| Summary: | Τα βιολογικά δίκτυα παρέχουν μια μαθηματική αναπαράσταση των συνδέσεων που βρίσκονται σε οικολογικές, εξελικτικές και βιολογικές μελέτες, όπως για παράδειγμα η ακολουθία του ανθρώπινου γονιδιώματος. Στόχος της παρούσας μελέτης είναι να μελετηθούν τα βιολογικά δίκτυα από τη σκοπιά της θεωρίας της πληροφορίας, καθώς και να πραγματοποιηθεί η ανάπτυξη εργαλείου για την ανάλυση βιολογικών γράφων μεγάλης κλίμακας. Για την ορθή προσέγγιση του θέματος πραγματοποιήθηκε βιβλιογραφική και ιστορική ανασκόπηση επί των βιολογικών δικτύων και του ανθρώπινου γονιδιώματος, το οποίο αποτελεί παράδειγμα βιολογικού δικτύου. Παράλληλα, έγινε θεωρητική προσέγγιση μεθόδων που αφορούν την ανάλυση μονοπατιών σε βιολογικούς γράφους, όπως η μέθοδος TEAK, DEAP και CLIPPER. Στο ερευνητικό μέρος της εργασίας έγινε υλοποίηση μιας πλατφόρμας μοντελοποίησης βιολογικών γράφων, μέσω της γλώσσας προγραμματισμού R και του πακέτου shiny. Επίσης, χρησιμοποιήθηκε το πακέτο σχεδιασμού και υλοποίησης γράφων δεδομένων igraph.
|
|---|
