Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
Η ανάλυση μονοπατιών είναι μια ακμάζουσα ερευνητική περιοχή μεθόδων και εργαλείων της Βιολογίας Συστημάτων η οποία επιχειρεί να ξεδιπλώσει την εγγενή πολυπλοκότητα των βιολογικών δεδομένων τα οποία παράγονται από τις ομικές τεχνολογίες. Μέσα από την παρούσα εργασία θα δούμε τα προβλήματα τα οπ...
Κύριος συγγραφέας: | |
---|---|
Άλλοι συγγραφείς: | |
Γλώσσα: | Greek |
Έκδοση: |
2021
|
Θέματα: | |
Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/14638 |
id |
nemertes-10889-14638 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
nemertes-10889-146382022-09-05T20:24:52Z Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών Methods for finding sub-paths in path networks Μπάιερ, Κωνσταντίνος Baier, Konstantinos Μέθοδοι εύρεσης μονοπατιών Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών Γονιδιακή έκφραση RNA-seq RNA-seq Η ανάλυση μονοπατιών είναι μια ακμάζουσα ερευνητική περιοχή μεθόδων και εργαλείων της Βιολογίας Συστημάτων η οποία επιχειρεί να ξεδιπλώσει την εγγενή πολυπλοκότητα των βιολογικών δεδομένων τα οποία παράγονται από τις ομικές τεχνολογίες. Μέσα από την παρούσα εργασία θα δούμε τα προβλήματα τα οποία καλείται να λύσει η περιοχή και τα στοιχεία εκείνα που θα την κάνουν ένα από τα πιο συναρπαστικά ερευνητικά πεδία της επόμενης δεκαετίας. Θα δούμε την εξέλιξη της στο χρόνο, τη σαγηνευτική διεπιστημονικότητα της, καθώς και μεθοδολογίες που μπορούν να κατευθύνουν τον αναγνώστη στην ουσιαστική κατανόηση του θέματος. Ακόμη, θα δούμε τρεις νέες μεθόδους ανάλυσης μονοπατιών. (i) Η πρώτη μέθοδος (CHRONOS) εντοπίζει εμπλουτισμένα miRNA-ρυθμιζόμενα υπομονοπάτια μέσα σε σηματοδοτικά μονοπάτια τα βρίσκονται διαταραγμένα σε μια μελέτη γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (ii) Η δεύτερη μέθοδος εντοπίζει υπομονοπάτια σχετιζόμενα με τη γήρανση σε σηματοδοτικά μονοπάτια μέσω μετα-ανάλυσης πολλαπλών πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (iii) Η τρίτη μέθοδος (DESA) εντοπίζει διαφορικά εκφρασμένα υπομονοπάτια σε ένα διαταραγμένο σηματοδοτικό δίκτυο για μελέτες γονιδιακής έκφρασης RNA-seq. 2021-03-09T11:34:15Z 2021-03-09T11:34:15Z 2020-01-30 http://hdl.handle.net/10889/14638 gr application/pdf winrar |
institution |
UPatras |
collection |
Nemertes |
language |
Greek |
topic |
Μέθοδοι εύρεσης μονοπατιών Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών Γονιδιακή έκφραση RNA-seq RNA-seq |
spellingShingle |
Μέθοδοι εύρεσης μονοπατιών Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών Γονιδιακή έκφραση RNA-seq RNA-seq Μπάιερ, Κωνσταντίνος Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
description |
Η ανάλυση μονοπατιών είναι μια ακμάζουσα ερευνητική περιοχή μεθόδων και εργαλείων
της Βιολογίας Συστημάτων η οποία επιχειρεί να ξεδιπλώσει την εγγενή πολυπλοκότητα των
βιολογικών δεδομένων τα οποία παράγονται από τις ομικές τεχνολογίες. Μέσα από την
παρούσα εργασία θα δούμε τα προβλήματα τα οποία καλείται να λύσει η περιοχή και τα
στοιχεία εκείνα που θα την κάνουν ένα από τα πιο συναρπαστικά ερευνητικά πεδία της
επόμενης δεκαετίας. Θα δούμε την εξέλιξη της στο χρόνο, τη σαγηνευτική
διεπιστημονικότητα της, καθώς και μεθοδολογίες που μπορούν να κατευθύνουν τον
αναγνώστη στην ουσιαστική κατανόηση του θέματος. Ακόμη, θα δούμε τρεις νέες μεθόδους
ανάλυσης μονοπατιών. (i) Η πρώτη μέθοδος (CHRONOS) εντοπίζει εμπλουτισμένα
miRNA-ρυθμιζόμενα υπομονοπάτια μέσα σε σηματοδοτικά μονοπάτια τα βρίσκονται
διαταραγμένα σε μια μελέτη γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (ii) Η δεύτερη μέθοδος
εντοπίζει υπομονοπάτια σχετιζόμενα με τη γήρανση σε σηματοδοτικά μονοπάτια μέσω
μετα-ανάλυσης πολλαπλών πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (iii) Η τρίτη
μέθοδος (DESA) εντοπίζει διαφορικά εκφρασμένα υπομονοπάτια σε ένα διαταραγμένο
σηματοδοτικό δίκτυο για μελέτες γονιδιακής έκφρασης RNA-seq. |
author2 |
Baier, Konstantinos |
author_facet |
Baier, Konstantinos Μπάιερ, Κωνσταντίνος |
author |
Μπάιερ, Κωνσταντίνος |
author_sort |
Μπάιερ, Κωνσταντίνος |
title |
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
title_short |
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
title_full |
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
title_fullStr |
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
title_full_unstemmed |
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
title_sort |
μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών |
publishDate |
2021 |
url |
http://hdl.handle.net/10889/14638 |
work_keys_str_mv |
AT mpaierkōnstantinos methodoieuresēsypomonopatiōnsediktyamonopatiōn AT mpaierkōnstantinos methodsforfindingsubpathsinpathnetworks |
_version_ |
1771297290285219840 |