Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς
Η μείζων καταθλιπτική διαταραχή είναι μία σοβαρή ψυχιατρική διαταραχή που χαρακτηρίζεται από συνεχή και έντονη αίσθηση της λύπης, της απόγνωσης και του αισθήματος της απομόνωσης από τον κοινωνικό περίγυρο. Την τυπική εκδήλωση της νόσου φαίνεται να αποτελούν συμπτώματα όπως η απώλεια ενδιαφέροντος ή...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2023
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | https://hdl.handle.net/10889/25090 |
| id |
nemertes-10889-25090 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Μείζων κατάθλιψη Ψυχιατρική νόσος Γονιδιωματική Γενετική ποικιλομορφία Πολυμορφισμοί Υψηλή απόδοση Γονοτύπηση Αλληλοειδική pcr Major depression Psychiatrics Genomics Genetic variation Ces1 Polymorphisms Greek population High throughput Kasp Genotyping Allele-Specific |
| spellingShingle |
Μείζων κατάθλιψη Ψυχιατρική νόσος Γονιδιωματική Γενετική ποικιλομορφία Πολυμορφισμοί Υψηλή απόδοση Γονοτύπηση Αλληλοειδική pcr Major depression Psychiatrics Genomics Genetic variation Ces1 Polymorphisms Greek population High throughput Kasp Genotyping Allele-Specific Ευαγγελάτου, Ελένη Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| description |
Η μείζων καταθλιπτική διαταραχή είναι μία σοβαρή ψυχιατρική διαταραχή που χαρακτηρίζεται από συνεχή και έντονη αίσθηση της λύπης, της απόγνωσης και του αισθήματος της απομόνωσης από τον κοινωνικό περίγυρο. Την τυπική εκδήλωση της νόσου φαίνεται να αποτελούν συμπτώματα όπως η απώλεια ενδιαφέροντος ή ευχαρίστησης, μεταβολές σωματικού βάρους, αλλαγές στον ύπνο, αυξημένη κόπωση, σκέψεις για τον θάνατο ή την αυτοκτονία. Η διάγνωση της νόσου γίνεται γίνεται από ψυχίατρο βασιζόμενο στα κριτήρια που καθορίζονται από το Διαγνωστικό και Στατιστικό Εγχειρίδιο Ψυχικών Διαταραχών (Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, DSM-5), ενώ η θεραπεία μπορεί να περιλαμβάνει φαρμακευτική αγωγή, ψυχοθεραπεία και συνδυαστικές προσεγγίσεις. Η νόσος είναι αποτέλεσμα τόσο γενετικών όσο και περιβαλλοντικών παραγόντων. Έπειτα από μελέτη αλληλούχησης νέας γενιάς που πραγματοποιήθηκε στο εργαστήριο σε 304 ψυχιατρικούς ασθενείς από την Ελλάδα για 100 γονίδια, προέκυψε ότι ορισμένοι μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί εμφάνισαν διαφοροποίηση ως προς τη συχνότητα των αλληλομόρφων τους σε σχέση με το γενικό πληθυσμό. Μεταξύ αυτών βρίσκεται και ο μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός rs71647871 που εμπεριέχεται στο γονίδιο CES1. Σκοπός της παρούσας διπλωματικής είναι η περαιτέρω διερεύνηση και η πειραματική εξακρίβωση της συσχέτισης του rs71647871 του CES1 με μείζονα καταθλιπτική διαταραχή σε καταθλιπτικούς και μη καταθλιπτικούς Έλληνες. Στην πειραματική διαδικασία πραγματοποιήθηκε απομόνωση DNA από ολικό περιφερικό αίμα και δείγμα σίελου, προσδιορισμός της συγκέντρωσης και καθαρότητας του DNA και εφαρμόστηκε η μέθοδος γονοτύπησης υψηλής απόδοσης που είναι βασισμένη σε ανταγωνιστική αλληλοειδική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (Kompetetive Allele Specific Polymerase Chain Reaction, KAS-PCR) για τη γενετική περιοχή ενδιαφέροντος που περιλαμβάνει τον συγκεκριμένο πολυμορφισμό σε 437 καταθλιπτικούς ασθενείς και 80 ψυχιατρικώς υγιείς Έλληνες εθελοντές. Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε στατιστική ανάλυση των αποτελεσμάτων των γονοτυπήσεων. Προέκυψε ότι η τιμή σημαντικότητας P-value είναι μικρότερη του 0,05 για τη συχνότητα εμφάνισης των αλληλόμορφων και γονότυπων μεταξύ των Ελλήνων καταθλιπτικών ασθενών και των στοιχείων της Ensembl για τον πληθυσμό ελέγχου γεγονός που σημαίνει ότι παρατηρείται στατιστικά σημαντική διαφορά μεταξύ τους. Ωστόσο, η τιμή σημαντικότητας P-value βρέθηκε μεγαλύτερη του 0,05 για τη συχνότητα εμφάνισης των αλληλόμορφων και γονότυπων μεταξύ των δεδομένων για τους Έλληνες καταθλιπτικούς ασθενείς και των δεδομένων των Ελλήνων υγιών εθελοντών του πειράματος, δηλαδή δεν παρατηρείται στατιστικά σημαντική διαφορά μεταξύ αυτών. Για την ισχυροποίηση της συσχέτισης, προτείνεται η διερεύνηση της συχνότητας εμφάνισης αυτού του πολυμορφισμού σε μεγαλύτερο δείγμα μη καταθλιπτικών Ελλήνων, καθώς και σε μη Ελληνες καταθλιπτικούς ασθενείς. |
| author2 |
Evangelatou, Eleni |
| author_facet |
Evangelatou, Eleni Ευαγγελάτου, Ελένη |
| author |
Ευαγγελάτου, Ελένη |
| author_sort |
Ευαγγελάτου, Ελένη |
| title |
Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| title_short |
Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| title_full |
Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| title_fullStr |
Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| title_full_unstemmed |
Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| title_sort |
συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς |
| publishDate |
2023 |
| url |
https://hdl.handle.net/10889/25090 |
| work_keys_str_mv |
AT euangelatouelenē syschetisētēsgenetikēspoikilomorphiastougonidiouces1metēmeizonakatathlipsēseellēnesastheneis AT euangelatouelenē associationofthegeneticvariationofces1genewithmajordepressioningreekpatients |
| _version_ |
1799945011323731968 |
| spelling |
nemertes-10889-250902023-06-17T03:59:55Z Συσχέτιση της γενετικής ποικιλομορφίας του γονιδίου Ces1 με τη μείζονα κατάθλιψη σε έλληνες ασθενείς Association of the genetic variation of Ces1 gene with major depression in Greek patients Ευαγγελάτου, Ελένη Evangelatou, Eleni Μείζων κατάθλιψη Ψυχιατρική νόσος Γονιδιωματική Γενετική ποικιλομορφία Πολυμορφισμοί Υψηλή απόδοση Γονοτύπηση Αλληλοειδική pcr Major depression Psychiatrics Genomics Genetic variation Ces1 Polymorphisms Greek population High throughput Kasp Genotyping Allele-Specific Η μείζων καταθλιπτική διαταραχή είναι μία σοβαρή ψυχιατρική διαταραχή που χαρακτηρίζεται από συνεχή και έντονη αίσθηση της λύπης, της απόγνωσης και του αισθήματος της απομόνωσης από τον κοινωνικό περίγυρο. Την τυπική εκδήλωση της νόσου φαίνεται να αποτελούν συμπτώματα όπως η απώλεια ενδιαφέροντος ή ευχαρίστησης, μεταβολές σωματικού βάρους, αλλαγές στον ύπνο, αυξημένη κόπωση, σκέψεις για τον θάνατο ή την αυτοκτονία. Η διάγνωση της νόσου γίνεται γίνεται από ψυχίατρο βασιζόμενο στα κριτήρια που καθορίζονται από το Διαγνωστικό και Στατιστικό Εγχειρίδιο Ψυχικών Διαταραχών (Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, DSM-5), ενώ η θεραπεία μπορεί να περιλαμβάνει φαρμακευτική αγωγή, ψυχοθεραπεία και συνδυαστικές προσεγγίσεις. Η νόσος είναι αποτέλεσμα τόσο γενετικών όσο και περιβαλλοντικών παραγόντων. Έπειτα από μελέτη αλληλούχησης νέας γενιάς που πραγματοποιήθηκε στο εργαστήριο σε 304 ψυχιατρικούς ασθενείς από την Ελλάδα για 100 γονίδια, προέκυψε ότι ορισμένοι μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί εμφάνισαν διαφοροποίηση ως προς τη συχνότητα των αλληλομόρφων τους σε σχέση με το γενικό πληθυσμό. Μεταξύ αυτών βρίσκεται και ο μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός rs71647871 που εμπεριέχεται στο γονίδιο CES1. Σκοπός της παρούσας διπλωματικής είναι η περαιτέρω διερεύνηση και η πειραματική εξακρίβωση της συσχέτισης του rs71647871 του CES1 με μείζονα καταθλιπτική διαταραχή σε καταθλιπτικούς και μη καταθλιπτικούς Έλληνες. Στην πειραματική διαδικασία πραγματοποιήθηκε απομόνωση DNA από ολικό περιφερικό αίμα και δείγμα σίελου, προσδιορισμός της συγκέντρωσης και καθαρότητας του DNA και εφαρμόστηκε η μέθοδος γονοτύπησης υψηλής απόδοσης που είναι βασισμένη σε ανταγωνιστική αλληλοειδική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (Kompetetive Allele Specific Polymerase Chain Reaction, KAS-PCR) για τη γενετική περιοχή ενδιαφέροντος που περιλαμβάνει τον συγκεκριμένο πολυμορφισμό σε 437 καταθλιπτικούς ασθενείς και 80 ψυχιατρικώς υγιείς Έλληνες εθελοντές. Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε στατιστική ανάλυση των αποτελεσμάτων των γονοτυπήσεων. Προέκυψε ότι η τιμή σημαντικότητας P-value είναι μικρότερη του 0,05 για τη συχνότητα εμφάνισης των αλληλόμορφων και γονότυπων μεταξύ των Ελλήνων καταθλιπτικών ασθενών και των στοιχείων της Ensembl για τον πληθυσμό ελέγχου γεγονός που σημαίνει ότι παρατηρείται στατιστικά σημαντική διαφορά μεταξύ τους. Ωστόσο, η τιμή σημαντικότητας P-value βρέθηκε μεγαλύτερη του 0,05 για τη συχνότητα εμφάνισης των αλληλόμορφων και γονότυπων μεταξύ των δεδομένων για τους Έλληνες καταθλιπτικούς ασθενείς και των δεδομένων των Ελλήνων υγιών εθελοντών του πειράματος, δηλαδή δεν παρατηρείται στατιστικά σημαντική διαφορά μεταξύ αυτών. Για την ισχυροποίηση της συσχέτισης, προτείνεται η διερεύνηση της συχνότητας εμφάνισης αυτού του πολυμορφισμού σε μεγαλύτερο δείγμα μη καταθλιπτικών Ελλήνων, καθώς και σε μη Ελληνες καταθλιπτικούς ασθενείς. The Major Depressive Disorder is a severe psychiatric disorder characterized by persistent and intense feelings of sadness, despair, and isolation from the world. The typical symptoms of the disease seem to be the following: loss of interest or pleasure, weight loss or gain, sleep changes, increased fatigue, thoughts of death or suicide. The diagnosis of the disease is made by a psychiatrist based on the criteria established by the Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders (DSM-5), while the treatment may include medication, psychotherapy, and combined approaches. The disease is the result of both genetic and environmental factors. Next-generation sequencing for 100 genes has been previously performed on 304 Greek psychiatric patients. Results indicated several genetic polymorphisms that showed different genotype and/or allele frequency compared to the psychiatrically healthy control population; among them the single nucleotide polymorphism rs71647871 located on the CES1 gene. The purpose of the present thesis is to further investigate and experimentally verify the association of rs71647871 of gene CES1 with the major depressive disorder in Greek patients. Its study was carried out in 437 depressed patients and 80 healthy controls, all of Greek origin, with the high-throughput KASP genotyping method (Competitive Allele Specific PCR) to amplify the desired DNA segment and to genotype the samples. The experimental procedure included DNA isolation from whole peripheral blood and saliva samples, measurement of DNA concentration and purity, and the high-throughput genotyping based on competitive allele specific polymerase chain reaction (Kompetetive Allele Specific Polymerase Chain Reaction, KAS-PCR), which was applied for the part of the genome including the specific polymorphism, in 437 depressed patients and 80 healthy controls of Greek origin. Afterwards, the genotyping results were statistically analysed. P-value < 0.05 was found for alleles and genotypes between the experimental data for Greek depressed patients and the Ensembl data for the psychiatrically healthy control population, which means that a statistically significant difference is present between them, while the P-value > 0.05 for alleles and genotypes between the depressed patients and the healthy volunteers (all Greeks) of the experiment means that no statistical significance is present. To strengthen the correlation, it is proposed to investigate the frequency of this polymorphism in a larger sample of Greeks who do not suffer from depression, as well as in depressed patients from other regions of the world. 2023-06-16T08:12:49Z 2023-06-16T08:12:49Z 2023-06-15 https://hdl.handle.net/10889/25090 el application/pdf |
