Μελέτη της εξελικτικής πορείας των γονιδίων του συμπληρώματος που ανήκουν στην οικογένεια "MACPF" με τη χρήση εργαλείων της βιοπληροφορικής

Στην παρούσα διπλωματική εργασία, επιχειρήθηκε η μελέτη της εξέλιξης των γονιδίων C6, C7, C8α, C8β και C9 του συστήματος του Συμπληρώματος που ανήκουν στην οικογένεια MACPF. Για την συλλογή των δεδομένων και την ανάλυσή τους, χρησιμοποιήθηκαν εργαλεία της βιοπληροφορικής. Στο τελικό στάδιο επεξεργασ...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Μυλωνά, Σύλβια-Χριστίνα
Άλλοι συγγραφείς: Ζαρκάδης, Ιωάννης
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2010
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/3814
Περιγραφή
Περίληψη:Στην παρούσα διπλωματική εργασία, επιχειρήθηκε η μελέτη της εξέλιξης των γονιδίων C6, C7, C8α, C8β και C9 του συστήματος του Συμπληρώματος που ανήκουν στην οικογένεια MACPF. Για την συλλογή των δεδομένων και την ανάλυσή τους, χρησιμοποιήθηκαν εργαλεία της βιοπληροφορικής. Στο τελικό στάδιο επεξεργασίας, οικοδομήθηκαν φυλογενετικά δένδρα που αφορούσαν είτε τις πλήρεις αλληλουχίες των πρωτεϊνών της υπεροικογένειας MACPF, είτε ξεχωριστά κάθε μία περιοχή (domain) που εμφανίζεται στις πρωτεΐνες της οικογένειας MACPF του Συμπληρώματος. Τα συμπεράσματα από τη ανάλυση των φυλογενετικών δένδρων, πιστοποιούν ότι πιθανόν από ένα προγονικό γονίδιο που ομοιάζει με τα γονίδια C6/C7 και έλκει την καταγωγή του στην εμφάνιση των πρώτων σπονδυλωτών και αποδεδειγμένα στο εξελικτικό στάδιο των χονδροιχθύων, μετά από συνεχείς γονιδιακούς διπλασιασμούς και απώλειες δομών, προέκυψαν τα υπόλοιπα γονίδια της οικογένειας MACPF, C8α, C8β και C9. Η μη εύρεση μέχρι σήμερα γονιδίων της οικογένειας αυτής σε ασπόνδυλα, αλλά και στο γονιδίωμα των αγνάθων, καθώς και η μη ταυτοποίηση μέχρι σήμερα των γονιδίων C7 και C9 στους χονδροιχθύες, δεν επιτρέπει απόλυτα και τελικά συμπεράσματα για την εξελικτική τους πορεία. Αν η πρωταρχική εμφάνιση των γονιδίων C6/C7 συνδυαστεί και με την ανεξάρτητη εξέλιξη μιας άλλης οικογένειας γονιδίων C3/C4/C5, στο ίδιο εξελικτικό στάδιο, με τα οποία και αλληλεπιδρά στο πρωτεϊνικό επίπεδο, κατά τον καταρράκτη ενεργοποίησης της λυτικής οδού του Συμπληρώματος, τότε ενισχύεται η άποψη ότι προηγήθηκε κατά την εξέλιξη η εμφάνιση των γονιδίων C6/C7.