Μέθοδοι clustering για single-cell RNAseq δεδομένα

• Κύριος συγγραφέας: Κορνιαχτός, Ιωάννης
• Άλλοι συγγραφείς: Korniachtos, Ioannis
• Γλώσσα: Greek
• Έκδοση: 2023
• Θέματα: Καταλογισμός; Συσταδοποίηση; Μείωση διαστάσεων; Επίδραση καταλογισμού; Δεδομένα αλληλούχισης RNA ενός κυττάρου; Single-cell RNA-seq data; Machine learning; Imputation; Clustering; Dimensionality reduction

Σκοπός της διπλωματικής είναι να ελεγχθεί η επίδραση των αλγορίθμων καταλογισμού DrImpute, ENHANCE, scImpute, I-Impute και McImpute στην απόδοση των αλγορίθμων συσταδοποίησης Spectral Clustering με Kmeans, Συσσωρευτικό Ιεραρχικό, DBScan, OPTICS και BIRCH και μείωσης διαστάσεων tSNE, UMAP, ISOMAP, PC...