Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10

Η Μυασθένεια είναι μια αυτοάνοση νόσος της νευρομυϊκής σύναψης που χαρακτηρίζεται από την παραγωγή αυτοαντισωμάτων έναντι, συνήθως, του AChR, καθώς και άλλων πρωτεϊνών της σύναψης. Στην παρούσα εργασία, πραγματοποιήθηκε μελέτη γενετικής συσχέτισης για την ταυτοποίηση πολυμορφισμών που πιθανώς εμπλέκ...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Ζαγορίτη, Ζωή
Other Authors: Τζάρτος, Σωκράτης
Format: Thesis
Language:Greek
Published: 2013
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10889/6060
id nemertes-10889-6060
record_format dspace
spelling nemertes-10889-60602022-09-05T06:57:55Z Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10 Ζαγορίτη, Ζωή Τζάρτος, Σωκράτης Τζάρτος, Σωκράτης Πουλάς, Κωνσταντίνος Πατρινός, Γεώργιος Zagoriti, Zoi Μυασθένεια Πολυμορφισμοί Μελέτη γενετικής συσχέτισης Myasthenia gravis Polymorphisms IRF5 TNFAIP3 IL-10 Η Μυασθένεια είναι μια αυτοάνοση νόσος της νευρομυϊκής σύναψης που χαρακτηρίζεται από την παραγωγή αυτοαντισωμάτων έναντι, συνήθως, του AChR, καθώς και άλλων πρωτεϊνών της σύναψης. Στην παρούσα εργασία, πραγματοποιήθηκε μελέτη γενετικής συσχέτισης για την ταυτοποίηση πολυμορφισμών που πιθανώς εμπλέκονται στην εκδήλωση της Μυασθένειας. Για το σκοπό αυτό, επιλέχθηκαν πολυμορφισμοί οι οποίοι εδράζονται σε γονίδια που αποτελούν σημαντικούς ρυθμιστές της ανοσολογικής απόκρισης και έχουν προηγουμένως συσχετισθεί με άλλες αυτοάνοσες νόσους. Τα υποψήφια γονίδια είναι τα: interferon regulatory factor 5 (IRF-5), TNFα-induced protein 3 (TNFAIP3) και interleukin-10 (IL-10). Στη μελέτη συμμετείχαν 101 μυασθενείς και ισάριθμα υγιή άτομα ως ομάδα αναφοράς, όλοι ελληνικής καταγωγής. Οι μέθοδοι γονοτύπησης που εφαρμόσθηκαν περιλαμβάνουν τον προσδιορισμό αλληλουχίας κατά Sanger, την HRM ανάλυση, την PCR-RFLP και την PCR σε συνδυασμό με ηλεκτροφόρηση σε αγαρόζη, στην περίπτωση ενός in/del 30 bp. Μια στατιστική τάση συσχέτισης (p=0.068) ανιχνεύθηκε για τους πολυμορφισμούς στον υποκινητή της IL-10 μεταξύ των μυασθενών με πρώιμη ηλικία έναρξης της νόσου (early-onset) και αυτών που εμφάνισαν τη νόσο ηλικιακά αργότερα (late-onset). Για τους υπόλοιπους πολυμορφισμούς που μελετήθηκαν, δεν παρατηρήθηκαν στατιστικά σημαντικές διαφορές. Η μελέτη αυτή αποτελεί την πρώτη προσπάθεια συσχέτισης πολυμορφισμών των γονιδίων IRF-5 και TNFAIP3 με τη Μυασθένεια, σε οποιονδήποτε πληθυσμό. Όσον αφορά τους πολυμορφισμούς του υποκινητή της IL-10, περαιτέρω μελέτες σε πολυπληθέστερες ομάδες πιθανώς να αποκαλύψουν μια στατιστικώς ισχυρότερη συσχέτιση. Myasthenia gravis (MG) is a heterogeneous autoimmune disease characterized by the production of autoantibodies against proteins of the postsynaptic membrane, in the neuromuscular junction. The contribution of genetic factors to MG susceptibility has been evaluated through family and twin studies, however, the precise genetic background of the disease remains elusive. We conducted a case-control association study in 101 unrelated MG patients, of Hellenic origin and 101 healthy volunteers in order to assess the involvement of common genetic variants in susceptibility to MG. We focused on three candidate genes which have been clearly associated with several autoimmune diseases, aiming to investigate their potential implication in MG pathogenesis. These are interferon regulatory factor 5 (IRF-5), TNFα-induced protein 3 (TNFAIP3), also known as A20, and interleukin-10 (IL-10), key molecules in the regulation of immune function. Genotyping was performed by PCR-RFLP, direct automated sequencing, High Resolution Melt curve Analysis (HRM) and PCR-agarose gel electrophoresis analysis in the case of a 30 bp in/del polymorphism. A statistical trend of association (p=0.068) between IL-10 promoter single nucleotide polymorphisms (SNPs) and the subgroups of early and late-onset MG patients was revealed. No statistically significant differences were observed in the rest of the variants examined. As far as we are aware, this is the first worldwide attempt to address the possible association between IRF-5 and TNFAIP3 common genetic variants and the genetic basis of MG. 2013-06-07T09:23:19Z 2013-06-07T09:23:19Z 2013-02-11 2013-06-07 Thesis http://hdl.handle.net/10889/6060 gr Η ΒΚΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. 0 application/pdf
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Μυασθένεια
Πολυμορφισμοί
Μελέτη γενετικής συσχέτισης
Myasthenia gravis
Polymorphisms
IRF5
TNFAIP3
IL-10
spellingShingle Μυασθένεια
Πολυμορφισμοί
Μελέτη γενετικής συσχέτισης
Myasthenia gravis
Polymorphisms
IRF5
TNFAIP3
IL-10
Ζαγορίτη, Ζωή
Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10
description Η Μυασθένεια είναι μια αυτοάνοση νόσος της νευρομυϊκής σύναψης που χαρακτηρίζεται από την παραγωγή αυτοαντισωμάτων έναντι, συνήθως, του AChR, καθώς και άλλων πρωτεϊνών της σύναψης. Στην παρούσα εργασία, πραγματοποιήθηκε μελέτη γενετικής συσχέτισης για την ταυτοποίηση πολυμορφισμών που πιθανώς εμπλέκονται στην εκδήλωση της Μυασθένειας. Για το σκοπό αυτό, επιλέχθηκαν πολυμορφισμοί οι οποίοι εδράζονται σε γονίδια που αποτελούν σημαντικούς ρυθμιστές της ανοσολογικής απόκρισης και έχουν προηγουμένως συσχετισθεί με άλλες αυτοάνοσες νόσους. Τα υποψήφια γονίδια είναι τα: interferon regulatory factor 5 (IRF-5), TNFα-induced protein 3 (TNFAIP3) και interleukin-10 (IL-10). Στη μελέτη συμμετείχαν 101 μυασθενείς και ισάριθμα υγιή άτομα ως ομάδα αναφοράς, όλοι ελληνικής καταγωγής. Οι μέθοδοι γονοτύπησης που εφαρμόσθηκαν περιλαμβάνουν τον προσδιορισμό αλληλουχίας κατά Sanger, την HRM ανάλυση, την PCR-RFLP και την PCR σε συνδυασμό με ηλεκτροφόρηση σε αγαρόζη, στην περίπτωση ενός in/del 30 bp. Μια στατιστική τάση συσχέτισης (p=0.068) ανιχνεύθηκε για τους πολυμορφισμούς στον υποκινητή της IL-10 μεταξύ των μυασθενών με πρώιμη ηλικία έναρξης της νόσου (early-onset) και αυτών που εμφάνισαν τη νόσο ηλικιακά αργότερα (late-onset). Για τους υπόλοιπους πολυμορφισμούς που μελετήθηκαν, δεν παρατηρήθηκαν στατιστικά σημαντικές διαφορές. Η μελέτη αυτή αποτελεί την πρώτη προσπάθεια συσχέτισης πολυμορφισμών των γονιδίων IRF-5 και TNFAIP3 με τη Μυασθένεια, σε οποιονδήποτε πληθυσμό. Όσον αφορά τους πολυμορφισμούς του υποκινητή της IL-10, περαιτέρω μελέτες σε πολυπληθέστερες ομάδες πιθανώς να αποκαλύψουν μια στατιστικώς ισχυρότερη συσχέτιση.
author2 Τζάρτος, Σωκράτης
author_facet Τζάρτος, Σωκράτης
Ζαγορίτη, Ζωή
format Thesis
author Ζαγορίτη, Ζωή
author_sort Ζαγορίτη, Ζωή
title Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10
title_short Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10
title_full Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10
title_fullStr Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10
title_full_unstemmed Γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια IRF5, TNFAIP3 και IL-10
title_sort γενετική της μυασθένειας στον ελληνικό πληθυσμό: μελέτη γενετικής συσχέτισης πολυμορφισμών στα γονίδια irf5, tnfaip3 και il-10
publishDate 2013
url http://hdl.handle.net/10889/6060
work_keys_str_mv AT zagoritēzōē genetikētēsmyastheneiasstonellēnikoplēthysmomeletēgenetikēssyschetisēspolymorphismōnstagonidiairf5tnfaip3kaiil10
_version_ 1771297174892576768