Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων
Η αγριελιά Olea europaea var Sylvestris ή αλλιώς oleaster αποτελεί τον πρόγονο της καλλιεργήσιμης ελιάς. Συνεχείς έρευνες έχουν αναδείξει τη βελτιωμένη θρεπτική αξία και τις αντιοξειδωτικές ιδιότητες του αγριελαίου συγκριτικά με τα χαρακτηριστικά του κοινού ελαιόλαδου (Olea europaea L. var Europaea)...
| Κύριος συγγραφέας: | |
|---|---|
| Άλλοι συγγραφείς: | |
| Γλώσσα: | Greek |
| Έκδοση: |
2022
|
| Θέματα: | |
| Διαθέσιμο Online: | http://hdl.handle.net/10889/16608 |
| id |
nemertes-10889-16608 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
nemertes-10889-166082022-09-05T20:21:55Z Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων Quantification methods for nucleic acids Κυριακοπούλου, Χριστίνα-Μαρία Kyriakopoulou, Christina-Maria Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης πραγματικού χρόνου Νουκλεϊκά οξέα Μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί Αγριέλαιο Ελαιόλαδο Νοθεία Μικροπλαστικά Real-time polymerase chain reaction Nucleic acids DNA Single nucleotide polymorphisms Wild-type olive oil Olive oil Adulteration Microplastics Η αγριελιά Olea europaea var Sylvestris ή αλλιώς oleaster αποτελεί τον πρόγονο της καλλιεργήσιμης ελιάς. Συνεχείς έρευνες έχουν αναδείξει τη βελτιωμένη θρεπτική αξία και τις αντιοξειδωτικές ιδιότητες του αγριελαίου συγκριτικά με τα χαρακτηριστικά του κοινού ελαιόλαδου (Olea europaea L. var Europaea), γεγονός που αυξάνει σημαντικά την οικονομική αξία του αγριελαίου. Έτσι, το αγριέλαιο, ανάμεσα στα γεωργικά προϊόντα, καθίσταται ένα από τα πλέον επιρρεπή για νοθεία με άλλα ελαιόλαδα χαμηλότερης θρεπτικής και οικονομικής αξίας. Εξαιτίας του γεγονότος ότι η καλλιεργήσιμη ελιά και η αγριελιά διαθέτουν παρόμοιους φαινότυπους, έχει προκύψει η ανάγκη ανάπτυξης αναλυτικών μεθόδων για τον διαχωρισμό των δύο τύπων φυτών. Στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία, η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης πραγματικού χρόνου (real-time PCR) χρησιμοποιήθηκε για την ανάπτυξη μιας νέας μεθόδου ταυτοποίησης της αγριελιάς Olea europaea var Sylvestris, συγκριτικά με την καλλιεργήσιμη ποικιλία της ελιάς, Olea europaea. Η μέθοδος για τη διαφοροποίηση των δύο ποικιλιών βασίστηκε για πρώτη φορά στη γονοτύπηση μέσω της αλληλοειδικής real-time PCR διαφορετικών μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs) που εντοπίζονται στο χλωροπλαστικό γονιδίωμα των δύο τύπων ελιάς. Με την προτεινόμενη τεχνική κατέστη δυνατή η ανίχνευση έως και 1% ποσοστού αγριελιάς σε διμερή μίγματα DNA των δύο ποικιλιών. Τέλος, στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία, μελετήθηκε η επίδραση των μικρο- ή νανοπλαστικών, ως παράγοντα επιμόλυνσης του νερού, στην ποσοτική PCR πραγματικού χρόνου. The wild-type of olive tree, Olea europaea var Sylvestris or oleaster, is the ancestor of the cultivated olive tree. Wild-type olive oil is considered to be more nutritious with increased antioxidant activity compared to the common cultivated type (Olea europaea L. var Europaea). This has led to the wild-type of olive oil having a much higher financial value. Thus, wild olive oil is one of the most susceptible agricultural food products to adulteration with other olive oils of lower nutritional and economical value. As cultivated and wild-type olives have similar phenotypes, there is a need to establish analytical methods to distinguish the two plant species. In this Master thesis, real-time polymerase chain reaction (real-time PCR) has been used to develop a new method which is able to distinguish wild-type olive Olea europaea var Sylvestris from cultivated olive Olea europaea L. var Europaea. The method is based, for the first time, on the genotyping, by allele-specific, real-time PCR, of a single nucleotide polymorphism (SNP) present in the two olives’ chloroplastic genomes. With the proposed method, we were able to detect as low as 1% content of the wild-type olive in binary DNA mixtures of the two olive species. Finally, the effect of micro- and nanoplastics as a water contamination factor in real-time PCR has been studied in the present Master thesis. 2022-08-29T07:20:12Z 2022-08-29T07:20:12Z 2022-07-07 http://hdl.handle.net/10889/16608 gr application/pdf |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης πραγματικού χρόνου Νουκλεϊκά οξέα Μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί Αγριέλαιο Ελαιόλαδο Νοθεία Μικροπλαστικά Real-time polymerase chain reaction Nucleic acids DNA Single nucleotide polymorphisms Wild-type olive oil Olive oil Adulteration Microplastics |
| spellingShingle |
Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης πραγματικού χρόνου Νουκλεϊκά οξέα Μονονουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί Αγριέλαιο Ελαιόλαδο Νοθεία Μικροπλαστικά Real-time polymerase chain reaction Nucleic acids DNA Single nucleotide polymorphisms Wild-type olive oil Olive oil Adulteration Microplastics Κυριακοπούλου, Χριστίνα-Μαρία Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| description |
Η αγριελιά Olea europaea var Sylvestris ή αλλιώς oleaster αποτελεί τον πρόγονο της καλλιεργήσιμης ελιάς. Συνεχείς έρευνες έχουν αναδείξει τη βελτιωμένη θρεπτική αξία και τις αντιοξειδωτικές ιδιότητες του αγριελαίου συγκριτικά με τα χαρακτηριστικά του κοινού ελαιόλαδου (Olea europaea L. var Europaea), γεγονός που αυξάνει σημαντικά την οικονομική αξία του αγριελαίου. Έτσι, το αγριέλαιο, ανάμεσα στα γεωργικά προϊόντα, καθίσταται ένα από τα πλέον επιρρεπή για νοθεία με άλλα ελαιόλαδα χαμηλότερης θρεπτικής και οικονομικής αξίας. Εξαιτίας του γεγονότος ότι η καλλιεργήσιμη ελιά και η αγριελιά διαθέτουν παρόμοιους φαινότυπους, έχει προκύψει η ανάγκη ανάπτυξης αναλυτικών μεθόδων για τον διαχωρισμό των δύο τύπων φυτών. Στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία, η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης πραγματικού χρόνου (real-time PCR) χρησιμοποιήθηκε για την ανάπτυξη μιας νέας μεθόδου ταυτοποίησης της αγριελιάς Olea europaea var Sylvestris, συγκριτικά με την καλλιεργήσιμη ποικιλία της ελιάς, Olea europaea. Η μέθοδος για τη διαφοροποίηση των δύο ποικιλιών βασίστηκε για πρώτη φορά στη γονοτύπηση μέσω της αλληλοειδικής real-time PCR διαφορετικών μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs) που εντοπίζονται στο χλωροπλαστικό γονιδίωμα των δύο τύπων ελιάς. Με την προτεινόμενη τεχνική κατέστη δυνατή η ανίχνευση έως και 1% ποσοστού αγριελιάς σε διμερή μίγματα DNA των δύο ποικιλιών. Τέλος, στην παρούσα Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία, μελετήθηκε η επίδραση των μικρο- ή νανοπλαστικών, ως παράγοντα επιμόλυνσης του νερού, στην ποσοτική PCR πραγματικού χρόνου. |
| author2 |
Kyriakopoulou, Christina-Maria |
| author_facet |
Kyriakopoulou, Christina-Maria Κυριακοπούλου, Χριστίνα-Μαρία |
| author |
Κυριακοπούλου, Χριστίνα-Μαρία |
| author_sort |
Κυριακοπούλου, Χριστίνα-Μαρία |
| title |
Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| title_short |
Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| title_full |
Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| title_fullStr |
Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| title_full_unstemmed |
Μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| title_sort |
μέθοδοι ποσοτικού προσδιορισμού νουκλεϊκών οξέων |
| publishDate |
2022 |
| url |
http://hdl.handle.net/10889/16608 |
| work_keys_str_mv |
AT kyriakopoulouchristinamaria methodoiposotikouprosdiorismounoukleïkōnoxeōn AT kyriakopoulouchristinamaria quantificationmethodsfornucleicacids |
| _version_ |
1771297318909247488 |
