Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών
Ο καρκίνος μαστού είναι ο πιο κοινός εμφανιζόμενος καρκίνος στις γυναίκες, παγκοσμίως. Μοριακά ταξινομείται σε τέσσερις υπότυπους, οι οποίοι διαφέρουν τόσο στην πρόγνωση όσο και στην θεραπευτική ανταπόκριση. Η ταξινόμηση αυτή παρέχει σημαντικές πληροφορίες σχετικά με νέες στρατηγικές θεραπείας και...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2023
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | https://hdl.handle.net/10889/24323 |
| id |
nemertes-10889-24323 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Καρκίνος μαστού Πρωτεογλυκάνες Breast cancer Proteoglycans miRNA |
| spellingShingle |
Καρκίνος μαστού Πρωτεογλυκάνες Breast cancer Proteoglycans miRNA Χωραττά, Εύη Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| description |
Ο καρκίνος μαστού είναι ο πιο κοινός εμφανιζόμενος καρκίνος στις γυναίκες, παγκοσμίως. Μοριακά ταξινομείται σε τέσσερις υπότυπους, οι οποίοι διαφέρουν τόσο στην πρόγνωση όσο και στην θεραπευτική ανταπόκριση. Η ταξινόμηση αυτή παρέχει σημαντικές πληροφορίες σχετικά με νέες στρατηγικές θεραπείας και κατάλληλης αντιμετώπισης των ασθενών. Η θεραπεία καρκίνου μαστού είναι πολύπλοκη και πολλές φορές πραγματοποιείται με συνδυασμό πολλών μεθόδων όπως χειρουργική επέμβαση, χημειοθεραπεία, ραδιοθεραπεία, ορμονική θεραπεία και βιολογική θεραπεία. Δεδομένου της συνεχούς αύξησης ποσοστού τόσο της εμφάνισης όσο και της θνησιμότητας καρκίνου μαστού, είναι επείγουσα ανάγκη η μελέτη πιθανών διαγνωστικών και προγνωστικών βιοδεικτών οι οποίοι θα συνεισφέρουν στην βελτίωση των κλινικών αποτελεσμάτων των ασθενών.
Οι πρωτεογλυκάνες αποτελούν κύρια συστατικά του εξωκυττάριου χώρου, τα οποία εκτός του ότι εμπλέκονται σε διάφορες φυσιολογικές διαδικασίες, ελέγχουν και διάφορες παθολογικές καταστάσεις. Στον καρκίνο μαστού, πολλές πρωτεογλυκάνες παρουσιάζουν διαφορετικά προφίλ έκφρασης τα οποία συνεισφέρουν σε διάφορες διεργασίες οι οποίες ευνοούν την ανάπτυξη, τον πολλαπλασιασμό και την εξάπλωση του όγκου. Τα miRNAs αποτελούν μονόκλωνα μόρια RNA, τα οποία ρυθμίζουν σε μετα-μεταγραφικό επίπεδο την γονιδιακή έκφραση. Έχει εντοπιστεί μεγάλος αριθμός miRNAs τα οποία εμφανίζουν τροποποιημένη έκφραση σε διάφορους υπότυπους καρκίνου μαστού και συμβάλλουν στην ανάπτυξη και εξέλιξη του όγκου.
O καθορισμός των πρωτεογλυκανών που ευνοούν την ανάπτυξη καρκίνου μαστού, αλλά και των σχετιζόμενων μ΄αυτές miRNAs ανοίγει καινούρια παράθυρα τόσο στην διάγνωση όσο και στην θεραπεία του καρκίνου μαστού. Η κατανόηση των δικτύων που ρυθμίζουν τα παραπάνω μόρια και η μελέτη αλλαγής έκφρασης τους μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη νέων βιοδεικτών και νέων θεραπευτικών προσεγγίσεων.
Στην παρούσα διπλωματική εργασία σκοπός ήταν η εύρεση πρωτεογλυκανών οι οποίες παρουσιάζουν τροποποιημένη έκφραση μεταξύ φυσιολογικών και καρκινικών κυττάρων μαστού, καθώς και η αξιολόγηση της προγνωστικής τους αξίας μέσω των προγραμμάτων ualcan και kMplot, αντίστοιχα. Ακολούθως, μέσω της βάσης δεδομένων miRDB, πραγματοποιήθηκε διερεύνηση πιθανών miRNAs τα οποία ρυθμίζουν πρωτεογλυκάνες οι οποίες εκφράζονται διαφορετικώς στα καρκινικά κύτταρα και τέλος μελετήθηκε η έκφραση τους, μέσω του προγράμματος ualcan.
Συνοπτικά, τ’ αποτελέσματα καταδεικνύουν τις πρωτεογλυκάνες glypican-3, lumican, syndecan-1 και versican ως δυνητικούς βιοδείκτες, αλλά και ως φαρμακευτικούς στόχους για βελτιωμένες θεραπευτικές ανταποκρίσεις. Επίσης miRNAs, όπως hsa-miR-9-5p, hsa-miR-98-3p έχουν βρεθεί ότι ελέγχουν παράλληλα περισσότερες από μία από τις προαναφερθείσες πρωτεογλυκάνες, τα οποία είτε μέσω σίγασης είτε μέσω χορήγησης μπορούν ν’ ανοίξουν νέα παράθυρα ως προς την θεραπεία καρκίνου μαστού. |
| author2 |
Horatta, Evi |
| author_facet |
Horatta, Evi Χωραττά, Εύη |
| author |
Χωραττά, Εύη |
| author_sort |
Χωραττά, Εύη |
| title |
Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| title_short |
Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| title_full |
Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| title_fullStr |
Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| title_full_unstemmed |
Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| title_sort |
έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων mirnas σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών |
| publishDate |
2023 |
| url |
https://hdl.handle.net/10889/24323 |
| work_keys_str_mv |
AT chōrattaeuē ekphrasētōnprōteoglykanōnkaitōnschetizomenōnmirnassekarkinomastouepidrasētēsekphrasēsstēnepibiōsētōnasthenōn AT chōrattaeuē exrpessionofproteoglycansandrelatedmirnasinbreastcancereffectofexpressioninpatientssurvival |
| _version_ |
1771297306744717312 |
| spelling |
nemertes-10889-243232023-02-01T04:37:44Z Έκφραση των πρωτεογλυκανών και των σχετιζόμενων miRNAs σε καρκίνο μαστού : επίδραση της έκφρασης στην επιβίωση των ασθενών Exrpession of proteoglycans and related miRNAs in breast cancer : effect of expression in patients' survival Χωραττά, Εύη Horatta, Evi Καρκίνος μαστού Πρωτεογλυκάνες Breast cancer Proteoglycans miRNA Ο καρκίνος μαστού είναι ο πιο κοινός εμφανιζόμενος καρκίνος στις γυναίκες, παγκοσμίως. Μοριακά ταξινομείται σε τέσσερις υπότυπους, οι οποίοι διαφέρουν τόσο στην πρόγνωση όσο και στην θεραπευτική ανταπόκριση. Η ταξινόμηση αυτή παρέχει σημαντικές πληροφορίες σχετικά με νέες στρατηγικές θεραπείας και κατάλληλης αντιμετώπισης των ασθενών. Η θεραπεία καρκίνου μαστού είναι πολύπλοκη και πολλές φορές πραγματοποιείται με συνδυασμό πολλών μεθόδων όπως χειρουργική επέμβαση, χημειοθεραπεία, ραδιοθεραπεία, ορμονική θεραπεία και βιολογική θεραπεία. Δεδομένου της συνεχούς αύξησης ποσοστού τόσο της εμφάνισης όσο και της θνησιμότητας καρκίνου μαστού, είναι επείγουσα ανάγκη η μελέτη πιθανών διαγνωστικών και προγνωστικών βιοδεικτών οι οποίοι θα συνεισφέρουν στην βελτίωση των κλινικών αποτελεσμάτων των ασθενών. Οι πρωτεογλυκάνες αποτελούν κύρια συστατικά του εξωκυττάριου χώρου, τα οποία εκτός του ότι εμπλέκονται σε διάφορες φυσιολογικές διαδικασίες, ελέγχουν και διάφορες παθολογικές καταστάσεις. Στον καρκίνο μαστού, πολλές πρωτεογλυκάνες παρουσιάζουν διαφορετικά προφίλ έκφρασης τα οποία συνεισφέρουν σε διάφορες διεργασίες οι οποίες ευνοούν την ανάπτυξη, τον πολλαπλασιασμό και την εξάπλωση του όγκου. Τα miRNAs αποτελούν μονόκλωνα μόρια RNA, τα οποία ρυθμίζουν σε μετα-μεταγραφικό επίπεδο την γονιδιακή έκφραση. Έχει εντοπιστεί μεγάλος αριθμός miRNAs τα οποία εμφανίζουν τροποποιημένη έκφραση σε διάφορους υπότυπους καρκίνου μαστού και συμβάλλουν στην ανάπτυξη και εξέλιξη του όγκου. O καθορισμός των πρωτεογλυκανών που ευνοούν την ανάπτυξη καρκίνου μαστού, αλλά και των σχετιζόμενων μ΄αυτές miRNAs ανοίγει καινούρια παράθυρα τόσο στην διάγνωση όσο και στην θεραπεία του καρκίνου μαστού. Η κατανόηση των δικτύων που ρυθμίζουν τα παραπάνω μόρια και η μελέτη αλλαγής έκφρασης τους μπορεί να συμβάλει στην ανάπτυξη νέων βιοδεικτών και νέων θεραπευτικών προσεγγίσεων. Στην παρούσα διπλωματική εργασία σκοπός ήταν η εύρεση πρωτεογλυκανών οι οποίες παρουσιάζουν τροποποιημένη έκφραση μεταξύ φυσιολογικών και καρκινικών κυττάρων μαστού, καθώς και η αξιολόγηση της προγνωστικής τους αξίας μέσω των προγραμμάτων ualcan και kMplot, αντίστοιχα. Ακολούθως, μέσω της βάσης δεδομένων miRDB, πραγματοποιήθηκε διερεύνηση πιθανών miRNAs τα οποία ρυθμίζουν πρωτεογλυκάνες οι οποίες εκφράζονται διαφορετικώς στα καρκινικά κύτταρα και τέλος μελετήθηκε η έκφραση τους, μέσω του προγράμματος ualcan. Συνοπτικά, τ’ αποτελέσματα καταδεικνύουν τις πρωτεογλυκάνες glypican-3, lumican, syndecan-1 και versican ως δυνητικούς βιοδείκτες, αλλά και ως φαρμακευτικούς στόχους για βελτιωμένες θεραπευτικές ανταποκρίσεις. Επίσης miRNAs, όπως hsa-miR-9-5p, hsa-miR-98-3p έχουν βρεθεί ότι ελέγχουν παράλληλα περισσότερες από μία από τις προαναφερθείσες πρωτεογλυκάνες, τα οποία είτε μέσω σίγασης είτε μέσω χορήγησης μπορούν ν’ ανοίξουν νέα παράθυρα ως προς την θεραπεία καρκίνου μαστού. Breast cancer is the most frequently diagnosed cancer in women, worldwide. Molecularly, is classified into four subtypes, which differ both in prognosis and in therapeutic response. This classification provides important information about new treatment strategies and appropriate patient management. Treatment of breast cancer is complex and is often performed with a combination of many methods such as surgery, chemotherapy, radiotherapy, hormone therapy and biological therapy. Keeping in mind the increasing rate of incidence and mortality of breast cancer, it is urgent to study possible diagnostic and prognostic biomarkers that will contribute to the improvement of patient’s clinical outcomes. Proteoglycans, important components of extracellular matrix, although are involved in various physiological processes, also control various pathological conditions. In breast cancer, many proteoglycans have individual expression profiles that contribute to processes that promote tumor growth, proliferation and spread. miRNAs are single-stranded RNA molecules that regulate gene expression on a post-transcriptional level. A large number of miRNAs have been identified to show altered expression in various subtypes of breast cancer, which are involved in tumor growth and development. Identification of proteoglycans that promote the development of breast cancer and their associated miRNAs, open new windows in diagnosis and treatment of breast cancer. Understanding the networks that regulate the above molecules and their differential expression, offers to the investigation of new biomarkers and therapeutic approaches, that can be used as either supportive or as substitutes. The objective of this research was to find otherwise expressed proteoglycans between normal and breast cancer cells, as well as to evaluate their prognostic value, through “Ualcan” and “KmPlot” database, respectively. Consequently, possible miRNAs were investigated that are associated with those proteoglycans. Finally, the profile expression of these miRNAs through “Ualcan” was studied. In summary, results deomonstrate glypican-3, lumican, syndecan-1 and versican proteoglycans as potential biomarkes and drug targets for improved therapeutic responses. Also, miRNAs such as hsa-miR-9-5p, hsa-miR-98-3p have been found to control more than one of mentioned proteoglycans, which either by silencing or by replacement offer ground to new therapeutic treatments of breast cancer. 2023-01-24T08:03:15Z 2023-01-24T08:03:15Z 2022-07-08 https://hdl.handle.net/10889/24323 el CC0 1.0 Universal http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ application/pdf |
