Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων
Τα τελευταία χρόνια ο κλάδος της επιστήμης της Βιοπληροφορικής γνωρίζει ιδιαίτερη ανάπτυξη, με ορόσημο το πρόγραμμα του ανθρώπινου γονιδιώματος (human genome project), το οποίο ως στόχο είχε την απόκτηση βασικών πληροφοριών που αφορούν το γενετικό μας υπόστρωμα και την ανάλυση και σύνθεση των πληροφ...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2020
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/13330 |
| id |
nemertes-10889-13330 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-133302022-09-05T05:00:36Z Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων Τζαννής, Παναγιώτης Μακρής, Χρήστος Σιούτας, Σπυρίδων Κουτσομητρόπουλος, Δημήτριος Tzannis, Panagiotis Διάσταση Γονίδια Ταξινομητής Bioinformatics Human genome project Τα τελευταία χρόνια ο κλάδος της επιστήμης της Βιοπληροφορικής γνωρίζει ιδιαίτερη ανάπτυξη, με ορόσημο το πρόγραμμα του ανθρώπινου γονιδιώματος (human genome project), το οποίο ως στόχο είχε την απόκτηση βασικών πληροφοριών που αφορούν το γενετικό μας υπόστρωμα και την ανάλυση και σύνθεση των πληροφοριών αυτών για πληρέστερη κατανόηση του ρόλου των διαφόρων γονιδίων στη διατήρηση της υγείας και στη δημιουργία γενετικών νόσων. Ως αποτέλεσμα των ερευνών πάνω στην καταγραφή και την αποκρυπτογράφηση του γονιδιώματος των οργανισμών, ο όγκος των προς επεξεργασία δεδομένων που προκύπτουν έχει αυξηθεί σημαντικά και αναμένεται να πολλαπλασιάζεται τα επόμενα χρόνια. Έτσι, καθίσταται αναγκαία η έρευνα σε τεχνικές επεξεργασίας και διαχείρισης των δεδομένων αυτών που ως στόχο έχουν την μείωση της διαστατικότητάς τους. Η παρούσα διπλωματική εργασία ακολουθεί αυτή την κατεύθυνση και χωρίζεται σε δύο μέρη. Το πρώτο μέρος είναι βιβλιογραφικό και ασχολείται με την ανασκόπηση της ερευνητικής περιοχής και την θεωρητική τεκμηρίωση των γενικότερων τεχνικών μείωσης διαστατικότητας, σε δεδομένα μεγάλου όγκου που προκύπτουν από τεχνικές DNA ακολουθιών. Το δεύτερο πειραματικό τμήμα, επιχειρεί την συγκριτική μελέτη 4 αλγορίθμων μείωσης της διάστασης σε προβλήματα ταξινόμησης. In recent years, Bioinformatics has witnessed a significant development, with a milestone in the «human genome project», which aimed at acquiring basic information about our genetic background and analyzing and synthesizing this information for a fuller understanding of the role of different genes in maintaining health and genetic disease. As a result of research on organism genome registration and decryption, the volume of data to be processed has increased significantly and is expected to multiply in the coming years. Thus, it is necessary to research techniques for the processing and management of such data with the aim of reducing their dimensionality. The present thesis moves in this direction and is divided into two parts. The first part is bibliographical and deals with the review of the research area and the theoretical documentation of the most general dimensionality reduction techniques, in large volume data derived from DNA sequencing techniques. The second experimental section attempts to confirm the performance of dimensionality reduction techniques on well – known classifiers. 2020-03-13T21:35:20Z 2020-03-13T21:35:20Z 2020-02-04 Thesis http://hdl.handle.net/10889/13330 gr 0 application/pdf text/plain |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Διάσταση Γονίδια Ταξινομητής Bioinformatics Human genome project |
| spellingShingle |
Διάσταση Γονίδια Ταξινομητής Bioinformatics Human genome project Τζαννής, Παναγιώτης Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| description |
Τα τελευταία χρόνια ο κλάδος της επιστήμης της Βιοπληροφορικής γνωρίζει ιδιαίτερη ανάπτυξη, με ορόσημο το πρόγραμμα του ανθρώπινου γονιδιώματος (human genome project), το οποίο ως στόχο είχε την απόκτηση βασικών πληροφοριών που αφορούν το γενετικό μας υπόστρωμα και την ανάλυση και σύνθεση των πληροφοριών αυτών για πληρέστερη κατανόηση του ρόλου των διαφόρων γονιδίων στη διατήρηση της υγείας και στη δημιουργία γενετικών νόσων.
Ως αποτέλεσμα των ερευνών πάνω στην καταγραφή και την αποκρυπτογράφηση του γονιδιώματος των οργανισμών, ο όγκος των προς επεξεργασία δεδομένων που προκύπτουν έχει αυξηθεί σημαντικά και αναμένεται να πολλαπλασιάζεται τα επόμενα χρόνια. Έτσι, καθίσταται αναγκαία η έρευνα σε τεχνικές επεξεργασίας και διαχείρισης των δεδομένων αυτών που ως στόχο έχουν την μείωση της διαστατικότητάς τους.
Η παρούσα διπλωματική εργασία ακολουθεί αυτή την κατεύθυνση και χωρίζεται σε δύο μέρη. Το πρώτο μέρος είναι βιβλιογραφικό και ασχολείται με την ανασκόπηση της ερευνητικής περιοχής και την θεωρητική τεκμηρίωση των γενικότερων τεχνικών μείωσης διαστατικότητας, σε δεδομένα μεγάλου όγκου που προκύπτουν από τεχνικές DNA ακολουθιών. Το δεύτερο πειραματικό τμήμα, επιχειρεί την συγκριτική μελέτη 4 αλγορίθμων μείωσης της διάστασης σε προβλήματα ταξινόμησης. |
| author2 |
Μακρής, Χρήστος |
| author_facet |
Μακρής, Χρήστος Τζαννής, Παναγιώτης |
| format |
Thesis |
| author |
Τζαννής, Παναγιώτης |
| author_sort |
Τζαννής, Παναγιώτης |
| title |
Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| title_short |
Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| title_full |
Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| title_fullStr |
Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| title_full_unstemmed |
Τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| title_sort |
τεχνικές μείωσης διαστάσεων σε δεδομένα γονιδιακών εκφράσεων |
| publishDate |
2020 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/13330 |
| work_keys_str_mv |
AT tzannēspanagiōtēs technikesmeiōsēsdiastaseōnsededomenagonidiakōnekphraseōn |
| _version_ |
1771297141479702528 |
