Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών
Η τεχνολογία των μικροσυστοιχιών επιτρέπει τη μέτρηση των επιπέδων έκφρασης χιλιάδων γονιδίων ταυτόχρονα σε ένα μόνο πείραμα δημιουργώντας έτσι ένα τεράστιο σύνολο δεδομένων για ανάλυση. Για να είναι δυνατή η εξαγωγή σημαντικής πληροφορίας για το υπό μελέτη βιολογικό σύστημα, έχουν χρησιμοποιηθεί δι...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2011
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/4103 |
| id |
nemertes-10889-4103 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-41032022-09-05T05:38:17Z Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών Κόρμαλη, Ελισσάβετ Κουτσούρης, Διονύσιος-Δημήτριος Κουτσούρης, Διονύσιος-Δημήτριος Νικήτα, Κωνσταντίνα Πρέντζα, Ανδριάνα Kormali, Elissavet cDNA μικροσυστοιχίες Γονιδιακή έκφραση Κανονικοποίηση δεδομένων Πηγές μεταβλητότητας cDNA microarrays Gene expression Data normalization Variation sources 572.863 6 Η τεχνολογία των μικροσυστοιχιών επιτρέπει τη μέτρηση των επιπέδων έκφρασης χιλιάδων γονιδίων ταυτόχρονα σε ένα μόνο πείραμα δημιουργώντας έτσι ένα τεράστιο σύνολο δεδομένων για ανάλυση. Για να είναι δυνατή η εξαγωγή σημαντικής πληροφορίας για το υπό μελέτη βιολογικό σύστημα, έχουν χρησιμοποιηθεί διάφορες μέθοδοι προεπεξεργασίας και ανάλυσης των δεδομένων. Στις μεθόδους προεπεξεργασίας των δεδομένων συμπεριλαμβάνονται και οι μέθοδοι κανονικοποίησης. Σκοπός της κανονικοποίησης είναι η ελαχιστοποίηση των συστηματικών σφαλμάτων που εντοπίζονται στα εκτιμώμενα επίπεδα έκφρασης των γονιδίων, έτσι ώστε οι εμφανιζόμενες διαφορές τους να οφείλονται κυρίως σε βιολογικούς παράγοντες. Επίσης, η κανονικοποίηση καθιστά εφικτή τη σύγκριση των επιπέδων έκφρασης δεδομένων από περισσότερες της μίας μικροσυστοιχίες. Στην παρούσα διπλωματική εργασία παρατίθεται μια ανασκόπηση των μεθόδων κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών καθώς και μια σύγκριση των αναλυόμενων μεθόδων κανονικοποίησης. Microarray technology allows the measurement of gene expression levels of thousands of genes simultaneously in a single experiment, therefore creating a vast set of data for analysis. In order to be able to extract the most essential information for the biological system under examination in a specific microarray, various methods are used for data pre-processing and analysis. These data pre-processing methods also include normalization methods. The purpose of normalization is the minimization of the systematic errors that are found in the estimated gene expression levels, so as the observed biological differences be due mainly to biological factors. Furthermore, the normalization makes possible the comparison of gene expression levels of data from more than one microarrays. In the present thesis a review of the normalization methods for gene expression microarray data is presented, as well as a comparison between the analysed normalization methods. 2011-01-19T11:23:26Z 2011-01-19T11:23:26Z 2010-10-04 2011-01-19T11:23:26Z Thesis http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/4103 gr Η ΒKΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου. 0 application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
cDNA μικροσυστοιχίες Γονιδιακή έκφραση Κανονικοποίηση δεδομένων Πηγές μεταβλητότητας cDNA microarrays Gene expression Data normalization Variation sources 572.863 6 |
| spellingShingle |
cDNA μικροσυστοιχίες Γονιδιακή έκφραση Κανονικοποίηση δεδομένων Πηγές μεταβλητότητας cDNA microarrays Gene expression Data normalization Variation sources 572.863 6 Κόρμαλη, Ελισσάβετ Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών |
| description |
Η τεχνολογία των μικροσυστοιχιών επιτρέπει τη μέτρηση των επιπέδων έκφρασης χιλιάδων γονιδίων ταυτόχρονα σε ένα μόνο πείραμα δημιουργώντας έτσι ένα τεράστιο σύνολο δεδομένων για ανάλυση. Για να είναι δυνατή η εξαγωγή σημαντικής πληροφορίας για το υπό μελέτη βιολογικό σύστημα, έχουν χρησιμοποιηθεί διάφορες μέθοδοι προεπεξεργασίας και ανάλυσης των δεδομένων. Στις μεθόδους προεπεξεργασίας των δεδομένων συμπεριλαμβάνονται και οι μέθοδοι κανονικοποίησης. Σκοπός της κανονικοποίησης είναι η ελαχιστοποίηση των συστηματικών σφαλμάτων που εντοπίζονται στα εκτιμώμενα επίπεδα έκφρασης των γονιδίων, έτσι ώστε οι εμφανιζόμενες διαφορές τους να οφείλονται κυρίως σε βιολογικούς παράγοντες. Επίσης, η κανονικοποίηση καθιστά εφικτή τη σύγκριση των επιπέδων έκφρασης δεδομένων από περισσότερες της μίας μικροσυστοιχίες. Στην παρούσα διπλωματική εργασία παρατίθεται μια ανασκόπηση των μεθόδων κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών καθώς και μια σύγκριση των αναλυόμενων μεθόδων κανονικοποίησης. |
| author2 |
Κουτσούρης, Διονύσιος-Δημήτριος |
| author_facet |
Κουτσούρης, Διονύσιος-Δημήτριος Κόρμαλη, Ελισσάβετ |
| format |
Thesis |
| author |
Κόρμαλη, Ελισσάβετ |
| author_sort |
Κόρμαλη, Ελισσάβετ |
| title |
Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών |
| title_short |
Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών |
| title_full |
Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών |
| title_fullStr |
Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών |
| title_full_unstemmed |
Μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cDNA μικροσυστοιχιών |
| title_sort |
μέθοδοι κανονικοποίησης για δεδομένα γονιδιακής έκφρασης cdna μικροσυστοιχιών |
| publishDate |
2011 |
| url |
http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/4103 |
| work_keys_str_mv |
AT kormalēelissabet methodoikanonikopoiēsēsgiadedomenagonidiakēsekphrasēscdnamikrosystoichiōn |
| _version_ |
1771297152220266496 |
