Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα

Τα μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα (ΜΔΣ) αποτελούν μια ομάδα ετερογενών, κλωνικών, αιμοποιητικών διαταραχών στα βλαστικά κύτταρα. Χαρακτηρίζεται από κυτταροπενίες, μη φυσιολογική αιμοποίηση και συνήθως μεταβαίνει σε οξεία μυελογενή λευχαιμία (ΟΜΛ) στις περιπτώσεις υψηλού κινδύνου. Η ταξινόμηση των ΜΔΣ...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Λυχναρόπουλος, Ιωάννης
Άλλοι συγγραφείς: Lychnaropoulos, Ioannis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2021
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/15205
id nemertes-10889-15205
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
Αζακυτιδίνη
Μεθυλίωση DNA
Επιγενετική ρύθμιση
Myelodysplastic syndromes
Azacytidine
DNA methylation
Epigenetic regulation
spellingShingle Μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
Αζακυτιδίνη
Μεθυλίωση DNA
Επιγενετική ρύθμιση
Myelodysplastic syndromes
Azacytidine
DNA methylation
Epigenetic regulation
Λυχναρόπουλος, Ιωάννης
Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
description Τα μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα (ΜΔΣ) αποτελούν μια ομάδα ετερογενών, κλωνικών, αιμοποιητικών διαταραχών στα βλαστικά κύτταρα. Χαρακτηρίζεται από κυτταροπενίες, μη φυσιολογική αιμοποίηση και συνήθως μεταβαίνει σε οξεία μυελογενή λευχαιμία (ΟΜΛ) στις περιπτώσεις υψηλού κινδύνου. Η ταξινόμηση των ΜΔΣ βασίζεται σε κλινικές και παθολογικές παραμέτρους που προκύπτουν από κυτταρογενετικές πληροφορίες. Γενετικές μεταλλάξεις αλλά και επιγενετικοί μηχανισμοί, όπως η μεθυλίωση του DNA και η τροποποίηση των ιστονών, τροποποιούν την έκφραση κάποιων γονιδίων που εμπλέκονται με τα ΜΔΣ, με άμεσο ή έμμεσο τρόπο.. Σε αυτές τις κατηγορίες περιλαμβάνονται γονίδια που ελέγχουν τον πολλαπλασιασμό, την προσκόλληση κυττάρων, τη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου και άλλα χαρακτηριστικά που προκαλούν ΜΔΣ. Γενικά, η υπέρμετρη μεθυλίωση του DNA σχετίζεται με κακή πρόγνωση στα ΜΔΣ και με γρηγορότερη μετατροπή σε ΟΜΛ. Η φαρμακο(επι)γονιδιωματική είναι η επιστήμη που μας βοηθά να μελετήσουμε αυτές τις αλλαγές σε σχέση με μια ήδη υπάρχουσα θεραπεία, εκτιμώντας έτσι το πόσο αποτελεσματική ή όχι είναι αυτή για τη συγκεκριμένο σύνδρομο. Ανάμεσα στις θεραπευτικές επιλογές για τα ΜΔΣ είναι και οι υπομεθυλιωτικοί παράγοντες. Το πιο ευρέως χρησιμοποιούμενο φάρμακο είναι ένα ανάλογο της κυτιδίνης, η αζακυτιδίνη (ΑΖΑ), η οποία μπορεί να αντιστρέφει μια κατάσταση υπέρμετρης μεθυλίωσης, επαναφέροντας το μυελό των οστών σε μια κατάσταση σωστότερης λειτουργίας και ίσως, προεκτείνοντας τελικά το προσδόκιμο ζωής των ασθενών με ΜΔΣ. Στην παρούσα εργασία συγκεντρώθηκαν πληροφορίες από πολλές έρευνες που συσχετίζουν τη δράση της ΑΖΑ με την επιγενετική κυρίως ρύθμιση της ασθένειας, δηλαδή κατά πόσο επηρεάζεται το προφίλ μεθυλίωσης των εμπλεκόμενων με ΜΔΣ γονιδίων και, σε δεύτερο χρόνο, κατά πόσο αυτό μεταφράζεται σε κλινικό αποτέλεσμα για τον ασθενή. Ταυτόχρονα, αξιολογήθηκαν δεδομένα από βάσεις δεδομένων όπως Pubmed, PharmGKB, αλλά και κάποιες GWAS μελέτες και αναλύσεις ολόκληρου του επιγονιδιώματος (Whole Epimethylome analysis – WEA). Γενικά, γονίδια που ελέγχουν τη μεθυλίωση εμφανίζουν μεταλλάξεις, που άλλες φορές επηρεάζουν τη δράση της ΑΖΑ (π.χ. ΤΕΤ2) και άλλες την πρόοδο της ασθένειας (π.χ. ASXL1, IDH1/2). Άλλα γονίδια (CDA, TYMS, XRCC1, MTHFR) εμφανίζουν μεταλλάξεις που έχουν επίδραση στην απόκριση στην ΑΖΑ, αλλά δεν είναι στατιστικά σημαντική, λόγω του μικρού όγκου δείγματος που έχουν γίνει οι μελέτες. Τα αποτελέσματά μας από τη WEA αφορούν την επιγενετική ρύθμιση, η οποία φαίνεται να ασκεί επιρροή στην απόκριση στην ΑΖΑ, άλλοτε θετική και άλλοτε αρνητική. Σε αυτή την κατηγορία, ανήκουν τα γονίδια ALOX-5, ALOX-12, FZD9 και TNK2, τα οποία προέκυψαν ύστερα από διασταύρωση των ευρημάτων της WEA με την υπάρχουσα βιβλιογραφία. Οι υποκινητές αυτών των γονιδίων σε νησίδες CpG είναι συχνά υπερμεθυλιωμένοι, επηρεάζοντας την έκφρασή τους και την απόκριση των ασθενών στην ΑΖΑ και αυτό τα καθιστά πιθανούς στόχους. Ελάχιστες αναφορές τα συνδέουν ωστόσο άμεσα με τα ΜΔΣ, υπάρχουν όμως μελέτες για συγγενή γονίδια με αυτά, που εμπλέκονται συχνότερα στη νόσο. Επίσης μη ομαλή μεθυλίωση έχει βρεθεί και στα KLF11, TLR9, TERT, και MBD1, με παρόμοια αποτελέσματα με τα προηγούμενα. Περισσότερες έρευνες σχετικά με αυτά θα ρίξουν φως στο πόσο μεγάλη και σημαντική είναι η εμπλοκή τους στα ΜΔΣ και την απόκριση στην ΑΖΑ. Τα πιο πλούσια σε αναφορές γονίδια στα ΜΔΣ ήταν τα CDKN2A, CDKN2B και CDH1. Η υπερμεθυλίωση των γονιδίων αυτών είναι συχνή σε πολλά στάδια της ασθένειας και έχει συσχετιστεί και με την εξέλιξη προς ΟΜΛ, αλλά ειδικά για το CDKN2B, επηρεάζει την απόκριση στο φάρμακο χωρίς όμως να επιφέρει αλλαγές στα κλινικά χαρακτηριστικά των ασθενών. Η υπερμεθυλίωση του CDH1 δεν προκαλεί μειωμένη ανταπόκριση στο φάρμακο, αντίθετα με κάποιους πολυμορφισμούς του CDKN2A. Η πολυπλοκότητα της ασθένειας καθώς και η εμπλοκή επιγενετικών παραγόντων σε συνδυασμό με το μηχανισμό δράσης της ΑΖΑ, χρίζει απαραίτητη την πραγματοποίηση περισσότερων μελλοντικών μελετών για την επιβεβαίωση της εμπλοκής αυτών και άλλων γονιδίων με τη νόσο και την απόκριση φάρμακο.
author2 Lychnaropoulos, Ioannis
author_facet Lychnaropoulos, Ioannis
Λυχναρόπουλος, Ιωάννης
author Λυχναρόπουλος, Ιωάννης
author_sort Λυχναρόπουλος, Ιωάννης
title Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
title_short Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
title_full Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
title_fullStr Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
title_full_unstemmed Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
title_sort φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
publishDate 2021
url http://hdl.handle.net/10889/15205
work_keys_str_mv AT lychnaropoulosiōannēs pharmakoepigonidiōmatikēkaiexatomikeusētēstherapeiasasthenōnmemyelodysplastikasyndroma
AT lychnaropoulosiōannēs pharmacoepigenomicsandindividualizedtherapyforpatientswithmyelodysplasticsyndromes
_version_ 1771297145307004928
spelling nemertes-10889-152052022-09-05T05:39:17Z Φαρμακοεπιγονιδιωματική και εξατομίκευση της θεραπείας ασθενών με μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα Pharmacoepigenomics and individualized therapy for patients with myelodysplastic syndromes Λυχναρόπουλος, Ιωάννης Lychnaropoulos, Ioannis Μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα Αζακυτιδίνη Μεθυλίωση DNA Επιγενετική ρύθμιση Myelodysplastic syndromes Azacytidine DNA methylation Epigenetic regulation Τα μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα (ΜΔΣ) αποτελούν μια ομάδα ετερογενών, κλωνικών, αιμοποιητικών διαταραχών στα βλαστικά κύτταρα. Χαρακτηρίζεται από κυτταροπενίες, μη φυσιολογική αιμοποίηση και συνήθως μεταβαίνει σε οξεία μυελογενή λευχαιμία (ΟΜΛ) στις περιπτώσεις υψηλού κινδύνου. Η ταξινόμηση των ΜΔΣ βασίζεται σε κλινικές και παθολογικές παραμέτρους που προκύπτουν από κυτταρογενετικές πληροφορίες. Γενετικές μεταλλάξεις αλλά και επιγενετικοί μηχανισμοί, όπως η μεθυλίωση του DNA και η τροποποίηση των ιστονών, τροποποιούν την έκφραση κάποιων γονιδίων που εμπλέκονται με τα ΜΔΣ, με άμεσο ή έμμεσο τρόπο.. Σε αυτές τις κατηγορίες περιλαμβάνονται γονίδια που ελέγχουν τον πολλαπλασιασμό, την προσκόλληση κυττάρων, τη ρύθμιση του κυτταρικού κύκλου και άλλα χαρακτηριστικά που προκαλούν ΜΔΣ. Γενικά, η υπέρμετρη μεθυλίωση του DNA σχετίζεται με κακή πρόγνωση στα ΜΔΣ και με γρηγορότερη μετατροπή σε ΟΜΛ. Η φαρμακο(επι)γονιδιωματική είναι η επιστήμη που μας βοηθά να μελετήσουμε αυτές τις αλλαγές σε σχέση με μια ήδη υπάρχουσα θεραπεία, εκτιμώντας έτσι το πόσο αποτελεσματική ή όχι είναι αυτή για τη συγκεκριμένο σύνδρομο. Ανάμεσα στις θεραπευτικές επιλογές για τα ΜΔΣ είναι και οι υπομεθυλιωτικοί παράγοντες. Το πιο ευρέως χρησιμοποιούμενο φάρμακο είναι ένα ανάλογο της κυτιδίνης, η αζακυτιδίνη (ΑΖΑ), η οποία μπορεί να αντιστρέφει μια κατάσταση υπέρμετρης μεθυλίωσης, επαναφέροντας το μυελό των οστών σε μια κατάσταση σωστότερης λειτουργίας και ίσως, προεκτείνοντας τελικά το προσδόκιμο ζωής των ασθενών με ΜΔΣ. Στην παρούσα εργασία συγκεντρώθηκαν πληροφορίες από πολλές έρευνες που συσχετίζουν τη δράση της ΑΖΑ με την επιγενετική κυρίως ρύθμιση της ασθένειας, δηλαδή κατά πόσο επηρεάζεται το προφίλ μεθυλίωσης των εμπλεκόμενων με ΜΔΣ γονιδίων και, σε δεύτερο χρόνο, κατά πόσο αυτό μεταφράζεται σε κλινικό αποτέλεσμα για τον ασθενή. Ταυτόχρονα, αξιολογήθηκαν δεδομένα από βάσεις δεδομένων όπως Pubmed, PharmGKB, αλλά και κάποιες GWAS μελέτες και αναλύσεις ολόκληρου του επιγονιδιώματος (Whole Epimethylome analysis – WEA). Γενικά, γονίδια που ελέγχουν τη μεθυλίωση εμφανίζουν μεταλλάξεις, που άλλες φορές επηρεάζουν τη δράση της ΑΖΑ (π.χ. ΤΕΤ2) και άλλες την πρόοδο της ασθένειας (π.χ. ASXL1, IDH1/2). Άλλα γονίδια (CDA, TYMS, XRCC1, MTHFR) εμφανίζουν μεταλλάξεις που έχουν επίδραση στην απόκριση στην ΑΖΑ, αλλά δεν είναι στατιστικά σημαντική, λόγω του μικρού όγκου δείγματος που έχουν γίνει οι μελέτες. Τα αποτελέσματά μας από τη WEA αφορούν την επιγενετική ρύθμιση, η οποία φαίνεται να ασκεί επιρροή στην απόκριση στην ΑΖΑ, άλλοτε θετική και άλλοτε αρνητική. Σε αυτή την κατηγορία, ανήκουν τα γονίδια ALOX-5, ALOX-12, FZD9 και TNK2, τα οποία προέκυψαν ύστερα από διασταύρωση των ευρημάτων της WEA με την υπάρχουσα βιβλιογραφία. Οι υποκινητές αυτών των γονιδίων σε νησίδες CpG είναι συχνά υπερμεθυλιωμένοι, επηρεάζοντας την έκφρασή τους και την απόκριση των ασθενών στην ΑΖΑ και αυτό τα καθιστά πιθανούς στόχους. Ελάχιστες αναφορές τα συνδέουν ωστόσο άμεσα με τα ΜΔΣ, υπάρχουν όμως μελέτες για συγγενή γονίδια με αυτά, που εμπλέκονται συχνότερα στη νόσο. Επίσης μη ομαλή μεθυλίωση έχει βρεθεί και στα KLF11, TLR9, TERT, και MBD1, με παρόμοια αποτελέσματα με τα προηγούμενα. Περισσότερες έρευνες σχετικά με αυτά θα ρίξουν φως στο πόσο μεγάλη και σημαντική είναι η εμπλοκή τους στα ΜΔΣ και την απόκριση στην ΑΖΑ. Τα πιο πλούσια σε αναφορές γονίδια στα ΜΔΣ ήταν τα CDKN2A, CDKN2B και CDH1. Η υπερμεθυλίωση των γονιδίων αυτών είναι συχνή σε πολλά στάδια της ασθένειας και έχει συσχετιστεί και με την εξέλιξη προς ΟΜΛ, αλλά ειδικά για το CDKN2B, επηρεάζει την απόκριση στο φάρμακο χωρίς όμως να επιφέρει αλλαγές στα κλινικά χαρακτηριστικά των ασθενών. Η υπερμεθυλίωση του CDH1 δεν προκαλεί μειωμένη ανταπόκριση στο φάρμακο, αντίθετα με κάποιους πολυμορφισμούς του CDKN2A. Η πολυπλοκότητα της ασθένειας καθώς και η εμπλοκή επιγενετικών παραγόντων σε συνδυασμό με το μηχανισμό δράσης της ΑΖΑ, χρίζει απαραίτητη την πραγματοποίηση περισσότερων μελλοντικών μελετών για την επιβεβαίωση της εμπλοκής αυτών και άλλων γονιδίων με τη νόσο και την απόκριση φάρμακο. Myelodysplastic syndromes (MDS) are a group of heterogeneous, clonal, hematopoietic disorders in stem cells. It is characterized by cytopenia, abnormal hematopoiesis and usually progresses to acute myelogenous leukemia (AML) in highrisk cases. The classification of MDS is based on clinical and pathological parameters derived from cytogenetic information. Genetic mutations as well as epigenetic mechanisms, such as DNA methylation and histone modification, control the expression of certain genes. These genes are either directly involved in MDS, or affect the expression of other MDS-related genes. These categories include genes that control proliferation, cell adhesion, cell cycle regulation, and other characteristics that cause MDS. In general, abnormal DNA hypermethylation is associated with poor prognosis in MDS and faster conversion to AML. Pharmaco(epi)genomics is the science that helps us to study these changes in relation to an existing treatment, thus assessing the effectiveness of the drug for the specific syndrome. Among the treatment options for MDS are hypomethylating agents. The most widely used drug is azacitidine (AZA), a cytidine analogue, which can reverse the state of abnormal methylation, extending the life expectancy of patients with MDS. In the present review, information was collected from many studies that correlate the action of AZA mainly with the epigenetic regulation of the disease, i.e. whether the methylation profile of the MDS-involved genes is affected and, as a result, whether this situation sums up into a clinical outcome for the patient. Data from databases such as Pubmed, PharmGKB were evaluated, as well as some GWAS studies and whole epigenome analyses (WEA). In general, genes that control methylation show mutations, which sometimes affect the action of AZA (eg TET2) and some others the progression of the disease (eg ASXL1, IDH1 / 2). Other genes (CDA, TYMS, XRCC1, MTHFR) show mutations that affect the response to AZA, but are not statistically significant, due to the small sample size studied. The ALOX-5, ALOX-12, FZD9 and TNK2 genes appear to be epigenetically regulated, which appears to influence the AZA response, sometimes positively and sometimes negatively. The importance of these genes was taken into consideration, since they resulted from the study of WEA, as well as the existing literature. The promoters of these genes on CpG islands are often hypermethylated, affecting their expression and patient response to AZA. This is why we considered they may be considerable target genes for pharmacoepigenomic regulation in MDS. A small number of reports link these particular genes directly to MDS, but there are many other studies for genes of the same family with them, which are more often involved in the disease. Abnormal methylation has also been found in KLF11, TLR9, TERT, and MBD1, with similar results to the previous ones. More research on these will shed light on how big and important their involvement in MDS and the response to the AZA is. The most referenced genes in MDS were CDKN2A, CDKN2B and CDH1. Hypermethylation of these genes is common in many stages of the disease and has been associated with progression to AML, but especially for CDKN2B, it affects the drug response without altering the clinical characteristics of patients. Hypermethylation of CDH1 does not elicit a reduced response to the drug, unlike some polymorphisms of CDKN2A. The complexity of the disease as well as the involvement of epigenetic factors in combination with the mechanism of action of AZA, necessitates the conduct of more future studies to confirm the involvement of these, as well as other genes, with the disease and drug response. 2021-09-23T05:09:00Z 2021-09-23T05:09:00Z 2021-09-22 http://hdl.handle.net/10889/15205 gr application/pdf