Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών

Η ανάλυση μονοπατιών είναι μια ακμάζουσα ερευνητική περιοχή μεθόδων και εργαλείων της Βιολογίας Συστημάτων η οποία επιχειρεί να ξεδιπλώσει την εγγενή πολυπλοκότητα των βιολογικών δεδομένων τα οποία παράγονται από τις ομικές τεχνολογίες. Μέσα από την παρούσα εργασία θα δούμε τα προβλήματα τα οπ...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Μπάιερ, Κωνσταντίνος
Άλλοι συγγραφείς: Baier, Konstantinos
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2021
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/14638
id nemertes-10889-14638
record_format dspace
spelling nemertes-10889-146382022-09-05T20:24:52Z Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών Methods for finding sub-paths in path networks Μπάιερ, Κωνσταντίνος Baier, Konstantinos Μέθοδοι εύρεσης μονοπατιών Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών Γονιδιακή έκφραση RNA-seq RNA-seq Η ανάλυση μονοπατιών είναι μια ακμάζουσα ερευνητική περιοχή μεθόδων και εργαλείων της Βιολογίας Συστημάτων η οποία επιχειρεί να ξεδιπλώσει την εγγενή πολυπλοκότητα των βιολογικών δεδομένων τα οποία παράγονται από τις ομικές τεχνολογίες. Μέσα από την παρούσα εργασία θα δούμε τα προβλήματα τα οποία καλείται να λύσει η περιοχή και τα στοιχεία εκείνα που θα την κάνουν ένα από τα πιο συναρπαστικά ερευνητικά πεδία της επόμενης δεκαετίας. Θα δούμε την εξέλιξη της στο χρόνο, τη σαγηνευτική διεπιστημονικότητα της, καθώς και μεθοδολογίες που μπορούν να κατευθύνουν τον αναγνώστη στην ουσιαστική κατανόηση του θέματος. Ακόμη, θα δούμε τρεις νέες μεθόδους ανάλυσης μονοπατιών. (i) Η πρώτη μέθοδος (CHRONOS) εντοπίζει εμπλουτισμένα miRNA-ρυθμιζόμενα υπομονοπάτια μέσα σε σηματοδοτικά μονοπάτια τα βρίσκονται διαταραγμένα σε μια μελέτη γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (ii) Η δεύτερη μέθοδος εντοπίζει υπομονοπάτια σχετιζόμενα με τη γήρανση σε σηματοδοτικά μονοπάτια μέσω μετα-ανάλυσης πολλαπλών πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (iii) Η τρίτη μέθοδος (DESA) εντοπίζει διαφορικά εκφρασμένα υπομονοπάτια σε ένα διαταραγμένο σηματοδοτικό δίκτυο για μελέτες γονιδιακής έκφρασης RNA-seq. 2021-03-09T11:34:15Z 2021-03-09T11:34:15Z 2020-01-30 http://hdl.handle.net/10889/14638 gr application/pdf winrar
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Μέθοδοι εύρεσης μονοπατιών
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών
Γονιδιακή έκφραση RNA-seq
RNA-seq
spellingShingle Μέθοδοι εύρεσης μονοπατιών
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών
Γονιδιακή έκφραση RNA-seq
RNA-seq
Μπάιερ, Κωνσταντίνος
Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
description Η ανάλυση μονοπατιών είναι μια ακμάζουσα ερευνητική περιοχή μεθόδων και εργαλείων της Βιολογίας Συστημάτων η οποία επιχειρεί να ξεδιπλώσει την εγγενή πολυπλοκότητα των βιολογικών δεδομένων τα οποία παράγονται από τις ομικές τεχνολογίες. Μέσα από την παρούσα εργασία θα δούμε τα προβλήματα τα οποία καλείται να λύσει η περιοχή και τα στοιχεία εκείνα που θα την κάνουν ένα από τα πιο συναρπαστικά ερευνητικά πεδία της επόμενης δεκαετίας. Θα δούμε την εξέλιξη της στο χρόνο, τη σαγηνευτική διεπιστημονικότητα της, καθώς και μεθοδολογίες που μπορούν να κατευθύνουν τον αναγνώστη στην ουσιαστική κατανόηση του θέματος. Ακόμη, θα δούμε τρεις νέες μεθόδους ανάλυσης μονοπατιών. (i) Η πρώτη μέθοδος (CHRONOS) εντοπίζει εμπλουτισμένα miRNA-ρυθμιζόμενα υπομονοπάτια μέσα σε σηματοδοτικά μονοπάτια τα βρίσκονται διαταραγμένα σε μια μελέτη γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (ii) Η δεύτερη μέθοδος εντοπίζει υπομονοπάτια σχετιζόμενα με τη γήρανση σε σηματοδοτικά μονοπάτια μέσω μετα-ανάλυσης πολλαπλών πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης μικροσυστοιχιών. (iii) Η τρίτη μέθοδος (DESA) εντοπίζει διαφορικά εκφρασμένα υπομονοπάτια σε ένα διαταραγμένο σηματοδοτικό δίκτυο για μελέτες γονιδιακής έκφρασης RNA-seq.
author2 Baier, Konstantinos
author_facet Baier, Konstantinos
Μπάιερ, Κωνσταντίνος
author Μπάιερ, Κωνσταντίνος
author_sort Μπάιερ, Κωνσταντίνος
title Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
title_short Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
title_full Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
title_fullStr Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
title_full_unstemmed Μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
title_sort μέθοδοι εύρεσης υπομονοπατιών σε δίκτυα μονοπατιών
publishDate 2021
url http://hdl.handle.net/10889/14638
work_keys_str_mv AT mpaierkōnstantinos methodoieuresēsypomonopatiōnsediktyamonopatiōn
AT mpaierkōnstantinos methodsforfindingsubpathsinpathnetworks
_version_ 1771297290285219840