Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό

Η γονιδιωματική, με τη βοήθεια των νέων τεχνολογιών που έχουν αναπτυχθεί τα τελευταία χρόνια έχει οδηγήσει στη δημιουργία νέων προϊόντων και υπηρεσιών που μπορούν να συμβάλλουν στη βελτίωση της ποιότητας ζωής των ανθρώπων. Στα πλαίσια της παρούσας μελέτης έχει μελετηθεί η γενετική κατατομή του ελλη...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής
Κύριος συγγραφέας: Μπάρμπα, Ευαγγελία
Άλλοι συγγραφείς: Barba, Evaggelia
Γλώσσα:Greek
Έκδοση: 2020
Θέματα:
Διαθέσιμο Online:http://hdl.handle.net/10889/14121
id nemertes-10889-14121
record_format dspace
institution UPatras
collection Nemertes
language Greek
topic Γευστικοί υποδοχείς
Πικάντικη αίσθηση
Λιπαρή αίσθηση
Πολυμορφισμοί
Taste receptors
Pungency
Fatty
TRPA1
CD36
Polymorphisms
spellingShingle Γευστικοί υποδοχείς
Πικάντικη αίσθηση
Λιπαρή αίσθηση
Πολυμορφισμοί
Taste receptors
Pungency
Fatty
TRPA1
CD36
Polymorphisms
Μπάρμπα, Ευαγγελία
Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό
description Η γονιδιωματική, με τη βοήθεια των νέων τεχνολογιών που έχουν αναπτυχθεί τα τελευταία χρόνια έχει οδηγήσει στη δημιουργία νέων προϊόντων και υπηρεσιών που μπορούν να συμβάλλουν στη βελτίωση της ποιότητας ζωής των ανθρώπων. Στα πλαίσια της παρούσας μελέτης έχει μελετηθεί η γενετική κατατομή του ελληνικού πληθυσμού ως προς τον τρόπο με τον οποίο ο κάθε άνθρωπος αντιλαμβάνεται συγκεκριμένα γευστικά ερεθίσματα. Ο εντοπισμός των γονότυπων και των γονιδιωματικών αλλαγών που εμπλέκονται στην αντίληψη των γεύσεων μπορεί να συμβάλλει στην ερμηνεία των γευστικών προτιμήσεων του ατόμου και γενικότερα, στη διευκόλυνση της καθημερινής ζωής. Τα βασικά είδη γευστικών αισθήσεων που αντιλαμβάνεται ο άνθρωπος είναι τα εξής 5: umami (L-γλουταμινικό), γλυκό, πικρό, αλμυρό και ξινό. Μεταξύ των παραπάνω έχει, κατά πολλούς ερευνητές, προστεθεί και έκτη γευστική αίσθηση, που ονομάζεται λιπαρή. Τέλος, η πικάντικη είναι ακόμη μία γευστική αίσθηση που επίσης αναγνωρίζεται σε πολλά μέρη του κόσμου, αλλά γενικά θεωρείται ως αίσθηση καψίματος ή πρόκλησης πόνου. Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία το ενδιαφέρον εστιάζεται στο γονίδιο CD36 για το λιπαρό και στο γονίδιο TRPA1 για το πικάντικο. Πιο συγκεκριμένα, για το γονίδιο CD36 μελετήθηκαν οι μεταγραφικοί διμορφισμοί rs1761667 και rs1527483, ενώ για το γονίδιο TRPA1 οι rs3735942 και rs11988795. Σύμφωνα με τη λεπτομερή βιβλιογραφική ανασκόπηση που πραγματοποιήθηκε σε συνδυασμό με τα ευρήματα της παρούσας μελέτης, φαίνεται πως αυτοί οι μεταγραφικοί διμορφισμοί ευθύνονται σημαντικά για τη διαφορά στην αντίληψη της λιπαρής και της πικάντικης γεύσης μεταξύ των ατόμων, δηλαδή για το αν το άτομο τις αντιλαμβάνεται έντονα, μέτρια ή καθόλου. Ωστόσο, λόγω του μικρού αριθμού δειγμάτων απαιτείται περαιτέρω έρευνα για ένα ασφαλές συμπέρασμα. Το πληθυσμιακό δείγμα της μελέτης (n=38) αφορά άτομα ελληνικής καταγωγής κι ως εκ τούτου, υποπληθυσμό Καυκάσιο (CEU). Μέχρι σήμερα δεν έχουν διεξαχθεί αντίστοιχες μελέτες για τον ελληνικό πληθυσμό και σε αυτό συνίσταται η πρωτοτυπία της παρούσας έρευνας. Για τη γονοτύπηση των δειγμάτων DNA αναπτύχθηκε, επικυρώθηκε και εφαρμόστηκε μέθοδος αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης συζευγμένη με αλληλούχιση κατά Sanger, καθώς και αλληλοειδική μέθοδος αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (Allele Specific PCR). Επίσης, αναπτύχθηκε ένα καινούριο πρωτόκολλο απομόνωσης DNA από σίελο, το οποίο αποδίδει επαρκώς και είναι σύντομο χρονικά. Τέλος, κατά την ανάλυση των δεδομένων της μελέτης, εξετάστηκε η απόκλιση από την ισορροπία Hardy-Weinberg και πραγματοποιήθηκε στατιστική επεξεργασία των αποτελεσμάτων.
author2 Barba, Evaggelia
author_facet Barba, Evaggelia
Μπάρμπα, Ευαγγελία
author Μπάρμπα, Ευαγγελία
author_sort Μπάρμπα, Ευαγγελία
title Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό
title_short Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό
title_full Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό
title_fullStr Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό
title_full_unstemmed Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό
title_sort μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων trpa1 και cd36 στον ελληνικό πληθυσμό
publishDate 2020
url http://hdl.handle.net/10889/14121
work_keys_str_mv AT mparmpaeuangelia meletētēsgenetikēseterogeneiastōngonidiōntōngeustikōnypodocheōntrpa1kaicd36stonellēnikoplēthysmo
AT mparmpaeuangelia studyofthegeneticheterogeneityofthegenesofthetastereceptorstrpa1andcd36inthegreekpopulation
_version_ 1771297168096755712
spelling nemertes-10889-141212022-09-05T06:58:32Z Μελέτη της γενετικής ετερογένειας των γονιδίων των γευστικών υποδοχέων TRPA1 και CD36 στον ελληνικό πληθυσμό Study of the genetic heterogeneity of the genes of the taste receptors TRPA1 and CD36 in the Greek population Μπάρμπα, Ευαγγελία Barba, Evaggelia Γευστικοί υποδοχείς Πικάντικη αίσθηση Λιπαρή αίσθηση Πολυμορφισμοί Taste receptors Pungency Fatty TRPA1 CD36 Polymorphisms Η γονιδιωματική, με τη βοήθεια των νέων τεχνολογιών που έχουν αναπτυχθεί τα τελευταία χρόνια έχει οδηγήσει στη δημιουργία νέων προϊόντων και υπηρεσιών που μπορούν να συμβάλλουν στη βελτίωση της ποιότητας ζωής των ανθρώπων. Στα πλαίσια της παρούσας μελέτης έχει μελετηθεί η γενετική κατατομή του ελληνικού πληθυσμού ως προς τον τρόπο με τον οποίο ο κάθε άνθρωπος αντιλαμβάνεται συγκεκριμένα γευστικά ερεθίσματα. Ο εντοπισμός των γονότυπων και των γονιδιωματικών αλλαγών που εμπλέκονται στην αντίληψη των γεύσεων μπορεί να συμβάλλει στην ερμηνεία των γευστικών προτιμήσεων του ατόμου και γενικότερα, στη διευκόλυνση της καθημερινής ζωής. Τα βασικά είδη γευστικών αισθήσεων που αντιλαμβάνεται ο άνθρωπος είναι τα εξής 5: umami (L-γλουταμινικό), γλυκό, πικρό, αλμυρό και ξινό. Μεταξύ των παραπάνω έχει, κατά πολλούς ερευνητές, προστεθεί και έκτη γευστική αίσθηση, που ονομάζεται λιπαρή. Τέλος, η πικάντικη είναι ακόμη μία γευστική αίσθηση που επίσης αναγνωρίζεται σε πολλά μέρη του κόσμου, αλλά γενικά θεωρείται ως αίσθηση καψίματος ή πρόκλησης πόνου. Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία το ενδιαφέρον εστιάζεται στο γονίδιο CD36 για το λιπαρό και στο γονίδιο TRPA1 για το πικάντικο. Πιο συγκεκριμένα, για το γονίδιο CD36 μελετήθηκαν οι μεταγραφικοί διμορφισμοί rs1761667 και rs1527483, ενώ για το γονίδιο TRPA1 οι rs3735942 και rs11988795. Σύμφωνα με τη λεπτομερή βιβλιογραφική ανασκόπηση που πραγματοποιήθηκε σε συνδυασμό με τα ευρήματα της παρούσας μελέτης, φαίνεται πως αυτοί οι μεταγραφικοί διμορφισμοί ευθύνονται σημαντικά για τη διαφορά στην αντίληψη της λιπαρής και της πικάντικης γεύσης μεταξύ των ατόμων, δηλαδή για το αν το άτομο τις αντιλαμβάνεται έντονα, μέτρια ή καθόλου. Ωστόσο, λόγω του μικρού αριθμού δειγμάτων απαιτείται περαιτέρω έρευνα για ένα ασφαλές συμπέρασμα. Το πληθυσμιακό δείγμα της μελέτης (n=38) αφορά άτομα ελληνικής καταγωγής κι ως εκ τούτου, υποπληθυσμό Καυκάσιο (CEU). Μέχρι σήμερα δεν έχουν διεξαχθεί αντίστοιχες μελέτες για τον ελληνικό πληθυσμό και σε αυτό συνίσταται η πρωτοτυπία της παρούσας έρευνας. Για τη γονοτύπηση των δειγμάτων DNA αναπτύχθηκε, επικυρώθηκε και εφαρμόστηκε μέθοδος αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης συζευγμένη με αλληλούχιση κατά Sanger, καθώς και αλληλοειδική μέθοδος αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (Allele Specific PCR). Επίσης, αναπτύχθηκε ένα καινούριο πρωτόκολλο απομόνωσης DNA από σίελο, το οποίο αποδίδει επαρκώς και είναι σύντομο χρονικά. Τέλος, κατά την ανάλυση των δεδομένων της μελέτης, εξετάστηκε η απόκλιση από την ισορροπία Hardy-Weinberg και πραγματοποιήθηκε στατιστική επεξεργασία των αποτελεσμάτων. The field of genomics combined with the emergence of new, recently developed technologies, has led to the creation of new products and services capable of improving people's quality of life. In the context of this study, the genetic distribution of the Greek population has been studied in terms of the way in which each person perceives specific taste stimuli. The identification of the genotypes and the genomic changes involved in the perception of taste can help to interpret the individual's taste preferences and in general, to facilitate daily life. The five basic types of taste a person perceives are: Umami (L-glutamine), sweet, bitter, salty and sour. According to numerous researchers, a sixth sensation called fatty has been added. Pungency is another taste sensation also recognized in many parts of the world, although it is generally considered as more of a burning or aching sensation. This postgraduate thesis focuses on the CD36 and the TRPA1 gene, responsible for the fatty and pungent sensations respectively. More specifically, for the CD36 gene the transcriptional dimorphisms rs1761667 and rs1527483 were studied, while for the TRPA1 gene the rs3735942 and rs11988795. According to the detailed literature review conducted in conjunction with the findings of this present study, it appears that these transcriptional dimorphisms are significantly responsible for the difference in the perception of fatty and pungent taste between individuals, for example whether the individual perceives them strongly, moderately or not at all. However, due to the small number of samples further research is required for a safe conclusion. As the population sample of this study (n=38) concerns individuals of Greek origin, it is therefore a Caucasian subpopulation (CEU) sample. To date, there have been no corresponding studies conducted for the Greek population, making this study unique in that respect. For the genotyping of the DNA samples, a Sanger sequence along with a polymerase chain reaction method was developed, validated and applied, as well as an allele specific polymerase chain reaction method (Allele Specific PCR). In addition, a new saliva DNA isolation protocol, which performs adequately and is short-timed, has also been developed. Finally, during the data analysis of this study, the deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium was examined and the results were statistically processed. 2020-10-21T15:52:40Z 2020-10-21T15:52:40Z 2020-10-13 http://hdl.handle.net/10889/14121 gr application/pdf