| Περίληψη: | Οι macro επικράτειες είναι οικογένεια δομών που έχουν αναγνωριστεί σε όλες τις μορφές ζωής και σε ss(+)RNA ιούς. Οι οικογένειες των ιών που διαθέτουν macro επικράτειες είναι οι εξής: Togaviridae, Hepeviridae, Coronaviridae, με τον SARS-CoV-2 να ανήκει στην τελευταία. Ο SARS-CoV-2 είναι η αιτία της νόσου COVID-19, η οποία στις μέρες μας έχει πάρει διαστάσεις πανδημίας. Μετά την macro επικράτεια στην ακολουθία του SARS-CoV-2 ιικού πολυπεπτιδίου, έπονται οι επικράτειες, γνωστές ως SARS Unique-Domains (SUDs). Είναι επικράτειες οι οποίες εμφανίζονται μόνο σε ορισμένα είδη ιών/κορονοϊών. Αυτές υιοθετούν macro-like αρχιτεκτονική αλλά δεν διαθέτουν την ικανότητα να προσδένουν ADP-r. Ωστόσο, παραμένουν απαραίτητες για την αντιγραφή/μεταγραφή του γονιδιώματος του ιού και συνεπώς αποτελούν εν δυνάμει φαρμακευτικούς στόχους. Επιπλέον, για τις συγκεκριμένες επικράτειες ακόμα έχει δειχθεί ότι αλληλεπιδρούν με μόρια RNA και DNA που είναι πλούσια σε γουανίνη (G), ενώ προσδένουν με μεγαλύτερη συγγένεια ολιγονουκλεοτίδια που διαθέτουν δευτεροταγή δομή που ονομάζεται G-quadruplexes. Ακόμα αλληλεπιδρούν με αρκετές πρωτεΐνες των ξενιστών. Στον άνθρωπο έχουν αναγνωριστεί 16 PARPs, όπως αναφέρεται στη βιβλιογραφία και τρεις εκ των οποίων διαθέτουν macro επικράτειες (hPARP9, hPARP14, hPARP15 – “macro-PARPs”). Πιο συγκεκριμένα έχει αναφερθεί πως η hPARP9, η οποία διαθέτει δύο macro επικράτειες, εκδηλώνει ή ενισχύει την δράση της ως ετεροδιμερές με την DTX3L, μια Ε3 λιγάση της ουβικιτίνης, και συμμετέχουν συνεργατικά στην επιδιόρθωση βλαβών του DNA αλλά και στην ανοσολογική απόκριση έναντι ιών μέσω του μονοπατιού των ιντερφερονών. Η συγκεκριμένη μεταπτυχιακή εργασία έχει ως σκοπό τη μελέτη ανθρώπινων και ιικών macro και “macro-like” επικρατειών και πιο συγκεκριμένα στοχεύει α) στη αποσαφήνιση της δομής της macro 2 επικράτειας της hPARP9 σε σύμπλοκο με τον φυσικό προσδέτη ΑDP-r, β) στη μελέτη των macro-like επικρατειών του SARS-CoV-2 ,SUD επικρατειών, (SUD-N, SUD-M) αλλά και της καρβοξυτελικής επικράτειας του SARS-UNIQUE-DOMAIN (SUD-C) καθώς και η μελέτη των αλληλεπιδράσεων αυτών με μόρια RNA και DNA. Η δομική μελέτη και οι αλληλεπιδράσεις των παραπάνω πολυπεπτιδίων πραγματοποιήθηκε μέσω φασματοσκοπίας NMR. Η διερεύνηση της πρωτεϊνικής αρχιτεκτονικής των παραπάνω μορίων και των αλληπιδράσεων θα συνεισφέρουν στη διαλεύκανση της σχέσης δομής-δράσης των υπό μελέτη ανθρώπινων και ιικών πρωτεϊνών.
|
|---|
