Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού

Ο πρωτογενής κροσσός είναι μια δομή αποτελούμενη από μικροσωληνίσκους που εκφύεται από την επιφάνεια του κυττάρου όταν αυτό βρίσκεται εκτός κυτταρικού κύκλου. Είναι ακίνητος κροσσός και συμμετέχει στη μεταγωγή σημάτων στο κύτταρο, ενώ ανεπάρκεια στο σχηματισμό του είναι ικανή να οδηγήσει σε διάφορες...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Μπουρνάκα, Σπυριδούλα
Άλλοι συγγραφείς: Λυγερού, Ζωή
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2020
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/14321
id nemertes-10889-14321
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Πρωτογενής κροσσός
Κεντροσωμάτιο
Geminin
McIdas
Primary cilium
Centrosome
spellingShingle Πρωτογενής κροσσός
Κεντροσωμάτιο
Geminin
McIdas
Primary cilium
Centrosome
Μπουρνάκα, Σπυριδούλα
Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
description Ο πρωτογενής κροσσός είναι μια δομή αποτελούμενη από μικροσωληνίσκους που εκφύεται από την επιφάνεια του κυττάρου όταν αυτό βρίσκεται εκτός κυτταρικού κύκλου. Είναι ακίνητος κροσσός και συμμετέχει στη μεταγωγή σημάτων στο κύτταρο, ενώ ανεπάρκεια στο σχηματισμό του είναι ικανή να οδηγήσει σε διάφορες ασθένειες (ciliopathies). Για να σχηματιστεί ο πρωτογενής κροσσός, το κεντροσωμάτιο του κυττάρου ωριμάζει σε βασικό σωμάτιο, προσδένεται σε κυστίδια από το σύμπλεγμα Golgi, οπότε και αρχίζει να εκφύεται από το μητρικό κεντριόλιο ο κροσσός. Το κυστίδιο με το βασικό σωμάτιο και τον νεοσχηματιζόμενο κροσσό μεταναστεύει προς την πλασματική μεμβράνη όπου και συντήκεται με αυτή για να εξωκυτταρωθεί ο κροσσός και να επιμηκυνθεί. Ο σχηματισμός του πρωτογενούς κροσσού είναι μια διαδικασία αυστηρά ελεγχόμενη από τον κυτταρικό κύκλο, καθώς, όταν το κύτταρο είναι εκτός κυτταρικού κύκλου σχηματίζει τον πρωτογενή κροσσό και όταν επανεισέρχεται σε αυτόν πρέπει να τον αποικοδομήσει. Το κεντροσωμάτιο αποτελεί κέντρο οργάνωσης των μικροσωληνίσκων του κυττάρου οι οποίοι σχηματίζουν τον κυτταροσκελετό στη μεσόφαση, τη μιτωτική άτρακτο στη μίτωση και τους/τον κροσσούς/κροσσό μετά τη διαφοροποίηση ή την έξοδο από τον κυτταρικό κύκλο. Το κεντροσωμάτιο αποτελείται από δύο κεντριόλια που ανάλογα με τη φάση του κυτταρικού κύκλου είτε είναι στενά συνδεδεμένα μεταξύ τους είτε συνδέονται μέσω πρωτεϊνικών ινιδίων. Το κεντροσωμάτιο διπλασιάζεται σε κάθε κυτταρικό κύκλο με ημισυντηριτικό τρόπο, με ένα νέο κεντριόλιο να εκφύεται από κάθε μητρικό. Ο συντονισμός του διπλασιασμού των κεντροσωματίων και του γενετικού υλικού, ώστε να συμβαίνει μία και μόνο φορά ανά κύκλο, διασφαλίζει την ακεραιότητα του γενετικού υλικού από γενιά σε γενιά. H υπεροικογένεια Geminin απαρτίζεται από τρεις πρωτεΐνες, τις Geminin, McIdas και GemC1. Οι τρείς αυτές πρωτεΐνες έχει βρεθεί πως παίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου αλλά και στη διαφοροποίηση των πολυκροσσωτών κυττάρων. Επιπλέον, η Geminin έχει σημαντικό ρόλο στον κύκλο των κεντροσωματίων, καθώς απαλοιφή της οδηγεί σε υπερδιπλασιασμό τους. Παράλληλα, πρόσφατες μελέτες στο εργαστήριό μας συνδέουν και τον McIdas με τον διπλασιασμό των κεντροσωματίων. Στην παρούσα εργασία μελετήθηκε ο ρόλος των πρωτεϊνών Geminin και McIdas στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού αλλά και ένας επιπλέον ρόλος της Geminin στη συνοχή των κεντριολίων. Για το σκοπό αυτό χρησιμοποιήθηκαν μη καρκινικά αθανατοποιημένα, επιθηλιακά κύτταρα hTERT-RPE1, τα οποία καλλιεργήθηκαν σε συνθήκες αποστέρησης ορού για την επαγωγή της εξόδου από τον κυτταρικό κύκλο και τον συνεπακόλουθο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού. Βρέθηκε πως απουσία του McIdas μειώνεται ο αριθμός των κυττάρων που σχηματίζουν πρωτογενή κροσσό. Αντίθετα, η υπερέκφρασή του οδηγεί σε αύξηση των κυττάρων που είναι ικανά να σχηματίσουν κροσσό. Σε μια προσπάθεια διαλεύκανσης του ρόλου του McIdas στο μονοπάτι της βιογένεσης του κροσσού, διερευνήθηκαν τρία βήματα αυτής. Η ωρίμανση του βασικού σωματίου και η αγκυροβόλησή του στην πλασματική μεμβράνη ή το κυστίδιο Golgi, η ικανότητα σχηματισμού των κυστιδίων γύρω από το βασικό σωμάτιο και η ικανότητα σχηματισμού του κροσσού από το βασικό σωμάτιο. Τα πειράματα που έχουν διεξαχθεί δείχνουν πως απουσία του McIdas, ούτε η ικανότητα του βασικού σωματίου να σχηματίζει κροσσό επηρεάζεται ούτε και η ωρίμανσή του ή η αγκυροβόλησή του. Ωστόσο, ενδέχεται να μειώνεται ο σχηματισμός των κυστιδίων Golgi γύρω από το βασικό σωμάτιο, όπως δείχνει η μείωση του σήματος της Rab8a στο κεντροσωμάτιο, μιας πρωτεΐνης χαρακτηριστικής των κυστιδίων που συμμετέχουν στο σχηματισμό του κροσσού. Η αποσιώπηση της Geminin, επίσης, μειώνει την ικανότητα των κυττάρων να σχηματίζουν πρωτογενή κροσσό όταν αυτά είναι εκτός κύκλου. Ταυτόχρονα όμως με τον φαινότυπο αυτό παρατηρήθηκε και ένας ακόμα, αυτός της αυξημένης απόστασης μεταξύ των κεντροσωματίων. Η διαδικασία του αποχωρισμού των κεντροσωματίων λαμβάνει, φυσιολογικά, χώρα λίγο πριν τη μίτωση. Μένει να διαπιστωθεί εάν τα απομακρυσμένα κεντροσωμάτια είναι διπλασιασμένα ή εάν η έλλειψη της Geminin επιδρά στο δεσμό των κεντριολίων. Η παρούσα διπλωματική διευρύνει το φάσμα των λειτουργιών που επιτελούν οι πρωτεΐνες της υπεροικογένειας Geminin. Η κατανόηση των λειτουργιών των πρωτεϊνών αυτών θα βοηθήσει στη διαλεύκανση του ρόλου τους στην διατήρηση της ισορροπίας μεταξύ πολλαπλασιασμού και διαφοροποίησης.
author2 Λυγερού, Ζωή
author_facet Λυγερού, Ζωή
Μπουρνάκα, Σπυριδούλα
format Thesis
author Μπουρνάκα, Σπυριδούλα
author_sort Μπουρνάκα, Σπυριδούλα
title Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
title_short Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
title_full Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
title_fullStr Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
title_full_unstemmed Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
title_sort μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού
publishDate 2020
url http://hdl.handle.net/10889/14321
work_keys_str_mv AT mpournakaspyridoula meletētouroloutōnprōteïnōntēsyperoikogeneiasgemininstoschēmatismotouprōtogenouskrossou
AT mpournakaspyridoula studyoftheroleofgemininsuperfamilyproteinsinprimaryciliumformation
_version_ 1771297281616642048
spelling nemertes-10889-143212022-09-05T20:30:18Z Μελέτη του ρόλου των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας Geminin στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού Study of the role of Geminin superfamily proteins in primary cilium formation Μπουρνάκα, Σπυριδούλα Λυγερού, Ζωή Ταραβήρας, Σταύρος Σανταμά, Νιόβη Λυγερού, Ζωή Bournaka, Spyridoula Πρωτογενής κροσσός Κεντροσωμάτιο Geminin McIdas Primary cilium Centrosome Ο πρωτογενής κροσσός είναι μια δομή αποτελούμενη από μικροσωληνίσκους που εκφύεται από την επιφάνεια του κυττάρου όταν αυτό βρίσκεται εκτός κυτταρικού κύκλου. Είναι ακίνητος κροσσός και συμμετέχει στη μεταγωγή σημάτων στο κύτταρο, ενώ ανεπάρκεια στο σχηματισμό του είναι ικανή να οδηγήσει σε διάφορες ασθένειες (ciliopathies). Για να σχηματιστεί ο πρωτογενής κροσσός, το κεντροσωμάτιο του κυττάρου ωριμάζει σε βασικό σωμάτιο, προσδένεται σε κυστίδια από το σύμπλεγμα Golgi, οπότε και αρχίζει να εκφύεται από το μητρικό κεντριόλιο ο κροσσός. Το κυστίδιο με το βασικό σωμάτιο και τον νεοσχηματιζόμενο κροσσό μεταναστεύει προς την πλασματική μεμβράνη όπου και συντήκεται με αυτή για να εξωκυτταρωθεί ο κροσσός και να επιμηκυνθεί. Ο σχηματισμός του πρωτογενούς κροσσού είναι μια διαδικασία αυστηρά ελεγχόμενη από τον κυτταρικό κύκλο, καθώς, όταν το κύτταρο είναι εκτός κυτταρικού κύκλου σχηματίζει τον πρωτογενή κροσσό και όταν επανεισέρχεται σε αυτόν πρέπει να τον αποικοδομήσει. Το κεντροσωμάτιο αποτελεί κέντρο οργάνωσης των μικροσωληνίσκων του κυττάρου οι οποίοι σχηματίζουν τον κυτταροσκελετό στη μεσόφαση, τη μιτωτική άτρακτο στη μίτωση και τους/τον κροσσούς/κροσσό μετά τη διαφοροποίηση ή την έξοδο από τον κυτταρικό κύκλο. Το κεντροσωμάτιο αποτελείται από δύο κεντριόλια που ανάλογα με τη φάση του κυτταρικού κύκλου είτε είναι στενά συνδεδεμένα μεταξύ τους είτε συνδέονται μέσω πρωτεϊνικών ινιδίων. Το κεντροσωμάτιο διπλασιάζεται σε κάθε κυτταρικό κύκλο με ημισυντηριτικό τρόπο, με ένα νέο κεντριόλιο να εκφύεται από κάθε μητρικό. Ο συντονισμός του διπλασιασμού των κεντροσωματίων και του γενετικού υλικού, ώστε να συμβαίνει μία και μόνο φορά ανά κύκλο, διασφαλίζει την ακεραιότητα του γενετικού υλικού από γενιά σε γενιά. H υπεροικογένεια Geminin απαρτίζεται από τρεις πρωτεΐνες, τις Geminin, McIdas και GemC1. Οι τρείς αυτές πρωτεΐνες έχει βρεθεί πως παίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου αλλά και στη διαφοροποίηση των πολυκροσσωτών κυττάρων. Επιπλέον, η Geminin έχει σημαντικό ρόλο στον κύκλο των κεντροσωματίων, καθώς απαλοιφή της οδηγεί σε υπερδιπλασιασμό τους. Παράλληλα, πρόσφατες μελέτες στο εργαστήριό μας συνδέουν και τον McIdas με τον διπλασιασμό των κεντροσωματίων. Στην παρούσα εργασία μελετήθηκε ο ρόλος των πρωτεϊνών Geminin και McIdas στο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού αλλά και ένας επιπλέον ρόλος της Geminin στη συνοχή των κεντριολίων. Για το σκοπό αυτό χρησιμοποιήθηκαν μη καρκινικά αθανατοποιημένα, επιθηλιακά κύτταρα hTERT-RPE1, τα οποία καλλιεργήθηκαν σε συνθήκες αποστέρησης ορού για την επαγωγή της εξόδου από τον κυτταρικό κύκλο και τον συνεπακόλουθο σχηματισμό του πρωτογενούς κροσσού. Βρέθηκε πως απουσία του McIdas μειώνεται ο αριθμός των κυττάρων που σχηματίζουν πρωτογενή κροσσό. Αντίθετα, η υπερέκφρασή του οδηγεί σε αύξηση των κυττάρων που είναι ικανά να σχηματίσουν κροσσό. Σε μια προσπάθεια διαλεύκανσης του ρόλου του McIdas στο μονοπάτι της βιογένεσης του κροσσού, διερευνήθηκαν τρία βήματα αυτής. Η ωρίμανση του βασικού σωματίου και η αγκυροβόλησή του στην πλασματική μεμβράνη ή το κυστίδιο Golgi, η ικανότητα σχηματισμού των κυστιδίων γύρω από το βασικό σωμάτιο και η ικανότητα σχηματισμού του κροσσού από το βασικό σωμάτιο. Τα πειράματα που έχουν διεξαχθεί δείχνουν πως απουσία του McIdas, ούτε η ικανότητα του βασικού σωματίου να σχηματίζει κροσσό επηρεάζεται ούτε και η ωρίμανσή του ή η αγκυροβόλησή του. Ωστόσο, ενδέχεται να μειώνεται ο σχηματισμός των κυστιδίων Golgi γύρω από το βασικό σωμάτιο, όπως δείχνει η μείωση του σήματος της Rab8a στο κεντροσωμάτιο, μιας πρωτεΐνης χαρακτηριστικής των κυστιδίων που συμμετέχουν στο σχηματισμό του κροσσού. Η αποσιώπηση της Geminin, επίσης, μειώνει την ικανότητα των κυττάρων να σχηματίζουν πρωτογενή κροσσό όταν αυτά είναι εκτός κύκλου. Ταυτόχρονα όμως με τον φαινότυπο αυτό παρατηρήθηκε και ένας ακόμα, αυτός της αυξημένης απόστασης μεταξύ των κεντροσωματίων. Η διαδικασία του αποχωρισμού των κεντροσωματίων λαμβάνει, φυσιολογικά, χώρα λίγο πριν τη μίτωση. Μένει να διαπιστωθεί εάν τα απομακρυσμένα κεντροσωμάτια είναι διπλασιασμένα ή εάν η έλλειψη της Geminin επιδρά στο δεσμό των κεντριολίων. Η παρούσα διπλωματική διευρύνει το φάσμα των λειτουργιών που επιτελούν οι πρωτεΐνες της υπεροικογένειας Geminin. Η κατανόηση των λειτουργιών των πρωτεϊνών αυτών θα βοηθήσει στη διαλεύκανση του ρόλου τους στην διατήρηση της ισορροπίας μεταξύ πολλαπλασιασμού και διαφοροποίησης. The primary cilium is a microtubule-based organelle that protrudes from the cell surface upon cell cycle exit. It is an immotile cilium and many cell signals are transduced through it. A defective primary cilium can be the cause of various diseases, named ciliopathies. For the primary cilium to be formed, mother centriole of the centrosome needs to mature and transform into a basal body. After that, the basal body can dock onto Golgi-derived vesicles and then the whole structure migrates towards the plasma membrane where the vesicle is fused to it and the growing cilium is exocytosed. There the cilium continues to grow to reach its final length. The whole procedure is strictly cell cycle regulated, since cells form a primary cilium as they exit the cell cycle, but when they reenter, they re-absorb and degrade their cilium. The centrosome is the major organizing center of the microtubules in the cell. During interphase it organizes the cytoskeleton of the cell and in mitosis the duplicated centrosome splits to form the two poles of the mitotic spindle. When the cell is in G0 phase or it is differentiated the centrosome gives rise to the primary cilium. The centrosome consists of two centrioles that are either firmly attached or binding through protein fibers, depending on the cell cycle phase. Each centriole will give rise to a daughter centriole during S centrosome duplication. The coordination of centrosome duplication with chromosome duplication is essential to ensure genome integrity at each cell division. The Geminin superfamily consists of three proteins, Geminin, McIdas and GemC1. It is well known that each of them has an important role not only during the cell cycle but also in cell fate decisions, especially in multiciliated cells. Geminin has also been shown to be implicated in the centrosome cycle, while recent studies in our lab suggest that the same may be the case for McIdas. In this thesis, the role of Geminin and McIdas in the formation of the primary cilium is investigated, and a new role for Geminin in centrosome integrity has been highlighted. To this end, a non-cancerous immortalized, epithelial cell line, hTERT-RPE1, was used. Cells were cultured under serum starvation to enforce cell cycle exit and primary cilium formation. It was found out that upon depletion of McIdas the number of cells that form a primary cilium is significantly reduced. On the other hand, overexpression of McIdas led to an increase in the number of the cells with a primary cilium. It was then examined at which point of the ciliogenesis McIdas acts. Three steps were investigated. Basal body maturation and docking, the ability of vesicles to form around the basal body and the ability of the basal body to generate a cilium. We know that neither maturation and docking of the basal body nor its ability to form a primary cilium is affected. On the contrary, in the absence of McIdas the ability of vesicles to be formed is reduced, as the signal of Rab8a around the centrosome is attenuated. Rab8a is a distinctive protein of the vesicles that serve for ciliogenesis. Geminin depletion, also, reduces the number of cells that form a primary cilium upon cell cycle exit. In addition, an increased distance between centrioles was observed. Normally, the separation of the newly replicated centrosomes takes place just before cells enter mitosis. It remains to be shown whether the increased distance is due to centrosome duplication, or Geminin plays also a role in centrosome cohesion. It becomes clear that the members of the Geminin superfamily are involved in an increasing number of cellular processes. Understanding their functions will allow their role in the balance between proliferation and differentiation to be elucidated. 2020-12-08T12:13:19Z 2020-12-08T12:13:19Z 2019-10-30 Thesis http://hdl.handle.net/10889/14321 gr 12 application/pdf