Μέθοδοι clustering για single-cell RNAseq δεδομένα

• Main Author: Κορνιαχτός, Ιωάννης
• Other Authors: Korniachtos, Ioannis
• Language: Greek
• Published: 2023
• Subjects: Καταλογισμός; Συσταδοποίηση; Μείωση διαστάσεων; Επίδραση καταλογισμού; Δεδομένα αλληλούχισης RNA ενός κυττάρου; Single-cell RNA-seq data; Machine learning; Imputation; Clustering; Dimensionality reduction

Σκοπός της διπλωματικής είναι να ελεγχθεί η επίδραση των αλγορίθμων καταλογισμού DrImpute, ENHANCE, scImpute, I-Impute και McImpute στην απόδοση των αλγορίθμων συσταδοποίησης Spectral Clustering με Kmeans, Συσσωρευτικό Ιεραρχικό, DBScan, OPTICS και BIRCH και μείωσης διαστάσεων tSNE, UMAP, ISOMAP, PC...