Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό
Σκοπός της συγκεκριμένης ερευνητικής εργασίας ήταν η αποκάλυψη του ρόλου και της θέσης του PlCOUP-TF στο ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης του αχινού Paracentrotus lividus, αλλά και η διερεύνηση των επιδράσεων του συγκεκριμένου μεταγραφικού παράγοντα στα υπόλοιπα γονίδια που εμπλέκονται σ...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2015
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/8203 |
| id |
nemertes-10889-8203 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-82032022-09-05T13:58:08Z Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό Καλογήρου, Χριστίνα Φλυτζάνης, Κωνσταντίνος Μίντζας, Αναστάσιος Ζαρκάδης, Ιωάννης Kalogirou, Christina Νευρογένεση Αχινός Ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο Neurogenesis Sea urchin Gene regulatory network 593.95 Σκοπός της συγκεκριμένης ερευνητικής εργασίας ήταν η αποκάλυψη του ρόλου και της θέσης του PlCOUP-TF στο ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης του αχινού Paracentrotus lividus, αλλά και η διερεύνηση των επιδράσεων του συγκεκριμένου μεταγραφικού παράγοντα στα υπόλοιπα γονίδια που εμπλέκονται στην δημιουργία νευρώνων. Ο PlCOUP-TF είναι ένας μητρικός μεταγραφικός παράγοντας και ορφανός πυρηνικός υποδοχέας που φαίνεται να διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην δημιουργία νευρώνων σε μια ποικιλία οργανισμών. Τα υπό μελέτη γονίδια της νευρογένεσης είναι επίσης μεταγραφικοι παράγοντες με εξελικτικά συντηρημένες επικράτειες. Για τον προαναφερθέντα σκοπό, πραγματοποίηθηκαν πειράματα διπλής φθορίζουσας in situ υβριδοποίησης ώστε να αποκαλυφθούν οι περιοχές συνεντοπίσμου του PlCOUP-TF και των γονιδίων της νευρογένεσης σε ώριμα στάδια της ανάπτυξης. Επίσης, διεξήχθησαν πειράματα καταστολής της μητρικής έκφρασης του PlCOUP-TF με ενέσεις με ΜΑSO σε γονιμοποιημένα ωάρια και έλεγχος της έκφρασης των νευροειδικών γονιδίων στα ενεμένα και στα αντίστοιχα control έμβρυα. Ο έλεγχος της έκφρασης ήταν τόσο ποιοτικός (in situ χρωμογόνος υβριδοποίηση) όσο και ποσοτικός (Q-PCR). Με τα πειράματα αυτά, αποκαλύφθηκε ότι πιθανότατα ο συγκεκριμένος μεταγραφικός παράγοντας λειτουργεί ενεργοποιητικά για τα εν λόγω γονίδια. Συγκεκριμένα, φαίνεται η ύπαρξη κατασταλτικής δράσης του PlCOUP-TF πάνω σε καταστολέα των γονιδίων της νευρογένεσης (double negative gate) στην περιοχή του εμπρόσθιου νευροεξωδέρματος και σε συγκεκριμένες περιοχές της βλεφαριδωτής ζώνης. Our aim was to identify the role of the orphan nuclear receptor PlCoup-TF in sea urchin embryonic neurogenesis and especially in the determination of the anterior neuroectoderm (ANE). To this end, we cloned a set of embryonic cDNAs encoding regulatory proteins expressed specifically in the ANE and we prepared antisense RNA probes for double fluorescence in situ hybridization for the following genes: PlCoup-TF, PlHbn, Plz81 and PlFoxG. We studied the spatial pattern of expression of ANE genes in conjunction with the expression pattern of PlCoup-TF in all embryonic stages of the sea urchin Paracentrotus lividus. A neurogenic territory specified within the animal pole of the embryo, is formed as a result of the interplay of the aforementioned regulatory factors that together constitute a sub-circuit within the embryonic gene regulatory network (GRN). We wanted to determine PlCoup-TF’s place within the GRN and specifically the ANE sub-circuit. Therefore, we knockdowned PlCoup-TF expression during embryogenesis by injecting specific morpholino antisense oligonucleotides (MASO) into sea urchin eggs and determine the expression pattern of the ANE specific genes by chromogenic in situ hybridization to resulting morphant embryos. The efficiency of the knockdown was measured by QPCR, where the amount of PlCoup-TF transcripts of morphants is compared to that of control embryos. Finally, we concluded that probably PlCoup-TF activate the ANE genes, by repressing repressor(s) of these genes (double negative gate) in ANE and in specific regions of CBE. 2015-01-13T09:42:24Z 2015-01-13T09:42:24Z 2014-10-20 2015-01-13 Thesis http://hdl.handle.net/10889/8203 gr 0 application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Νευρογένεση Αχινός Ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο Neurogenesis Sea urchin Gene regulatory network 593.95 |
| spellingShingle |
Νευρογένεση Αχινός Ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο Neurogenesis Sea urchin Gene regulatory network 593.95 Καλογήρου, Χριστίνα Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| description |
Σκοπός της συγκεκριμένης ερευνητικής εργασίας ήταν η αποκάλυψη του ρόλου και της θέσης του PlCOUP-TF στο ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης του αχινού Paracentrotus lividus, αλλά και η διερεύνηση των επιδράσεων του συγκεκριμένου μεταγραφικού παράγοντα στα υπόλοιπα γονίδια που εμπλέκονται στην δημιουργία νευρώνων. Ο PlCOUP-TF είναι ένας μητρικός μεταγραφικός παράγοντας και ορφανός πυρηνικός υποδοχέας που φαίνεται να διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην δημιουργία νευρώνων σε μια ποικιλία οργανισμών. Τα υπό μελέτη γονίδια της νευρογένεσης είναι επίσης μεταγραφικοι παράγοντες με εξελικτικά συντηρημένες επικράτειες. Για τον προαναφερθέντα σκοπό, πραγματοποίηθηκαν πειράματα διπλής φθορίζουσας in situ υβριδοποίησης ώστε να αποκαλυφθούν οι περιοχές συνεντοπίσμου του PlCOUP-TF και των γονιδίων της νευρογένεσης σε ώριμα στάδια της ανάπτυξης. Επίσης, διεξήχθησαν πειράματα καταστολής της μητρικής έκφρασης του PlCOUP-TF με ενέσεις με ΜΑSO σε γονιμοποιημένα ωάρια και έλεγχος της έκφρασης των νευροειδικών γονιδίων στα ενεμένα και στα αντίστοιχα control έμβρυα. Ο έλεγχος της έκφρασης ήταν τόσο ποιοτικός (in situ χρωμογόνος υβριδοποίηση) όσο και ποσοτικός (Q-PCR). Με τα πειράματα αυτά, αποκαλύφθηκε ότι πιθανότατα ο συγκεκριμένος μεταγραφικός παράγοντας λειτουργεί ενεργοποιητικά για τα εν λόγω γονίδια. Συγκεκριμένα, φαίνεται η ύπαρξη κατασταλτικής δράσης του PlCOUP-TF πάνω σε καταστολέα των γονιδίων της νευρογένεσης (double negative gate) στην περιοχή του εμπρόσθιου νευροεξωδέρματος και σε συγκεκριμένες περιοχές της βλεφαριδωτής ζώνης. |
| author2 |
Φλυτζάνης, Κωνσταντίνος |
| author_facet |
Φλυτζάνης, Κωνσταντίνος Καλογήρου, Χριστίνα |
| format |
Thesis |
| author |
Καλογήρου, Χριστίνα |
| author_sort |
Καλογήρου, Χριστίνα |
| title |
Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| title_short |
Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| title_full |
Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| title_fullStr |
Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| title_full_unstemmed |
Ο PlCOUP-TF και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| title_sort |
ο plcoup-tf και το ρυθμιστικό γονιδιακό δίκτυο της νευρογένεσης στον αχινό |
| publishDate |
2015 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/8203 |
| work_keys_str_mv |
AT kalogērouchristina oplcouptfkaitorythmistikogonidiakodiktyotēsneurogenesēsstonachino |
| _version_ |
1771297250521120768 |
