Εκτίμηση συχνότητας των HLA-A, -B , - DRB1 αλληλόμορφων και απλοτύπων σε σύνολο δεδομένων 5131 Ελλήνων εθελοντών δοτών μυελού των οστών και εφαρμογές για στρατηγικό σχεδιασμό μητρώου δοτών

• Κύριος συγγραφέας: Κορμπάκης, Παναγιώτης
• Άλλοι συγγραφείς: Σπυριδωνίδης, Αλέξανδρος
• Μορφή: Thesis
• Γλώσσα: Greek
• Έκδοση: 2016
• Θέματα: Μεταμόσχευση αιμοποιητικών βλαστοκυττάρων; Μυελός των οστών; Πιθανότητα ιστοσυμβατότητας; Σύστημα ανθρώπινων λευκοκυτταρικών αντιγόνων; Μείζον σύμπλεγμα ιστοσυμβατότητας; Ανισορροπία γενετικής σύνδεσης; Αλληλόμορφο; Απλότυπος; Φαινότυπος; Γονότυπος; Βιοστατιστική; Μητρώο εθελοντών δοτών μυελού των οστών; Αντιγόνο; Αλγόριθμος μεγιστοποίησης προσδοκίας; Συχνότητα; Hematopoietic stem cell transplantation; Bone marrow; Histocompatibility probability; HLA; MHC; NMDP; Linkage disequilibrium; Hardy-Weinberg; Allele; Haplotype; Arlequin; Phenotype; Genotype; Biostatistics; Bone marrow donor registry; Antigen; Expectation-maximization algorithm; Frequency; 617.441 059 2

Η ανάλυση της συμβατότητας των HLA (Human Leukocyte Antigen - Ανθρώπινων Λευκοκυτταρικών Αντιγόνων) γονιδίων μεταξύ δότη και λήπτη βελτιώνει την επιβίωση των ασθενών μετά από μεταμόσχευση αιμοποιητικών βλαστικών κυττάρων. Κατά συνέπεια, η αναζήτηση του κατάλληλου δότη έχει στόχο την εξεύρεση δοτών οι οποίοι είναι συμβατοί με τους αντίστοιχους ασθενείς τουλάχιστον για αυτά τα γονίδια, τα οποία έχουν τυποποιηθεί σε υψηλή ανάλυση. Σε αυτό το πλαίσιο, η διαθεσιμότητα των κατανομών των συχνοτήτων των HLA αλληλόμορφων γονιδίων και των αντίστοιχων απλοτύπων που προκύπτουν από τον συνδυασμό τους είναι χρήσιμη για δύο λόγους: Πρώτον, αυξάνεται η αποδοτικότητα των επιμέρους αναζητήσεων συμβατού δότη, εφόσον πολλοί εγγεγραμμένοι δότες στο μητρώο εθελοντών δοτών μυελού των οστών παρατίθενται με ελλιπείς HLA πληροφορίες. Δεύτερον, οι κατανομές των συχνοτήτων των HLA απλοτύπων και η βιοστατιστική ανάλυση των HLA δεδομένων του πληθυσμού των δοτών, καθορίζουν πόσοι ασθενείς βρίσκουν συμβατούς δότες σε ένα μητρώο με Ν εθελοντές δότες, από την ανάλυση του πληθυσμού. Στα πλαίσια της εκπόνησης της παρούσας μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας θα προσδιοριστεί η κατανομή των συχνοτήτων των HLA αλληλόμορφων γονιδίων και των HLA απλοτύπων σε έναν πληθυσμό Ελλήνων εθελοντών δοτών μυελού των οστών για τα γονίδια HLA-A, HLA-B και HLA-DRB1, η οποία εν συνεχεία θα χρησιμοποιηθεί για τη βελτιστοποίηση της αναζήτησης μεμονωμένων βλαστικών κυττάρων των δοτών και την αποδοτική διαχείριση του αντίστοιχου μητρώου των εθελοντών δοτών. Επιπλέον, οι συχνότητες των HLA απλοτύπων που θα υπολογιστούν, θα χρησιμοποιηθούν για την εκτίμηση της πιθανότητας εύρεσης συμβατών δοτών εντός του συνόλου των εθελοντών δοτών. Οι αναλύσεις και η επεξεργασία του συνόλου των δεδομένων των εθελοντών δοτών θα υλοποιηθούν με ειδικά πακέτα λογισμικού βιοστατιστικής ανάλυσης, υπολογιστικούς αλγορίθμους και μεθοδολογίες. Τέλος, θα πραγματοποιηθεί μια προσπάθεια σύγκρισης των στατιστικών αποτελεσμάτων που θα προκύψουν από την ανάλυση των δεδομένων του πληθυσμού των Ελλήνων δοτών, με τα αντίστοιχα αποτελέσματα άλλων πληθυσμών (Γερμανών δοτών) για την εξαγωγή συμπερασμάτων ως προς το ποσοστό της HLA ιστοσυμβατότητας μεταξύ των πληθυσμών αυτών και την ποιότητα των μητρώων.