Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια

Ο περιορισμός αλυσιδωτών μακρομορίων σε νανο-πόρους με διαστάσεις συγκρίσιμες με τις χαρακτηριστικές διαστάσεις της μοριακής αλυσίδας όπως και η δυνατότητα αποδέσμευσης (απελευθέρωσης) της αλυσίδας από το νανο-πόρο παίζουν σημαντικό ρόλο σε πολλές βιολογικές διαδικασίες και βιοτεχνολογικές εφαρμογές...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Χατζηάδη, Αργυρώ
Άλλοι συγγραφείς: Βανακάρας, Αλέξανδρος
Μορφή: Thesis
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2014
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/7254
id nemertes-10889-7254
record_format dspace
spelling nemertes-10889-72542022-09-05T14:02:47Z Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια Χατζηάδη, Αργυρώ Βανακάρας, Αλέξανδρος Φωτεινός, Δημήτριος Μπακανδρίτσος, Άρης Chatziadi, Argiro Ιδανικές πολυμερικές αλυσίδες Περιορισμός Ideal polymer chains Confinement Monte Carlo 547.28 Ο περιορισμός αλυσιδωτών μακρομορίων σε νανο-πόρους με διαστάσεις συγκρίσιμες με τις χαρακτηριστικές διαστάσεις της μοριακής αλυσίδας όπως και η δυνατότητα αποδέσμευσης (απελευθέρωσης) της αλυσίδας από το νανο-πόρο παίζουν σημαντικό ρόλο σε πολλές βιολογικές διαδικασίες και βιοτεχνολογικές εφαρμογές. Η διαδικασία της αποδέσμευσης μιας αρχικά εγκλωβισμένης πολυμερικής αλυσίδας εξαρτάται από μια σειρά παράγοντες όπως: το μοριακό βάρος της αλυσίδας, το μέγεθος του νανο-δοχείου σε σχέση με το μήκος της αλυσίδας, το σχήμα του νανο-δοχείου, το μέγεθος του πόρου διαφυγής/εισόδου της αλυσίδας στο νανοδοχείο, η ποιότητα του διαλύτη εντός και εκτός του νανοδοχείου κ.α. Το φαινόμενο και ο ρόλος των παραμέτρων που το επηρεάζουν θα μελετηθούν με αναλυτικές μεθόδους περιγράφοντας το μακρομόριο με μοντέλα ιδανικών αλυσίδων και το νανοδοχείο ως ένα αδιαπέραστο περιορισμό (σφαιρικού σχήματος) με ένα πόρο διαφυγής για την αλυσίδα. Η μελέτη αυτή αποτελεί το πρώτο βήμα για την εφαρμογή ρεαλιστικών μοντέλων για την περιγραφή των διαδικασιών δέσμευσης/αποδέσμευσης γραμμικών πολυμερών σε σφαιρικές κοιλότητες νανοσκοπικών μεγεθών. The confinement of the macromolecules into nanopores with dimensions translocation of the chain through the nanopore has a key role in many biological processes and biotechnological applications. The process of packing/releasing of the polymer chain depends on many factors like molecular weight of the chain, the size of the nano-container in comparison with the length of the chain, the shape of the nano-container, the size of the nanopore, the quality of the solvent into and out of the nano-container etc. In the present work we will study the translocation of an ideal chain, confined initially into an impenetrable spherical cavity, through a tiny pore on the surface of the spherical cavity. Using analytical tools and Monte Carlo simulations we examine the effects of the molecular weight and the size of the spherical cavity in the translocation process. This study is a first step towards more realistic descriptions of the confinement/translocation problem of linear polymers from nanopores. 2014-04-30T07:15:24Z 2014-04-30T07:15:24Z 2013-04-12 2014-04-30 Thesis http://hdl.handle.net/10889/7254 gr Η ΒΚΠ διαθέτει αντίτυπο της διατριβής σε έντυπη μορφή στο βιβλιοστάσιο διδακτορικών διατριβών που βρίσκεται στο ισόγειο του κτιρίου της. 12 application/pdf
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Ιδανικές πολυμερικές αλυσίδες
Περιορισμός
Ideal polymer chains
Confinement
Monte Carlo
547.28
spellingShingle Ιδανικές πολυμερικές αλυσίδες
Περιορισμός
Ideal polymer chains
Confinement
Monte Carlo
547.28
Χατζηάδη, Αργυρώ
Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
description Ο περιορισμός αλυσιδωτών μακρομορίων σε νανο-πόρους με διαστάσεις συγκρίσιμες με τις χαρακτηριστικές διαστάσεις της μοριακής αλυσίδας όπως και η δυνατότητα αποδέσμευσης (απελευθέρωσης) της αλυσίδας από το νανο-πόρο παίζουν σημαντικό ρόλο σε πολλές βιολογικές διαδικασίες και βιοτεχνολογικές εφαρμογές. Η διαδικασία της αποδέσμευσης μιας αρχικά εγκλωβισμένης πολυμερικής αλυσίδας εξαρτάται από μια σειρά παράγοντες όπως: το μοριακό βάρος της αλυσίδας, το μέγεθος του νανο-δοχείου σε σχέση με το μήκος της αλυσίδας, το σχήμα του νανο-δοχείου, το μέγεθος του πόρου διαφυγής/εισόδου της αλυσίδας στο νανοδοχείο, η ποιότητα του διαλύτη εντός και εκτός του νανοδοχείου κ.α. Το φαινόμενο και ο ρόλος των παραμέτρων που το επηρεάζουν θα μελετηθούν με αναλυτικές μεθόδους περιγράφοντας το μακρομόριο με μοντέλα ιδανικών αλυσίδων και το νανοδοχείο ως ένα αδιαπέραστο περιορισμό (σφαιρικού σχήματος) με ένα πόρο διαφυγής για την αλυσίδα. Η μελέτη αυτή αποτελεί το πρώτο βήμα για την εφαρμογή ρεαλιστικών μοντέλων για την περιγραφή των διαδικασιών δέσμευσης/αποδέσμευσης γραμμικών πολυμερών σε σφαιρικές κοιλότητες νανοσκοπικών μεγεθών.
author2 Βανακάρας, Αλέξανδρος
author_facet Βανακάρας, Αλέξανδρος
Χατζηάδη, Αργυρώ
format Thesis
author Χατζηάδη, Αργυρώ
author_sort Χατζηάδη, Αργυρώ
title Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
title_short Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
title_full Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
title_fullStr Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
title_full_unstemmed Θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
title_sort θεωρητική και υπολογιστική μελέτη του εγκλωβισμού και της αποδέσμευσης μακρομοριακών αλυσίδων από νανοδοχεία/νανοκαψίδια
publishDate 2014
url http://hdl.handle.net/10889/7254
work_keys_str_mv AT chatzēadēargyrō theōrētikēkaiypologistikēmeletētouenklōbismoukaitēsapodesmeusēsmakromoriakōnalysidōnaponanodocheiananokapsidia
_version_ 1771297218125365248