Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα

Οι επιγενετικές αλλαγές, οι τροποποιήσεις δηλαδή που συμβαίνουν στην λειτουργία των γονιδίων, χωρίς να υπάρχει μεταβολή στην αλληλουχία του DNA, βρέθηκε ότι σχετίζονται με διάφορες παθολογικές καταστάσεις όπως ο καρκίνος. Η μεθυλίωση υπολειμμάτων λυσίνης και αργινίνης σε ουρές ιστόνης αντιπροσωπεύει...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Μποσγανά, Πηνελόπη
Άλλοι συγγραφείς: Bosgana, Pinelopi
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2022
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/16586
id nemertes-10889-16586
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα
Καρκίνος
Lung adenocarcinoma
Cancer
H3K4me
spellingShingle Αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα
Καρκίνος
Lung adenocarcinoma
Cancer
H3K4me
Μποσγανά, Πηνελόπη
Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
description Οι επιγενετικές αλλαγές, οι τροποποιήσεις δηλαδή που συμβαίνουν στην λειτουργία των γονιδίων, χωρίς να υπάρχει μεταβολή στην αλληλουχία του DNA, βρέθηκε ότι σχετίζονται με διάφορες παθολογικές καταστάσεις όπως ο καρκίνος. Η μεθυλίωση υπολειμμάτων λυσίνης και αργινίνης σε ουρές ιστόνης αντιπροσωπεύει μια σύνθετη διαδικασία επιγενετικής τροποποίησης της χρωματίνης. Αυτή η τροποποιήση ρυθμίζεται από ένζυμα μεθυλοτρανσφεράσες και απομεθυλάσες, που τοποθετούν και αφαιρούν, αντίστοιχα, ειδικά σήματα μεθυλίου κρίσιμα για την έκφραση γονιδίων. Η μεθυλίωση της ιστόνη Η3 στην λυσίνη 4 (H3K4me), είναι μια εξελικτικά διατηρημένη τροποποίηση ιστόνης που σηματοδοτεί περιοχές δραστικής μεταγραφής και ρυθμίζει την κυτταρική ανάπτυξη, τη μετανάστευση και την ικανότητα διήθησης των κυττάρων. Η ανώμαλη μεθυλίωση της ιστόνης συνδέεται στενά με την ανάπτυξη και την εξέλιξη του όγκου και έχει συσχετιστεί με κακή πρόγνωση σε καρκινοπαθείς. Τα μέλη της οικογένειας MLL / KMT2 των μεθυλοτρανσφερασών της ιστόνης μεθυλιώνουν συγκεκριμένα την ιστόνη Η3 στην λυσίνη 4 και προσθέτουν μία, δύο ή τρεις ομάδες μεθυλίου σε Η3 που καταλήγουν σε μονομεθυλίωση Η3Κ4 (me1), διμεθυλίωση Η3Κ4 (me2) ή τριμεθυλίωση Η3Κ4 (me3), αντίστοιχα. Τα μέλη αυτής της ομάδας συχνά απορρυθμίζονται στον καρκίνο. Το KMT2C (επίσης γνωστό ως MLL3) είναι ένας υποτιθέμενος καταστολέας όγκων σε αρκετά επιθηλιακά κύτταρα και ένα από τα πλέον συχνά μεταλλαγμένα γονίδια στον καρκίνο με συχνότητα μετάλλαξης περίπου 8%. Οι μεταλλάξεις στο γονίδιο MLL3 έχουν επίσης εντοπιστεί σε αδενοκαρκινώματα πνεύμονα. Ωστόσο, μέχρι σήμερα είναι διαθέσιμα πολύ περιορισμένα δεδομένα για την έκφραση των ενζύμων τροποποίησης της ιστόνης και των αντίστοιχων δεικτών τροποποιήσεων τους στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Τα καρκινικά βλαστικά κύτταρα (CSC’s) από την άλλη, έχουν αποκτήσει αυξημένη προσοχή των μελετητών τα τελευταία χρόνια, λόγω της δυνατότητάς τους να δημιουργούν νέους όγκους, μέσω της ικανότητας τους να αυτοανανεώνονται και να διαφοροποιούνται, σε πολλαπλές κυτταρικές γενεές. To OCT 4 και το LIN 28 (ομόλογο Α και Β) έχουν αναγνωριστεί ως βασικοί ρυθμιστές της πολυδύναμης δράσης σε εμβρυϊκά κύτταρα και επαγόμενα βλαστοκύτταρα και έχουν αποδειχθεί καθοριστικά για την ανάπτυξη του καρκίνου, αλλά οι γνώσεις μας σχετικά με τον ακριβή ρόλο τους στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα είναι περιορισμένη. Σκοπός της παρούσας διδακτορικής διατριβής ήταν η διερεύνηση του ρόλου των KMT2C / MLL3, H3K4me2 και H3K4me3 καθώς και των δεικτών βλαστικών κυττάρων OCT4 και LIN 28 (A και B ) στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Για τον σκοπό αυτό μελετήθηκε η πρωτεϊνική έκφραση των δεικτών αυτών σε ιστικά δείγματα 96 ασθενών με αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα και συσχετίστηκε με της κλινικοπαθολογοανατομικές παραμέτρους της νόσου. Τα κύρια αποτελέσματα της μελέτης μπορούν να συνοψιστούν ως εξής: 1.Η πυρηνική έκφραση του KMT2C / MLL3 στα νεοπλασματικά επιθηλιακά κύτταρα που συσχετίστηκε με την επιβίωση παρουσίασε ένα διφασικό πρότυπο. Μετά από δύο χρόνια κλινικής παρακολούθησης, οι ασθενείς σταδίου 1, 2 και 3 και με αυξημένη πυρηνική έκφραση του MLL3 είχαν χειρότερη επιβίωση. 2. Η πυρηνική έκφραση της διμεθυλιωμένης ιστόνης H3K4me2 συσχετίστηκε με το φύλο και ανέδειξε ότι οι γυναίκες είχαν υψηλότερη έκφραση από τους άνδρες. Με την ανάλυση σύμφωνα με το στάδιο, βρέθηκε ότι οι ασθενείς με τα στάδια 1 και 2 και υψηλότερη έκφραση της H3K4me2, είχαν καλύτερη διετή- και τριετή- επιβίωση, σε σχέση με αυτούς που είχαν χαμηλή έκφραση της H3K4me2. 3. Υψηλότερη έκφραση του OCT4 σχετίστηκε με καλύτερη συνολική 5 ετή επιβίωση. 4. Οι ασθενείς με μεταστατική νόσο στους λεμφαδένες σταδίου N2 βρέθηκε να έχουν χαμηλότερη έκφραση του LIN28A σε σχέση με τους ασθενείς σταδίου N0 και N1. 5.H κυτταροπλασματική έκφραση του LIN28B σχετίστηκε με την 5-ετή επιβίωση και βρέθηκε ότι ασθενείς με χαμηλότερη έκφραση είχαν καλύτερη 5-ετή επιβίωση. Σημαντική ήταν επίσης η συσχέτιση μεταξύ της πυρηνικής έκφρασης του LIN28B και της 2-ετούς επιβίωσης. Συμπερασματικά τα αποτελέσματα της μελέτης μας ανέδειξαν τον προγνωστικό ρόλο της MLL3, της H3K4me2 και του Lin28B στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα, καθώς και την αλληλεπίδραση του δείκτη βλαστικών κυττάρων (Lin28B) με τους επιγενετικούς μηχανισμούς (MLL3, H3K4me2), οι οποίοι μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως ανεξάρτητοι προγνωστικοί παράγοντες και να αποτελέσουν μελλοντικούς στόχους θεραπείας.
author2 Bosgana, Pinelopi
author_facet Bosgana, Pinelopi
Μποσγανά, Πηνελόπη
author Μποσγανά, Πηνελόπη
author_sort Μποσγανά, Πηνελόπη
title Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
title_short Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
title_full Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
title_fullStr Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
title_full_unstemmed Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
title_sort μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα
publishDate 2022
url http://hdl.handle.net/10889/16586
work_keys_str_mv AT mposganapēnelopē meletēepigenetikōnallagōnkaiarchegonōnblastikōnkyttarōnstoprōtopathesadenokarkinōmatoupneumona
AT mposganapēnelopē studyofepigeneticchangesandstemcellsinprimarylungadenocarcinoma
_version_ 1771297270947381248
spelling nemertes-10889-165862022-09-05T20:14:37Z Μελέτη επιγενετικών αλλαγών και αρχέγονων βλαστικών κυττάρων στο πρωτοπαθές αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα Study of epigenetic changes and stem cells in primary lung adenocarcinoma Μποσγανά, Πηνελόπη Bosgana, Pinelopi Αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα Καρκίνος Lung adenocarcinoma Cancer H3K4me Οι επιγενετικές αλλαγές, οι τροποποιήσεις δηλαδή που συμβαίνουν στην λειτουργία των γονιδίων, χωρίς να υπάρχει μεταβολή στην αλληλουχία του DNA, βρέθηκε ότι σχετίζονται με διάφορες παθολογικές καταστάσεις όπως ο καρκίνος. Η μεθυλίωση υπολειμμάτων λυσίνης και αργινίνης σε ουρές ιστόνης αντιπροσωπεύει μια σύνθετη διαδικασία επιγενετικής τροποποίησης της χρωματίνης. Αυτή η τροποποιήση ρυθμίζεται από ένζυμα μεθυλοτρανσφεράσες και απομεθυλάσες, που τοποθετούν και αφαιρούν, αντίστοιχα, ειδικά σήματα μεθυλίου κρίσιμα για την έκφραση γονιδίων. Η μεθυλίωση της ιστόνη Η3 στην λυσίνη 4 (H3K4me), είναι μια εξελικτικά διατηρημένη τροποποίηση ιστόνης που σηματοδοτεί περιοχές δραστικής μεταγραφής και ρυθμίζει την κυτταρική ανάπτυξη, τη μετανάστευση και την ικανότητα διήθησης των κυττάρων. Η ανώμαλη μεθυλίωση της ιστόνης συνδέεται στενά με την ανάπτυξη και την εξέλιξη του όγκου και έχει συσχετιστεί με κακή πρόγνωση σε καρκινοπαθείς. Τα μέλη της οικογένειας MLL / KMT2 των μεθυλοτρανσφερασών της ιστόνης μεθυλιώνουν συγκεκριμένα την ιστόνη Η3 στην λυσίνη 4 και προσθέτουν μία, δύο ή τρεις ομάδες μεθυλίου σε Η3 που καταλήγουν σε μονομεθυλίωση Η3Κ4 (me1), διμεθυλίωση Η3Κ4 (me2) ή τριμεθυλίωση Η3Κ4 (me3), αντίστοιχα. Τα μέλη αυτής της ομάδας συχνά απορρυθμίζονται στον καρκίνο. Το KMT2C (επίσης γνωστό ως MLL3) είναι ένας υποτιθέμενος καταστολέας όγκων σε αρκετά επιθηλιακά κύτταρα και ένα από τα πλέον συχνά μεταλλαγμένα γονίδια στον καρκίνο με συχνότητα μετάλλαξης περίπου 8%. Οι μεταλλάξεις στο γονίδιο MLL3 έχουν επίσης εντοπιστεί σε αδενοκαρκινώματα πνεύμονα. Ωστόσο, μέχρι σήμερα είναι διαθέσιμα πολύ περιορισμένα δεδομένα για την έκφραση των ενζύμων τροποποίησης της ιστόνης και των αντίστοιχων δεικτών τροποποιήσεων τους στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Τα καρκινικά βλαστικά κύτταρα (CSC’s) από την άλλη, έχουν αποκτήσει αυξημένη προσοχή των μελετητών τα τελευταία χρόνια, λόγω της δυνατότητάς τους να δημιουργούν νέους όγκους, μέσω της ικανότητας τους να αυτοανανεώνονται και να διαφοροποιούνται, σε πολλαπλές κυτταρικές γενεές. To OCT 4 και το LIN 28 (ομόλογο Α και Β) έχουν αναγνωριστεί ως βασικοί ρυθμιστές της πολυδύναμης δράσης σε εμβρυϊκά κύτταρα και επαγόμενα βλαστοκύτταρα και έχουν αποδειχθεί καθοριστικά για την ανάπτυξη του καρκίνου, αλλά οι γνώσεις μας σχετικά με τον ακριβή ρόλο τους στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα είναι περιορισμένη. Σκοπός της παρούσας διδακτορικής διατριβής ήταν η διερεύνηση του ρόλου των KMT2C / MLL3, H3K4me2 και H3K4me3 καθώς και των δεικτών βλαστικών κυττάρων OCT4 και LIN 28 (A και B ) στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Για τον σκοπό αυτό μελετήθηκε η πρωτεϊνική έκφραση των δεικτών αυτών σε ιστικά δείγματα 96 ασθενών με αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα και συσχετίστηκε με της κλινικοπαθολογοανατομικές παραμέτρους της νόσου. Τα κύρια αποτελέσματα της μελέτης μπορούν να συνοψιστούν ως εξής: 1.Η πυρηνική έκφραση του KMT2C / MLL3 στα νεοπλασματικά επιθηλιακά κύτταρα που συσχετίστηκε με την επιβίωση παρουσίασε ένα διφασικό πρότυπο. Μετά από δύο χρόνια κλινικής παρακολούθησης, οι ασθενείς σταδίου 1, 2 και 3 και με αυξημένη πυρηνική έκφραση του MLL3 είχαν χειρότερη επιβίωση. 2. Η πυρηνική έκφραση της διμεθυλιωμένης ιστόνης H3K4me2 συσχετίστηκε με το φύλο και ανέδειξε ότι οι γυναίκες είχαν υψηλότερη έκφραση από τους άνδρες. Με την ανάλυση σύμφωνα με το στάδιο, βρέθηκε ότι οι ασθενείς με τα στάδια 1 και 2 και υψηλότερη έκφραση της H3K4me2, είχαν καλύτερη διετή- και τριετή- επιβίωση, σε σχέση με αυτούς που είχαν χαμηλή έκφραση της H3K4me2. 3. Υψηλότερη έκφραση του OCT4 σχετίστηκε με καλύτερη συνολική 5 ετή επιβίωση. 4. Οι ασθενείς με μεταστατική νόσο στους λεμφαδένες σταδίου N2 βρέθηκε να έχουν χαμηλότερη έκφραση του LIN28A σε σχέση με τους ασθενείς σταδίου N0 και N1. 5.H κυτταροπλασματική έκφραση του LIN28B σχετίστηκε με την 5-ετή επιβίωση και βρέθηκε ότι ασθενείς με χαμηλότερη έκφραση είχαν καλύτερη 5-ετή επιβίωση. Σημαντική ήταν επίσης η συσχέτιση μεταξύ της πυρηνικής έκφρασης του LIN28B και της 2-ετούς επιβίωσης. Συμπερασματικά τα αποτελέσματα της μελέτης μας ανέδειξαν τον προγνωστικό ρόλο της MLL3, της H3K4me2 και του Lin28B στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα, καθώς και την αλληλεπίδραση του δείκτη βλαστικών κυττάρων (Lin28B) με τους επιγενετικούς μηχανισμούς (MLL3, H3K4me2), οι οποίοι μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως ανεξάρτητοι προγνωστικοί παράγοντες και να αποτελέσουν μελλοντικούς στόχους θεραπείας. Epigenetic changes are modifications that occur in the function of genes, without altering the DNA sequence and they are associated with various pathological conditions like cancer. Methylation of lysine and arginine in histone tails represents a complex process of epigenetic modification of chromatin. This modification is regulated by methyltransferase and dimethylase enzymes, which insert and remove specific methyl signals, critical for gene expression. The methylation of histone H3 to lysine 4 (H3K4me) is an evolutionarily conserved histone modification that signals regions of active transcription and regulates cell growth, migration, and cell infiltration capacity. Abnormal histone methylation is closely associated with tumor growth and development and has been associated with a poor prognosis in cancer patients. Members of the MLL / KMT2 family of histone methyltransferases specifically methylate H3 histone to lysine 4 and add one, two or three methyl groups to H3 resulting H3K4 monomethylation (H3K4me1), H3K4 dimethylation (H3K4me2) or H3K4 trimethylation (H3K4me3) . Members of this group are often deregulated in cancer. KMT2C (also known as MLL3) is a putative tumor suppressor in several epithelial cells and one of the most commonly mutated genes in cancer with a mutation rate about 8%. Mutations in the MLL3 gene have also been identified in lung adenocarcinomas. However, very limited data are available on the expression of histone modifying enzymes and their corresponding markers of modification in lung carcinoma. Cancer stem cells (CSCs), on the other hand, have received increasing attention from researchers in recent years, because of their ability to create new tumors, through their ability to self-renew and differentiate into multiple cell generations. OCT 4 and LIN 28 (homologs A and B) have been identified as key regulators of multivalent activity in mammalian embryonic and induced stem cells and have been shown to be crucial for the development of cancer, but our knowledge about their exact role in lung adenocarcinoma is limited. The aim of our study was to investigate the role of KMT2C / MLL3, H3K4me2 and H3K4me3 as well as OCT4 and LIN 28 stem cell markers (A and B) in lung adenocarcinoma. For this purpose, the protein expression of these markers was stydied in tissue samples of 96 patients with lung adenocarcinoma and correlated with the clinical and pathological parameters of the disease. The main results of the study can be summarized as follows:  Nuclear expression of KMT2C / MLL3 in survival-associated neoplastic epithelial cells showed a biphasic pattern. After two years of clinical follow-up, patients with stage 1, 2, and 3 and increased nuclear expression of MLL3 had worse survival.  Nuclear expression of dimethylated histone H3K4me2 was correlated with gender and showed that women had higher expression than men. Stage analysis found that patients with stages 1 and 2 and higher H3K4me2 expression had better two- and three-year survival than those with low H3K4me2 expression.  Higher OCT4 expression was associated with better overall 5-year survival.  Patients with stage N2 metastatic lymph node disease were found to have lower LIN28A expression than patients with stage N0 and N1.  Cytoplasmic expression of LIN28B was correlated with 5-year survival and patients with lower expression were found to have a better 5-year survival. The correlation between LIN28B nuclear expression and 2-year survival was also significant. In conclusion, the results of our study highlighted the prognostic role of MLL3, H3K4me2 and Lin28B in lung adenocarcinoma, as well as the interaction of the stem cell marker (Lin28B) with epigenetic mechanisms (MLL3, H3K4me2), which can be used as independent prognostic factors and be future treatment targets. 2022-08-03T10:09:35Z 2022-08-03T10:09:35Z 2021-08-28 http://hdl.handle.net/10889/16586 gr application/pdf