των δύο νεότερων μελών της υπέρ-οικογένειας της Geminin κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου, πραγματοποιήθηκε συγκριτική μελέτη της έκφρασης τους, αντιπαραβάλλοντάς τους με άλλους γνωστούς κυτταρικούς ρυθμιστές. Αρχικά, δείχθηκε ότι ο McIdas και ο GemC1 εμφανίζουν μια προτίμηση ως προς τη φάση του κυτταρικού κύκλου στην οποία εκφράζονται. Συγκεκριμένα, ο McIdas εκφράζεται κατά κύριο λόγο στις φάσεις S και G2 του κυτταρικού κύκλου, ενώ ο GemC1 εκφράζεται κυρίως στη G1 φάση του κυτταρικού κύκλου. Κατά τη μίτωση παρατηρούμε και άλλες διαφορές μεταξύ του McIdas και του GemC1, καθώς ο πρώτος υφίσταται ρύθμιση κατά τη μίτωση μέσω του συμπλόκου προώθησης της ανάφασης, το οποίο σηματοδοτεί την πρωτεόλυση του, ενώ ο GemC1 φαίνεται να παραμένει σταθερός στο ίδιο χρονικό διάστημα. Στη συνέχεια, χαρακτηρίζεται το μονοπάτι μέσω του οποίου αναγνωρίζεται ο McIdas από τους συν-ενεργοποιητές του συμπλόκου προώθησης της ανάφασης (Cdc20 και Cdh1), σύμφωνα με το οποίο ο McIdas αναγνωρίζεται τόσο από το Cdc20 όσο και από το Cdh1. Τα παραπάνω ευρήματα δείχνουν ότι ο McIdas και ο GemC1 αποτελούν δύο μόρια με διαφορετικές λειτουργίες στον κυτταρικό κύκλο. Επίσης, τα αποτελέσματα της παρούσας διπλωματικής εργασίας μας φέρνουν πιο κοντά στο χαρακτηρισμό του ρόλου του McIdas και του GemC1 στην πρόοδο του κυτταρικού κύκλου, καθώς η έκφραση και ρύθμιση τους κατά τη διάρκειά του υπέδειξε τα κύρια μονοπάτια με τα οποία συσχετίζονται.
author2 Λυγερού, Ζωή
author_facet Λυγερού, Ζωή
Πετρουλάκη, Βασιλική
format Thesis
author Πετρουλάκη, Βασιλική
author_sort Πετρουλάκη, Βασιλική
title Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
title_short Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
title_full Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
title_fullStr Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
title_full_unstemmed Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
title_sort μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων mcidas και gemc1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου
publishDate 2020
url http://hdl.handle.net/10889/13047
work_keys_str_mv AT petroulakēbasilikē meletētēsekphrasēskaitēsrythmisēstōnparagontōnmcidaskaigemc1katatēdiarkeiatoukyttarikoukyklou
AT petroulakēbasilikē studyoftheexpressionandregulationofthefactormcidasandgemc1throughoutthecellcycle
_version_ 1771297355491966976
spelling nemertes-10889-130472022-09-05T20:44:04Z Μελέτη της έκφρασης και της ρύθμισης των παραγόντων McIdas και GemC1 κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου Study of the expression and regulation of the factor McIdas and GemC1 throughout the cell cycle Πετρουλάκη, Βασιλική Λυγερού, Ζωή Λυγερού, Ζωή Ταραβήρας, Σταύρος Σταθόπουλος, Κωσταντίνος Petroulaki, Vasiliki Κυτταρικός κύκλος Αντιγραφή Cell cycle McIdas GemC1 Replication DNA 571.84 Τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin, τα οποία είναι η Geminin, ο McIdas και ο GemC1 συγκροτούν μια ομάδα παραγόντων, η οποία εμφανίζει αυξημένη συντήρηση λόγω της λειτουργικής επικράτειας του σπειροειδούς σπειράματος, την οποία έχουν κοινή. Μέσω του σπειροειδούς σπειράματος, τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin μπορούν να σχηματίζουν ομοδιμερή και ετεροδιμερή μεταξύ τους, με αποτέλεσμα να ασκούν τις πολύπλοκες δράσεις τους. Σύμφωνα με ευρήματα από το εργαστήριό μας και άλλες ερευνητικές ομάδες, τα μέλη της υπέρ-οικογένειας της Geminin εμπλέκονται στα ρυθμιστικά μονοπάτια τα οποία ελέγχουν την ομαλή εξέλιξη του κυτταρικού κύκλου και σε μονοπάτια διαφοροποίησης. Η Geminin ήταν το πρώτο μέλος της υπέρ-οικογένειας το οποίο χαρακτηρίστηκε για το ρόλο του στον κυτταρικό κύκλο. Ταυτοποιήθηκε ως αναστολέας της αντιγραφής του DNA, λόγω της ικανότητάς της να προσδένεται στον αδειοδοτικό παράγοντα Cdt1, με αποτέλεσμα τελικά να αποτρέπει την επαναντιγραφή. Επίσης, η Geminin έχει τη δυνατότητα να αλληλεπιδρά με παράγοντες αναδιαμόρφωσης της χρωματίνης και μεταγραφικούς παράγοντες. Ακόμη, συμμετέχει σε διαδικασίες κυτταρικής διαφοροποίησης. Στη συνέχεια, ανακαλύφθηκαν ο McIdas και ο GemC1 με βάση την ομοιότητα που έχουν με τη Geminin, ιδιαίτερα στην επικράτεια του σπειροειδούς σπειράματος. Όπως και στην περίπτωση της Geminin,τα δύο νεότερα χαρακτηρισμένα μέλη της υπέρ-οικογένειας συσχετίστηκαν με διαδικασίες διαφοροποίησης και του κυτταρικού κύκλου. Όσον αφορά στη διαφοροποίηση, έχει δειχθεί ότι συμμετέχουν ενεργά στο μονοπάτι της γένεσης των πολυκροσσωτών κυττάρων, διότι έχουν την ικανότητα να επάγουν τη μεταγραφική ενεργοποίηση πολλών γονιδίων που εμπλέκονται στο εν λόγω μονοπάτι. Όσον αφορά στην εμπλοκή τους στον κυτταρικό κύκλο, είναι γνωστό ότι ο McIdas είναι απαραίτητος για την πρόοδο του κυτταρικού κύκλου και έχει τη δυνατότητα με την πρόσδεσή του στη Geminin, να αναστέλλει την πρόσδεση της δεύτερης στον αδειοδοτικό παράγοντα Cdt1. Ακόμη, υπάρχουν ενδείξεις σύμφωνα με τις οποίες ο McIdas υπόκειται σε ρύθμιση κατά τη διάρκεια της μίτωσης. Αντίθετα, ο GemC1 εμπλέκεται στο σχηματισμό του προ-εναρκτήριου συμπλόκου της αντιγραφής του DNA. Για τον περεταίρω χαρακτηρισμό των δύο νεότερων μελών της υπέρ-οικογένειας της Geminin κατά τη διάρκεια του κυτταρικού κύκλου, πραγματοποιήθηκε συγκριτική μελέτη της έκφρασης τους, αντιπαραβάλλοντάς τους με άλλους γνωστούς κυτταρικούς ρυθμιστές. Αρχικά, δείχθηκε ότι ο McIdas και ο GemC1 εμφανίζουν μια προτίμηση ως προς τη φάση του κυτταρικού κύκλου στην οποία εκφράζονται. Συγκεκριμένα, ο McIdas εκφράζεται κατά κύριο λόγο στις φάσεις S και G2 του κυτταρικού κύκλου, ενώ ο GemC1 εκφράζεται κυρίως στη G1 φάση του κυτταρικού κύκλου. Κατά τη μίτωση παρατηρούμε και άλλες διαφορές μεταξύ του McIdas και του GemC1, καθώς ο πρώτος υφίσταται ρύθμιση κατά τη μίτωση μέσω του συμπλόκου προώθησης της ανάφασης, το οποίο σηματοδοτεί την πρωτεόλυση του, ενώ ο GemC1 φαίνεται να παραμένει σταθερός στο ίδιο χρονικό διάστημα. Στη συνέχεια, χαρακτηρίζεται το μονοπάτι μέσω του οποίου αναγνωρίζεται ο McIdas από τους συν-ενεργοποιητές του συμπλόκου προώθησης της ανάφασης (Cdc20 και Cdh1), σύμφωνα με το οποίο ο McIdas αναγνωρίζεται τόσο από το Cdc20 όσο και από το Cdh1. Τα παραπάνω ευρήματα δείχνουν ότι ο McIdas και ο GemC1 αποτελούν δύο μόρια με διαφορετικές λειτουργίες στον κυτταρικό κύκλο. Επίσης, τα αποτελέσματα της παρούσας διπλωματικής εργασίας μας φέρνουν πιο κοντά στο χαρακτηρισμό του ρόλου του McIdas και του GemC1 στην πρόοδο του κυτταρικού κύκλου, καθώς η έκφραση και ρύθμιση τους κατά τη διάρκειά του υπέδειξε τα κύρια μονοπάτια με τα οποία συσχετίζονται. The members of the Geminin superfamily, namely Geminin, McIdas and GemC1 constitute a group of factors that are highly conserved due to their common functional domain, the coiled coil. These factors are able to form homodimers and heterodimers, due to their interaction through their coiled coil domains and therefore are able to manifest their diverse function. According to findings both from our research group and from others, the members of the Geminin superfamily are implicated in pathways that regulate cell cycle progression and differentiation. Geminin was the first member of the superfamily that was characterised for its role in cell cycle progression. Geminin was identified as an inhibitor of DNA replication, due to its ability to bind to the licencing factor Cdt1, thereby preventing re-replication. Also, Geminin is known to associate with chromatin remodeling complexes and transcription factors. In addition to that, Geminin is also implicated in differentiation decisions. Subsequently, the identification of McIdas and GemC1 follows, due to their similarity with Geminin, especially in their coiled coil domains. Similarly to Geminin, McIdas and GemC1 were associated with proliferation and differentiation decisions. In the context of differentiation, McIdas and GemC1 are involved in the multicilliate differentiation pathway by transcriptionally activating key components of the pathway. Regarding their implication in the regulation of cell cycle progression, it has been shown that McIdas is essential for the cell cycle and is able to inhibit the binding of Cdt1 to Geminin, through its interaction with the latter. Furthermore, there is evidence that McIdas’ protein levels are regulated during mitosis. On the contrary, GemC1 has been shown to be implicated in the formation of the pre – initiation complex (pre – IC) during the process of DNA replication. To further characterise the newest members of the Geminin superfamily during cell cycle progression, comparative analysis of their expression was conducted by correlating their expression with that of known cell cycle regulators. First of all, it is shown that McIdas and GemC1 are preferentially expressed in the cell cycle phases. Specifically, McIdas is more abundant during the S and G2 phases of the cell cycle. In contrast, GemC1 is more abundant during the G1 phase of the cell cycle. Furthermore, McIdas and GemC1 display different expression during mitosis. Specifically, McIdas is targeted by the anaphase promoting complex / cyclosome and therefore is regulated. On the contrary, GemC1 levels remain unaltered during this time period. In addition, we investigate the pathway by which McIdas is recognised and targeted for proteolysis from the anaphase promoting complex / cyclosome with the aid of the co- activators Cdc20 and Cdh1. In conclusion, all the above findings suggest that McIdas and GemC1 are two factors with distinct functions in the cell cycle. Also, the data about the expression and the regulation of these two factors during the cell cycle, have advanced our understanding about their core function in cell cycle regulation. 2020-02-06T19:53:58Z 2020-02-06T19:53:58Z 2020-01-08 Thesis http://hdl.handle.net/10889/13047 gr 12 application/pdf