Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας

Η K. pneumoniae ανήκει στην οικογένεια των Εντεροβακτηριοειδών. Τα τελευταία χρόνια, η πολυαντοχή των στελεχών K. pneumoniae ιδιαίτερα των ανθεκτικών και στις καρβαπενέμες, δημιουργεί δυσκολίες στην θεραπεία των λοιμώξεων που προκαλούν. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η μελέτη των βακτηριαιμιών α...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Λαμπροπούλου, Αναστασία
Άλλοι συγγραφείς: Χριστοφίδου, Μυρτώ
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2020
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/13499
id nemertes-10889-13499
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Βακτηριαιμίες
Γονίδια αντοχής
Κλωνική διασπορά
K. pneumoniae
Blood-stream infection
Ulti resistance
Clonal spread
spellingShingle Βακτηριαιμίες
Γονίδια αντοχής
Κλωνική διασπορά
K. pneumoniae
Blood-stream infection
Ulti resistance
Clonal spread
Λαμπροπούλου, Αναστασία
Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
description Η K. pneumoniae ανήκει στην οικογένεια των Εντεροβακτηριοειδών. Τα τελευταία χρόνια, η πολυαντοχή των στελεχών K. pneumoniae ιδιαίτερα των ανθεκτικών και στις καρβαπενέμες, δημιουργεί δυσκολίες στην θεραπεία των λοιμώξεων που προκαλούν. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η μελέτη των βακτηριαιμιών από K. pneumoniae σε νοσομειακούς ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια της διετίας 2016- 2017. Στα πλαίσια της διετούς μελέτης, πραγματοποιήθηκε φαινοτυπικός έλεγχος των 213 στελεχών K. pneumoniae (ένα στέλεχος ανά ασθενή) από αιματοκαλλιέργειες, με βιοχημική τυποποίηση και αντιβιόγραμμα για τον έλεγχο ευαισθησίας τους σε διαφορετικές ομάδες αντιμικροβιακών (β- λακταμικά, αμινογλυκοσίδες, κινολόνες, σουλφοναμίδες). Τα στελέχη που παρουσίαζαν αντοχή στην ιμιπενέμη ελέγχθηκαν για την παραγωγή β- λακταμασών. Ο έλεγχος της παραγωγής ESBL β- λακταμάσης έγινε με τη μέθοδο συνέργειας των δίσκων ενώ των καρβαπενεμασών με τη χρήση του Hodge test. Στη συνέχεια, ο φαινοτυπικός έλεγχος παραγωγής ΜΒL και KPC καρβαπενεμασών πραγματοποιήθηκε με τη χρήση δίσκων μεροπεμένης και ειδικών αναστολέων EDTA και boronic acid αντίστοιχα. Ακολούθησε γονιδιακός έλεγχος (PCR) και ηλεκτροφόρηση σε γέλη αγαρόζης του DNA των στελεχών K. pneumoniae που παράγουν καρβαπενεμάσες για την ανίχνευση των γονιδίων αντοχής blaVIM. blaKPC και blaNDM. Τέλος, αντιπροσωπευτικό δείγμα των στελεχών που παράγουν καρβαπενεμάσες, ελέγχθηκαν περαιτέρω επιδημιολογικά με PFGE προκειμένου να καθοριστεί σε ποιους κλώνους ανήκουν τα υπό μελέτη στελέχη. Μεταξύ των 213 στελεχών που διερευνήθηκαν, το μεγαλύτερο ποσοστό απομονώθηκε από ασθενείς που νοσηλεύονταν στις Παθολογικές κλινικές (45%) και τη ΜΕΘ (30%) και αφορούσε περισσότερους άρρενες ασθενείς (63%) (p<0,05). Επιπλέον, το 82% των στελεχών παρουσίαζε αντοχή σε όλα τα β- λακταμικά αντιμικροβιακά και το 76% στην ιμιπενέμη. Από το σύνολο των 213 στελεχών, το 34% παρήγαγε ESBL β- λακταμάσες. Τα μεγαλύτερα ποσοστά τόσο των KPC K. pneumoniae όσο και των MBL στελεχών απομονώνονται από τις Παθολογικές κλινικές (41%, 42%) και τη ΜΕΘ (39%, 42%) αντίστοιχα. Μεταξύ των 20 MBL στελεχών K. pneumoniae, επικρατούν αυτά που φέρουν το blaNDM γονίδιο (90%) ενώ τα στελέχη που φέρουν blaKPC γονίδιο φαίνεται να είναι σημαντικά περισσότερα των υπολοίπων και στα δύο έτη (87%) (p<0,05). Η PFGE ηλεκτροφόρηση ανέδειξε την ύπαρξη τριών κύριων κλώνων (Α, Β, C) και την εμφάνιση κάποιων νέων (NEW). Από τα 65 στελέχη που ελέγχθηκαν με PFGE, τα 33 (51%) ανήκουν στον κλώνο A, τα 20 (31%) στον κλώνο B, τα 6 (9%) στον κλώνο C και 6 (9%) σε νέους κλώνους. Στις παθολογικές κλινικές, στις χειρουργικές και τη ΜΕΝΝ φαίνεται να επικρατεί ο κλώνος Α, 68%, 50% και 83% αντίστοιχα ενώ ο κλώνος Β επικρατεί στη ΜΕΘ (65%) και ακολουθεί ο κλώνος Α (20%). Από τα αποτελέσματα της μελέτης διαπιστώνεται η επικράτηση των πολυανθεκτικών στελεχών K. pneumoniae και η ευρεία κλωνική εξάπλωση τους σε όλες τις κλινικές του Νοσοκομείου. Ο έλεγχος αυτού του φαινομένου μπορεί να επιτευχθεί με την εφαρμογή μέτρων προφύλαξης (υγιεινή χεριών, απολύμανση περιβάλλοντος των ασθενών, απομόνωση των ασθενών ή ομαδοποίησης αυτών [(cohorting), σωστή αναλογία νοσηλευτικού προσωπικού- ασθενών)] και με πλέον ορθολογική χρήση των καρβαπενεμών και των νεότερων αντιμικροβιακών.
author2 Χριστοφίδου, Μυρτώ
author_facet Χριστοφίδου, Μυρτώ
Λαμπροπούλου, Αναστασία
format Thesis
author Λαμπροπούλου, Αναστασία
author_sort Λαμπροπούλου, Αναστασία
title Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
title_short Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
title_full Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
title_fullStr Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
title_full_unstemmed Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
title_sort εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του πγνπ κατά τη διάρκεια μιας διετίας
publishDate 2020
url http://hdl.handle.net/10889/13499
work_keys_str_mv AT lampropoulouanastasia ergastēriakēmeletēperiptōseōnbaktēriaimiasapoklebsiellapneumoniaeseastheneistoupgnpkatatēdiarkeiamiasdietias
_version_ 1771297277090988032
spelling nemertes-10889-134992022-09-05T20:33:14Z Εργαστηριακή μελέτη περιπτώσεων βακτηριαιμίας από Klebsiella pneumoniae σε ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια μιας διετίας Λαμπροπούλου, Αναστασία Χριστοφίδου, Μυρτώ Χριστοφίδου, Μυρτώ Σπηλιοπούλου, Ίρις Γελαστοπούλου, Ελένη Lampropoulou, Anastasia Βακτηριαιμίες Γονίδια αντοχής Κλωνική διασπορά K. pneumoniae Blood-stream infection Ulti resistance Clonal spread Η K. pneumoniae ανήκει στην οικογένεια των Εντεροβακτηριοειδών. Τα τελευταία χρόνια, η πολυαντοχή των στελεχών K. pneumoniae ιδιαίτερα των ανθεκτικών και στις καρβαπενέμες, δημιουργεί δυσκολίες στην θεραπεία των λοιμώξεων που προκαλούν. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η μελέτη των βακτηριαιμιών από K. pneumoniae σε νοσομειακούς ασθενείς του ΠΓΝΠ κατά τη διάρκεια της διετίας 2016- 2017. Στα πλαίσια της διετούς μελέτης, πραγματοποιήθηκε φαινοτυπικός έλεγχος των 213 στελεχών K. pneumoniae (ένα στέλεχος ανά ασθενή) από αιματοκαλλιέργειες, με βιοχημική τυποποίηση και αντιβιόγραμμα για τον έλεγχο ευαισθησίας τους σε διαφορετικές ομάδες αντιμικροβιακών (β- λακταμικά, αμινογλυκοσίδες, κινολόνες, σουλφοναμίδες). Τα στελέχη που παρουσίαζαν αντοχή στην ιμιπενέμη ελέγχθηκαν για την παραγωγή β- λακταμασών. Ο έλεγχος της παραγωγής ESBL β- λακταμάσης έγινε με τη μέθοδο συνέργειας των δίσκων ενώ των καρβαπενεμασών με τη χρήση του Hodge test. Στη συνέχεια, ο φαινοτυπικός έλεγχος παραγωγής ΜΒL και KPC καρβαπενεμασών πραγματοποιήθηκε με τη χρήση δίσκων μεροπεμένης και ειδικών αναστολέων EDTA και boronic acid αντίστοιχα. Ακολούθησε γονιδιακός έλεγχος (PCR) και ηλεκτροφόρηση σε γέλη αγαρόζης του DNA των στελεχών K. pneumoniae που παράγουν καρβαπενεμάσες για την ανίχνευση των γονιδίων αντοχής blaVIM. blaKPC και blaNDM. Τέλος, αντιπροσωπευτικό δείγμα των στελεχών που παράγουν καρβαπενεμάσες, ελέγχθηκαν περαιτέρω επιδημιολογικά με PFGE προκειμένου να καθοριστεί σε ποιους κλώνους ανήκουν τα υπό μελέτη στελέχη. Μεταξύ των 213 στελεχών που διερευνήθηκαν, το μεγαλύτερο ποσοστό απομονώθηκε από ασθενείς που νοσηλεύονταν στις Παθολογικές κλινικές (45%) και τη ΜΕΘ (30%) και αφορούσε περισσότερους άρρενες ασθενείς (63%) (p<0,05). Επιπλέον, το 82% των στελεχών παρουσίαζε αντοχή σε όλα τα β- λακταμικά αντιμικροβιακά και το 76% στην ιμιπενέμη. Από το σύνολο των 213 στελεχών, το 34% παρήγαγε ESBL β- λακταμάσες. Τα μεγαλύτερα ποσοστά τόσο των KPC K. pneumoniae όσο και των MBL στελεχών απομονώνονται από τις Παθολογικές κλινικές (41%, 42%) και τη ΜΕΘ (39%, 42%) αντίστοιχα. Μεταξύ των 20 MBL στελεχών K. pneumoniae, επικρατούν αυτά που φέρουν το blaNDM γονίδιο (90%) ενώ τα στελέχη που φέρουν blaKPC γονίδιο φαίνεται να είναι σημαντικά περισσότερα των υπολοίπων και στα δύο έτη (87%) (p<0,05). Η PFGE ηλεκτροφόρηση ανέδειξε την ύπαρξη τριών κύριων κλώνων (Α, Β, C) και την εμφάνιση κάποιων νέων (NEW). Από τα 65 στελέχη που ελέγχθηκαν με PFGE, τα 33 (51%) ανήκουν στον κλώνο A, τα 20 (31%) στον κλώνο B, τα 6 (9%) στον κλώνο C και 6 (9%) σε νέους κλώνους. Στις παθολογικές κλινικές, στις χειρουργικές και τη ΜΕΝΝ φαίνεται να επικρατεί ο κλώνος Α, 68%, 50% και 83% αντίστοιχα ενώ ο κλώνος Β επικρατεί στη ΜΕΘ (65%) και ακολουθεί ο κλώνος Α (20%). Από τα αποτελέσματα της μελέτης διαπιστώνεται η επικράτηση των πολυανθεκτικών στελεχών K. pneumoniae και η ευρεία κλωνική εξάπλωση τους σε όλες τις κλινικές του Νοσοκομείου. Ο έλεγχος αυτού του φαινομένου μπορεί να επιτευχθεί με την εφαρμογή μέτρων προφύλαξης (υγιεινή χεριών, απολύμανση περιβάλλοντος των ασθενών, απομόνωση των ασθενών ή ομαδοποίησης αυτών [(cohorting), σωστή αναλογία νοσηλευτικού προσωπικού- ασθενών)] και με πλέον ορθολογική χρήση των καρβαπενεμών και των νεότερων αντιμικροβιακών. Klebsiella pneumoniae is a Gram-negative bacterium of the Enterobacterales family. Over recent years, the multi-resistance of carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates has created serious problems to the treatment of infected patients. In this study, K. pneumoniae isolates causing blood-stream infections (BSIs) in patients hospitalized in the University Hospital of Patras during two years (2016- 2017) were investigated. In the 2-year period, 213 isolates from blood cultures (one per patient) were identified and the antibiotic susceptibility was performed against β-lactams, aminoglycosides, fluoroquinolones and sulphonamides. The imipenem-resistant isolates were tested for beta-lactamases’ production. ESBL production was tested by the synergy disks’ method and the carbapenemases’ production by the Hodge test. The phenotypic testing of KPC and MBL was verified by the use of meropenem disk and specific inhibitors (Boronic acid and EDTA). PCR investigation indicated the presence of blaVIM. blaKPC και blaNDM genes. The classification of carbapenem-resistant isolates into clones was performed by PFGE. In a total of 213 K. pneumoniae isolates causing BSIs were more commonly recovered from men (63%) hospitalized at the Internal Medicine Department (IMD) (45%) followed by the Intensive Care Unit (ICU) (30%) (p<0,05). Moreover, high resistant rates (82%) to beta-lactams and to imipenem (76%) were detected. Among the 213 K. pneumoniae isolates, 72 (34%) were ESBL-producing. The majority of KPC- and MBL -producing K. pneumoniae isolates, was isolated from the IMD (41%, 42%) and the ICU (39%, 42%) respectively. Moreover, among the 20 MBL-producing isolates, 18 (90%) carried blaNDM gene whereas, the blaKPC seems to predominate (87%) in the 2-year period (p<0,05). PFGE of 65 representative K. pneumoniae revealed three main types and some new ones. Thirty three of them (51%) belonged to clone A, 20 (31%) to clone B, 6 (9%) to clone C and 6 (9%) to new clones. Clone A seems to predominate in the IMD (68%), Surgical Units (50%) and Neonatal ICU (83%), whereas, clone B predominated in the adults’ ICU (65%) followed by clone A (20%). The predominance of multi- resistant K. pneumoniae isolates and the detection of clonal spread to the Hospital Departments is of great concern. In order to control the spread of such strains, the implementation of infection control measures including hand hygiene, isolation and environment disinfection combined with a wiser use of carbapenems as well as newer antibiotics is necessary. 2020-06-22T12:37:45Z 2020-06-22T12:37:45Z 2019-10-17 Thesis http://hdl.handle.net/10889/13499 gr 6 application/pdf