Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR

Το Μετατρεπτικό Ένζυμο της Αγγειοτενσίνης (ACE, E.C. 3. 4. 15. 1) είναι μία μεταλλοπρωτεάση ψευδαργύρου που εμπλέκεται μέσω της καταλυτικής του δράσης στη λειτουργία του συστήματος Ρενίνης-Αγγειοτενσίνης (RAS), το οποίο είναι υπεύθυνο για τη ρύθμιση της αρτηριακής πίεσης. Το ACE καταλύει την υδρό...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Τσάμη, Ναταλία
Άλλοι συγγραφείς: Σπυρούλιας, Γεώργιος
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2009
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/1320
id nemertes-10889-1320
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Μετατρεπτικό ένζυμο αγγειοτενσίνης
Angiotensin converting enzyme
612.015 22
spellingShingle Μετατρεπτικό ένζυμο αγγειοτενσίνης
Angiotensin converting enzyme
612.015 22
Τσάμη, Ναταλία
Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR
description Το Μετατρεπτικό Ένζυμο της Αγγειοτενσίνης (ACE, E.C. 3. 4. 15. 1) είναι μία μεταλλοπρωτεάση ψευδαργύρου που εμπλέκεται μέσω της καταλυτικής του δράσης στη λειτουργία του συστήματος Ρενίνης-Αγγειοτενσίνης (RAS), το οποίο είναι υπεύθυνο για τη ρύθμιση της αρτηριακής πίεσης. Το ACE καταλύει την υδρόλυση του βιολογικά ανενεργού δεκαπεπτιδίου Αγγειοτενσίνη Ι, αποσπώντας τo C-τελικό του διπεπτίδιο, μετατρέποντας το στο βιοδραστικό οκταπεπτίδιο Αγγειοτενσίνη ΙΙ. Η Αγγειοτενσίνη ΙΙ δρα στο αγγειακό σύστημα μέσω της άμεσης συστολής των αγγείων, με αποτέλεσμα την ταχεία αύξηση της αρτηριακής πίεσης. Επιπλέον, το ACE καταλύει και την υδρόλυση του αγγειοδιασταλτικού εννιαπεπτιδίου Βραδυκινίνη προς ανενεργά προϊόντα. Το ACE απαντάται στον ανθρώπινο οργανισμό σε δύο μορφές, το σωματικό και το σπερματικό τύπο. Ο σωματικός τύπος περιλαμβάνει δύο καταλυτικά κέντρα ψευδαργύρου υψηλής ομολογίας (Ν-ενεργό κέντρο και C-ενεργό κέντρο). Ο σπερματικός τύπος ένα καταλυτικό κέντρο ψευδαργύρου (C-ενεργό κέντρο). Στην παρούσα εργασία παρουσιάζεται η NMR διαμορφωτική μελέτη ενός πεπτιδίου 46 αμινοξέων αντιπροσωπευτικού του C-καταλυτικού κέντρου του ACE κατά την αλληλεπίδρασή του με το φυσικό υπόστρωμα Αγγειοτενσίνη Ι και τον αναστολέα Καπτοπρίλη, καθώς και η NMR μελέτη της αλληλεπίδρασης μέσω πειραμάτων τιτλοδότησης με σκοπό την διαπίστωση των φυσικοχημικών παραγόντων που διέπουν την αλληλεπίδραση ACE-Αγγειοτενσίνης Ι και Καπτοπρίλης. Αυτή η μελέτη βασίστηκε στη σύνθεση του πεπτιδίου των 46 αμινοξέων, η οποία έλαβε χώρα στο εργαστήριο Φαρμακογνωσίας & Χημείας Φυσικών Προϊόντων του Τμήματος Φαρμακευτικής του Πανεπιστημίου Πατρών. Ακολούθησε η ταυτοποίηση και αναγνώριση των αμινοξέων μέσω της συνδυασμένης ανάλυσης των 2D 1H-1H TOCSY και NOESY φασμάτων για το ACE σε ελεύθερη κατάσταση, σε σύμπλεξη με τον ψευδάργυρο, σε σύμπλεξη με τον ψευδάργυρο παρουσία Καπτοπρίλης, παρουσία Αγγειοτενσίνης Ι, παρουσία Αγγειοτενσίνης Ι και Καπτοπρίλης, καθώς και για την Αγγειοτενσίνη σε ελεύθερη κατάσταση, κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE και κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE παρουσία Καπτοπρίλης. Επίσης υπολογίστηκαν τα 3D μοντέλα της Αγγειοτενσίνης Ι σε ελεύθερη κατάσταση, κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE, κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE παρουσία Καπτοπρίλης, καθώς και το 3D μοντέλο του ACE κατά την αληλεπίδρασή του με την Αγγειοτενσίνη Ι. Τέλος, πραγματοποιήθηκε ανάλυση της διαταραχής των χημικών μετατοπίσεων. Τα αποτελέσματα της παρούσας μελέτης παρέχουν χρήσιμες πληροφορίες για τα αμινοξέα, τα οποία επηρεάζονται περισσότερο κατά την αλληλεπίδραση του C- καταλυτικού κέντρου του ACE και τα οποία πιθανότατα διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στον προσανατολισμό και τη δέσμευση είτε του αναστολέα Καπτοπρίλη είτε του φυσικού υποστρώματος Αγγειοτενσίνη Ι. Επομένως, θα μπορούσαν να αξιοποιηθούν στο σχεδιασμό νέων υποκαταστατών με ισχυρή συγγένεια δέσμευσης.
author2 Σπυρούλιας, Γεώργιος
author_facet Σπυρούλιας, Γεώργιος
Τσάμη, Ναταλία
format Thesis
author Τσάμη, Ναταλία
author_sort Τσάμη, Ναταλία
title Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR
title_short Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR
title_full Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR
title_fullStr Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR
title_full_unstemmed Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR
title_sort μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη ι μέσω φασματοσκοπίας nmr
publishDate 2009
url http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/1320
work_keys_str_mv AT tsamēnatalia meletētēsallēlepidrasēstoukatalytikoukentroutoumetatreptikouenzymoutēsangeiotensinēsmetophysikoypostrōmaangeiotensinēimesōphasmatoskopiasnmr
_version_ 1771297365417787392
spelling nemertes-10889-13202022-09-06T05:13:17Z Μελέτη της αλληλεπίδρασης του καταλυτικού κέντρου του μετατρεπτικού ενζύμου της αγγειοτενσίνης με το φυσικό υπόστρωμα αγγειοτενσίνη Ι μέσω φασματοσκοπίας NMR Τσάμη, Ναταλία Σπυρούλιας, Γεώργιος Κορδοπάτης, Παύλος Μάνεση-Ζούπα, Έβη Σπυρούλιας, Γεώργιος Tsami, Natalia Μετατρεπτικό ένζυμο αγγειοτενσίνης Angiotensin converting enzyme 612.015 22 Το Μετατρεπτικό Ένζυμο της Αγγειοτενσίνης (ACE, E.C. 3. 4. 15. 1) είναι μία μεταλλοπρωτεάση ψευδαργύρου που εμπλέκεται μέσω της καταλυτικής του δράσης στη λειτουργία του συστήματος Ρενίνης-Αγγειοτενσίνης (RAS), το οποίο είναι υπεύθυνο για τη ρύθμιση της αρτηριακής πίεσης. Το ACE καταλύει την υδρόλυση του βιολογικά ανενεργού δεκαπεπτιδίου Αγγειοτενσίνη Ι, αποσπώντας τo C-τελικό του διπεπτίδιο, μετατρέποντας το στο βιοδραστικό οκταπεπτίδιο Αγγειοτενσίνη ΙΙ. Η Αγγειοτενσίνη ΙΙ δρα στο αγγειακό σύστημα μέσω της άμεσης συστολής των αγγείων, με αποτέλεσμα την ταχεία αύξηση της αρτηριακής πίεσης. Επιπλέον, το ACE καταλύει και την υδρόλυση του αγγειοδιασταλτικού εννιαπεπτιδίου Βραδυκινίνη προς ανενεργά προϊόντα. Το ACE απαντάται στον ανθρώπινο οργανισμό σε δύο μορφές, το σωματικό και το σπερματικό τύπο. Ο σωματικός τύπος περιλαμβάνει δύο καταλυτικά κέντρα ψευδαργύρου υψηλής ομολογίας (Ν-ενεργό κέντρο και C-ενεργό κέντρο). Ο σπερματικός τύπος ένα καταλυτικό κέντρο ψευδαργύρου (C-ενεργό κέντρο). Στην παρούσα εργασία παρουσιάζεται η NMR διαμορφωτική μελέτη ενός πεπτιδίου 46 αμινοξέων αντιπροσωπευτικού του C-καταλυτικού κέντρου του ACE κατά την αλληλεπίδρασή του με το φυσικό υπόστρωμα Αγγειοτενσίνη Ι και τον αναστολέα Καπτοπρίλη, καθώς και η NMR μελέτη της αλληλεπίδρασης μέσω πειραμάτων τιτλοδότησης με σκοπό την διαπίστωση των φυσικοχημικών παραγόντων που διέπουν την αλληλεπίδραση ACE-Αγγειοτενσίνης Ι και Καπτοπρίλης. Αυτή η μελέτη βασίστηκε στη σύνθεση του πεπτιδίου των 46 αμινοξέων, η οποία έλαβε χώρα στο εργαστήριο Φαρμακογνωσίας & Χημείας Φυσικών Προϊόντων του Τμήματος Φαρμακευτικής του Πανεπιστημίου Πατρών. Ακολούθησε η ταυτοποίηση και αναγνώριση των αμινοξέων μέσω της συνδυασμένης ανάλυσης των 2D 1H-1H TOCSY και NOESY φασμάτων για το ACE σε ελεύθερη κατάσταση, σε σύμπλεξη με τον ψευδάργυρο, σε σύμπλεξη με τον ψευδάργυρο παρουσία Καπτοπρίλης, παρουσία Αγγειοτενσίνης Ι, παρουσία Αγγειοτενσίνης Ι και Καπτοπρίλης, καθώς και για την Αγγειοτενσίνη σε ελεύθερη κατάσταση, κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE και κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE παρουσία Καπτοπρίλης. Επίσης υπολογίστηκαν τα 3D μοντέλα της Αγγειοτενσίνης Ι σε ελεύθερη κατάσταση, κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE, κατά την αλληλεπίδρασή της με το ACE παρουσία Καπτοπρίλης, καθώς και το 3D μοντέλο του ACE κατά την αληλεπίδρασή του με την Αγγειοτενσίνη Ι. Τέλος, πραγματοποιήθηκε ανάλυση της διαταραχής των χημικών μετατοπίσεων. Τα αποτελέσματα της παρούσας μελέτης παρέχουν χρήσιμες πληροφορίες για τα αμινοξέα, τα οποία επηρεάζονται περισσότερο κατά την αλληλεπίδραση του C- καταλυτικού κέντρου του ACE και τα οποία πιθανότατα διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στον προσανατολισμό και τη δέσμευση είτε του αναστολέα Καπτοπρίλη είτε του φυσικού υποστρώματος Αγγειοτενσίνη Ι. Επομένως, θα μπορούσαν να αξιοποιηθούν στο σχεδιασμό νέων υποκαταστατών με ισχυρή συγγένεια δέσμευσης. Angiotensin Converting Enzyme (ACE, E.C. 3. 4. 15. 1) is a zinc metalloprotease that is involved in the function of the Renin-Angiotensin System (RAS). The RAS system is responsible for the modulation of arterial blood pressure. ACE catalyzes the hydrolysis of the biologically inactive decapeptide Angiotensin I, by cleaving its C-terminal dipeptide converting it into the bioactive octapeptide Angiotensin II. Angiotensin II acts at the vessel system through the immediate contraction of blood vessels resulting into the rapid increase of arterial blood pressure. Furthermore, ACE catalyzes the hydrolysis of the vasodilator nonapeptide Bradykinin into non active products. ACE exists in the human organism in two isoforms. These are the somatic form and the testicular form. The first one contains two catalytic sites of high homology (Ncatalytic site and C-catalytic site). The second contains one catalytic site (C-catalytic site). The present dissertation reports the NMR conformational study of a 46 aminoacids peptide, which is representative of the C-catalytic site of ACE during its interaction with the natural substrate Angiotensin I and the inhibitor Captopril. It also presents the NMR study of the interaction by titration experiments in order to ascertain the physicochemical factors which govern the interaction between ACE-Angiotensin I and Captopril. This study is based on the synthesis of the 46 aminoacids peptide, which took place in the laboratory of Pharmacognosy & Chemistry of Natural Products at the Department of Pharmacy at the University of Patras. The following step of the dissertation is the assignment and identification of the aminoacids through combined analysis of the 2D 1H-1H TOCSY and NOESY spectrums of ACE in its free state, during its interaction with the zinc metal, during its interaction with the zinc metal in the presence of Captopril, in the presence of Angiotensin I, in the presence of both Angiotensin I and Captopril and also of Angiotensin I in its free state, during its interaction with ACE and during its interaction with ACE in the presence of Captopril. Moreover, the 3D models of Angiotensin I in its free state, during its interaction with ACE and during its interaction with ACE in the presence of Captopril are calculated, as well as the 3D model of ACE during its interaction with Angiotensin I. Finally, analysis of chemical shift perturbation is conducted. The results of this study provide useful information for aminoacids which are influenced the most during the interaction of the C-catalytic site of ACE and are possibly of crucial importance for the orientation and binding of either the inhibitor Captopril or the natural substrate Angiotensin I. As a result, all the above can be exploited in order to design new ligands with high binding affinity. 2009-02-09T08:55:14Z 2009-02-09T08:55:14Z 2008-10-31 2009-02-09T08:55:14Z Thesis http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/1320 gr Η ΒΥΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της 0 application/pdf