Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων
Η χρήση της νανοτεχνολογίας στην εποχή μας βρίσκει όλο και περισσότερες εφαρμογές σε διάφορους τομείς. Ένας από αυτούς είναι η χρήση βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων με ιχνηθέτες τα νανοσωματίδια χρυσού, με τους οποίους επιτυγχάνεται η ανίχνευση ενός στόχου. Στην παρούσα μεταπτυχι...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2023
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | https://hdl.handle.net/10889/24854 |
| id |
nemertes-10889-24854 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Ολιγονουκλεοτίδια Βιοαισθητήρες Νανοσωματίδια πυριτίου Νανοσωματίδια χρυσού Αντίδραση επέκτασης εκκινητή Σημειακοί μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί Νοθεία Ελαιόλαδο Biosensors Oligonucleotides Silica nanoparticles Gold nanoparticles Primer extension reaction Single nucleotide polymorphisms Adulteration Olive oil |
| spellingShingle |
Ολιγονουκλεοτίδια Βιοαισθητήρες Νανοσωματίδια πυριτίου Νανοσωματίδια χρυσού Αντίδραση επέκτασης εκκινητή Σημειακοί μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί Νοθεία Ελαιόλαδο Biosensors Oligonucleotides Silica nanoparticles Gold nanoparticles Primer extension reaction Single nucleotide polymorphisms Adulteration Olive oil Μαμουλάκη, Βασιλική Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| description |
Η χρήση της νανοτεχνολογίας στην εποχή μας βρίσκει όλο και περισσότερες
εφαρμογές σε διάφορους τομείς. Ένας από αυτούς είναι η χρήση βιοαισθητήρων τύπου
ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων με ιχνηθέτες τα νανοσωματίδια χρυσού, με τους
οποίους επιτυγχάνεται η ανίχνευση ενός στόχου. Στην παρούσα μεταπτυχιακή
διπλωματική εργασία έγινε προσπάθεια σύνθεσης και βιοσύζευξης νανοσωματιδίων με
δυνατότητα ταυτόχρονου προσδιορισμού πολλών στόχων και συγκεκριμένα
νανοσωματιδίων πυριτίου που θεωρούνται κατάλληλοι γι’ αυτό ιχνηθέτες.
Αρχικά, πραγματοποιήθηκε σύνθεση νανοσωματιδίων πυριτίου σύμφωνα με τη
μέθοδο Stöber, τα οποία στη συνέχεια, χρωματίστηκαν με φυσικές, συνθετικές και
φθορίζουσες χρωστικές, δημιουργήθηκε πυρήνας/κέλυφος γύρω από τα
νανοσωματίδια και ακολούθησε η βιοσύζευξή τους με ολιγονουκλεοτίδια. Τα έγχρωμα
νανοσωματίδια παρατηρήθηκαν σε ηλεκτρονικό μικροσκόπιο διέλευσης (TEM), ενώ
τα συζευγμένα με ολιγονουκλεοτίδια νανοσωματίδια δοκιμάστηκαν σε βιοαισθητήρες
τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων. Για τα φθορίζοντα νανοσωματίδια, πριν και μετά
τη σύζευξη, πραγματοποιήθηκε μέτρηση του φθορισμού και λήψη φασμάτων
φθορισμού.
Στο δεύτερο μέρος της διπλωματικής εργασίας μελετήθηκε η ανίχνευση
σημειακών μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs) με στόχο την ανίχνευση της
νοθείας του ελαιολάδου από άλλα φυτικά έλαια ή/και καρπούς μέσω της αντίδρασης
επέκτασης εκκινητή (ΡΕΧΤ) σε συνδυασμό με δοκιμασίες πλευρικής ροής.
Κατασκευάστηκαν βιοαισθητήρες τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων με ιχνηθέτες
νανοσωματίδια χρυσού. Εξετάστηκε η νοθεία του ελαιολάδου με φουντουκέλαιο και
το αμυγδαλέλαιο σε βιοαισθητήρες για απλή, διπλή και πολλαπλή ανίχνευση, τόσο σε
συνθετικούς DNA στόχους όσο και σε πραγματικά δείγματα. |
| author2 |
Mamoulaki, Vasiliki |
| author_facet |
Mamoulaki, Vasiliki Μαμουλάκη, Βασιλική |
| author |
Μαμουλάκη, Βασιλική |
| author_sort |
Μαμουλάκη, Βασιλική |
| title |
Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| title_short |
Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| title_full |
Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| title_fullStr |
Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| title_full_unstemmed |
Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| title_sort |
παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων |
| publishDate |
2023 |
| url |
https://hdl.handle.net/10889/24854 |
| work_keys_str_mv |
AT mamoulakēbasilikē paraskeuēenchrōmōnkaiphthorizontōnnanosōmatidiōnpyritioukaisyzeugmatōnautōnmeoligonoukleotidiaanaptyxēkaiepharmogesbioaisthētērōntypoutainiasxērōnantidrastēriōn AT mamoulakēbasilikē synthesisofcoloredandfluorescentsilicananoparticlesandtheirconjugateswitholigonucleotidesdevelopmentandapplicationsoflateralflowassays |
| _version_ |
1771297149874601984 |
| spelling |
nemertes-10889-248542023-03-21T04:35:22Z Παρασκευή έγχρωμων και φθοριζόντων νανοσωματιδίων πυριτίου και συζευγμάτων αυτών με ολιγονουκλεοτίδια : ανάπτυξη και εφαρμογές βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων Synthesis of colored and fluorescent silica nanoparticles and their conjugates with oligonucleotides : development and applications of lateral flow assays Μαμουλάκη, Βασιλική Mamoulaki, Vasiliki Ολιγονουκλεοτίδια Βιοαισθητήρες Νανοσωματίδια πυριτίου Νανοσωματίδια χρυσού Αντίδραση επέκτασης εκκινητή Σημειακοί μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί Νοθεία Ελαιόλαδο Biosensors Oligonucleotides Silica nanoparticles Gold nanoparticles Primer extension reaction Single nucleotide polymorphisms Adulteration Olive oil Η χρήση της νανοτεχνολογίας στην εποχή μας βρίσκει όλο και περισσότερες εφαρμογές σε διάφορους τομείς. Ένας από αυτούς είναι η χρήση βιοαισθητήρων τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων με ιχνηθέτες τα νανοσωματίδια χρυσού, με τους οποίους επιτυγχάνεται η ανίχνευση ενός στόχου. Στην παρούσα μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία έγινε προσπάθεια σύνθεσης και βιοσύζευξης νανοσωματιδίων με δυνατότητα ταυτόχρονου προσδιορισμού πολλών στόχων και συγκεκριμένα νανοσωματιδίων πυριτίου που θεωρούνται κατάλληλοι γι’ αυτό ιχνηθέτες. Αρχικά, πραγματοποιήθηκε σύνθεση νανοσωματιδίων πυριτίου σύμφωνα με τη μέθοδο Stöber, τα οποία στη συνέχεια, χρωματίστηκαν με φυσικές, συνθετικές και φθορίζουσες χρωστικές, δημιουργήθηκε πυρήνας/κέλυφος γύρω από τα νανοσωματίδια και ακολούθησε η βιοσύζευξή τους με ολιγονουκλεοτίδια. Τα έγχρωμα νανοσωματίδια παρατηρήθηκαν σε ηλεκτρονικό μικροσκόπιο διέλευσης (TEM), ενώ τα συζευγμένα με ολιγονουκλεοτίδια νανοσωματίδια δοκιμάστηκαν σε βιοαισθητήρες τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων. Για τα φθορίζοντα νανοσωματίδια, πριν και μετά τη σύζευξη, πραγματοποιήθηκε μέτρηση του φθορισμού και λήψη φασμάτων φθορισμού. Στο δεύτερο μέρος της διπλωματικής εργασίας μελετήθηκε η ανίχνευση σημειακών μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs) με στόχο την ανίχνευση της νοθείας του ελαιολάδου από άλλα φυτικά έλαια ή/και καρπούς μέσω της αντίδρασης επέκτασης εκκινητή (ΡΕΧΤ) σε συνδυασμό με δοκιμασίες πλευρικής ροής. Κατασκευάστηκαν βιοαισθητήρες τύπου ταινίας ξηρών αντιδραστηρίων με ιχνηθέτες νανοσωματίδια χρυσού. Εξετάστηκε η νοθεία του ελαιολάδου με φουντουκέλαιο και το αμυγδαλέλαιο σε βιοαισθητήρες για απλή, διπλή και πολλαπλή ανίχνευση, τόσο σε συνθετικούς DNA στόχους όσο και σε πραγματικά δείγματα. Δράση ΕΡΕΥΝΩ – ΔΗΜΙΟΥΡΓΩ – ΚΑΙΝΟΤΟΜΩ και συγχρηματοδοτήθηκε από το Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης (ΕΤΠΑ) της Ευρωπαϊκής Ένωσης και εθνικούς πόρους μέσω του Ε.Π. Ανταγωνιστικότητα, Επιχειρηματικότητα & Καινοτομία (ΕΠΑνΕΚ) (κωδικός έργου: Τ2ΕΔΚ-02637) Nowadays, the use of nanotechnology has many applications in various fields. One application is the use of lateral flow assays using gold nanoparticles as labels for analyte detection. In this master’s thesis, an attempt was made in order to synthesize and bioconjugate nanoparticles with the possibility of simultaneous determination of several targets. More specifically, silica nanoparticles were synthesized that are considered suitable labels for this purpose. First, silica nanoparticles were synthesized according to the Stöber method, which were then colored with natural, synthetic and fluorescent dyes. Then a core/shell was created around the nanoparticles, and their bioconjugation with oligonucleotides was followed. Colored nanoparticles were observed using a transmission electron microscope (TEM), while oligonucleotide-conjugated nanoparticles were tested in lateral flow assays. For the fluorescent nanoparticles, before and after conjugation, fluorescence measurement and fluorescence spectra were obtained. In the second part of the thesis, the detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs) using primer extension reaction (PEXT) in combination with lateral flow assays was studied, for olive oil adulteration detection with other vegetable or/and seeds oils. Lateral flow assays with gold nanoparticles as tracers, were constructed for this purpose. More specifically, olive oil adulteration with hazelnut and almond-oil in dipstick-type biosensors for single, double and multiplex detection, both for synthetic DNA targets and real samples, was examined. 2023-03-20T11:14:55Z 2023-03-20T11:14:55Z 2023-03-20 https://hdl.handle.net/10889/24854 el application/pdf |
