| Περίληψη: | Ο καρκίνος είναι μια πολυπαραγοντική γενετική ασθένεια που χαρακτηρίζεται από τον ανεξέλεγκτο πολλαπλασιασμό των κυττάρων ενός οργανισμού. Την τελευταία δεκαετία, λόγω της προόδου της ιατρικής ακριβείας στην ογκολογία, οι γενετικοί πολυμορφισμοί θεωρούνται χρήσιμοι στην κατανόηση της εξέλιξης ενός όγκου. Βάσει του γενετικού τους προτύπου, οι ασθενείς χωρίζονται σε υποομάδες που πάσχουν από ίδιο τύπο καρκίνο, ο οποίος παρουσιάζει συγκεκριμένα μοριακά χαρακτηριστικά, που αφορούν κυρίως δομικές αλλαγές στο γονιδίωμα ή στο πρότυπο της γονιδιακής έκφρασης. Η ανίχνευση των μοριακών αλλαγών του καρκινικού γονιδιώματος έχει δειχθεί πως είναι χρήσιμη στη διάγνωση, την καλύτερη πρόγνωση και εν δυνάμει, τη θεραπεία κατά του καρκίνου. Το αντικείμενο της παρούσας διπλωματικής εργασίας ήταν η ανίχνευση μεταλλάξεων των γονιδίων EGFR, BRAF, KRAS, NRAS και KIT, σε DNA απομονωμένο από ιστικά δείγματα τομών παραφίνης καρκίνου του παχέος εντέρου. Επειδή τα ανωτέρω γονίδια συμβάλλουν και σε άλλους τύπους καρκίνου, συμπληρωματικά, αναλύθηκαν και 12 δείγματα ασθενών με μελάνωμα, καθώς και 14 δείγματα ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα. Όλα τα δείγματα χαρακτηρίζονται από καλά μελετημένα κλινικά και ιστοπαθολογικά δεδομένα του Εργαστηρίου Παθολογικής Ανατομίας του ΓΠΝΠ. H ανίχνευση των μεταλλάξεων έγινε αξιοποιώντας το σύστημα γονοτύπησης υψηλής απόδοσης MassARRAY της Agena Bioscience. Τα αποτελέσματα της μελέτης έδειξαν διαφορετικό πρότυπο γονιδιακών μεταλλάξεων στους τρεις τύπους καρκίνου. Στο
μελάνωμα ανιχνεύθηκαν μεταλλάξεις στις κωδικές περιοχές των γονιδίων BRAF, KRAS, NRAS και KIT, στον καρκίνο του πνεύμονα μόνο στα γονίδια EFGR και KRAS, ενώ στον καρκίνο του παχέος εντέρου ήταν μεταλλαγμένα κυρίως τα γονίδια BRAF, KRAS και σε ελάχιστα δείγματα το γονίδιο NRAS. Η στατιστική ανάλυση με Fisher’s exact test στα δείγματα του παχέος εντέρου, έδειξε μια συσχέτιση (P=0.01) των μεταλλάξεων στο γονίδιο BRAF με πιθανότητα μικροδορυφορικής αστάθειας του DNA (MSI-high), μεταξύ των μεταλλάξεων στο γονίδιο BRAF και δεξιάς κολεκτομής (P=0.05) και μεταξύ της μετάλλαξης BRAF-V600E με το γυναικείο φύλο (P=0.03) αλλά και με τους ασθενείς άνω
των 70 ετών (P=0.005). Από τη σύγκριση των δεδομένων των πειραμάτων μας με αυτά της σύγχρονης βιβλιογραφίας, το σύστημα MassARRAY αξιολογήθηκε ως μια αξιόπιστη υψηλής απόδοσης τεχνολογία γονοτύπησης και ποσοτικής εκτίμησης της συχνότητας μεταλλάξεων σε δείγματα καρκινικού ιστού.
|
|---|
