Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK
Η πρωτείνη MuSK (Muscle Specific Kinase) αποτελεί μέρος ενός συμπλόκου υποδοχέων της αγκρίνης (agrin) οι οποίοι διεγείρουν την φωσφορυλίωση της τυροσίνης και οδηγούν στην ομαδοποίηση των υποδοχέων ακετυλοχολίνης (AChRs) στην μετασυναπτική μεμβράνη της νευρομυϊκής σύναψης των σπονδυλωτών οργανισμών....
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2012
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/5690 |
| id |
nemertes-10889-5690 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-56902022-09-05T20:16:37Z Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK Χαϊντίνης, Βασίλειος Σπυρούλιας, Γεώργιος Σπυρούλιας, Γεώργιος Τσακαλίδης, Αθανάσιος Πουλάς, Κωνσταντίνος Chaintinis, Vasileios Πρωτείνη MuSK Μοντελοποίηση Μοριακή δυναμική Ομολογία MuSK (Muscle Specific Kinase) Modeling Molecular dynamics Homology 572.6 Η πρωτείνη MuSK (Muscle Specific Kinase) αποτελεί μέρος ενός συμπλόκου υποδοχέων της αγκρίνης (agrin) οι οποίοι διεγείρουν την φωσφορυλίωση της τυροσίνης και οδηγούν στην ομαδοποίηση των υποδοχέων ακετυλοχολίνης (AChRs) στην μετασυναπτική μεμβράνη της νευρομυϊκής σύναψης των σπονδυλωτών οργανισμών. Μεταλλάξεις της MuSK είναι υπεύθυνες για ασθένειες και δυσλειτουργίες της νευρομυϊκής σύναψης, όπως το εκ γενετής μυασθενικό σύνδρομο. Τα τελευταία χρόνια το ενδιαφέρον για την πρωτεΐνη MuSK έχει αυξηθεί, αλλά παρόλα αυτά δεν έχουν αποδειχθεί πλήρως, ούτε ο ρόλος της, ούτε η λειτουργία της ,ούτε η δομής της. Χρησιμοποιώντας τεχνικές μοντελοποίησης μέσω ομολογίας και χρησιμοποιώντας ως εκμαγεία γνωστές κρυσταλλογραφικές δομές, δημιουργήθηκε το υπολογιστικό μοντέλο της ανθρώπινης MuSK. Για την μελέτη της συμπεριφοράς της πρωτεΐνης πραγματοποιήθηκαν προσομοιώσεις Μοριακής Δυναμικής σε υδατικό περιβάλλον όπου εξήχθησαν συμπεράσματα για τον προσανατολισμό της δομής, τις αλληλεπιδράσεις των τμημάτων της και την συνολική συμπεριφορά του μορίου. The protein MuSK (Muscle specific Kinase) is part of an agrin receptor complex which stimulates tyrosine phosphorylation and lead to the clustering of acetylcholine receptors (AChRs) in the postsynaptic membrane of the neuromuscular junction of vertebrate organisms. MuSK mutations are responsible for diseases and disorders of the neuromuscular junction, such as congenital myasthenic syndrome. In recent years interest over MuSK protein has increased, but till now neither the role nor function, nor the structure of the protein have been fully demonstrated. Using homology modeling techniques and based on templates of known crystallographic structures, we have generated in silico the model of human MuSK. To study the behavior of the protein we used molecular dynamics simulations carried out in an aqueous environment where conclusions were reached on the orientation of the structure, interactions between the domains of the protein and the overall behavior of the molecule. 2012-12-21T07:25:11Z 2012-12-21T07:25:11Z 2012-04-04 2012-12-21 Thesis http://hdl.handle.net/10889/5690 gr Η ΒΚΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. 6 application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Πρωτείνη MuSK Μοντελοποίηση Μοριακή δυναμική Ομολογία MuSK (Muscle Specific Kinase) Modeling Molecular dynamics Homology 572.6 |
| spellingShingle |
Πρωτείνη MuSK Μοντελοποίηση Μοριακή δυναμική Ομολογία MuSK (Muscle Specific Kinase) Modeling Molecular dynamics Homology 572.6 Χαϊντίνης, Βασίλειος Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK |
| description |
Η πρωτείνη MuSK (Muscle Specific Kinase) αποτελεί μέρος ενός συμπλόκου υποδοχέων της αγκρίνης (agrin) οι οποίοι διεγείρουν την φωσφορυλίωση της τυροσίνης και οδηγούν στην ομαδοποίηση των υποδοχέων ακετυλοχολίνης (AChRs) στην μετασυναπτική μεμβράνη της νευρομυϊκής σύναψης των σπονδυλωτών οργανισμών. Μεταλλάξεις της MuSK είναι υπεύθυνες για ασθένειες και δυσλειτουργίες της νευρομυϊκής σύναψης, όπως το εκ γενετής μυασθενικό σύνδρομο.
Τα τελευταία χρόνια το ενδιαφέρον για την πρωτεΐνη MuSK έχει αυξηθεί, αλλά παρόλα αυτά δεν έχουν αποδειχθεί πλήρως, ούτε ο ρόλος της, ούτε η λειτουργία της ,ούτε η δομής της.
Χρησιμοποιώντας τεχνικές μοντελοποίησης μέσω ομολογίας και χρησιμοποιώντας ως εκμαγεία γνωστές κρυσταλλογραφικές δομές, δημιουργήθηκε το υπολογιστικό μοντέλο της ανθρώπινης MuSK. Για την μελέτη της συμπεριφοράς της πρωτεΐνης πραγματοποιήθηκαν προσομοιώσεις Μοριακής Δυναμικής σε υδατικό περιβάλλον όπου εξήχθησαν συμπεράσματα για τον προσανατολισμό της δομής, τις αλληλεπιδράσεις των τμημάτων της και την συνολική συμπεριφορά του μορίου. |
| author2 |
Σπυρούλιας, Γεώργιος |
| author_facet |
Σπυρούλιας, Γεώργιος Χαϊντίνης, Βασίλειος |
| format |
Thesis |
| author |
Χαϊντίνης, Βασίλειος |
| author_sort |
Χαϊντίνης, Βασίλειος |
| title |
Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK |
| title_short |
Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK |
| title_full |
Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK |
| title_fullStr |
Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK |
| title_full_unstemmed |
Μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης MuSK |
| title_sort |
μοριακή μοντελοποίηση και διαμορφωτική ανάλυση της δομής της πρωτείνης musk |
| publishDate |
2012 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/5690 |
| work_keys_str_mv |
AT chaïntinēsbasileios moriakēmontelopoiēsēkaidiamorphōtikēanalysētēsdomēstēsprōteinēsmusk |
| _version_ |
1771297348643717120 |
