Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας
Οι αιμοσφαιρινοπάθειες αποτελούν την κύρια κατηγορία των μονογονιδιακών κληρονομικών ασθενειών. Η β-θαλασσαιμία είναι κληρονομική διαταραχή του αίματος που χαρακτηρίζεται από μειωμένη (β+) ή απουσία (β0) σύνθεση των αλυσίδων β-σφαιρίνης, με αποτέλεσμα μεταβλητούς φαινοτύπους που κυμαίνονται από σοβα...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Μορφή: | Thesis |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2019
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/12882 |
| id |
nemertes-10889-12882 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Β-θαλασσαιμία KLF9 γονίδιο Μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός B-thalassemia KLF9 gene Single-nucleotide polymorphism (SNP) 616.152 071 |
| spellingShingle |
Β-θαλασσαιμία KLF9 γονίδιο Μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός B-thalassemia KLF9 gene Single-nucleotide polymorphism (SNP) 616.152 071 Τσεκούρα, Σωτηρία Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| description |
Οι αιμοσφαιρινοπάθειες αποτελούν την κύρια κατηγορία των μονογονιδιακών κληρονομικών ασθενειών. Η β-θαλασσαιμία είναι κληρονομική διαταραχή του αίματος που χαρακτηρίζεται από μειωμένη (β+) ή απουσία (β0) σύνθεση των αλυσίδων β-σφαιρίνης, με αποτέλεσμα μεταβλητούς φαινοτύπους που κυμαίνονται από σοβαρή αναιμία έως τα κλινικώς ασυμπτωματικά άτομα. Υπάρχουν τρεις κλινικές και αιματολογικές συνθήκες αυξανόμενης σοβαρότητας που αναγνωρίζονται ως εξής: ελάσσονα β-θαλασσαιμία, μη ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-θαλασσαιμία και μείζονα β- θαλασσαιμία, η οποία φέρει την πιο σοβαρή αναιμία, ανεξάρτητη από τη μετάγγιση. Η οικογένεια παραγόντων μεταγραφής τύπου Krüppel (KLFs) είναι ένα σύνολο πρωτεϊνών δέσμευσης DNA δακτύλου ψευδαργύρου που ρυθμίζουν την γονιδιακή έκφραση και είναι ικανές να δεσμεύουν τις πλούσιες σε GC αλληλουχίες. Χαρακτηρίζονται από ένα εξαιρετικά διατηρημένο C-τερματικό πρότυπο σύνδεσης DNA που περιέχει τρεις περιοχές C2H2 δακτύλου ψευδαργύρου, με μεταβλητούς Ν-τερματικούς ρυθμιστικούς τομείς. Το KLF9 είναι ένας ρυθμιστικός μεταγραφικός παράγων με καθοριστικούς ρόλους στην ανάπτυξη, τη διαφοροποίηση και σε πολλές άλλες φυσιολογικές κυτταρικές διεργασίες.
Στην παρούσα μελέτη εξετάστηκε η συσχέτιση μιας γονιδιωματικής παραλλαγής (rs11142398) του KLF9 γονιδίου με την κλινική εικόνα των ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία. Για την γονοτύπηση χρησιμοποιήθηκαν οι μέθοδοι PCR και Sanger sequencing και επιλέχθηκαν δείγματα από υγιή (μη θαλασσαιμικά) άτομα, από ασθενείς με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία και από ασθενείς με β-θαλασσαιμία ανεξάρτητη μεταγγίσεων.
Σύμφωνα με την ανάλυση των δεδομένων της συγκεκριμένης μελέτης, παρατηρήθηκε συσχέτιση όσον αναφορά την σοβαρότητα της νόσου με το μονονουκλεοτιδικό πολυμορφισμό που εξετάστηκε. Επιπλέον, μελετήθηκε η συσχέτιση για την έναρξη συμπτωμάτων της νόσου, τόσο για το κλινικό προφίλ της μείζονος β-θαλασσαιμίας, όσο και για εκείνο της ανεξάρτητης μεταγγίσεων. Παρόλα αυτά, δεν βρέθηκε κάποιο στατιστικό αποτέλεσμα. |
| author2 |
Πατρινός, Γεώργιος |
| author_facet |
Πατρινός, Γεώργιος Τσεκούρα, Σωτηρία |
| format |
Thesis |
| author |
Τσεκούρα, Σωτηρία |
| author_sort |
Τσεκούρα, Σωτηρία |
| title |
Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| title_short |
Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| title_full |
Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| title_fullStr |
Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| title_full_unstemmed |
Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| title_sort |
μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου klf9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας |
| publishDate |
2019 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/12882 |
| work_keys_str_mv |
AT tsekourasōtēria meletētēssyschetisēstougonidiouklf9ōsgonidiōmatikoubiodeiktēgiatēnsobarotētatēsbmesogeiakēsanaimias AT tsekourasōtēria correlationstudyoftheklf9geneasagenomicbiomarkerfortheseverityofbmediterraneananemia |
| _version_ |
1771297279560384512 |
| spelling |
nemertes-10889-128822022-09-05T20:51:21Z Μελέτη της συσχέτισης του γονιδίου KLF9 ως γονιδιωματικού βιοδείκτη για την σοβαρότητα της β-μεσογειακής αναιμίας Correlation study of the KLF9 gene as a genomic biomarker for the severity of β Mediterranean anemia Τσεκούρα, Σωτηρία Πατρινός, Γεώργιος Πατρινός, Γεώργιος Σπυρούλιας, Γεώργιος Πουλάς, Κωνσταντίνος Tsekoura, Sotiria Β-θαλασσαιμία KLF9 γονίδιο Μονονουκλεοτιδικός πολυμορφισμός B-thalassemia KLF9 gene Single-nucleotide polymorphism (SNP) 616.152 071 Οι αιμοσφαιρινοπάθειες αποτελούν την κύρια κατηγορία των μονογονιδιακών κληρονομικών ασθενειών. Η β-θαλασσαιμία είναι κληρονομική διαταραχή του αίματος που χαρακτηρίζεται από μειωμένη (β+) ή απουσία (β0) σύνθεση των αλυσίδων β-σφαιρίνης, με αποτέλεσμα μεταβλητούς φαινοτύπους που κυμαίνονται από σοβαρή αναιμία έως τα κλινικώς ασυμπτωματικά άτομα. Υπάρχουν τρεις κλινικές και αιματολογικές συνθήκες αυξανόμενης σοβαρότητας που αναγνωρίζονται ως εξής: ελάσσονα β-θαλασσαιμία, μη ανεξάρτητη μεταγγίσεων β-θαλασσαιμία και μείζονα β- θαλασσαιμία, η οποία φέρει την πιο σοβαρή αναιμία, ανεξάρτητη από τη μετάγγιση. Η οικογένεια παραγόντων μεταγραφής τύπου Krüppel (KLFs) είναι ένα σύνολο πρωτεϊνών δέσμευσης DNA δακτύλου ψευδαργύρου που ρυθμίζουν την γονιδιακή έκφραση και είναι ικανές να δεσμεύουν τις πλούσιες σε GC αλληλουχίες. Χαρακτηρίζονται από ένα εξαιρετικά διατηρημένο C-τερματικό πρότυπο σύνδεσης DNA που περιέχει τρεις περιοχές C2H2 δακτύλου ψευδαργύρου, με μεταβλητούς Ν-τερματικούς ρυθμιστικούς τομείς. Το KLF9 είναι ένας ρυθμιστικός μεταγραφικός παράγων με καθοριστικούς ρόλους στην ανάπτυξη, τη διαφοροποίηση και σε πολλές άλλες φυσιολογικές κυτταρικές διεργασίες. Στην παρούσα μελέτη εξετάστηκε η συσχέτιση μιας γονιδιωματικής παραλλαγής (rs11142398) του KLF9 γονιδίου με την κλινική εικόνα των ασθενών με β-μεσογειακή αναιμία. Για την γονοτύπηση χρησιμοποιήθηκαν οι μέθοδοι PCR και Sanger sequencing και επιλέχθηκαν δείγματα από υγιή (μη θαλασσαιμικά) άτομα, από ασθενείς με μείζονα β-μεσογειακή αναιμία και από ασθενείς με β-θαλασσαιμία ανεξάρτητη μεταγγίσεων. Σύμφωνα με την ανάλυση των δεδομένων της συγκεκριμένης μελέτης, παρατηρήθηκε συσχέτιση όσον αναφορά την σοβαρότητα της νόσου με το μονονουκλεοτιδικό πολυμορφισμό που εξετάστηκε. Επιπλέον, μελετήθηκε η συσχέτιση για την έναρξη συμπτωμάτων της νόσου, τόσο για το κλινικό προφίλ της μείζονος β-θαλασσαιμίας, όσο και για εκείνο της ανεξάρτητης μεταγγίσεων. Παρόλα αυτά, δεν βρέθηκε κάποιο στατιστικό αποτέλεσμα. Hemoglobinopathies are the main category of monogenic hereditary diseases. Β-thalassemia is a hereditary blood disorder characterized by reduced (β+) or absent (β0) synthesis of β-globin chains, resulting in variable phenotypes ranging from severe anemia to clinically asymptomatic individuals. There are three clinical and hematologic conditions of increasing severity identified as: minor β-thalassemia, non-transfusion--dependent β-thalassemia, and major β-thalassemia, which is the most serious anemia with survival depending on transfusions. The Krüppel-like transcription factor family (KLFs) is a set of zinc finger DNA binding proteins that regulate gene expression and are capable of binding the GC-rich sequences. They are characterized by an extremely conserved C-terminal DNA binding motif containing three zinc finger C2H2 domains, with variable N-terminal regulatory domains. KLF9 is a transcriptional regulator with key roles in growth, differentiation and many other normal cellular processes. The present study examined the association of a genomic variant (rs11142398) of the KLF9 gene with the clinical profile of β-thalassaemia patients. PCR and Sanger sequencing methods were used to genotype samples from healthy (non-thalassemic) subjects, patients with major β-Thalassaemia and patients with transfusion- independent β-thalassemia Correlation was observed between the severity of the disease and the examined SNP. However, correlation with the onset of the disease was studied, for both the clinical entities of major β-thalassemia and of the transfusion- independent thalassaemia. However, no statistically significant result was found. 2019-12-21T08:59:38Z 2019-12-21T08:59:38Z 2018-12 Thesis http://hdl.handle.net/10889/12882 gr 12 application/pdf |
