| Περίληψη: | Από τα πιο σημαντικά οργανίδια του κυττάρου είναι τα μιτοχόνδρια, τα οποία χαρακτηρίζονται ως το εργοστάσιο παραγωγής ενέργειάς του, λόγω της σύνθεσης του ATP μέσω της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης. Αξιοσημείωτο είναι το γεγονός ότι τα μιτοχόνδρια διαθέτουν το δικό τους γενετικό υλικό 16.569 ζευγών βάσεων, που αποτελείται από γονίδια που κωδικοποιούν τις υπομονάδες των αλυσίδων μεταφοράς ηλεκτρονίων και της αναπνευστικής αλυσίδας.
Για τη σωστή λειτουργία της ροής της γενετικής πληροφορίας στα μιτοχόνδρια, είναι απαραίτητη η σωστή ωρίμανση και σταθερότητα των μορίων tRNA. Τα τελευταία χρόνια έχει δειχθεί ότι τα μιτοχονδριακά tRNAs όταν επεξεργαστούν από ενδονουκλεάσες μπορούν να παράξουν θραύσματα που είναι γνωστά ως tRFs (tRNA-derived fragments). Τα tRFs για πολλά χρόνια θεωρούνταν τυχαία υποπροϊόντα του tRNA, αλλά πλέον έχει αναγνωριστεί η κομβικής σημασίας συμμετοχή τους σε διάφορες βιολογικές διεργασίες, όπως η απόπτωση και ο κυτταρικός κύκλος. Ιδιαίτερος λόγος γίνεται για τα μιτοχονδριακά tRFs, τα οποία όχι μόνο εμπλέκονται σε νευρομυοπάθειες εξαιτίας της εξάρτησης των νευρικών κυττάρων από την ενέργεια που παράγεται στα μιτοχόνδρια, αλλά και λόγω του ότι είναι δυνατός ο εντοπισμός τους και εκτός του μιτοχονδρίου επηρεάζοντας πληθώρα κυτταρικών λειτουργιών. Τα δεδομένα αλληλούχισης που υπάρχουν σήμερα, έχουν καταστήσει δυνατή τη μελέτη τους και νευρολογικές ασθένειες, όπως το Αλτσχάιμερ, έχουν ξεκινήσει να ερευνώνται σε βάθος και να απαντώνται πολλά από τα μέχρι τώρα αναπάντητα ερωτήματα των επιστημόνων.
Η παρούσα διπλωματική εργασία έχει σαν στόχο να διερευνήσει το ρυθμιστικό ρόλο των μιτοχονδριακών tRFs στη νόσο Αλτσχάιμερ, κάνοντας χρήση εργαλείων και μεθόδων βιοπληροφορικής. Γι’ αυτό το λόγο, θα συλλεχθούν δεδομένα αλληλούχισης μορίων RNA μικρού μήκους από μελέτες που αφορούν το Αλτσχάιμερ, θα χαρτογραφηθούν σε βάσεις δεδομένων tRFs, θα εξεταστούν διαφορές στην έκφραση των tRFs μεταξύ ασθενών και μη, θα βρεθούν τα πιο σημαντικά εμπλουτισμένα μονοπάτια και τέλος όλα τα παραπάνω ευρήματα θα οπτικοποιηθούν για την καλύτερη κατανόηση τους.
|
|---|
