Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία
Οι αιμοσφαιρινοπάθειες αποτελούν κοινές μονογονιδιακές κληρονομικές ασθένειες που χαρακτηρίζονται από ανωμαλίες είτε στη δομή, είτε στη σύνθεση μιας εκ των δύο υπομονάδων της σφαιρίνης. Αποτελούν ένα παγκόσμιο πρόβλημα υγείας με περιορισμένη θεραπευτική προσέγγιση έως και σήμερα. Μια από τις θεραπε...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2019
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/11928 |
| id |
nemertes-10889-11928 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Αιμοσφαιρινοπάθειες Υδροξυουρία Παράγοντες Kruppel Hemoglobinopathies Hydroxyurea Kruppel like factors 616.151 042 |
| spellingShingle |
Αιμοσφαιρινοπάθειες Υδροξυουρία Παράγοντες Kruppel Hemoglobinopathies Hydroxyurea Kruppel like factors 616.151 042 Καραμπέρης, Καριοφύλλης Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| description |
Οι αιμοσφαιρινοπάθειες αποτελούν κοινές μονογονιδιακές κληρονομικές ασθένειες που χαρακτηρίζονται από ανωμαλίες είτε στη δομή, είτε στη σύνθεση μιας εκ των δύο υπομονάδων της σφαιρίνης. Αποτελούν ένα παγκόσμιο πρόβλημα υγείας με περιορισμένη θεραπευτική προσέγγιση έως και σήμερα. Μια από τις θεραπευτικές προσεγγίσεις που χρησιμοποιείται είναι η επαναγωγή των γ-σφαιρινών με στόχο την αύξηση των επιπέδων της εμβρυϊκής αιμοσφαιρίνης.
Η υδροξυουρία (HU) είναι μια φαρμακευτική δραστική ένωση, εγκεκριμένη από τον FDA, με κύρια δράση την επαναγωγή της εμβρυϊκής αιμοσφαιρίνης σε ασθενείς με δρεπανοκυτταρική αναιμία. Πολλαπλές ερευνητικές μελέτες έχουν διεξαχθεί ως προς την χρήση της HU και σε άλλους τύπους αιμοσφαιρινοπάθειας και έχουν δείξει ότι η απόκριση των ασθενών στη θεραπεία ποικίλλει. Για το λόγο αυτό, πολλαπλές ερευνητικές μελέτες πραγματοποιούνται σε μεταγραφικούς παράγοντες όπου συμμετέχουν στη ρύθμιση της εμβρυϊκής αιμοσφαιρίνης.
Οι Klfs είναι μια οικογένεια μεταγραφικών παραγόντων τύπου Kruppel και μεσολαβούν στην ενεργοποίηση της έκφρασης των γονιδιακών συμπλεγμάτων των σφαιρινών κατά τα στάδια ανάπτυξης.
Η παρούσα εργασία στοχεύει στη μελέτη των μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών rs2242189 (T>C) και rs980112 (C>T) που εδράζονται στα γονίδια Klf3 και Klf10, αντίστοιχα. Συγκεκριμένα, μελετήθηκε η πιθανή συσχέτιση τους με την απόκριση των διπλά ετερόζυγων ασθενών (70 δείγματα για τον rs2242189 και 82 για rs980112) για δρεπανοκυτταρική αναιμία και β-θαλασσαιμία, στη θεραπευτική αγωγή με HU. Χρησιμοποιήθηκαν δύο ομάδες ασθενών: 1) Ασθενείς που είναι επιδεκτικοί στην θεραπεία με HU 2) ασθενείς ανεπίδεκτοι στη θεραπεία με HU. Η κατηγοριοποίηση των επιδεκτικών ή μη στην HU έγινε με τη χρήση των κριτηρίων Επιδεκτικότητας >20% και Τριπλασιασμού.
Η ενίσχυση των αλληλουχιών-στόχων πραγματοποιήθηκε με την τεχνική της PCR. Οι γονότυποι των πολυμορφισμών rs2242189 και rs980112 αναλύθηκαν με τις μεθόδους RFLP και αλληλούχισης κατά Sanger, εξετάζοντας τις συχνότητες αλληλομόρφων και γονοτύπων των υπό μελέτη πολυμορφισμών.
Τα αποτελέσματα της στατιστικής ανάλυσης δεν εμφάνισαν στατιστικώς σημαντική σχέση των υπό μελέτη πολυμορφισμών με την απόκριση στην HU, στις συγκεκριμένες ομάδες ασθενών, με βάση το κριτήριο x2. |
| author2 |
Πατρινός, Γεώργιος |
| author_facet |
Πατρινός, Γεώργιος Καραμπέρης, Καριοφύλλης |
| format |
Thesis |
| author |
Καραμπέρης, Καριοφύλλης |
| author_sort |
Καραμπέρης, Καριοφύλλης |
| title |
Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| title_short |
Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| title_full |
Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| title_fullStr |
Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| title_full_unstemmed |
Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| title_sort |
μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια klf3 και klf10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία |
| publishDate |
2019 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/11928 |
| work_keys_str_mv |
AT karamperēskariophyllēs meletētourolougenetikōnallagōnstagonidiaklf3kaiklf10ōspharmakogonidiōmatikoibiodeiktestēsapokrisēsasthenōnmebtypouaimosphairinopatheiesstēnydroxyouria AT karamperēskariophyllēs studyoftheroleofgeneticvariantsinklf3andklf10genesaspharmacogenomicbiomakerstohydroxyureatreatmentonbetahemoglobinopathiespatients |
| _version_ |
1771297356769132544 |
| spelling |
nemertes-10889-119282022-09-05T20:22:13Z Μελέτη του ρόλου γενετικών αλλαγών στα γονίδια KLF3 και KLF10 ως φαρμακογονιδιωματικοί βιοδείκτες της απόκρισης ασθενών με Β-τύπου αιμοσφαιρινοπάθειες στην υδροξυουρία Study of the role of genetic variants in KLF3 and KLF10 genes as pharmacogenomic biomakers to hydroxyurea treatment on beta-hemoglobinopathies patients Καραμπέρης, Καριοφύλλης Πατρινός, Γεώργιος Πατρινός, Γεώργιος Σπυρούλιας, Γεώργιος Πούλας, Κωνσταντίνος Karamperis, Kariofyllis Αιμοσφαιρινοπάθειες Υδροξυουρία Παράγοντες Kruppel Hemoglobinopathies Hydroxyurea Kruppel like factors 616.151 042 Οι αιμοσφαιρινοπάθειες αποτελούν κοινές μονογονιδιακές κληρονομικές ασθένειες που χαρακτηρίζονται από ανωμαλίες είτε στη δομή, είτε στη σύνθεση μιας εκ των δύο υπομονάδων της σφαιρίνης. Αποτελούν ένα παγκόσμιο πρόβλημα υγείας με περιορισμένη θεραπευτική προσέγγιση έως και σήμερα. Μια από τις θεραπευτικές προσεγγίσεις που χρησιμοποιείται είναι η επαναγωγή των γ-σφαιρινών με στόχο την αύξηση των επιπέδων της εμβρυϊκής αιμοσφαιρίνης. Η υδροξυουρία (HU) είναι μια φαρμακευτική δραστική ένωση, εγκεκριμένη από τον FDA, με κύρια δράση την επαναγωγή της εμβρυϊκής αιμοσφαιρίνης σε ασθενείς με δρεπανοκυτταρική αναιμία. Πολλαπλές ερευνητικές μελέτες έχουν διεξαχθεί ως προς την χρήση της HU και σε άλλους τύπους αιμοσφαιρινοπάθειας και έχουν δείξει ότι η απόκριση των ασθενών στη θεραπεία ποικίλλει. Για το λόγο αυτό, πολλαπλές ερευνητικές μελέτες πραγματοποιούνται σε μεταγραφικούς παράγοντες όπου συμμετέχουν στη ρύθμιση της εμβρυϊκής αιμοσφαιρίνης. Οι Klfs είναι μια οικογένεια μεταγραφικών παραγόντων τύπου Kruppel και μεσολαβούν στην ενεργοποίηση της έκφρασης των γονιδιακών συμπλεγμάτων των σφαιρινών κατά τα στάδια ανάπτυξης. Η παρούσα εργασία στοχεύει στη μελέτη των μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών rs2242189 (T>C) και rs980112 (C>T) που εδράζονται στα γονίδια Klf3 και Klf10, αντίστοιχα. Συγκεκριμένα, μελετήθηκε η πιθανή συσχέτιση τους με την απόκριση των διπλά ετερόζυγων ασθενών (70 δείγματα για τον rs2242189 και 82 για rs980112) για δρεπανοκυτταρική αναιμία και β-θαλασσαιμία, στη θεραπευτική αγωγή με HU. Χρησιμοποιήθηκαν δύο ομάδες ασθενών: 1) Ασθενείς που είναι επιδεκτικοί στην θεραπεία με HU 2) ασθενείς ανεπίδεκτοι στη θεραπεία με HU. Η κατηγοριοποίηση των επιδεκτικών ή μη στην HU έγινε με τη χρήση των κριτηρίων Επιδεκτικότητας >20% και Τριπλασιασμού. Η ενίσχυση των αλληλουχιών-στόχων πραγματοποιήθηκε με την τεχνική της PCR. Οι γονότυποι των πολυμορφισμών rs2242189 και rs980112 αναλύθηκαν με τις μεθόδους RFLP και αλληλούχισης κατά Sanger, εξετάζοντας τις συχνότητες αλληλομόρφων και γονοτύπων των υπό μελέτη πολυμορφισμών. Τα αποτελέσματα της στατιστικής ανάλυσης δεν εμφάνισαν στατιστικώς σημαντική σχέση των υπό μελέτη πολυμορφισμών με την απόκριση στην HU, στις συγκεκριμένες ομάδες ασθενών, με βάση το κριτήριο x2. Hemoglobinopathies represent a family of monogenic hereditary blood disorders characterized by defective or absent synthesis of one of the two polypeptide chains of hemoglobin. It is a global health problem with a limited therapeutic approach to date. One of the therapeutically approaches used is the induction of γ globin genes in order to increase fetal hemoglobin levels. Hydroxyurea (HU) is a pharmaceutically active compound, approved by the FDA, with main activity, the induction of fetal hemoglobin in patients with sickle cell anemia. Multiple research studies have been conducted on the use of HU to other types of hemoglobinopathies and have shown that the response of patients to treatment varies. For this reason, research studies are carried out on transcription factors involved in the regulation of fetal hemoglobin. Kruppel like factors (KLFs), are a family of transcription factors that mediate the activation of the expression of gene clusters during the developmental stages of a human. This study aims to a further approach of single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs2242189 (T>C) and rs980112 (C>T) located at Klf3 and Klf10 genes, respectively. In particular, the response of double heterozygous patients (70 samples for rs2242189 and 82 for rs980112) for sickle cell anemia and β thalassemia to HU treatment was studied. The patients were classified as: 1) Responders to HU treatment; 2) Non-responders to HU treatment. The classification of susceptible or non-eligible to HUs was made using the Susceptibility >20% and Three-Fold criteria. The amplification of the target sequences was performed by the PCR technique. SNPs were analyzed by Sanger sequencing and RFLP method, to examine the genotype and allele frequency. There was no statistically significant correlation of the studied SNPs, with the HU response in these patient groups, based on criterion x2. 2019-02-01T19:20:55Z 2019-02-01T19:20:55Z 2018-11 Thesis http://hdl.handle.net/10889/11928 gr 0 application/pdf |
