Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους
Το ήπαρ (γνωστό και ως συκώτι) είναι ένα μεγάλο όργανο των σπονδυλωτών στο οποίο πραγματοποιούνται πολλές, ζωτικής σημασίας λειτουργίες για τον οργανισμό. Μερικές φορές παρατηρείται το φαινόμενο τα κύτταρα στο ήπαρ να αλλάζουν και σα συνέπεια αυτού να μην αναπτύσσονται πλέον ή να μη συμπεριφέρονται...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2022
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | https://hdl.handle.net/10889/23797 |
| id |
nemertes-10889-23797 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα Καρκίνος του ήπατος Liver HepatoCellular Carcinoma (LHCC) |
| spellingShingle |
Ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα Καρκίνος του ήπατος Liver HepatoCellular Carcinoma (LHCC) Κόκκινου, Αλεξάνδρα Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| description |
Το ήπαρ (γνωστό και ως συκώτι) είναι ένα μεγάλο όργανο των σπονδυλωτών στο οποίο πραγματοποιούνται πολλές, ζωτικής σημασίας λειτουργίες για τον οργανισμό. Μερικές φορές παρατηρείται το φαινόμενο τα κύτταρα στο ήπαρ να αλλάζουν και σα συνέπεια αυτού να μην αναπτύσσονται πλέον ή να μη συμπεριφέρονται φυσιολογικά. Αυτές οι αλλαγές μπορεί να οδηγήσουν σε καλοήθεις όγκους, αλλά σε ορισμένες περιπτώσεις οι αλλαγές στα ηπατικά κύτταρα μπορούν να προκαλέσουν καρκίνο. Τις περισσότερες φορές, ο καρκίνος του ήπατος ξεκινά σε κύτταρα που ονομάζονται ηπατοκύτταρα. Αυτός ο τύπος καρκίνου ονομάζεται ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα (Liver HepatoCellular Carcinoma – LHCC) και είναι ο πιο κοινός τύπος καρκίνου του ήπατος σε παγκόσμιο επίπεδο και η τρίτη σε σειρά πιο κοινή αιτία θανάτου από καρκίνο. Ως παράγοντες κινδύνου για το LHCC έχουν αναφερθεί μεταξύ άλλων η χρόνια ηπατίτιδα Β και Γ, η κατάχρηση αλκοόλ και η κύρωση (Yan et al., 2020). Η θεραπεία του LHCC εξαρτάται από το στάδιο του όγκου, και για ασθενείς αρχικού σταδίου περιλαμβάνει μεταμόσχευση, εκτομή, χημειοθεραπεία και ακτινοθεραπεία (Ouyang, Yi, Pan, & Chen, 2020). Προκύπτει λοιπόν η ανάγκη για την έγκαιρη διάγνωση της νόσου και των παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση των ασθενών. Σε αυτή την κατεύθυνση βοηθούν βάσεις δεδομένων με στοιχεία από παρακολούθηση ασθενών LHCC. Μια τέτοια βάση δεδομένων είναι η The Cancer Genome Atlas (TCGA) η οποία περιλαμβάνει μεταξύ διαφόρων τύπων δεδομένων και κλινικά δεδομένα για 377 ασθενείς LHCC (Ally et al., 2017). Στην παρούσα εργασία θα μελετηθεί ο συγκεκριμένος τύπος καρκίνου καθώς και οι κλινικοί παράγοντες από τους οποίους επηρεάζεται η πρόγνωση του ασθενούς. Πιο συγκεκριμένα θα ερευνηθεί η ύπαρξη συσχετίσεων μεταξύ των διαθέσιμων κλινικών δεδομένων και της ένδειξης αν ο ασθενής έχει επιζήσει για όλη τη διάρκεια της παρακολούθησης, για 5 χρόνια από τη διάγνωση, για 3 και για 1. Κάθε ένα από τα κλινικά δεδομένα θα ερευνηθεί αν συσχετίζεται με την επιβίωση με στατιστικές μεθόδους. Στη συνέχεια, θα διερευνηθεί αν με τεχνικές μηχανικής μάθησης θα μπορούσε να εντοπιστεί ένα υποσύνολο των κλινικών δεδομένων με δυνατότητα πρόβλεψης της επιβίωσης ενός ασθενούς. |
| author2 |
Kokkinou, Alexandra |
| author_facet |
Kokkinou, Alexandra Κόκκινου, Αλεξάνδρα |
| author |
Κόκκινου, Αλεξάνδρα |
| author_sort |
Κόκκινου, Αλεξάνδρα |
| title |
Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| title_short |
Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| title_full |
Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| title_fullStr |
Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| title_full_unstemmed |
Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| title_sort |
μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους |
| publishDate |
2022 |
| url |
https://hdl.handle.net/10889/23797 |
| work_keys_str_mv |
AT kokkinoualexandra meletēparagontōnpouepēreazountēnprognōsētouliverhepatocellularcarcinomameypologistikesmethodous AT kokkinoualexandra studyoffactorsinfluencingtheprognosisofliverhepatocellularcarcinomawithcomputationalmethods |
| _version_ |
1771297267378028544 |
| spelling |
nemertes-10889-237972022-11-10T04:36:41Z Μελέτη παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση του liver hepatocellular carcinoma με υπολογιστικές μεθόδους Study of factors influencing the prognosis of liver hepatocellular carcinoma with computational methods Κόκκινου, Αλεξάνδρα Kokkinou, Alexandra Ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα Καρκίνος του ήπατος Liver HepatoCellular Carcinoma (LHCC) Το ήπαρ (γνωστό και ως συκώτι) είναι ένα μεγάλο όργανο των σπονδυλωτών στο οποίο πραγματοποιούνται πολλές, ζωτικής σημασίας λειτουργίες για τον οργανισμό. Μερικές φορές παρατηρείται το φαινόμενο τα κύτταρα στο ήπαρ να αλλάζουν και σα συνέπεια αυτού να μην αναπτύσσονται πλέον ή να μη συμπεριφέρονται φυσιολογικά. Αυτές οι αλλαγές μπορεί να οδηγήσουν σε καλοήθεις όγκους, αλλά σε ορισμένες περιπτώσεις οι αλλαγές στα ηπατικά κύτταρα μπορούν να προκαλέσουν καρκίνο. Τις περισσότερες φορές, ο καρκίνος του ήπατος ξεκινά σε κύτταρα που ονομάζονται ηπατοκύτταρα. Αυτός ο τύπος καρκίνου ονομάζεται ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα (Liver HepatoCellular Carcinoma – LHCC) και είναι ο πιο κοινός τύπος καρκίνου του ήπατος σε παγκόσμιο επίπεδο και η τρίτη σε σειρά πιο κοινή αιτία θανάτου από καρκίνο. Ως παράγοντες κινδύνου για το LHCC έχουν αναφερθεί μεταξύ άλλων η χρόνια ηπατίτιδα Β και Γ, η κατάχρηση αλκοόλ και η κύρωση (Yan et al., 2020). Η θεραπεία του LHCC εξαρτάται από το στάδιο του όγκου, και για ασθενείς αρχικού σταδίου περιλαμβάνει μεταμόσχευση, εκτομή, χημειοθεραπεία και ακτινοθεραπεία (Ouyang, Yi, Pan, & Chen, 2020). Προκύπτει λοιπόν η ανάγκη για την έγκαιρη διάγνωση της νόσου και των παραγόντων που επηρεάζουν την πρόγνωση των ασθενών. Σε αυτή την κατεύθυνση βοηθούν βάσεις δεδομένων με στοιχεία από παρακολούθηση ασθενών LHCC. Μια τέτοια βάση δεδομένων είναι η The Cancer Genome Atlas (TCGA) η οποία περιλαμβάνει μεταξύ διαφόρων τύπων δεδομένων και κλινικά δεδομένα για 377 ασθενείς LHCC (Ally et al., 2017). Στην παρούσα εργασία θα μελετηθεί ο συγκεκριμένος τύπος καρκίνου καθώς και οι κλινικοί παράγοντες από τους οποίους επηρεάζεται η πρόγνωση του ασθενούς. Πιο συγκεκριμένα θα ερευνηθεί η ύπαρξη συσχετίσεων μεταξύ των διαθέσιμων κλινικών δεδομένων και της ένδειξης αν ο ασθενής έχει επιζήσει για όλη τη διάρκεια της παρακολούθησης, για 5 χρόνια από τη διάγνωση, για 3 και για 1. Κάθε ένα από τα κλινικά δεδομένα θα ερευνηθεί αν συσχετίζεται με την επιβίωση με στατιστικές μεθόδους. Στη συνέχεια, θα διερευνηθεί αν με τεχνικές μηχανικής μάθησης θα μπορούσε να εντοπιστεί ένα υποσύνολο των κλινικών δεδομένων με δυνατότητα πρόβλεψης της επιβίωσης ενός ασθενούς. The liver is a large organ of vertebrates which performs many vital body functions. Occasionally there is a phenomenon of cells in the liver changing and as a result no longer growing or behaving normally. These changes can lead to benign tumors, but in some cases changes in liver cells can cause cancer. Most often, liver cancer starts in cells called hepatocytes. This type of cancer is called Liver HepatoCellular Carcinoma (LHCC) and is the most common type of liver cancer worldwide and the third most common cause of cancer death. Chronic hepatitis B and C, alcohol abuse and sanction have been reported as risk factors for LHCC (Yan et al., 2020). LHCC treatment depends on the stage of the tumor, and for early-stage patients includes transplantation, resection, chemotherapy, and radiotherapy (Ouyang, Yi, Pan, & Chen, 2020). Thus, early diagnosis of the disease and understanding of the factors that affect the patients’ prognosis is crucial. Databases with data from monitoring LHCC patients could help in this direction. One such database is The Cancer Genome Atlas (TCGA) which includes various data types and clinical data for 377 LHCC patients (Ally et al., 2017). In this work we will explore the factors that affect LHCC patients’ prognosis. More specifically, the existence of correlations between the available clinical data and the indication of whether the patient has survived for the entire duration of the follow-up, for 5 years from the diagnosis, for 3 and for 1 will be studied. Each of the clinical factors will be investigated for potential correlation with survival by statistical methods. Next, it will be investigated whether machine learning techniques could identify a subset of clinical factors that can predict a patient's survival. 2022-11-09T07:00:52Z 2022-11-09T07:00:52Z 2022-06-16 https://hdl.handle.net/10889/23797 el CC0 1.0 Universal http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ application/pdf |
