| Περίληψη: | Το αδενοκαρκίνωμα (LUADC) αποτελεί περίπου το 30% των καρκίνων του πνεύμονα. Ανήκει στην κατηγορία του μη μικροκυτταρικού τύπου καρκινώματος, το οποίο χαρακτηρίζεται από σχετικά μεγάλη συχνότητα μετάστασης και από την αρχικώς καλή απάντηση στη χημειοθεραπεία. Στην εμφάνιση του καρκίνου σημαντικό ρόλο διαδραματίζει η απορρύθμιση της επικοινωνίας του κυττάρου με τον εξωκυττάριο χώρο. Ορισμένες σημαντικές πρωτεΐνες που επηρεάζουν αυτήν την επικοινωνία στο αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα είναι η ILK (Integrin Linked Kinase), η PARVIN και η PINCH. Οι τρεις αυτές πρωτεΐνες αποτελούν ένα ετεροτριμερές σύμπλοκο, το ΙΡΡ, το οποίο εδράζεται στις εστιακές συνδέσεις, τα οποία αποτελούν μεγάλα μακρομοριακά συγκροτήματα μέσω των οποίων μεταδίδονται μηχανικά σήματα «δύναμης» και ρύθμισης μεταξύ της εξωκυττάριας μήτρας και του αλληλοεπιδρώντος κυττάρου. Η ILK ενώνεται με μια ιντεγκρίνη, έναν διαμεμβρανικό υποδοχέα, σημαντικό για την φυσιολογική μεταγωγή σήματος από τον εξωκυττάριο χώρο προς τον ενδοκυττάριο. Η ιντεγκρίνη ωστόσο δεν διαθέτει ενδογενή ενζυμική δραστηριότητα, επομένως για την ενεργοποίηση της είναι απαραίτητη η ILK. H PARVIN είναι σημαντική καθώς ενώνεται με τον κυτταροσκελετό και η PINCH γιατί δεσμεύει την πρωτεΐνη καταστολέα Rsu1. Οι παραπάνω πρωτεΐνες εμπλέκονται σε βασικές κυτταρικές διεργασίες όπως κυτταρική προσκόλληση, εξάπλωση, πολλαπλασιασμό κ.α. Από προηγούμενες μελέτες γνωρίζουμε πως η ILK υπερεκφράζεται στο μη μικροκυτταρικό καρκίνωμα του πνεύμονα, προάγει την διήθηση και την επιθετική βιολογική συμπεριφορά καθώς και το ότι συσχετίζεται με δυσμενείς προγνωστικούς παράγοντες. Από τις μεταλλάξεις που σχετίζονται με το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα, κυρίως θα εστιάσουμε στην KRAS μετάλλαξη, η οποία γίνεται στο ογκογονίδιο KRAS και οδηγεί σε ανεξέλεγκτο κυτταρικό πολλαπλασιασμό. Είναι γνωστό πως υπάρχει μια αμφίδρομη ρυθμιστική σχέση μεταξύ της ILK και της εν λόγω μετάλλαξης. Η σχέση αυτή διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην εκδήλωση των ογκογόνων δράσεων του KRAS στον καρκίνο του παγκρέατος. Επίσης, η Rsu1 καταστέλλει την ογκογόνο δράση του KRAS και ρυθμίζει μέσω του ΙΡΡ την κυτταρική προσκόλληση και μετανάστευση. Παρά τα υπάρχοντα δεδομένα, ο ρόλος της σηματοδότησης από την ILK στην βιολογία των KRAS μεταλλαγμένων καρκινωμάτων πνεύμονα δεν είναι γνωστός. Στην παρούσα διπλωματική εργασία θα αναλυθούν δεδομένα από ελεύθερες βάσεις δεδομένων, όπως η Gene Expression Omnibus, με κατάλληλα εργαλεία βιοπληροφορικής προκειμένου να διερευνηθεί η σημασία των υπό μελέτη πρωτεϊνών. Οι πρωτεΐνες της οικογένειας των τενσινών και τα μέλη του συμπλόκου ΙΡΡ προέκυψαν ως τα πιο σημαντικά και ειδικότερα στα δείγματα με KRAS μεταλλάξεις. Οι πιο κοινές βιολογικές λειτουργίες, σχετικές με τις εστιακές συνδέσεις, που προέκυψαν ειδικά όταν τα δείγματα LUADC συγκρίθηκαν με φυσιολογικά, αφορούσαν την κυτταρική προσκόλληση, το εξωκυττάριο χώρο και τη πρωτεϊνική φωσφορυλίωση. Οι πρωτεΐνες των εστιακών συνδέσεων, ειδικότερα οι τενσίνες και τα μέλη του ΙΡΡ ενέχονται στην εξέλιξη των καρκινωμάτων LUADC με μετάλλαξη KRAS και αποτελούν ελπιδοφόρους θεραπευτικούς στόχους.
|
|---|
