Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab)
Στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία στόχο αποτελεί η μελέτη σύνθεσης του τμήματος (1-121αμινοξέα) της περιοχής κρυσταλλώσιμου θραύσματος ( περιοχή Fc ) της Αδαλιμουμάμπης (Adalimumab) μέσω της πεπτιδικής χημείας. Η αδαλιμουμάμπη ( adalimumab) που πωλείται με το εμπορικό όνομα Humira απο...
Κύριος συγγραφέας: | |
---|---|
Άλλοι συγγραφείς: | |
Γλώσσα: | Greek |
Έκδοση: |
2022
|
Θέματα: | |
Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/16307 |
id |
nemertes-10889-16307 |
---|---|
record_format |
dspace |
institution |
UPatras |
collection |
Nemertes |
language |
Greek |
topic |
Αδαλιμουμάμπη Νανοσώματα Θειοεστερική σύνδεση Adalimumab Nanobodies Native chemical ligation |
spellingShingle |
Αδαλιμουμάμπη Νανοσώματα Θειοεστερική σύνδεση Adalimumab Nanobodies Native chemical ligation Καστανά, Κωνσταντίνα Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
description |
Στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία στόχο αποτελεί η μελέτη σύνθεσης του τμήματος (1-121αμινοξέα) της περιοχής κρυσταλλώσιμου θραύσματος ( περιοχή Fc ) της Αδαλιμουμάμπης (Adalimumab) μέσω της πεπτιδικής χημείας.
Η αδαλιμουμάμπη ( adalimumab) που πωλείται με το εμπορικό όνομα Humira αποτελεί ένα πλήρως ανθρώπινο μονοκλωνικό αντίσωμα ανασυνδιασμένης ανοσοσφαιρίνης G1(IgG1). Επειδή δεν διακρίνεται στη δομή και τη λειτουργία από τη φυσική ανθρώπινη IgG1 έχει υψηλή εκλεκτικότητα και συγγένεια έναντι της πρωτεΐνης παράγοντα νέκρωσης όγκων (Tumor Necrosis Factor alpha, TNFα), ο οποίος επάγει φλεγμονώδεις αντιδράσεις και παίζει κεντρικό ρόλο σε φλεγμονώδη αυτοάνοσα νοσήματα. Η αδαλιμουμάμπη προσδένεται ειδικά στον ΤNF, τροποποιεί τις βιολογικές ανταποκρίσεις που επάγει και εξουδετερώνει την λειτουργία του, παρεμποδίζοντας την αλληλεπίδραση του με τους υποδοχείς της κυτταρικής μεμβράνης. Το εν λόγω πεπτίδιο ανήκει στην κατηγορία των νανοσωμάτων (nanobodies) δηλαδή θεραπευτικών πρωτεϊνών που βασίζονται σε θραύσματα αντισώματος μονής περιοχής που περιέχουν δομικές και λειτουργικές ιδιότητες μόνο της βαριάς αλυσίδας η οποία περιέχει δυο σταθερές και μια μοναδική μεταβλητή περιοχή με πλήρη ικανότητα δέσμευσης του αντιγόνου.
Θα πραγματοποιηθούν δυο προσεγγίσεις σύνθεσης με Fmoc/tBu μεθοδολογία πάνω στη 2-χλωροτρίτυλο- χλωρίδιο ρητίνη (CTC) συνδυάζοντας την μέθοδο της τμηματικής συμπύκνωσης σε στερεή φάση καθώς και αυτήν της step by step, έχοντας η μια από αυτές απώτερο σκοπό την προσπάθεια σύνθεσης ολόκληρου του τμήματος μέσω της Φυσικής Χημικής Σύνδεσης (Native Chemical Ligation). Κατά την διεξαγωγή των δυο προσεγγίσεων παρουσιάστηκαν πολλές δυσκολίες κατά την σύνθεση και ανάλυση των επιμέρους τμημάτων και για τον λόγο αυτό έλαβαν χώρα ποικίλες μέθοδοι σύνθεσης και σχεδιασμοί αναλύσεων.
Ο έλεγχος της πορείας της σύνθεσης πραγματοποιείται μέσω της υγρής χρωματογραφίας υψηλής απόδοσης ( HPLC) ενώ η ταυτοποίηση μέσω της φασματομετρίας μάζας ιονισμού ηλεκτροψεκασμού (ESI-MS). |
author2 |
Kastana, Konstantina |
author_facet |
Kastana, Konstantina Καστανά, Κωνσταντίνα |
author |
Καστανά, Κωνσταντίνα |
author_sort |
Καστανά, Κωνσταντίνα |
title |
Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
title_short |
Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
title_full |
Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
title_fullStr |
Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
title_full_unstemmed |
Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
title_sort |
χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) |
publishDate |
2022 |
url |
http://hdl.handle.net/10889/16307 |
work_keys_str_mv |
AT kastanakōnstantina chēmikēsynthesēnanosōmatōnnanobodiesmeletēsynthesēsnanosōmatostēsadalimoumampēsadalimumab AT kastanakōnstantina chemicalsynthesisofnanobodiessynthesisstudyofadalimumabnanobody |
_version_ |
1771297258087645184 |
spelling |
nemertes-10889-163072022-09-05T13:58:31Z Χημική σύνθεση νανοσωμάτων (nanobodies). Μελέτη σύνθεσης νανοσώματος της αδαλιμουμάμπης (adalimumab) Chemical synthesis of nanobodies. Synthesis study of adalimumab nanobody Καστανά, Κωνσταντίνα Kastana, Konstantina Αδαλιμουμάμπη Νανοσώματα Θειοεστερική σύνδεση Adalimumab Nanobodies Native chemical ligation Στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία στόχο αποτελεί η μελέτη σύνθεσης του τμήματος (1-121αμινοξέα) της περιοχής κρυσταλλώσιμου θραύσματος ( περιοχή Fc ) της Αδαλιμουμάμπης (Adalimumab) μέσω της πεπτιδικής χημείας. Η αδαλιμουμάμπη ( adalimumab) που πωλείται με το εμπορικό όνομα Humira αποτελεί ένα πλήρως ανθρώπινο μονοκλωνικό αντίσωμα ανασυνδιασμένης ανοσοσφαιρίνης G1(IgG1). Επειδή δεν διακρίνεται στη δομή και τη λειτουργία από τη φυσική ανθρώπινη IgG1 έχει υψηλή εκλεκτικότητα και συγγένεια έναντι της πρωτεΐνης παράγοντα νέκρωσης όγκων (Tumor Necrosis Factor alpha, TNFα), ο οποίος επάγει φλεγμονώδεις αντιδράσεις και παίζει κεντρικό ρόλο σε φλεγμονώδη αυτοάνοσα νοσήματα. Η αδαλιμουμάμπη προσδένεται ειδικά στον ΤNF, τροποποιεί τις βιολογικές ανταποκρίσεις που επάγει και εξουδετερώνει την λειτουργία του, παρεμποδίζοντας την αλληλεπίδραση του με τους υποδοχείς της κυτταρικής μεμβράνης. Το εν λόγω πεπτίδιο ανήκει στην κατηγορία των νανοσωμάτων (nanobodies) δηλαδή θεραπευτικών πρωτεϊνών που βασίζονται σε θραύσματα αντισώματος μονής περιοχής που περιέχουν δομικές και λειτουργικές ιδιότητες μόνο της βαριάς αλυσίδας η οποία περιέχει δυο σταθερές και μια μοναδική μεταβλητή περιοχή με πλήρη ικανότητα δέσμευσης του αντιγόνου. Θα πραγματοποιηθούν δυο προσεγγίσεις σύνθεσης με Fmoc/tBu μεθοδολογία πάνω στη 2-χλωροτρίτυλο- χλωρίδιο ρητίνη (CTC) συνδυάζοντας την μέθοδο της τμηματικής συμπύκνωσης σε στερεή φάση καθώς και αυτήν της step by step, έχοντας η μια από αυτές απώτερο σκοπό την προσπάθεια σύνθεσης ολόκληρου του τμήματος μέσω της Φυσικής Χημικής Σύνδεσης (Native Chemical Ligation). Κατά την διεξαγωγή των δυο προσεγγίσεων παρουσιάστηκαν πολλές δυσκολίες κατά την σύνθεση και ανάλυση των επιμέρους τμημάτων και για τον λόγο αυτό έλαβαν χώρα ποικίλες μέθοδοι σύνθεσης και σχεδιασμοί αναλύσεων. Ο έλεγχος της πορείας της σύνθεσης πραγματοποιείται μέσω της υγρής χρωματογραφίας υψηλής απόδοσης ( HPLC) ενώ η ταυτοποίηση μέσω της φασματομετρίας μάζας ιονισμού ηλεκτροψεκασμού (ESI-MS). In the present Master's Thesis the aim is the synthesis study of the part (1-121 amino acids) of the crystalline fragment region (region Fc) of Adalimumab through peptide chemistry. Adalimumab, sold under the brand name Humira, is a fully human recombinant immunoglobulin G1 (IgG1) monoclonal antibody. Because it is indistinguishable in structure and function from natural human IgG1, it has a high selectivity and affinity for tumor necrosis factor (TNFα) protein, which induces inflammatory reactions and plays a central role in inflammatory autoimmune diseases. Adalimumab specifically binds to TNF, modifies the biological responses it induces and neutralizes its function by inhibiting its interaction with cell membrane receptors. This peptide belongs to the category of nanobodies that is therapeutic proteins based on single region antibody fragments that contain structural and functional properties of only the heavy chain, which contains two constants and a single variable region with full antigen binding capacity. Two synthesis approaches will be performed with the Fmoc / tBu methodology in the 2-chlorotrityl chloride (CTC) resin that combines the solid phase fragment condensation, as well as the step-by-step method, one of which with the ultimate goal of trying to synthesize the whole through Native Chemical Ligation. During the application of the two approaches, many difficulties approve during the composition and analysis of the individual parts. For this reason various synthesis methods and analysis designs were carried out. The progress of the synthesis is checked by high performance liquid chromatography (HPLC) while the identification is done by ionization mass spectrometry with Electrospray (ESI-MS). 2022-06-28T09:15:55Z 2022-06-28T09:15:55Z 2022-06-28 http://hdl.handle.net/10889/16307 gr application/pdf |