| Περίληψη: | Οι άλφα ιοί αποτελούν ένα γένος ιών οι οποίοι διαθέτουν νοηματικό μονόκλωνο RNA ως γενετικό υλικό. Τα τελευταία χρόνια έχουν καταγραφεί πολλές πανδημίες οφειλόμενες σε άλφα ιούς σε ολόκληρο τον κόσμο. Η ανάγκη περιορισμού αυτών παράλληλα με την ανυπαρξία ειδικής προληπτικής και θεραπευτικής φαρμακευτικής αγωγής ώθησε την επιστημονική κοινότητα στη μελέτη των μηχανισμών παθογονικότητας και εξάπλωση πολλών από τα μέλη του γένους. Δύο από τα μέλη είναι οι ιοί Chikungunya και Mayaro. Η μελέτη των στελεχών της οικογένειας αποκάλυψε πολύ χρήσιμα στοιχεία για τη βιολογική λειτουργία πολλών από τις ιικές πρωτεΐνες. Το ιικό γονιδίωμα κωδικοποιεί δομικές και μη δομικές πρωτεΐνες. Άγνωστη παραμένει μέχρι σήμερα η λειτουργία ενός τομέα ο οποίος εδράζεται στο N τελικό άκρο της μη δομικής πρωτεΐνης 3. Ο συγκεκριμένος τομέας είναι συντηρημένος σε όλα τα μέλη της οικογένειας και ονομάζεται macrο. Οι macro τομείς αποτελούν μία οικογένεια δομών, συντηρημένη εξελικτικά σε πολλά είδη οργανισμών όπως βακτήρια, αρχαία, ασπόνδυλα, φυτά καθώς και θηλαστικά. Για ελάχιστους από αυτούς έχει αποσαφηνιστεί ο βιολογικός ρόλος. Οι περισσότεροι διαθέτουν ικανότητα πρόσδεσης του ADPr και παραγώγων αυτού και ικανότητα υδρόλυσης του ADPr-1ʹʹ- φωσφόρου. Τέλος, οι αντίστοιχοι τομείς στον άνθρωπο εμπλέκονται στην επιδιόρθωση του DNA και στην κυτταρική απόπτωση.
Όπως προαναφέρθηκε ο ρόλος των macro τομέων στους ιούς δεν έχει διευκρινιστεί. Γι’ αυτόν το λόγο συγκριτικές δομικές και βιοχημικές μελέτες σε τομείς διαφόρων στελεχών της οικογένειας είναι χρήσιμες στον προσδιορισμό της βιολογικής λειτουργίας των τομέων στους ιούς. Στην παρούσα εργασία, πραγματοποιείται έκφραση, απομόνωση και μελέτη μέσω φασματοσκοπίας NMR των macro τομέων Chikungunya και Mayaro. Η NMR δομή του macro τομέα του ιού Mayaro επιλύθηκε σε υψηλή διακρισιμότητα (tf=0,73±7.87*10-2 Å2, RMSD=1,07±0.14 Å και RMSD= RMSD=1.27±0.1 Å για τα άτομα της πολυπεπτιδικής αλυσίδας και τα βαρέα άτομα αντίστοιχα) και αποκάλυψε μια βαβ «σάντουιτς» δομή στο κέντρο της οποίας σχηματίζεται μια εκτεταμένη β-πτυχωτή επιφάνεια. Στη συνέχεια πραγματοποιήθηκαν ΝΜR και βιοχημικά πειράματα αλληλεπίδρασης τα οποία αποκάλυψαν ότι το ADPr και μόρια RNA αποτελούν προσδέτες στον macro τομέα του ιού Mayaro και επιβεβαίωσαν την συγγένεια του τομέα του ιού Chikungunya έναντι διαφόρων παραγώγων του ADPr.
|
|---|
