Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA
Η ΒΥΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της.
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2007
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/469 |
| id |
nemertes-10889-469 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Ριβοσώματα 5S ριβοσωματικό RNA Πολυαμίνες Αντίδραση πεπτιδυλοτρανσφεράσης Παράγοντες επιμήκυνσης Αζιδοβενζαμίδινο-σπερμίνη Αντίδραση πουρομυκίνης Φωτοσήμανση Ribosomes 5S rRNA Polyamines Peptidyltransferase center Elongation factors ABA-spm Puromycin reaction Photlabelling 572.548 |
| spellingShingle |
Ριβοσώματα 5S ριβοσωματικό RNA Πολυαμίνες Αντίδραση πεπτιδυλοτρανσφεράσης Παράγοντες επιμήκυνσης Αζιδοβενζαμίδινο-σπερμίνη Αντίδραση πουρομυκίνης Φωτοσήμανση Ribosomes 5S rRNA Polyamines Peptidyltransferase center Elongation factors ABA-spm Puromycin reaction Photlabelling 572.548 Γερμπανάς, Γεώργιος Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA |
| description |
Η ΒΥΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. |
| author2 |
Καλπαξής, Δημήτριος |
| author_facet |
Καλπαξής, Δημήτριος Γερμπανάς, Γεώργιος |
| author |
Γερμπανάς, Γεώργιος |
| author_sort |
Γερμπανάς, Γεώργιος |
| title |
Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA |
| title_short |
Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA |
| title_full |
Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA |
| title_fullStr |
Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA |
| title_full_unstemmed |
Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA |
| title_sort |
επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού rna |
| publishDate |
2007 |
| url |
http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/469 |
| work_keys_str_mv |
AT germpanasgeōrgios epidrasētōnpolyaminōnstēdomēkaileitourgiatou5sribosōmatikourna |
| _version_ |
1771297349828608000 |
| spelling |
nemertes-10889-4692022-09-05T20:12:49Z Επίδραση των πολυαμινών στη δομή και λειτουργία του 5s ριβοσωματικού RNA Γερμπανάς, Γεώργιος Καλπαξής, Δημήτριος Καλπαξής, Δημήτριος Δραΐνας, Διονύσιος Ντίνος, Γεώργιος Ριβοσώματα 5S ριβοσωματικό RNA Πολυαμίνες Αντίδραση πεπτιδυλοτρανσφεράσης Παράγοντες επιμήκυνσης Αζιδοβενζαμίδινο-σπερμίνη Αντίδραση πουρομυκίνης Φωτοσήμανση Ribosomes 5S rRNA Polyamines Peptidyltransferase center Elongation factors ABA-spm Puromycin reaction Photlabelling 572.548 Η ΒΥΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. Στα βακτήρια, η μεγάλη ριβοσωματική υπομονάδα αποτελείται από δύο είδη RNA, το 23S και το 5S rRNA, καθώς και 33 πρωτεΐνες. Ο σχηματισμός του πεπτιδικού δεσμού και η απελευθέρωση της πεπτιδικής αλυσίδας επιτελούνται στη μεγάλη υπομονάδα, όπου εδράζεται το καταλυτικό κέντρο της πεπτιδυλοτρανσφεράσης (PTase). Εκτός αυτού, η μεγάλη υπομονάδα περιλαμβάνει το κέντρο προσδέσεως των μεταφραστικών παραγόντων, το οποίο πυροδοτεί τη GTPase δραστηριότητα των G-πρωτεϊνικών παραγόντων, που εμπλέκονται στη μετατόπιση των υποστρωμάτων και άλλες ριβοσωματικές λειτουργίες. Έχει υποτεθεί ότι το 5S rRNA παίζει ουσιώδη ρόλο στη συγκρότηση του κέντρου της PTase και στη μετάδοση σημάτων μεταξύ του καταλυτικού κέντρου και των ριβοσωματικών συστατικών που διεκπεραιώνουν τη μετατόπιση των υποστρωμάτων. Το ιοντικό περιβάλλον φαίνεται να επηρεάζει καθοριστικά τη διαμόρφωση του 5S rRNA. Για παράδειγμα, έχει βρεθεί ότι οι πολυαμίνες δεσμεύονται εκλεκτικά στο 5S rRNA και επηρεάζουν τη δραστικότητα του έναντι του διμεθυλο-θεϊκού, ενός αντιδραστηρίου-ιχνηθέτη της τριτοταγούς δομής του RNA. Αρχικά ελέγξαμε αν υπάρχουν εξειδικευμένες θέσεις πρόσδεσης των πολυαμινών στο 5S rRNA. Στη συνέχεια, με σκοπό να ελέγξουμε αν η πρόσδεση των πολυαμινών επηρεάζει τη λειτουργία του 5S rRNA, 70S ριβοσώματα προγραμματισμένα με πολύ-ουριδυλικό σχηματίσθηκαν από 50S υπομονάδες, ολικά ή εκλεκτικά φωτοσημασμένες με ένα φωτοδραστικό ανάλογο της σπερμίνης και από 30S ακατέργαστες υπομονάδες. Αυτά τα ριβοσώματα είχαν την ικανότητα να δεσμεύουν AcPhe-tRNA ελαφρώς ισχυρότερα, σε σύγκριση με ριβοσώματα συγκροτημένα από φυσικά συστατικά, μη περιέχοντα πολυαμίνες. Το γεγονός αυτό υποδηλώνει ότι η πρόσδεση πολυαμινών στο 5S rRNA επηρεάζει, σε μικρό βαθμό, τη λειτουργία του παράγοντα επιμήκυνσης EF-Tu. Συζευγμένα, όμως, τα εν λόγω ριβοσώματα με tRNAPhe στην Ε-θέση και AcPhe-tRNAστην Ρ-θέση, επέδειξαν ισχυρότερη καταλυτική δραστικότητα και αυξημένη ικανότητα για μετατόπιση των υποστρωμάτων. Τα αποτελέσματα αυτά εισηγούνται σημαντική εμπλοκή των πολυαμινών στο λειτουργικό ρόλο του 5S rRNA κατά την κατάλυση και μετατόπιση των υποστρωμάτων. In bacteria, the large ribosomal subunit comprises two RNA species, 23S and 5S rRNA, and 33 proteins. Peptide bond formation and peptide release are catalyzed by the large subunit, where the peptidyltransferase (PTase) center is located. In addition to this center, which triggers the GTPase activities of G-protein factors involved in translocation and other ribosomal functions. It has been hypothesized that 5S rRNA plays essential role in assembling the PTase center and mediating signal transmissions between this center and the translocation machinery. Furthermore, the ionic environment seems to affect the conformation of 5S rRNA. For instance, polyamines have been found to bind specifically to 5S rRNA and influence the 5S rRNA reactivity towards dimethyl-sulfate (DMS), a chemical probe of RNA tertiary structure. Initially we examined whether there are specific sites for binding of polyamines. To test whether the binding of polyamines influence the function of 5S rRNA poly(U)-programmed 70S ribosomes were reconstituted from 50S subunits, totally or specifically photolabelled in their 5S rRNA with a photoreactive analogue of spermine, and native 30S subunits. These ribosomes were found to enzymatically bind AcPhe-tRNA better than ribosomes reconstituted from native components. This means, that furnishing 5S rRNA with spermine slightly influences the elongation factor EF-Tu function. However, equipped with tRNAPhe at the A-site and AcPhe-tRNA at the P-site, these ribosomes exhibited higher catalytic activity and enhanced tRNA translocation efficiency. These results suggest an essential impact of polyamines on the functional role of 5S rRNA in catalysis and translocation of translation substrates. 2007-07-30T10:48:18Z 2007-07-30T10:48:18Z 2006 2007-07-30T10:48:18Z http://nemertes.lis.upatras.gr/jspui/handle/10889/469 gr Η ΒΥΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. application/pdf |
