Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου
Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία μελετήθηκε η προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae AXAZ-1 κατά τη διάρκεια 48 γενεών σε συνθήκες πενίας αζώτου και φυσική επιλογή σε συνθήκες παρουσίας αζώτου. Η κάθε καλλιέργεια διερχόταν από τρεις διακριτές φάσεις: της ισόρροπης αύξησης (παρουσ...
Κύριος συγγραφέας: | |
---|---|
Άλλοι συγγραφείς: | |
Γλώσσα: | Greek |
Έκδοση: |
2021
|
Θέματα: | |
Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/15063 |
id |
nemertes-10889-15063 |
---|---|
record_format |
dspace |
institution |
UPatras |
collection |
Nemertes |
language |
Greek |
topic |
Ζύμες Προσαρμοστική εξέλιξη Saccharomyces cerevisiae Adaptive laboratory evolution |
spellingShingle |
Ζύμες Προσαρμοστική εξέλιξη Saccharomyces cerevisiae Adaptive laboratory evolution Κοθρή, Μαρία Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
description |
Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία μελετήθηκε η προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae AXAZ-1 κατά τη διάρκεια 48 γενεών σε συνθήκες πενίας αζώτου και φυσική επιλογή σε συνθήκες παρουσίας αζώτου.
Η κάθε καλλιέργεια διερχόταν από τρεις διακριτές φάσεις: της ισόρροπης αύξησης (παρουσία αζώτου και άνθρακα), της ελαιογένεσης (σε συνθήκες περιοριστικές σε άζωτο και παρουσία άνθρακα), και τη φάση αποδόμησης των αποθεματικών λιπιδίων (σε συνθήκες παρουσίας αζώτου). Υποθέσαμε ότι τα αποθεματικά λιπίδια των περισσότερο ελαιογόνων κυττάρων του πληθυσμού θα τους έδινε πλεονέκτημα στην αύξηση, κατά την αποδόμηση των λιπιδίων, έναντι των κυττάρων με μικρότερη ικανότητα ελαιογένεσης. Παρόλα αυτά, κατά τη διάρκεια των 48 γενεών παρατηρήθηκε μείωση της ικανότητας βιοσύνθεσης αποθεματικών λιπιδίων. Πιο συγκεκριμένα, το ποσοστό των λιπιδίων στην βιομάζα μειώθηκε από 25,3 ± 2,5% σε 10,93 ± 1,25%.
Από τον χαρακτηρισμό της ικανότητας ελαιογένεσης των παραγόμενων από την προσαρμοστική εξέλιξη πληθυσμών, παρατηρήθηκε αλλαγή στην βιοσύνθεση των αποθεματικών λιπιδίων. Τα στελέχη έπειτα από 32 και 40 γενεές παρουσίασαν μέγιστα ποσοστά λιπιδίων αργότερα κατά την καλλιέργεια σε σχέση με το αρχικό στέλεχος. Παρατηρήθηκε, επίσης διαφορά στην μορφολογία των κυττάρων του αρχικού στελέχους και των κύτταρων έπειτα από 48 γενεές εξέλιξης, με τα πρώτα να παρατηρούνται διάσπαρτα, με 1-2 εκβλαστήματα, ενώ στις καλλιέργειες των τελευταίων να παρατηρούνται συσσωματώματα αποτελούμενα από περισσότερα των τριών κύτταρα.
Ως εφαρμογή, μελετήθηκε η ικανότητα του αρχικού στελέχους και του στελέχους που προέκυψε έπειτα από 48 γενεές να καλλιεργούνται σε υπόστρωμα παραγόμενο ως υποπροϊόν βιομηχανίας ροδιού για την παραγωγή αιθανόλης. Τα δύο στελέχη παρουσίασαν παρόμοια αύξηση, καταναλώνοντας όλη την γλυκόζη στο υπόστρωμα και παράγοντας περίπου ίδια ποσότητα αιθανόλης, 15 g/L για το αρχικό και 13,8 g/L για το τελικό στέλεχος. Αυτό καθιστά το υποπροϊόν βιομηχανίας ροδιού το ίδιο αξιοποιήσιμο με άλλα κοινά γεωργοβιομηχανικά υποπροϊόντα, ως εναλλακτικό υπόστρωμα βιοτεχνολογικών εφαρμογών. |
author2 |
Kothri, Maria |
author_facet |
Kothri, Maria Κοθρή, Μαρία |
author |
Κοθρή, Μαρία |
author_sort |
Κοθρή, Μαρία |
title |
Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
title_short |
Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
title_full |
Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
title_fullStr |
Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
title_full_unstemmed |
Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
title_sort |
προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου |
publishDate |
2021 |
url |
http://hdl.handle.net/10889/15063 |
work_keys_str_mv |
AT kothrēmaria prosarmostikēexelixētēszymēssaccharomycescerevisiaesesynthēkespeniasazōtou AT kothrēmaria adaptiveevolutionoftheyeastsaccharomycescerevisiaeundernitrogenlimitedconditions |
_version_ |
1771297348728651776 |
spelling |
nemertes-10889-150632022-09-05T20:13:54Z Προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae σε συνθήκες πενίας αζώτου Adaptive evolution of the yeast Saccharomyces cerevisiae under nitrogen-limited conditions Κοθρή, Μαρία Kothri, Maria Ζύμες Προσαρμοστική εξέλιξη Saccharomyces cerevisiae Adaptive laboratory evolution Στην παρούσα μεταπτυχιακή εργασία μελετήθηκε η προσαρμοστική εξέλιξη της ζύμης Saccharomyces cerevisiae AXAZ-1 κατά τη διάρκεια 48 γενεών σε συνθήκες πενίας αζώτου και φυσική επιλογή σε συνθήκες παρουσίας αζώτου. Η κάθε καλλιέργεια διερχόταν από τρεις διακριτές φάσεις: της ισόρροπης αύξησης (παρουσία αζώτου και άνθρακα), της ελαιογένεσης (σε συνθήκες περιοριστικές σε άζωτο και παρουσία άνθρακα), και τη φάση αποδόμησης των αποθεματικών λιπιδίων (σε συνθήκες παρουσίας αζώτου). Υποθέσαμε ότι τα αποθεματικά λιπίδια των περισσότερο ελαιογόνων κυττάρων του πληθυσμού θα τους έδινε πλεονέκτημα στην αύξηση, κατά την αποδόμηση των λιπιδίων, έναντι των κυττάρων με μικρότερη ικανότητα ελαιογένεσης. Παρόλα αυτά, κατά τη διάρκεια των 48 γενεών παρατηρήθηκε μείωση της ικανότητας βιοσύνθεσης αποθεματικών λιπιδίων. Πιο συγκεκριμένα, το ποσοστό των λιπιδίων στην βιομάζα μειώθηκε από 25,3 ± 2,5% σε 10,93 ± 1,25%. Από τον χαρακτηρισμό της ικανότητας ελαιογένεσης των παραγόμενων από την προσαρμοστική εξέλιξη πληθυσμών, παρατηρήθηκε αλλαγή στην βιοσύνθεση των αποθεματικών λιπιδίων. Τα στελέχη έπειτα από 32 και 40 γενεές παρουσίασαν μέγιστα ποσοστά λιπιδίων αργότερα κατά την καλλιέργεια σε σχέση με το αρχικό στέλεχος. Παρατηρήθηκε, επίσης διαφορά στην μορφολογία των κυττάρων του αρχικού στελέχους και των κύτταρων έπειτα από 48 γενεές εξέλιξης, με τα πρώτα να παρατηρούνται διάσπαρτα, με 1-2 εκβλαστήματα, ενώ στις καλλιέργειες των τελευταίων να παρατηρούνται συσσωματώματα αποτελούμενα από περισσότερα των τριών κύτταρα. Ως εφαρμογή, μελετήθηκε η ικανότητα του αρχικού στελέχους και του στελέχους που προέκυψε έπειτα από 48 γενεές να καλλιεργούνται σε υπόστρωμα παραγόμενο ως υποπροϊόν βιομηχανίας ροδιού για την παραγωγή αιθανόλης. Τα δύο στελέχη παρουσίασαν παρόμοια αύξηση, καταναλώνοντας όλη την γλυκόζη στο υπόστρωμα και παράγοντας περίπου ίδια ποσότητα αιθανόλης, 15 g/L για το αρχικό και 13,8 g/L για το τελικό στέλεχος. Αυτό καθιστά το υποπροϊόν βιομηχανίας ροδιού το ίδιο αξιοποιήσιμο με άλλα κοινά γεωργοβιομηχανικά υποπροϊόντα, ως εναλλακτικό υπόστρωμα βιοτεχνολογικών εφαρμογών. In this thesis, the adaptive evolution of the yeast Saccharomyces cerevisiae AXAZ-1 was studied during 48 generations under nitrogen deprivation and natural selection in the presence of nitrogen. In every culture, the growth of the yeast went through three distinct phases: the balanced growth (in nitrogen and carbon presence), the oleaginous phase (under nitrogen limited conditions and in carbon presence), and the lipid turnover phase (in nitrogen presence). We assumed that the lipid reserves of the more oleaginous cells in the population would give them an advantage over less oleaginous cells in terms of growth during the lipid turnover phase. However, during 48 generations a decrease in lipid biosynthesis was observed. In particular, the percentage of lipids in biomass decreased from 25.3 ± 2.5% to 10.93 ± 1.25%. By characterizing of the oleagenicity of the populations that derived from the adaptive evolution, a change in lipid biosynthesis was observed. The strains that emerge after 32 and 40 generations showed maximum lipid percentages later in the culture in relation to the original strain. There was also a difference in the morphology of the cells of the original strain and the cells that emerged after 48 generations of evolution, with the former being observed dispersed, with 1-2 buds, while in the cultures of the latter agglomerates consisting of more than three cells were observed. As an application, the ability of the original strain and the strain that emerged after 48 generations to be grown on a pomegranate industry by-product for ethanol production was studied. The two strains showed a similar growth, consuming the glucose in the substrate and producing approximately the same amount of ethanol, 15 g / L for the original strain and 13.8 g / L for the final strain. This makes the pomegranate industry by-product as utilizable as other common agro-industrial by-products, as an alternative substrate for biotechnological applications. 2021-07-21T06:07:10Z 2021-07-21T06:07:10Z 2021-04 http://hdl.handle.net/10889/15063 gr application/pdf |